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[L] (-) COG1107 Archaea-specific RecJ-like exonuclease, contains DnaJ-type Zn finger domain
9 genomes BUD0633 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0779

rrnAC1441

HVO_1018

Hbo0512

Hmu1959

Hut1406

hla0874

NP3224A

HQ1581A

Pairwise sequence scores
Consensus score4843 VNG0779 hla0874 HQ1581A HVO_1018 Hbo0512 NP3224A Hut1406 rrnAC1441 Hmu1959
2801VNG0779 4674 2476 2326 2498 2409 2553 2434 2543 2443
3920hla0874 2476 4931 3428 3665 3652 3264 3215 3284 3268
3712HQ1581A 2326 3428 4906 3683 3744 3122 3106 3151 3132
4083HVO_1018 2498 3665 3683 4830 3952 3285 3291 3296 3317
4001Hbo0512 2409 3652 3744 3952 4840 3247 3254 3289 3223
3737NP3224A 2553 3264 3122 3285 3247 4838 3229 3342 3424
3651Hut1406 2434 3215 3106 3291 3254 3229 4886 3421 3381
3774rrnAC1441 2543 3284 3151 3296 3289 3342 3421 4841 3795
3792Hmu1959 2443 3268 3132 3317 3223 3424 3381 3795 4875

660 symbols
consensus       MSDETAGDSG---DSGPNSGA---------RPVVYDLAPNCTLEDVEAGANYHATVNGVV
#oth            .26543224111244523335331111112222.12.135..5214.4125.212...1.
VNG0779         :T:A:V::EA:::--------::::::::AA:T:VR:DAS::TQE::::EY:::::::::
hla0874         :::N::::::TRG::S:EPD:DTAEGAADD::T:::::SD:::::A:VD:L:::E:::::
HQ1581A         :TTDS::::::::::R:::::DS:::::::::I:::::::::R::I:HD:::::V:::::
HVO_1018        ::::H:::::::D::::::D::::::::::::I:::::::::AD:::TD:Y:::V:::::
Hbo0512         :TV:N:::::::GE::S::DGDS::::::::::::::::::::::T:V::::::V:::::
NP3224A         :THSA:::A::::------:NRS:::::::AE:::E:::G:::::I::::A:L:::::::
Hut1406         :PISSDSNA::::SAD:D:SDGD::::::::::::::D:R::F::::::EQ:::::::::
rrnAC1441       ::SP:GTGD::::ATV:DG:T:::::::::--I:::::DQ::SD:L:E::L:::::::T:
Hmu1959         ::PPAGT:T::::APV:DG:T:::::::::--:::E::DG:::D:::E:SC:VG::::::

consensus       EYGVFVDLSDEVSGLVHESNLDGDYD--VGDRLIVELEEVRENGDLAFEEV--RPDDYRT
#oth            1..2.1.21142...1.1.11533231111.312.5.632121..22.245115432142
VNG0779         :::A:::::EH::::I:::TYS::P:LA:D:DV::H:SA::D::::S::F:::D:EE:::
hla0874         D::I:::V::AL:::::::::::::A:::::::V:R:T::K::::V::DDE::NL:::::
HQ1581A         :::I:I:IA:DI:::::D::::RS:E:::::::T:T::S::D::::::DVF::NESS:Q:
HVO_1018        :::I:::V::S::::I:::::SA::E:::::::V:R::S::D:::I::A:D::T::::::
Hbo0512         :::::::I::::::::::::::RT:E:::::::::S:D::::::::::DA:::SLS::::
NP3224A         D::::::::EH::::::::::QN:H::::::E:V:::V:E::::::G:::LDAD::EVDR
Hut1406         :::::::::E:::::::::::R:S:N::R::K:::A::D:::::::::A:R:::::::::
rrnAC1441       ::::::::::A::::::D:::L:Q:::::::D:::::G:I:PD:::S:::::::VA::EE
Hmu1959         :::::::::E:L:::::D:::V:::::::::E:V:::A:::::::VS::::::QFA::T:

consensus       ETVDHEPD-TRIADLAD-IGETVTVEGEVVQIKQTGGPTVFRVRDETGIVPCAAFEEAGV
#oth            4516433343546415254.331522.41311...1...1.421.33121221..22...
VNG0779         :QRS:AYER:TADAVGSR::D::HI::::::::::A:::::::::::SAI::T:::D:::
hla0874         :::V:::TVS:VRG:T-:P:DE:::::::::A:::::::I:A:A:AS:V:S:::::::::
HQ1581A         VV:E:D:EL:A:EE:E-:P:IDAY:A:K:TK::::::::I:::A::::::AT:::Q::::
HVO_1018        L::::::TI:P:SS:S-:V::S:::::V:T::::::::::::IA:DS:::AA::::::::
Hbo0512         V:::Y:::I:P::EVE-:A:MD:F:::V:A::::::::::::IA:D::::SA::::D:::
NP3224A         TS:NEGTA:A:TG::::HV::::HL::DI::::::A:::I:SL::GD:V:::::::S:::
Hut1406         VA:EADT::VGSPA:S:N:::S:RLA:::::::::::::::H:::GESV:::::::D:::
rrnAC1441       QR:A:GNA::TV:::D:AT::::II::Q:::::::::::::Q::::::::::::::::::
Hmu1959         :A:GRGT::AVVD::::VT::::::R:::L:::::::::I:QL:::S:V::::::D::::

consensus       RAHPAVELDDIVRVSGRVEDREGALQLEVDSLTVLDGEAAADVRERLDAALDERAEPADV
#oth            ..2.4.122.51324.311412234.2.12423315233333326221322522.3.521
VNG0779         ::::G::VG:::H:::DAD::::TT:::::AFE::S:GDS:::AR::::::A:Q:D:V::
hla0874         ::Y:E::VG:M:H:::T::T::N:::::::::KR:PEGR::EA:::FE::::::::::::
HQ1581A         ::F:T:::::T:::G:A::PHN:S::I::E:::Q:::AD:EET:A:::T:FTR::A:P:I
HVO_1018        ::F:G:D:::V::MA:T:::H::TR:::::G:::::D:::::A:Q:I::::::::::EP:
Hbo0512         ::::E:::::A:::::TA:SH::::::::N:M:R:TD:::EST::::EN::S:::::NE:
NP3224A         ::Y:::::::T::IT:A::TH:::::::::K:VR:R::::DE::TE:::D:EA::A::::
Hut1406         ::Y:D:DIE:L:QIR::::E:N:GI:I::E::ESVTDD:G::LA:::ETRTQ:A:Q:H::
rrnAC1441       ::::D::I:::::::::A:E:DDG::V:AE::::::::E::A:ESD:::::A:A::::::
Hmu1959         ::F:::D:G:VAE:T::::S:N:GV:V:::E::::G:DRERA::DDI:E::::A:::::I

consensus       EPLVEWPAFEKLRDDLRDVARLLRRTVLEGRPIRMRHHADGDGMCASVPVQLALERFIAE
#oth            21111.3.112141..231.24..11.121....3........21.12.113..132163
VNG0779         DA::D:::L:Q:LP:::S:::T:::A:::::::::::::::::::::L:::Y::RQ::ED
hla0874         D:::::E:::PIH::::EL:::::::::A:::::V:::::::::::AI:::::::N:VCD
HQ1581A         S::I::D:L:P:I:::::::Q:::::::::::::I:::::::::::::::::::::Y:RD
HVO_1018        ::::::S:::::::::E:::::::::::::::::V:::::::::::::::::::::L:T:
Hbo0512         ::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::::::::::::::::::N::S:
NP3224A         :::I::::::::H:::A:L::R:::A:::S::::L::::::::::::L:::I::::::D:
Hut1406         ::F:::D:LDP:L:::EG:::R:::A:I:::::::::::::::IA::::LAV:::N::E:
rrnAC1441       ::::::::::::W::::E::TE::K:::S::::::::::::::L:::::L:V:::S:::S
Hmu1959         D:::::::::::W::::::::Q:::::::::::::::::::::L:::::L:::::::V:R

consensus       VHDDPDAARHLLKRLPSKAPYYEMEDVTRDLNFALEGRARHGQKLPLLLMLDNGSTEEDV
#oth            314.42.21.12.....1..1..1..1.....1...3.3....1..212.1........1
VNG0779         T:Q:E:::::::::::::::::::::A:::::::::D::::::::::::::::::::::T
hla0874         ::E:::::Q::F::::::::::::::::::::::::::::::::::F:::::::::::::
HQ1581A         :Y::D::::::V::::::::F:::::::::::::::::S::::R::F:::::::::::::
HVO_1018        :::::::P:::F::::::::F::::::::::::::::::::::R::F:::::::::::::
Hbo0512         ::::E::P:::F::::::::F:::::::::::::::::S::::R::::::::::::::::
NP3224A         ::H::::G::::::::::::F:::::::::::::::D:E::::R::::F:V::::::::T
Hut1406         ::A:G::::::::::::R::::::::::::::H:::S:E:::::::::M:::::::::::
rrnAC1441       QYE:AS:PQ:::::::::::::::::::::::::::D:T:::::::M::::::::::::T
Hmu1959         HYQ:DE:G::M::::::::::::L::::::::::::N:E::::::::V:::::::::::T

consensus       PAYENLAHYDIPIAVVDHHHPDPEAVEPLLDAHVNPYLHDEDYRITTGMMCVELARMIDP
#oth            ...32132..1.22.1.......3..21.213......11....1....1......1.2.
VNG0779         :::KT:DN:::::V:::::::::G::D::V:E:::::::G:::::::::L::::::::Y:
hla0874         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::::L:::
HQ1581A         ::::::::::V:T::I:::::::S::D::::::::::::::::::::::L::::::::::
HVO_1018        ::::::::::V:::::::::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::H:
Hbo0512         ::::::::::V:::::::::::::::::::::::::::Y:::::::::::::::::::::
NP3224A         :::RAVSE::::VL:::::::::D::G::VEQ::::::::::::::::::::::::::::
Hut1406         :::Q::::::V::V:I:::::::::::G:V:D:::::::::::::::::L::::::::::
rrnAC1441       :::R::R:::::VV:::::::::::::::IEQ:::::::::::::::::L::::::::::
Hmu1959         :::R::R:::::VV:::::::::::::::I::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       SLTDELEHVPAVAGLSDRSKAEAMDDYIELAEDAGYDEEDLLDIGEALDYAAHWLRYDDG
#oth            22.3114.......11...1122.44123..444..1344.2231.....1121.1.33.
VNG0779         GI:SD::::::::::::::::D::T::LD::R::::::SF:QQMS:::::E:YM::::H:
hla0874         :I:G::::::::::::::::::T::::VA:::G:::::S::::::::::::::::::SE:
HQ1581A         :V:::IQ::::::::A:::::D::AS:::::TTV:::HDR::EL:::::::::::::S::
HVO_1018        DV::::R:::::::::::::::V::N::A::::E:::R:Q:::V:::::::::::::N::
Hbo0512         :V::D:K::::::::::::::TV:::FV::::EQ:::R:G:::::::::::::::::S::
NP3224A         :::E:::::::::::::::::D:::Q:L:::A::::::S::Q:::::::::::::::QS:
Hut1406         D:::D:T::::::::A:::E::::T::LA:::Q:::KQ:::R:::::::::T::::::::
rrnAC1441       D::ED:Q::::::::::::E::::R:::G::SEK::::N::R:::::::::T:::::NS:
Hmu1959         ::::::R:::::::V::::EG:::PE:V:::RQE::::A::R:V:::::::TF::K::::

consensus       RSLINDVLNVGCDDEARHEELVEFLSTRAERDVERQLDAAEDHVEHERLDSGAHLYRIDV
#oth            65214.2..1313.24..3.2.3..241.211.43.121242.12.12131..1..21.1
VNG0779         TQV:A:I:::D-G:AQ::R:::P::DRL:SEA:AE::::TRS::::::VA:::N::::::
hla0874         KT:V::A:::::E:::::::::::::E::D:::Q:::::VD::::::::A:::::::::L
HQ1581A         Q:IV::::::::S::S::A:::D:::S::::::::::N:TVP:LT:D::E::::::Q::L
HVO_1018        A:IV:::::::::::E::R::::::::::::::D:::E:::P:L:::::::::N:::::L
Hbo0512         Q:IV:::::::::::::::::::::A:::::::N:::::::S:::::T:S::::::T::L
NP3224A         :N::K:I::LD:::A:::R:::S::AD::::::AE:I:D::P::::::::N::::::L::
Hut1406         DP::T:::::A:::RD::::I:D::A::::::::E:::::M::::::E::N::::::L::
rrnAC1441       EE::T:::::D:::RD::G:V:::::E:::::::D:::::MS::D:::::N:::::T:::
Hmu1959         :E::D:A:::N:::RD::::I::::::::::::DT:::::M::L::::::N:::::Q:::

consensus       ENHAHRFTYPAPGKTTGKLHDRKVQETGDPVITIGYGPDFAVLRSDGVRLDIPRMVTELN
#oth            133.1.....11.1111321.3214121211111111111211.11.111.1142121.3
VNG0779         ::::::::::RA:ENNRR--:PRP:GR:N--------------:GA:---:HH:LRPG:R
hla0874         DEY::::::::::::::E:::TR:K:::::::::::::::C::::::::::::N::::::
HQ1581A         DEW:::::::::::::::::::Q:K:H:E:::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_1018        DKW:::::::::::::::::::::::::E:::::::::::::::::::::::::::A:::
Hbo0512         DEW::::::::::::::::::Q::::RQE::::::::::::::::::::::::Q::A:::
NP3224A         ::::R::::::::::::E::::::T::::::::::::::::::::::::::::N:::::K
Hut1406         ::A:R::::::::::::TI:::::E::::::::::::::::::::::::::::T:::::R
rrnAC1441       :::::::::::::::::EI:::::A::::::::::::::::::::::::::::::::::S
Hmu1959         :H::::::::::::::::I:::::E::::::::::::::::::::::::::::EY::::S

consensus       EEVDGGGVSGGGHLVVGSIKFVKGMREAVIDALVEKMADAEIDEELSSTAALDD------
#oth            313322111.11.1111111114.1.2513231121122122124.52454535421111
VNG0779         GAPV:RRAP:HP:---------D:R:TQRRTPWGRRLRRRPPGRR:DPVRSR:A::::::
hla0874         ::LPEA::::::::::::::::::R:S:::ET::::::::::::A::::V:I::::::::
HQ1581A         :::I::::::::::::::::::E::::::L:S::T::G:::L:AT:::H:VA:GASQIDD
HVO_1018        :::V::::::::::::::::::S::::E:::S::::::E:D::::::T::----::::::
Hbo0512         :::V::::::::::::::::::::::SE:::S::::::E::L:A::::Q:PV::L:::::
NP3224A         S::::A::::::::::::::::P::::P:::::::::::::L::D:R::LVR::::::::
Hut1406         ::IPS:::::::::::::::::E:R::D:V::::::::::::::::H:S:::PEDV::::
rrnAC1441       ::::::::::::::::::::::::R::S::::::::::E:::::::G:ST::PEEV::::
Hmu1959         D:I::::::::::::::::::::::::Q::::::::::::::::::Q::GV:SQD:::::