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Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2217 | HQ2592A | VNG0847 | hla2024 | HVO_1623 | Hbo3220 | Hut2049 | NP3148A | rrnAC0397 | Hmu1363 |
1516 | HQ2592A | 2318 | 1326 | 1299 | 1453 | 1468 | 1279 | 1282 | 1394 | 1327 |
1553 | VNG0847 | 1326 | 2259 | 1331 | 1377 | 1409 | 1324 | 1380 | 1368 | 1371 |
1534 | hla2024 | 1299 | 1331 | 2262 | 1467 | 1392 | 1263 | 1283 | 1312 | 1331 |
1753 | HVO_1623 | 1453 | 1377 | 1467 | 2239 | 1796 | 1367 | 1373 | 1479 | 1451 |
1821 | Hbo3220 | 1468 | 1409 | 1392 | 1796 | 2236 | 1389 | 1390 | 1448 | 1477 |
1660 | Hut2049 | 1279 | 1324 | 1263 | 1367 | 1389 | 2218 | 1437 | 1483 | 1539 |
1583 | NP3148A | 1282 | 1380 | 1283 | 1373 | 1390 | 1437 | 2176 | 1457 | 1380 |
1690 | rrnAC0397 | 1394 | 1368 | 1312 | 1479 | 1448 | 1483 | 1457 | 2232 | 1536 |
1690 | Hmu1363 | 1327 | 1371 | 1331 | 1451 | 1477 | 1539 | 1380 | 1536 | 2217 |
319 symbols consensus -MMETVRVAVPRKGRPLEAVLERIAARAD---AADVADDIISTLRYEKAITKGDQDPDAD #oth 12442231.............1.31543411163431.3132...1..221.15542443 HQ2592A ::SQS::::::::::::::::::::MVT:::::ES:V:EV:::::H:::::::SI::TMG VNG0847 MTPPP::I:::::::::::::D:VGEL:::::::S:::::AT::::::GL::::HHDARG hla2024 ::S:P:P:::::::::::::::::::VGPDDRLDGL::RVSN:::::::V:::RV:AEDG HVO_1623 M:T::::::::::::::::::::F:TTES:::I:E:::E:T:::::::SV:::HTR:EH: Hbo3220 ::T:::C::::::::::::::D:F::S:::::::Q:::::T::::H::S::::TTH::H: Hut2049 :-:TS::I:::::::::::::::::S:TG:::RTGL::E:::::::::::A::::Q:::P NP3148A :--M:T:::::::::::::::::V:SL:G:::VE:R::A:A::::::::V:::N:TDERS rrnAC0397 :-:T:T:::::::::::::::::L:G:TG:::TT:L:::::::::::::V:::N::AV:: Hmu1363 :-:T:IS::::::::::::::::L:TT:A:::FTEI:::V::::::::::::D:AT:::P consensus VYDRLADYSDLDDPTAPEYTLLRDDRDGMPRRIVFDSVTVPVDGVDLHLVGREEPFRALR #oth 1.2.1241.2333243.11..3..2.411...1...232234443424.1.......1.. HQ2592A ::E::STI:T:H:EYK:::::R::::P:::::::::TL:IDIS:IPVQ:I:::::::::: VNG0847 ::E:::A::TP:E::::D::::::S:V:K::::::::L::T:A:TRVE:I:::::::::: hla2024 P:E::IE:::P:N:RQ::F:::::::::K:::::::AA::DLGE:T:K:::::::::::: HVO_1623 ::E::::::::S::A:::::::::::::::::::::::VLEI::::I::::::::::::: Hbo3220 :::::::::::S::F:::::::::::E:::::V::::::IE:::TPV::::::::::::: Hut2049 :::::SS:::AT:::::::::M::::QS::::::::::RI:SET:::E:I:::::::::: NP3148A ::::::::::-T:TY::::::F::A:P::::::::::WR:::EDGE:::::::::::::: rrnAC0397 ::H:IS:::S::A:YK:::::::::::::::::::::::::TEHG:VQ:::::::::::: Hmu1363 ::::::A::::::::R::::::::::E:::::V::::L::::::I::R:::::::::S:: consensus THEFALGFDSADLVLEEVVQLRPEPLGSIADINERIDPMDTDVRVVTGLGDTVYHTLLAT #oth 1.1.11...1.........4123212241422.2....31.....23.1........113 HQ2592A ::T:G::::::::::::::D::ADGID::DE::A:::::N:::::::::::::::::::R VNG0847 :::::::::::::::::::G::::::T::::V::::::V::::::AS::::::::::::: hla2024 :::::V:::::::::::::GI::GG::Q::::::::::V:::::::N::::::::::MGR HVO_1623 ::::G::::::::::::::K::::G::::E:V:A::::::::::::S::::::::::M:D Hbo3220 ::::::::::::::::::::::EDGV::L::::A::::::::::::S::::::::::M:K Hut2049 K::::::::::::::::::R:D::::TDL:AL::::::L::::::H:::::::::::::: NP3148A K::::::::A:::::::::GIE::::::LSEL:D::::R::::::AG::::::::::::: rrnAC0397 ::::::::::::::::::::::D:::TA:HE::D::::L::::::::::::::::::::: Hmu1363 K:::::::::::::::::::::DD::TE::A:::::::V:::::::::M:::::::::G: consensus PEVL-SPGADLDREFVAEYEGPLCISPRYERLVEAVLGTDALEGVSFAYPNEDR-EEEAA #oth .23644436432.3.254.4.41..........1..1..4332223.4..546612..22 HQ2592A :D:::DYDVS:::S:II::Q:T:::::::::::::::::Y::DD:::K::H:EQ:Q:::: VNG0847 :DAHG:A:--V::A:LDA:S::V::::::::::::::::AVT::LT:T::DA:HD::::: hla2024 ::GI:E::T:F::D:::K:::S:::::::::::T:::::::::::E:V:::ANE:::::: HVO_1623 ::L::P::SE:::D:::D:A:D:::::::::::::::::RC:DD:T:::::DAP:::::: Hbo3220 :::::P:::::::::::::D:::::::::::::::::::RP::NI:::::E:SV::::S: Hut2049 :A:ADELD:::T:::::::A:E:::::::::::T:::::A:I::ID:R::DR:::T::DL NP3148A :D:SE::----T:::IED:::::::::::::::::::::::M:::::R::G:-::::::: rrnAC0397 :::MDTQDGP:::D::TN:::E:::::::::::::::::S::D::::T::T:GG:::::D Hmu1363 :A:RK:LPH::S:::LSA:::D::::::::::::::I:::::RDIE:V::ENG::::::: consensus IAEAGLGVYLTVTGSTARDHGLVVGEQLFPSETVLMENAAEAT-AAVERVADAIAGPELE #oth 1152.3...1.11.....11..51.13........12.53.5313623425433454452 HQ2592A :SN::V::::::::::::E:::::::E:::::::::Q:N::T:::KTD::R:IL:TC:M: VNG0847 ::D::V::::::::::::::::T:::::::::::::::QH:::GER:AS:RQ:LTTAPT: hla2024 ::RT::::::::::::::E:::D:::H:::::::::R::::HD:P::G:AL::::VEKSS HVO_1623 :::T:I:::::M::::::E::::L::H:::::::::::V:::::P:A:T:KR:::S:::: Hbo3220 ::DV:::::::M:::::::Y:::L::H:::::::::::V::T::::::H::Q::T::::: Hut2049 V::V:::::I::S:::::::::L::DR::::::::L:::::M:::HA::AV:LVD:ADI: NP3148A ::SV:M::::::::::::::::R::::::::::::L::PP:RS::DTDALLEQLV:SR:T rrnAC0397 ::AT::::::::::::::::::EL:::::::::::L:::H:R::ETT::::SLFEE::-: Hmu1363 ::::::::::::::::::::::EL:::::::::::L::RS:VG:DG:D::TELF:A:D-: consensus TALAV-------------- #oth 2427621111111111111 HQ2592A EMMTEINTQSLDANNKTTE VNG0847 ::IPPQ::::::::::::: hla2024 SEIR::::::::::::::: HVO_1623 :E:K::::::::::::::: Hbo3220 :E:V::::::::::::::: Hut2049 ::::IQ::::::::::::: NP3148A :P:--:::::::::::::: rrnAC0397 :::QSI::::::::::::: Hmu1363 SV::LQ:::::::::::::