|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2116 | rrnAC0318 | Hut0031 | VNG1681 | Hmu2511 | NP4768A | hla1350 | HQ2861A | HVO_2526 | Hbo2334 |
1531 | rrnAC0318 | 2254 | 1329 | 1236 | 1301 | 1178 | 1186 | 1239 | 1215 | 1188 |
1512 | Hut0031 | 1329 | 2222 | 1212 | 1266 | 1210 | 1194 | 1191 | 1280 | 1214 |
1462 | VNG1681 | 1236 | 1212 | 2111 | 1272 | 1213 | 1229 | 1119 | 1170 | 1154 |
1584 | Hmu2511 | 1301 | 1266 | 1272 | 2182 | 1235 | 1273 | 1194 | 1318 | 1245 |
1468 | NP4768A | 1178 | 1210 | 1213 | 1235 | 2117 | 1272 | 1151 | 1274 | 1186 |
1565 | hla1350 | 1186 | 1194 | 1229 | 1273 | 1272 | 2231 | 1272 | 1419 | 1316 |
1456 | HQ2861A | 1239 | 1191 | 1119 | 1194 | 1151 | 1272 | 2145 | 1405 | 1525 |
1658 | HVO_2526 | 1215 | 1280 | 1170 | 1318 | 1274 | 1419 | 1405 | 2228 | 1531 |
1525 | Hbo2334 | 1188 | 1214 | 1154 | 1245 | 1186 | 1316 | 1525 | 1531 | 2285 |
325 symbols consensus ----------------LRARLPPTRRRAEARLDRLVRENRFTIAVVFPLVGAVLLLASA- #oth 11111112234354454566547315332331123.421..2.1.2..23.113.21..1 rrnAC0318 :::::::MGSGEDRTLAGWT::E:KTD:T:QF:QF:T::::::::::::::::T:::::: Hut0031 ::::::::::::::::---VVEFD:::L::::::Y:A::::A:::L::AI:::M:V:::: VNG1681 ::::::::::::::::-----MAD:A:V::::HE::AAY::E::::::V::::T:::::: Hmu2511 :::::::::::::::MDDPLAT:::E::LD:::E::L:::::::::::VT:::::T:::L NP4768A ::::::::::::::::M:SFEL:A:PHV:R:::E::D:::::::::::A:::IT::G::: hla1350 VSDPAESAATSGRLGA::::::D:::E::RL:::I::::::::::L::::::IA:VG::: HQ2861A ::::::::::MGERSQ:LDQI:RS:LDW:::::::::::::::S:F:::N:I:::::::: HVO_2526 :::::::::::VSASD::::::SS::E::DA::::::D:::::S:F:::N:::::V:::: Hbo2334 :::::::::MVEADVA:AN:::T::EEW:Y:::::::::::::S:F:::N:I:::::::: consensus -EGWLPD----PLAFNPYFILFGTLVMRLPLIAGVAPLVDRRAALALVALTAYAYAIELT #oth 132221311112.3.12312.1.14...1..32132.2311.1243234.22.212..24 rrnAC0318 :::L:::::::::::::::V::::F::::::V:::F:::::::G:::::::L:S:G:::V Hut0031 ::::F:G::::I:E::::LV::::A:::::::::::::I:::::::I:G::L:T:G::FL VNG1681 :W::::P::::A:S::::::::::V::::::V::L:::::::::V:VAV:::::FG:::L Hmu2511 RPP::::::::A:V:H:LL::L:::::::::G::L::::::::G::::S:::::::::FV NP4768A :::V::E::::::S:::::L:::VA:::::::::I:::LTK:::AG:LV:CG:T::::F: hla1350 ::::V:E::::::::::W:V:::V::::S::VV::L:AL::::VGW:GV:V::T:::::F HQ2861A ::::::E:::::::::GLL:::::I:::S::LTAAL::T:::::ASV:::::::::::YA HVO_2526 :MD:::::::::::::AFL::L::::::S:::V::L:::T:::::GVG::::::::::Y: Hbo2334 :::::SGTVLA:::::GL::::::F:::S::LV::L:HTT::G:TGVGL::L:::L::Y: consensus GVATGWPYGEFAYGVDLGPMLAG-VPLGLPVFFFPLVVNAYLLCLLLLGDRARNTALRLP #oth .141.3...5.4.313...222141.31..2..3...2.1...13....31.44453.14 rrnAC0318 ::R::::::::I:::::::::L:E::F::::::::::L:::::V:::::N::AS::V::L Hut0031 ::L::L:::D:E:VI::::::LDA::AA::I::::::L::::::::::::::AL:RI::: VNG1681 ::TA:::::::::RIE:::::::K:::::::::::::::S:::VV::::P::::RL:::A Hmu2511 :I:::::::::::::S:::::::E::::::I::V:::::S::::T:::::::T:PW:::: NP4768A ::L::Y:::H:E:::::::::::H::AA::L::L:::::::::::::::SL::RA:V:I: hla1350 :::::::::T:E:T:S:::::G:::::A:::::I:::::::::::::::P::S:GW:::A HQ2861A ::H::F:::::F:::::::II:::I::::::::V:::M::::::I::::S::EH:PT::L HVO_2526 ::T::::::W:H:::::::TV:::::V::::::I:::M::::::::::::::::G:V::G Hbo2334 ::H::F:::Q:::::A:::TVG::I::::::::V:::M::::::::::::::EH:VI::C consensus AVIATVLAMDLVLDPGAVALGFWEY-AGG-------------AFYGVPLSNYAGWVLSAT #oth 31411.232.21...1..12...51553111111111122126112..32..3..21.12 rrnAC0318 :TL:::MLV::::::::::I:::I::EMP:::::::::::::Q:::::WQ:::::L::GS Hut0031 ::::::::::::::::::G::::::::PPLTGDGAWASATAIH:::::::::L::I:::S VNG1681 ::A:::VW::V::::A::G::::R:F::::::::::::::::PY:::::::::::::::V Hmu2511 ::::::::I:::::::::::::::::G:::::::::::::::SY::::R:::E::I::G: NP4768A I:V:A:VG:::::::A:::V:::A:D::::::::::::::::LY:Q::WT:::::::::: hla1350 T:::A:V:::V::::::::::::SF:G:::::::::::::::::F::::::::::::::: HQ2861A T::I:::L::II:::::::::::V:PD:::::::::::::::I::D::V:::V::::::: HVO_2526 V:T:A:::::V::::::::::::::YRL::::::::::DDALL:::::::::::::V::: Hbo2334 T::IA:::::V::::::::::::A:TPP:::::::::::::::::::::::::::::::: consensus VAVLLLDRGFDRAGLLARLRDCEFMLDDLVSFVILWGGINAWFGNWLPVAVAALFGVGLL #oth 11.331.3212353135.1531411...1...11...32.1411.221234.34214..2 rrnAC0318 :::::F:F:::::::RR:::::P::::::::::L::::::LFYA::V::GL:::L:A::: Hut0031 ::::AF:L::E:::::D::DRTG::::::::::::::A::::Y::::A:G::G::::::: VNG1681 :S:S:::W::S:::IQ::VA:::YL::::::::::::TV:LA:::L::A:A::AL::::: Hmu2511 :::::::W:::WQT:GE:::S:A:::::M::::::::A:::V:::::::GI::VL:L::V NP4768A :S:VV:::A::WN:::::VES:R::::::::::::::VV::Y::::::ALL:VGY:Y::W hla1350 :::VT:::A:ELGA:GD:::::::::::M:::::::::::L:Y::L::A:::VA:::::V HQ2861A I:::A::F:Y::HA::Q:VNE:A:::::::::I::::::::::::YI:TVF:II:AI::: HVO_2526 :::VA:::S:::EA:::::DRT::::::::::::::::::::::::I::::::::::::: Hbo2334 :::I:::W:Y:QHI::T::SE:::::::::::::::::L:::::::::::::::::L::: consensus RTDRFD-----FPLRERWR------ #oth 411...1122145537545554442 rrnAC0318 W:::::::::::D:S:TRLGRAVWR Hut0031 A:::::::::::EV::TVPLVDLRQ VNG1681 Q:::::::::::AVLRDRGPGTRQ: Hmu2511 A::::::::::V:T:P::MGS:::: NP4768A :::::::::::::E:----:::::: hla1350 :A:::::::::AT:FTQ:::::::: HQ2861A :AE::::::::TD:LSP--:::::: HVO_2526 K:::::SRLLRL:R:LP::S::::: Hbo2334 K:E:::SRVFR:SQ:K:SGKNSSE: