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Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1504 | VNG2657 | HQ3390A | hla0422 | HVO_0354 | Hbo1126 | Hut0041 | NP0124A | rrnAC2423 | Hmu0150 |
1189 | VNG2657 | 1546 | 1062 | 1103 | 1047 | 1096 | 1069 | 1058 | 1099 | 1077 |
1165 | HQ3390A | 1062 | 1686 | 1067 | 1118 | 1149 | 1069 | 1053 | 1071 | 1089 |
1232 | hla0422 | 1103 | 1067 | 1600 | 1123 | 1139 | 1025 | 1137 | 1105 | 1112 |
1254 | HVO_0354 | 1047 | 1118 | 1123 | 1496 | 1284 | 1045 | 1115 | 1122 | 1128 |
1268 | Hbo1126 | 1096 | 1149 | 1139 | 1284 | 1504 | 1090 | 1113 | 1172 | 1151 |
1222 | Hut0041 | 1069 | 1069 | 1025 | 1045 | 1090 | 1486 | 1094 | 1202 | 1164 |
1264 | NP0124A | 1058 | 1053 | 1137 | 1115 | 1113 | 1094 | 1508 | 1158 | 1222 |
1312 | rrnAC2423 | 1099 | 1071 | 1105 | 1122 | 1172 | 1202 | 1158 | 1509 | 1306 |
1329 | Hmu0150 | 1077 | 1089 | 1112 | 1128 | 1151 | 1164 | 1222 | 1306 | 1512 |
241 symbols consensus ------------MSAEDAPEPD----------------------APAS--SEEAAANAQL #oth 111111112111333334212211111111111111111111111335222242534.2. VNG2657 ::::::::MSDEQP:::ET:EA:::::::::::::::::::::::AE:EDTQ:V::::K: HQ3390A ::::::::::::-MS:SDTD::IDDDAHNNGDNDVDVAVDESES:ETTTDTDT:S:::K: hla0422 MSGEETEAPSDEDV:A:E::::::::::::::::::::::::::::::::::A:NE:::: HVO_0354 ::::::::::::::ES:::::E::::::::::::::::::::::S:::::::::KE::L: Hbo1126 ::::::::::::::DSEQ:::E::::::::::::::::::::::S::D::::::S::::: Hut0041 ::::::::::::::::TDA:A::::::::::::::::::::::::E--::A:TETTG:K: NP0124A ::::::::::::-MSSE:::::::::::::::::::::::::::::::::TDDERVS::: rrnAC2423 :::::::::::::::::T::A::::::::::::::::::::::::D:AEE::PET:R:K: Hmu0150 :::::::::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::G::TDDE::P::: consensus FGEWDVTEIEYEDPSTERYITVTPIAHTMGRHASKQFKKSEISIVERLINRLMQTDENTG #oth .13.22511215...14..331..1.......15...2..1..2...11....1122.1. VNG2657 ::K:::A::H::::::R::LA:::V::::::::Q::::::::::::::A::::K:GA:A: HQ3390A ::::::S:::::::::Q::::::::::::::::A:::E::K::V:::::::::::ED::: hla0422 :DV::::::A::::::K::M:::::::::::::::::::::::L:::M:::::::::::: HVO_0354 ::V:::S:M::T:::MS:::KA:::::::::::::::Q:::::::::::::::::ED::: Hbo1126 ::V::IVD:::A::::Q:::N::::::::::::::::Q::::::::::::::::SED::: Hut0041 ::S:ATDD::FR:::::::::::::::::::::K:::Q:::::::::::::::::E:::: NP0124A ::::EIG::::D::::R:::::::::::::::SE:::::::::::::::::::::::::: rrnAC2423 :::::I:D:::S:::::::::::::::::::::D:::::::::::::::::::::::::: Hmu0150 ::::::::::FS:::::::V::::::::::::SE:::::::::::::::::::::::::: consensus KKQQATKIVRDAFEIVHERTDENPVQVLVRAVENAAPREETVRLKYGGISVPKAVDVAPQ #oth 1..22341.31..121211.1...1.1.1311..11................1...21.. VNG2657 :::::L:::::::D::::::::::I::::S::::::::::::::::::::::Q:::T::: HQ3390A H::KTMN::E:::DTI:N::E:::::::::G:::::::::::::::::::::Q::::::: hla0422 ::::::R::::::D:I::::E:::::I::T:::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0354 H::KTS:::K::::::N:::E:::::::I::::::G::::::::::::::::Q::::::: Hbo1126 H::KTM:::K::::::::::::::I::::T::::::::::::::::::::::Q::::::: Hut0041 ::::S:RL::E::::::NN:::::I::::::I::S:::::::::::::::::::::IS:: NP0124A ::::::::::E::D::A::::::::::::T:::::G:::::::::::::::::::::::: rrnAC2423 :::L::S::TE:::L:::::::::I::::S::::S::::::::::::::::::::::::: Hmu0150 :::L::T::K::::TI::::E::::::::E::::S::::::::::::::::::::::::: consensus RRVDQALKFIAEGTYNGSFKTTTDAAEALAQQLIGAANYDVQ-TYAVNQKEEKERVAAAA #oth ....2..1.112.243211.12131111..22131.11212112.212..1.3....1.. VNG2657 :::::::::L:D:AHSA::::P::::::::N::A:::D:N::::::IG::K::::::::: HQ3390A :::::::::::D::QR::Y:SAQS::DS:::VI::::::::::S:::G::::S::::E:: hla0422 :::::::L::SD:VA:ATY:S::S::::::NE::T::D::PERS:SIS::::R::::::: HVO_0354 ::::E::::::Q::LS::Y::::T:::::::::::::D::::::::IS:::::::::E:: Hbo1126 :::::::::L::::AS::Y::::S:::::::::V::S::N:E::::I:::::R::::E:: Hut0041 ::::::::::::::H:A::::P:::E:::::::M::::N::::::::::::::::::::: NP0124A ::::L:::::::::::D::::::PVE::::H:::::::::L::A:P:S::::Q::::::: rrnAC2423 :::::::::L:::V:G:::::::T::::::::::::::D::::::::::::::::::::: Hmu0150 :::::::::L:::V:GD::::::::ED:::::::::::N::::::::::::::::::::: consensus R #oth . VNG2657 : HQ3390A : hla0422 : HVO_0354 : Hbo1126 : Hut0041 : NP0124A : rrnAC2423 : Hmu0150 :