|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1165 | HQ1160A | VNG0306 | hla1975 | HVO_0786 | Hbo0749 | rrnAC1916 | Hmu0822 | Hut0547 | NP0918A |
695 | HQ1160A | 1162 | 502 | 549 | 513 | 625 | 564 | 527 | 529 | 580 |
658 | VNG0306 | 502 | 1334 | 509 | 520 | 545 | 548 | 515 | 535 | 541 |
729 | hla1975 | 549 | 509 | 1148 | 501 | 603 | 568 | 543 | 587 | 592 |
689 | HVO_0786 | 513 | 520 | 501 | 1121 | 592 | 517 | 555 | 516 | 593 |
750 | Hbo0749 | 625 | 545 | 603 | 592 | 1133 | 562 | 541 | 594 | 634 |
830 | rrnAC1916 | 564 | 548 | 568 | 517 | 562 | 1263 | 751 | 680 | 664 |
820 | Hmu0822 | 527 | 515 | 543 | 555 | 541 | 751 | 1159 | 732 | 686 |
852 | Hut0547 | 529 | 535 | 587 | 516 | 594 | 680 | 732 | 1259 | 740 |
882 | NP0918A | 580 | 541 | 592 | 593 | 634 | 664 | 686 | 740 | 1163 |
180 symbols consensus ----------------------DMTGDAGIYARESDYLDRAVQLGVAGGRVISVSFPETP #oth 1111111112333333333333464453.11..33461215122.5112212311.1333 HQ1160A ::::::::::::::::::::::-:STEL::F::YFTQI:::IAV:L:S:::V::D:QS:V VNG0306 MHYSVHKACVSRDAQGPHDQPATHM:PT:V:::SI:GIG-T::::I::D::::::::THA hla1975 :::::::::::::::::::::M:T::TS:VF:::V:EIG:::EV:F:::::::::::T:A HVO_0786 ::::::::::::::::::::::--MPVS:::::::ST:G:P::V::VS:K::D::::DSL Hbo0749 ::::::::::::::::::::::---MN::VF:::::R:G::::I:::S:SI:::::::SA rrnAC1916 :::::::::MLKGRPADTNSMEAP:::::::::::S::::Y::::E::D:I::L:::SQ: Hmu0822 ::::::::::::::::::::::MASP::::::::FEF:::Y::::A::EKI:QL::::Q: Hut0547 :::::::::VTDIFKSVSVVRE::DEP::::::RI:::::D:::::::D:::A::::::: NP0918A :::::::::::::::::::::M:V:PE::::::::P::Q:H::V:::::::L:::::::: consensus PADAETDHALLDRIEAYLDGEADDFADVPVGLTVPTDQRRVLEALRNIPYGEEASVERLV #oth 3211442.32..11441352453214224211.32122.3..123231.1.153414334 HQ1160A :S::DD::::::::DT::N:DS:HL:::DIA:::::::::::::T::V:::::V:LD:IL VNG0306 :E::A:-:P:::::AD:AA:S:E::R:::I:::L::P::::::TI:SV:::DR:D::LAA hla1975 ::::AA::D:::::::::A::R:A:DG:AT:::::::R:E:::::ET::::::V::S::T HVO_0786 :::S:S:::H::AVL:AI:RGQT:LSS::I:::::::::S:::S:::V:R:DSVD:AL:: Hbo0749 :::::SE:PI:::VF:::::DE:H:D:A::A::::::H::::D:V:::::::TIALR:VI rrnAC1916 E:::GE::::::::DE::Q:VE::::::T::::A:::::I::::VQE:::::D:::AQVA Hmu0822 A:ESR:::D:::::::::SN:T:::R::D:::::S:ER:S::::V:E:::::::G:DQ:: Hut0547 A:::GD::P::::::::FE::TVA:ESTT:A::MAS:H:E:::T::S:::::GIT::Q:: NP0918A D:::::::Q::::::V::::::::::::E:AM:M:::::S:::T::SV::::TTT::A:T consensus RMTAGLDPDDDDDLRLVRTALAENPVPLLVPDHRVRDGPSAAPPAVEQKLRSIEGL---- #oth 2111321434412744125..22..2.2331....521.222.54.445.153.432111 HQ1160A ::-::::E:KT::QSTAQR::::::I::I::::::::A::G::SD:ITQ:QD::QIETVS VNG0306 :::::I:HTTT:GHNT:::::EA::::::::::::ENA::S:::R:AET::NL:R-:::: hla1975 GL-:A::A::P:::E::TD::R:::I:I:F:::::QG::Y:T:GE:RAE::RV::::::: HVO_0786 ::-:::::E:::SD:V::K:::A::::VV::::::K:::::::DD:VEA::QS::I:::: Hbo0749 ::-::M::E:E::VATA:S::R::::::FI:::::D:A:G:I:E::ARR::QV:SA:::: rrnAC1916 :::PD:ND:EE:::AQ::E:::A::::::I::::::::::::::P::::::A:::::::: Hmu0822 :::PV:::N::ESA:I::E:::D:::::VI::::::::::G::::::::::::::::::: Hut0547 :::P:::::S:E:I:::::::::::A:::L::::::::::::::::::::::::::A::: NP0918A Q:::::::EEN::R:::::::::::A::V:G::::S:::G:::A::::R:::L:E:::::