|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 4843 | VNG0779 | hla0874 | HQ1581A | HVO_1018 | Hbo0512 | NP3224A | Hut1406 | rrnAC1441 | Hmu1959 |
2801 | VNG0779 | 4674 | 2476 | 2326 | 2498 | 2409 | 2553 | 2434 | 2543 | 2443 |
3920 | hla0874 | 2476 | 4931 | 3428 | 3665 | 3652 | 3264 | 3215 | 3284 | 3268 |
3712 | HQ1581A | 2326 | 3428 | 4906 | 3683 | 3744 | 3122 | 3106 | 3151 | 3132 |
4083 | HVO_1018 | 2498 | 3665 | 3683 | 4830 | 3952 | 3285 | 3291 | 3296 | 3317 |
4001 | Hbo0512 | 2409 | 3652 | 3744 | 3952 | 4840 | 3247 | 3254 | 3289 | 3223 |
3737 | NP3224A | 2553 | 3264 | 3122 | 3285 | 3247 | 4838 | 3229 | 3342 | 3424 |
3651 | Hut1406 | 2434 | 3215 | 3106 | 3291 | 3254 | 3229 | 4886 | 3421 | 3381 |
3774 | rrnAC1441 | 2543 | 3284 | 3151 | 3296 | 3289 | 3342 | 3421 | 4841 | 3795 |
3792 | Hmu1959 | 2443 | 3268 | 3132 | 3317 | 3223 | 3424 | 3381 | 3795 | 4875 |
660 symbols consensus MSDETAGDSG---DSGPNSGA---------RPVVYDLAPNCTLEDVEAGANYHATVNGVV #oth .26543224111244523335331111112222.12.135..5214.4125.212...1. VNG0779 :T:A:V::EA:::--------::::::::AA:T:VR:DAS::TQE::::EY::::::::: hla0874 :::N::::::TRG::S:EPD:DTAEGAADD::T:::::SD:::::A:VD:L:::E::::: HQ1581A :TTDS::::::::::R:::::DS:::::::::I:::::::::R::I:HD:::::V::::: HVO_1018 ::::H:::::::D::::::D::::::::::::I:::::::::AD:::TD:Y:::V::::: Hbo0512 :TV:N:::::::GE::S::DGDS::::::::::::::::::::::T:V::::::V::::: NP3224A :THSA:::A::::------:NRS:::::::AE:::E:::G:::::I::::A:L::::::: Hut1406 :PISSDSNA::::SAD:D:SDGD::::::::::::::D:R::F::::::EQ::::::::: rrnAC1441 ::SP:GTGD::::ATV:DG:T:::::::::--I:::::DQ::SD:L:E::L:::::::T: Hmu1959 ::PPAGT:T::::APV:DG:T:::::::::--:::E::DG:::D:::E:SC:VG:::::: consensus EYGVFVDLSDEVSGLVHESNLDGDYD--VGDRLIVELEEVRENGDLAFEEV--RPDDYRT #oth 1..2.1.21142...1.1.11533231111.312.5.632121..22.245115432142 VNG0779 :::A:::::EH::::I:::TYS::P:LA:D:DV::H:SA::D::::S::F:::D:EE::: hla0874 D::I:::V::AL:::::::::::::A:::::::V:R:T::K::::V::DDE::NL::::: HQ1581A :::I:I:IA:DI:::::D::::RS:E:::::::T:T::S::D::::::DVF::NESS:Q: HVO_1018 :::I:::V::S::::I:::::SA::E:::::::V:R::S::D:::I::A:D::T:::::: Hbo0512 :::::::I::::::::::::::RT:E:::::::::S:D::::::::::DA:::SLS:::: NP3224A D::::::::EH::::::::::QN:H::::::E:V:::V:E::::::G:::LDAD::EVDR Hut1406 :::::::::E:::::::::::R:S:N::R::K:::A::D:::::::::A:R::::::::: rrnAC1441 ::::::::::A::::::D:::L:Q:::::::D:::::G:I:PD:::S:::::::VA::EE Hmu1959 :::::::::E:L:::::D:::V:::::::::E:V:::A:::::::VS::::::QFA::T: consensus ETVDHEPD-TRIADLAD-IGETVTVEGEVVQIKQTGGPTVFRVRDETGIVPCAAFEEAGV #oth 4516433343546415254.331522.41311...1...1.421.33121221..22... VNG0779 :QRS:AYER:TADAVGSR::D::HI::::::::::A:::::::::::SAI::T:::D::: hla0874 :::V:::TVS:VRG:T-:P:DE:::::::::A:::::::I:A:A:AS:V:S::::::::: HQ1581A VV:E:D:EL:A:EE:E-:P:IDAY:A:K:TK::::::::I:::A::::::AT:::Q:::: HVO_1018 L::::::TI:P:SS:S-:V::S:::::V:T::::::::::::IA:DS:::AA:::::::: Hbo0512 V:::Y:::I:P::EVE-:A:MD:F:::V:A::::::::::::IA:D::::SA::::D::: NP3224A TS:NEGTA:A:TG::::HV::::HL::DI::::::A:::I:SL::GD:V:::::::S::: Hut1406 VA:EADT::VGSPA:S:N:::S:RLA:::::::::::::::H:::GESV:::::::D::: rrnAC1441 QR:A:GNA::TV:::D:AT::::II::Q:::::::::::::Q:::::::::::::::::: Hmu1959 :A:GRGT::AVVD::::VT::::::R:::L:::::::::I:QL:::S:V::::::D:::: consensus RAHPAVELDDIVRVSGRVEDREGALQLEVDSLTVLDGEAAADVRERLDAALDERAEPADV #oth ..2.4.122.51324.311412234.2.12423315233333326221322522.3.521 VNG0779 ::::G::VG:::H:::DAD::::TT:::::AFE::S:GDS:::AR::::::A:Q:D:V:: hla0874 ::Y:E::VG:M:H:::T::T::N:::::::::KR:PEGR::EA:::FE:::::::::::: HQ1581A ::F:T:::::T:::G:A::PHN:S::I::E:::Q:::AD:EET:A:::T:FTR::A:P:I HVO_1018 ::F:G:D:::V::MA:T:::H::TR:::::G:::::D:::::A:Q:I::::::::::EP: Hbo0512 ::::E:::::A:::::TA:SH::::::::N:M:R:TD:::EST::::EN::S:::::NE: NP3224A ::Y:::::::T::IT:A::TH:::::::::K:VR:R::::DE::TE:::D:EA::A:::: Hut1406 ::Y:D:DIE:L:QIR::::E:N:GI:I::E::ESVTDD:G::LA:::ETRTQ:A:Q:H:: rrnAC1441 ::::D::I:::::::::A:E:DDG::V:AE::::::::E::A:ESD:::::A:A:::::: Hmu1959 ::F:::D:G:VAE:T::::S:N:GV:V:::E::::G:DRERA::DDI:E::::A:::::I consensus EPLVEWPAFEKLRDDLRDVARLLRRTVLEGRPIRMRHHADGDGMCASVPVQLALERFIAE #oth 21111.3.112141..231.24..11.121....3........21.12.113..132163 VNG0779 DA::D:::L:Q:LP:::S:::T:::A:::::::::::::::::::::L:::Y::RQ::ED hla0874 D:::::E:::PIH::::EL:::::::::A:::::V:::::::::::AI:::::::N:VCD HQ1581A S::I::D:L:P:I:::::::Q:::::::::::::I:::::::::::::::::::::Y:RD HVO_1018 ::::::S:::::::::E:::::::::::::::::V:::::::::::::::::::::L:T: Hbo0512 ::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::::::::::::::::::N::S: NP3224A :::I::::::::H:::A:L::R:::A:::S::::L::::::::::::L:::I::::::D: Hut1406 ::F:::D:LDP:L:::EG:::R:::A:I:::::::::::::::IA::::LAV:::N::E: rrnAC1441 ::::::::::::W::::E::TE::K:::S::::::::::::::L:::::L:V:::S:::S Hmu1959 D:::::::::::W::::::::Q:::::::::::::::::::::L:::::L:::::::V:R consensus VHDDPDAARHLLKRLPSKAPYYEMEDVTRDLNFALEGRARHGQKLPLLLMLDNGSTEEDV #oth 314.42.21.12.....1..1..1..1.....1...3.3....1..212.1........1 VNG0779 T:Q:E:::::::::::::::::::::A:::::::::D::::::::::::::::::::::T hla0874 ::E:::::Q::F::::::::::::::::::::::::::::::::::F::::::::::::: HQ1581A :Y::D::::::V::::::::F:::::::::::::::::S::::R::F::::::::::::: HVO_1018 :::::::P:::F::::::::F::::::::::::::::::::::R::F::::::::::::: Hbo0512 ::::E::P:::F::::::::F:::::::::::::::::S::::R:::::::::::::::: NP3224A ::H::::G::::::::::::F:::::::::::::::D:E::::R::::F:V::::::::T Hut1406 ::A:G::::::::::::R::::::::::::::H:::S:E:::::::::M::::::::::: rrnAC1441 QYE:AS:PQ:::::::::::::::::::::::::::D:T:::::::M::::::::::::T Hmu1959 HYQ:DE:G::M::::::::::::L::::::::::::N:E::::::::V:::::::::::T consensus PAYENLAHYDIPIAVVDHHHPDPEAVEPLLDAHVNPYLHDEDYRITTGMMCVELARMIDP #oth ...32132..1.22.1.......3..21.213......11....1....1......1.2. VNG0779 :::KT:DN:::::V:::::::::G::D::V:E:::::::G:::::::::L::::::::Y: hla0874 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::::L::: HQ1581A ::::::::::V:T::I:::::::S::D::::::::::::::::::::::L:::::::::: HVO_1018 ::::::::::V:::::::::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::H: Hbo0512 ::::::::::V:::::::::::::::::::::::::::Y::::::::::::::::::::: NP3224A :::RAVSE::::VL:::::::::D::G::VEQ:::::::::::::::::::::::::::: Hut1406 :::Q::::::V::V:I:::::::::::G:V:D:::::::::::::::::L:::::::::: rrnAC1441 :::R::R:::::VV:::::::::::::::IEQ:::::::::::::::::L:::::::::: Hmu1959 :::R::R:::::VV:::::::::::::::I:::::::::::::::::::::::::::::: consensus SLTDELEHVPAVAGLSDRSKAEAMDDYIELAEDAGYDEEDLLDIGEALDYAAHWLRYDDG #oth 22.3114.......11...1122.44123..444..1344.2231.....1121.1.33. VNG0779 GI:SD::::::::::::::::D::T::LD::R::::::SF:QQMS:::::E:YM::::H: hla0874 :I:G::::::::::::::::::T::::VA:::G:::::S::::::::::::::::::SE: HQ1581A :V:::IQ::::::::A:::::D::AS:::::TTV:::HDR::EL:::::::::::::S:: HVO_1018 DV::::R:::::::::::::::V::N::A::::E:::R:Q:::V:::::::::::::N:: Hbo0512 :V::D:K::::::::::::::TV:::FV::::EQ:::R:G:::::::::::::::::S:: NP3224A :::E:::::::::::::::::D:::Q:L:::A::::::S::Q:::::::::::::::QS: Hut1406 D:::D:T::::::::A:::E::::T::LA:::Q:::KQ:::R:::::::::T:::::::: rrnAC1441 D::ED:Q::::::::::::E::::R:::G::SEK::::N::R:::::::::T:::::NS: Hmu1959 ::::::R:::::::V::::EG:::PE:V:::RQE::::A::R:V:::::::TF::K:::: consensus RSLINDVLNVGCDDEARHEELVEFLSTRAERDVERQLDAAEDHVEHERLDSGAHLYRIDV #oth 65214.2..1313.24..3.2.3..241.211.43.121242.12.12131..1..21.1 VNG0779 TQV:A:I:::D-G:AQ::R:::P::DRL:SEA:AE::::TRS::::::VA:::N:::::: hla0874 KT:V::A:::::E:::::::::::::E::D:::Q:::::VD::::::::A:::::::::L HQ1581A Q:IV::::::::S::S::A:::D:::S::::::::::N:TVP:LT:D::E::::::Q::L HVO_1018 A:IV:::::::::::E::R::::::::::::::D:::E:::P:L:::::::::N:::::L Hbo0512 Q:IV:::::::::::::::::::::A:::::::N:::::::S:::::T:S::::::T::L NP3224A :N::K:I::LD:::A:::R:::S::AD::::::AE:I:D::P::::::::N::::::L:: Hut1406 DP::T:::::A:::RD::::I:D::A::::::::E:::::M::::::E::N::::::L:: rrnAC1441 EE::T:::::D:::RD::G:V:::::E:::::::D:::::MS::D:::::N:::::T::: Hmu1959 :E::D:A:::N:::RD::::I::::::::::::DT:::::M::L::::::N:::::Q::: consensus ENHAHRFTYPAPGKTTGKLHDRKVQETGDPVITIGYGPDFAVLRSDGVRLDIPRMVTELN #oth 133.1.....11.1111321.3214121211111111111211.11.111.1142121.3 VNG0779 ::::::::::RA:ENNRR--:PRP:GR:N--------------:GA:---:HH:LRPG:R hla0874 DEY::::::::::::::E:::TR:K:::::::::::::::C::::::::::::N:::::: HQ1581A DEW:::::::::::::::::::Q:K:H:E::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1018 DKW:::::::::::::::::::::::::E:::::::::::::::::::::::::::A::: Hbo0512 DEW::::::::::::::::::Q::::RQE::::::::::::::::::::::::Q::A::: NP3224A ::::R::::::::::::E::::::T::::::::::::::::::::::::::::N:::::K Hut1406 ::A:R::::::::::::TI:::::E::::::::::::::::::::::::::::T:::::R rrnAC1441 :::::::::::::::::EI:::::A::::::::::::::::::::::::::::::::::S Hmu1959 :H::::::::::::::::I:::::E::::::::::::::::::::::::::::EY::::S consensus EEVDGGGVSGGGHLVVGSIKFVKGMREAVIDALVEKMADAEIDEELSSTAALDD------ #oth 313322111.11.1111111114.1.2513231121122122124.52454535421111 VNG0779 GAPV:RRAP:HP:---------D:R:TQRRTPWGRRLRRRPPGRR:DPVRSR:A:::::: hla0874 ::LPEA::::::::::::::::::R:S:::ET::::::::::::A::::V:I:::::::: HQ1581A :::I::::::::::::::::::E::::::L:S::T::G:::L:AT:::H:VA:GASQIDD HVO_1018 :::V::::::::::::::::::S::::E:::S::::::E:D::::::T::----:::::: Hbo0512 :::V::::::::::::::::::::::SE:::S::::::E::L:A::::Q:PV::L::::: NP3224A S::::A::::::::::::::::P::::P:::::::::::::L::D:R::LVR:::::::: Hut1406 ::IPS:::::::::::::::::E:R::D:V::::::::::::::::H:S:::PEDV:::: rrnAC1441 ::::::::::::::::::::::::R::S::::::::::E:::::::G:ST::PEEV:::: Hmu1959 D:I::::::::::::::::::::::::Q::::::::::::::::::Q::GV:SQD:::::