9 genomes BUD0669 9 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG2613 rrnAC2102 HVO_0423 Hbo1081 Hmu0346 Hut1024 hla0154 NP0676A HQ1371A

Pairwise sequence scores
Consensus score	722	VNG2613	Hut1024	NP0676A	rrnAC2102	Hmu0346	hla0154	HQ1371A	HVO_0423	Hbo1081
397	VNG2613	721	289	347	324	327	293	299	341	333
415	Hut1024	289	704	336	356	395	279	354	346	351
479	NP0676A	347	336	774	385	450	308	371	426	396
475	rrnAC2102	324	356	385	717	471	292	346	381	406
482	Hmu0346	327	395	450	471	705	302	372	423	403
422	hla0154	293	279	308	292	302	740	375	395	434
526	HQ1371A	299	354	371	346	372	375	749	526	531
555	HVO_0423	341	346	426	381	423	395	526	744	616
580	Hbo1081	333	351	396	406	403	434	531	616	784

115 symbols
consensus       MATETADGLSGHLRGVTVTTLACLAGIAAAVVSGAVV--------AAAGSQQALLVLGAA
#oth            12312653433.61121..113322.23.1351434311113211542423431421423
VNG2613         -MA:NL:PTAA:R:SL::::I:T:G:VV::F::EVT:::::::::SDPT:RMG::::LGL
Hut1024         ::I::SHR:T::AKS::::A:STI::VI:G:S:HELF::::::::TVGQ::S::GLVI::
NP0676A         :::D::ERRIA:V::::::AI:::::V::::::A::A::::::::DG::DTLG:Y::VGG
rrnAC2102       ::::::::M:S:M::L:::::TAV::::::FG:N:LA:::::::::TPNDP:GV:::AV:
Hmu0346         :::D:VE:M:S::::L::::::A:S:L::G:AANEIA:::::::::G::DRL:VA::I::
hla0154         :SDDS--:I:::T:S:V:::ICS::::::G:I:AVY:G::TDP::VD:A:TTLV:::::F
HQ1371A         :::::GRN:::::::I::::::::::VG::IT::Q:IG::TSV:::::::::T:ILV::F
HVO_0423        :::::QT:::S:I::::::::::::::::::::::::G::TSP::E::TN:L:VGI:::L
Hbo1081         :::::QT:::D:V::::::::::::::G::LA:::::GLGTTPVSE::TN::T:A::::F

consensus       VLAQFPLLRVLG-----VDVGDFGAKDYLYVAFMTFALWFVSWGILLTTGVQL--
#oth            2331212234411111131222112..32112.1..21..12231.1.3125211
VNG2613         :IVELG:M:AF::::::::I:E:S::::F::::::::::::T::V:::A::S:::
Hut1024         AI::::I:YI:::::::::I:::ST::::::G::::S::::T:S:::::A---::
NP0676A         IIV::::::::EMAGLQL::D:::::::::I::::::M:::C:TV:::::ASV::
rrnAC2102       IA::::I:::I::::::I:TD:LST::V::IG::::S:::::::::::::A--::
Hmu0346         IVV:::I:S::::::::::ID::S:::::F::::::S::::::::::::AAL-::
hla0154         ::::Y::YKMI::::::--:::::V::N:::::L::T:::I:YTV:A:S::E:VV
HQ1371A         ::L:::V:KLA::::::I::NE:::::H:::V::::T:::ITFS::::E::T:::
HVO_0423        ::I:::V:::V:::::::::NG:::::::::V::::::::ITFA::::S::::::
Hbo1081         ::::::::::V:::::::::::::V:::I::V::::T:::I:Y:::::S::::::