| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2192 | VNG2669 | Hut0932 | NP1872A | hla2426 | HQ1604A | HVO_0915 | Hbo0625 | rrnAC1407 | Hmu1914 |
| 1078 | VNG2669 | 2295 | 744 | 768 | 883 | 908 | 891 | 869 | 869 | 902 |
| 1137 | Hut0932 | 744 | 2524 | 812 | 842 | 879 | 906 | 945 | 1002 | 972 |
| 1167 | NP1872A | 768 | 812 | 2370 | 936 | 942 | 971 | 928 | 822 | 836 |
| 1434 | hla2426 | 883 | 842 | 936 | 2389 | 1308 | 1278 | 1355 | 824 | 963 |
| 1719 | HQ1604A | 908 | 879 | 942 | 1308 | 2266 | 1651 | 1676 | 991 | 1166 |
| 1678 | HVO_0915 | 891 | 906 | 971 | 1278 | 1651 | 2248 | 1717 | 984 | 1056 |
| 1715 | Hbo0625 | 869 | 945 | 928 | 1355 | 1676 | 1717 | 2324 | 967 | 1078 |
| 1213 | rrnAC1407 | 869 | 1002 | 822 | 824 | 991 | 984 | 967 | 2482 | 1266 |
| 1357 | Hmu1914 | 902 | 972 | 836 | 963 | 1166 | 1056 | 1078 | 1266 | 2400 |
373 symbols consensus -----------------MPAALSDA-----LAWVVIAAFAAGVLLDARDD--EAARRVTA #oth 11111222223244334534424552312212.22433.343523553342345215342 VNG2669 :::::::::::::::::-MT:AT::::::::::::V::::TSA:I::AN:DH::L::YA: Hut0932 ::::::::::MIDPLVDWL:::NGYAGT:::::::LV::L:::V:ERY:E::TW:E:AYV NP1872A ::::::::::::MSLLEAI:E:HVIPYTDV:::::M:::I:::AA:Y::N:LL::::L:: hla2426 ::::::::::::MFGSGV::V:TLLPDTFTF::L:AIL::VAW:::S:GL::A:G:SLA: HQ1604A :::::::::::::::::::GV:::V:::::::::::V:::::T::RG:N:::RVG:I::V HVO_0915 :::::::::::::::::::GL:::I:::::::::::GT:V::AVANG::R:::LG:::MT Hbo0625 :::::::::::::::::::GL::::::::::::AA:IT:IL:S::VR:NE::RT::Y::: rrnAC1407 MSETVLQTGVDIAGLSFD:VTV:EP::::::M:L:L:::LGS:AVAQY:E:::L::P:GT Hmu1914 :::::MVGVAPLTSAVGD:L:VARP::::::S:LLVIS:L:TGV:A:HT:AR:R::QLG: consensus AA-WALFALFWLQLVPHFAFVHKSYVEGILSIAAVPASLYAGYLLWNGRDSLFVLSRAIA #oth 321.521231.232231141312.32124143311.111.212.233..52.21111.11 VNG2669 VGA::V:G:::GL:IE::L::QQ:LI::A:AA:::::C::TA::VAS::K::AT:T:::: Hut0932 G:::IVLSGY::TY:HY:V:AQ::IT::VGVVI:I:L:I:VA::IA:::RR:::V::::: NP1872A G:::W:::V::FV:IQ::::::R:V:QTV:ILI::::C::V:W:VFA:::::LT::::V: hla2426 GT:::::G::::TT::Y:::E:Q::::S::ALVG:::CI::::::Y:::G:::T:T:::: HQ1604A ::::GG::::::::::::::::::::::::::T:::::::T:L:::R::S::::::::V: HVO_0915 ::::V:::::::::I:::TL:::::I::L:T:::::::::::W::Y::::T:::::::V: Hbo0625 ::::T:::A:::::::YY::E::::I::F::L:::::C:::::::YS:::T:::::K:V: rrnAC1407 VG::V:::AY::V:A:::ILIQ::V:::LG:VI:::L:::T::::::::E::L::T:::G Hmu1914 LT::GV:G::::V:::::VL:Q::I::::G::::::L:::V::::::::::::T::K::G consensus AMGLIYLPFETIPAL---G------RRVLIETVAAQTGFLIDALG----------YEP-- #oth 4132312.1422334434253412112531231151253235421111111111126111 VNG2669 V:::L:I::Q::EP::::-::::::::WA:L:TTHHAAWIMGQ:::::::::::::H::: Hut0932 FAW:FF::LSSLAFV:::-::::::::P::Q::TSH:D:VLGM::DQYRLGDWYP:L:AG NP1872A F:TV:::::::SELA:::-:::::::GL:::A::F::ATV::::S::::::::::---:: hla2426 I:LF::::::::::FTLG:MAFPEP::I:::A::T:::M:::L:::::::::::::V::: HQ1604A ::::::::::::::IMAF:ISLPAP:G::M:I::::::M:VS:F:::::::::::::::: HVO_0915 :::VV:::::::::FTLL:ATVPAP:G::M:::::::R:::ES:::::::::::::T::: Hbo0625 :::V::::::::::FALF:VSIPAPKG::M::::T::H::VN:F::::::::::::H::: rrnAC1407 I::V::V::L::GP::::-:::::::QTI::V:TD:VV::MTLI::::::::::::D::: Hmu1914 Y:::L::::TYL:L:ESNPL:::::::WM::V::S:::T:LSLI:::::::::::V:::: consensus -ELIDG------------DQGYLNTFLF------MDGGHPITITVVLACTGIGSMSIFAG #oth 145432123344434243652152214211111264452544431321...2.111.22. VNG2669 :AIEVA::::::::::TSYH::PAK:A:HGTSVVTGEPWGFPT::L:::::::::::VG: Hut0932 L::P::SALSGQADLPEKHFP:R::::Y::::::SP::::::Y:IR:::::::::A::V: NP1872A :-:A:::::MEYMQDPDEGSTLM:::W:::::::PET:R--ASR::FE:::::A::::G: hla2426 ::RVAS::::::::::::SE::NAAY:W:::::TL:D::TYR:DI::::::L:::A::G: HQ1604A :AM:V:::::::::::::N:::::::Q:::::::F::N:EL:VS:::::::L::I::::: HVO_0915 :QM:V::::::::::::::::::::::W:::::::Q:S:RLE:S:::::::L::IA:::: Hbo0625 ::F:A::::::::::::::::::::::::::::::::D:RL::S:::::::L:::A::G: rrnAC1407 :MVV:::LSHNGIDIASKQYP:E:::W:::::::DGNER:::Y:II::::::::I::::: Hmu1914 :::VR:::TSVLSEVPSS:Y:::S::Y:::::::PGNER:::Y:IIV::::V::I::L:: consensus LIAAVEAPLRRKLRALAVAVPIIYVLNLLRNTFIAIAFGNQYF--QWFVGEILALFGSSD #oth 212..41121112222221122.121.13.221.2445.4.33223432341341.2321 VNG2669 :V:::D::M::R::::G::I:L::GM::V:VV:::::H:::W:GGDVIE:VVF:::PTDN Hut0932 ::G::RGS::Q:AK:MG::IGV:::::IV::V:::HTL:::RL::HI:PEL:MS::SA:: NP1872A :::::N::::::AVGI:LSIS::W:::IG::V:::L:N:Y:W:AYS:LE:P:M::::LT: hla2426 :V::::::::::::G:::S:SL:::::I::T:::SVVA::::M::::YPDLV::M::A:: HQ1604A :::::::::::::K:M::::::::G::I::T:::T::::K::M::::::Q:::F:::::: HVO_0915 :::::D::MG::::G::I::::::A:::::T:::::SV:K:::::HL::D:V:F:::::: Hbo0625 ::::::::::::F::::I:I::::A:::::T:::T:T::K::::::F::D:::LM::::: rrnAC1407 G:L::K::W:::::V:V:::G:::::::I::LG::L:::L:KA:::F:P:TVM::::L:: Hmu1914 A:L::::::G::A:::::S::V::G:::V::V:::TM::Q:RM:::::::T:TG:::TT: consensus PYMVSFFISDRILAQFLAVVALVGITWLVVREVPELLTIIEDVLYLVTGDEYDLREALDL #oth 232..1223..321.311.31.22213323231.12342311212321.41221464255 VNG2669 :NR::YLFA::V:::S:S::V::VL:LALL:I::::GGV::::AFVL::N:::ITGRFAG Hut0932 ::L::YY:G:::::::GS:F::IA:::::L:W::DV::VV:EG::VI::T::::TD:::V NP1872A :AR::::VA::V:::L::::::A:LA:FIA:W:::::D:A:EL:SI:-:IDVE:HHP-SV hla2426 ::R:::L:::::MS:L::::::I:::F:::::L:::VV:L::::::L::E:H::T:::E: HQ1604A ::::::::::::IS:L::::V:::::Y:::::L:::::V::::::MI:::::N:ARE:GF HVO_0915 ::::::::::::IS:A::::::::V:Y:::H:::::::V::::::M:::::::::NE:G: Hbo0625 ::::::::::::IS:::::L::::::Y::::::::::::::::::M:::::::::::::: rrnAC1407 AQL::YY:V::M::::GS:IV:::L::VLM::L:::TV:V::L:F::::T::::GTTFEK Hmu1914 EQ:::YY:A::L::::GS::::::::::::KVL::I:SLVD::A:::::T::::::E:TA consensus DRE---------- #oth 3455443232111 VNG2669 ::-:::::::::: Hut0932 ESTEN:::::::: NP1872A ::TDTDPAD:::: hla2426 P::PTNR:::::: HQ1604A Q::SV:::::::: HVO_0915 :--:::::::::: Hbo0625 ETPKSRGGSA::: rrnAC1407 :QSESGPATPGDD Hmu1914 E:D::::::::::