9 genomes BUD0744 9 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG1777 rrnAC1713 HVO_2314 Hbo2002 Hmu2320 Hut0482 hla1251 NP4554A HQ3333A

Pairwise sequence scores
Consensus score	1015	VNG1777	HQ3333A	HVO_2314	hla1251	Hbo2002	NP4554A	Hut0482	rrnAC1713	Hmu2320
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639	NP4554A	514	472	517	474	496	1010	576	623	633
630	Hut0482	445	432	489	441	503	576	1010	564	606
702	rrnAC1713	474	486	506	487	531	623	564	1036	741
754	Hmu2320	532	559	578	589	570	633	606	741	1027

142 symbols
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VNG1777         ::::::ANA::::D:V:::Q:::VT:A::VI::TY:N::ESKL:Q::LDA:Q:V:D:VAD
HQ3333A         :::TDS::K:::Q::M::I:::::D:V:TV:::::T:E:::::Q::::S:N:CL:S:I::
HVO_2314        ::::::I:E:::Q::L::::::::::V::::::::TSR:::::Q::::::ND::::::::
hla1251         ::::::::A:::T:::::::::::::A:C::::T:G:Q::::::::::A:N::::D::::
Hbo2002         ::::::::::::K::L::::::::::V:::I::::S:Q::::::::::::N::::D::E:
NP4554A         :::DSA:E::::K:::::::::::::::V::D:::TN::EPTL:QA:LDV:N:::AA::I
Hut0482         ::-MDAMG:::SEQ::::::::E:::R:L::R::VAN:QEP:LNR::I:::D::::::ET
rrnAC1713       MSEADAL:::::::::Q:::::E:Q::::V:::EY::SDEI::MQA:I:V::F:::G::L
Hmu2320         :MGA::L:E:::::::::::::E:::::T::::::::QD:I::M:T:L:A:N:::::::H

consensus       G--DTYVYSGNDDPDFASNQHQGLTLDDEEFVWECQQLLRDGTFDLVFYYEASADQDAIL
#oth            213122121.2.242.23..1..1221112........2.3.2122.1.1.143123113
VNG1777         :::::::::::::S::GV:::::RI:::DA::::::::::::A:AV:L:W::TD:HA:::
HQ3333A         :::E::I:A:::SSE:::::F::::I:::S::::::::::K:::::::::::GPT:A::A
HVO_2314        ::::AWIHA::::T::S:::F:::SVE:D:::::::::V:::::::::::::I::::::V
hla1251         :::ES:IEA::::TN:S:::F::::::::A::::::::::::::::::::::NV::E:LA
Hbo2002         :::E::I:A:::T:::::::F:::::::DA::::::::::N:::::::::::NV::::LT
NP4554A         EPT::::::::::EE:GI:::::::::GD:::::::::::E::YKV::::::::::T::V
Hut0482         D:A:::::::T:::E:GL:::::R:IEG::::::::::M::::::V:::::DT::T::::
rrnAC1713       DPT::F::::S:::E:::::::::::::::::::::::::N:S::::::::::::H:G::
Hmu2320         DPK::::::::::A::S::::::::I:G::::::::::::::S::I::::::::::A:::

consensus       DDLEALGYVDRVVEVP------
#oth            2222552444432523111111
VNG1777         :GIRDCDG:TS::A:TEDGFEA
HQ3333A         ::::SIEHIKN:TT::::::::
HVO_2314        EG::::DG::::TP::::::::
hla1251         :::AE:DN::::TQ::::::::
Hbo2002         A::::VEHI:::RP::::::::
NP4554A         EGV:G::FEATS:RGE::::::
Hut0482         A::R:K::DVED::S:::::::
rrnAC1713       EAV:NA::AVTG::GE::::::
Hmu2320         :::RDA::EVTG::G-::::::