|
Pairwise sequence scores | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2648 | NP3238A | NP7062A | rrnAC1468 | Hut1481 | rrnAC2382 | Hmu0216 | HVO_0385 | Hmu0192 | hla1618 | NP2370A | rrnAC0581 | Hmu2164 | HVO_0258 | Hbo1240 | VNG0989 | HVO_1422 | Hmu2901 | rrnAC2284 | Hmu0499 | NP5368A | rrnAC1836 | HVO_1839 | Hut0797 |
1366 | NP3238A | 2760 | 2760 | 918 | 833 | 850 | 791 | 864 | 875 | 838 | 1096 | 1092 | 1046 | 1226 | 1213 | 898 | 903 | 832 | 849 | 983 | 901 | 729 | 377 | 850 |
1366 | NP7062A | 2760 | 2760 | 918 | 833 | 850 | 791 | 864 | 875 | 838 | 1096 | 1092 | 1046 | 1226 | 1213 | 898 | 903 | 832 | 849 | 983 | 901 | 729 | 377 | 850 |
1355 | rrnAC1468 | 918 | 918 | 2623 | 1065 | 1012 | 1026 | 1065 | 1048 | 1028 | 813 | 852 | 833 | 922 | 942 | 1134 | 1019 | 971 | 949 | 1028 | 1063 | 905 | 487 | 1209 |
1691 | Hut1481 | 833 | 833 | 1065 | 2765 | 2171 | 2129 | 1808 | 1799 | 952 | 852 | 964 | 886 | 886 | 920 | 1028 | 1000 | 1043 | 1006 | 1004 | 1034 | 866 | 481 | 1075 |
1661 | rrnAC2382 | 850 | 850 | 1012 | 2171 | 2669 | 2430 | 1740 | 1761 | 918 | 884 | 918 | 877 | 914 | 912 | 980 | 1000 | 937 | 945 | 986 | 1028 | 875 | 476 | 1017 |
1630 | Hmu0216 | 791 | 791 | 1026 | 2129 | 2430 | 2680 | 1716 | 1722 | 920 | 883 | 893 | 839 | 880 | 882 | 982 | 981 | 928 | 946 | 976 | 1011 | 848 | 459 | 1014 |
1698 | HVO_0385 | 864 | 864 | 1065 | 1808 | 1740 | 1716 | 2627 | 1805 | 970 | 895 | 891 | 809 | 926 | 937 | 1019 | 1060 | 1040 | 1072 | 1011 | 1098 | 949 | 428 | 1066 |
1704 | Hmu0192 | 875 | 875 | 1048 | 1799 | 1761 | 1722 | 1805 | 2679 | 922 | 875 | 947 | 887 | 922 | 981 | 1019 | 1074 | 1041 | 1052 | 1009 | 1056 | 1024 | 472 | 1160 |
1210 | hla1618 | 838 | 838 | 1028 | 952 | 918 | 920 | 970 | 922 | 2610 | 800 | 880 | 866 | 866 | 880 | 1031 | 898 | 853 | 839 | 887 | 887 | 844 | 501 | 1072 |
1257 | NP2370A | 1096 | 1096 | 813 | 852 | 884 | 883 | 895 | 875 | 800 | 2852 | 1246 | 1185 | 1184 | 1136 | 858 | 895 | 840 | 869 | 930 | 857 | 720 | 433 | 824 |
1372 | rrnAC0581 | 1092 | 1092 | 852 | 964 | 918 | 893 | 891 | 947 | 880 | 1246 | 2707 | 2107 | 1374 | 1424 | 1004 | 970 | 893 | 904 | 895 | 897 | 845 | 509 | 1038 |
1289 | Hmu2164 | 1046 | 1046 | 833 | 886 | 877 | 839 | 809 | 887 | 866 | 1185 | 2107 | 2627 | 1398 | 1395 | 909 | 861 | 857 | 823 | 821 | 855 | 787 | 455 | 948 |
1378 | HVO_0258 | 1226 | 1226 | 922 | 886 | 914 | 880 | 926 | 922 | 866 | 1184 | 1374 | 1398 | 2703 | 2119 | 952 | 955 | 942 | 900 | 906 | 892 | 818 | 448 | 985 |
1372 | Hbo1240 | 1213 | 1213 | 942 | 920 | 912 | 882 | 937 | 981 | 880 | 1136 | 1424 | 1395 | 2119 | 2700 | 949 | 941 | 907 | 905 | 830 | 887 | 766 | 432 | 980 |
1475 | VNG0989 | 898 | 898 | 1134 | 1028 | 980 | 982 | 1019 | 1019 | 1031 | 858 | 1004 | 909 | 952 | 949 | 2697 | 1139 | 1109 | 1102 | 1119 | 1168 | 1042 | 541 | 1310 |
1437 | HVO_1422 | 903 | 903 | 1019 | 1000 | 1000 | 981 | 1060 | 1074 | 898 | 895 | 970 | 861 | 955 | 941 | 1139 | 2726 | 1508 | 1577 | 1498 | 1560 | 1027 | 519 | 1139 |
1504 | Hmu2901 | 832 | 832 | 971 | 1043 | 937 | 928 | 1040 | 1041 | 853 | 840 | 893 | 857 | 942 | 907 | 1109 | 1508 | 2761 | 1610 | 1587 | 1594 | 1002 | 539 | 1166 |
1488 | rrnAC2284 | 849 | 849 | 949 | 1006 | 945 | 946 | 1072 | 1052 | 839 | 869 | 904 | 823 | 900 | 905 | 1102 | 1577 | 1610 | 2581 | 1613 | 1616 | 1043 | 545 | 1194 |
1510 | Hmu0499 | 983 | 983 | 1028 | 1004 | 986 | 976 | 1011 | 1009 | 887 | 930 | 895 | 821 | 906 | 830 | 1119 | 1498 | 1587 | 1613 | 2793 | 1880 | 946 | 489 | 1170 |
1519 | NP5368A | 901 | 901 | 1063 | 1034 | 1028 | 1011 | 1098 | 1056 | 887 | 857 | 897 | 855 | 892 | 887 | 1168 | 1560 | 1594 | 1616 | 1880 | 2738 | 1113 | 577 | 1239 |
1268 | rrnAC1836 | 729 | 729 | 905 | 866 | 875 | 848 | 949 | 1024 | 844 | 720 | 845 | 787 | 818 | 766 | 1042 | 1027 | 1002 | 1043 | 946 | 1113 | 2615 | 577 | 1200 |
661 | HVO_1839 | 377 | 377 | 487 | 481 | 476 | 459 | 428 | 472 | 501 | 433 | 509 | 455 | 448 | 432 | 541 | 519 | 539 | 545 | 489 | 577 | 577 | 1061 | 750 |
1517 | Hut0797 | 850 | 850 | 1209 | 1075 | 1017 | 1014 | 1066 | 1160 | 1072 | 824 | 1038 | 948 | 985 | 980 | 1310 | 1139 | 1166 | 1194 | 1170 | 1239 | 1200 | 750 | 2632 |
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::::::::::::MNGPSE:K:R:::R:::DR:GTE:S::S:KTY::::KLW:::::DQN: Hbo1240 ::::::::::::MKTPSD:T:R:::R:::DR:STE:S::SV:TY::::KLW:::::D:N: VNG0989 :::::::::::MTT::K:ID:Q::K:W::EN:RGE::DA:YKA:K:::SP:::::DT::D HVO_1422 ::::::::::::M:E::S:E:AR::RM::EA:Q:E::DW:LKS:K::::::::::::S:: Hmu2901 ::::::::::MPDP::::I::V::::M:HDAMV:E:::::RKSNKH:::::IQF:D::E: rrnAC2284 ::::::::::::--------------M::KA:Q:E:T::::QSQE:::E::EQF:R:::: Hmu0499 :::::::::::V:D:::::::S:::DL:IEA:-::AT:Q:LQGQY:::Q::IQ::D:::: NP5368A :::::::::::M:D::::IA:A::::M:IEA:Q::CT:N::EGQY:::Q::LA::D::D: rrnAC1836 ::::::MKANTNPT::QAIT:V::LRL::ESKV:EW:TA:KELQQFH:NE::::LA::D: HVO_1839 ::::::::::::-----------------------------------------------: Hut0797 :::::::::::M:KE:::IR:V::K:M:::E:GT:ASDA::EA:D:::GH:IR:::V:E: consensus IENLNDLSGRDLADYRAWRRGD------------IAPVTLQGQLSTLRAFLRFCADIEAV #oth 357355264556682686265732223321114445872386438444954634474553 NP3238A ::QVSE:EKI:FEL:QDD:AAE:::::::::::::E:TS:EN:MGL:KR:VK::E::G:L NP7062A ::QVSE:EKI:FEL:QDD:AAE:::::::::::::E:TS:EN:MGL:KR:VK::E::G:L rrnAC1468 :::::E:::::CEN:KN::IAQG::::::::::DV:DI::EQ::R:F:V:::Y:ES:::I Hut1481 :::::T:T::::::FV::::::::::::::::::VKAL:::K::::I:TA:::W::V::: rrnAC2382 :::::N:T::::::FV::::::::::::::::::::AL:::K::::I:EA::YW::::G: Hmu0216 :::::H:T::::::FV::::S:::::::::::::::AL:::K::::I:EA::YW::::G: HVO_0385 ::::::::::::::FV:::::::::::::::::::::I:::K::::V::A:G:W::::G: Hmu0192 ::D::T:::::M::FV:::::::::::::::::::::I:::K::::I:QAC:WW:::D:: hla1618 LDYV:E:D:FHIS:FKIH::DED::::::::::G:NK:::YN:MTV::V:::W:ESRSL: NP2370A L:TVS:IQPL:IDE:HDI:AEA::::::::::::V:::::E:EMA::QEY::YLEGLD:: rrnAC0581 :TAMRE:T:WK:DE:ETF:::SD:::::::::::VS:A::N:EMQ::KNW:EYL:R:DV: Hmu2164 ::AMS::T:WT:DE:ETH:::QD:::::::::::L:AS::N:EMQ::KNW:EYL:R:GV: HVO_0258 ::RVS::N:WTFEQFE:F:A:QG:::::::::::::SP::H:EME::LG:IEYLER:::: Hbo1240 ::RVE::T:WTFEQFE:F:S:QG:::::::::::::SP::H:EME::KGHIEYLER:::: VNG0989 VS:M::::::HFHQ:KK:::ENG::::::::::DCNK::MAT:::::KV:ID::ES:D:: HVO_1422 VDD:TE:D::::YEF:V:::EGNFGVEDGETPEE::::::KS::T::::::::A:N:H:: Hmu2901 :::::::T::::YK::I:::EGN::GDGR:::EP:KK:::K:::A:::S::K:AGE:DS: rrnAC2284 ::::::::::::YA::V:::EGN::GKGR:::DE:E:I::R:::A:V:S::::A:EVD:: Hmu0499 :A:::E::::::YA::V:::EGGYS:DEG:::KELKT:::R:DMG:::::::::G::::: NP5368A :T:::E:D::::YA::V:::EGGYS:D:::::TEL:GA::R:D:A:::::::::GEV::: rrnAC1836 :DDMRNI:A:TVHRF:LKIK::::::::::::::::QS::AQRV:SV:R::Q::TT:D:: HVO_1839 ----------------------::::::::::::-------------------------- Hut0797 ::::::::::A:HQ:KL::QD:G::::::::::DLNQ:SVKT:MD:::V:I:::ES:D:: consensus EDGLAEKVHVPELPDGEESRDVMLDPERAEAILDYLRRY--Q-YASRDHVILELLWHTGA #oth 84547473771956976843456475362:843565698359143358146643636226 NP3238A PE:FH:S::::RATVE:Q:::EK:ST:D:TEL:LFF:DKSNDLFG:KW:A:::VI::::: NP7062A PE:FH:S::::RATVE:Q:::EK:ST:D:TEL:LFF:DKSNDLFG:KW:A:::VI::::: rrnAC1468 :T:IS::LI::KVSK::AV::DAITH:E:C::REH::K:::E:::TKE:::FS::Y:::M Hut1481 QE:::::L:A::::::A:::::A::AD::AD::E:::EL::H::::::::VM:I::R:AM rrnAC2382 D::::::::A::::::A:::E:H:SAD::HQ:::F:HD:::R::::::::VFLI::K:AM Hmu0216 D::::::::A::::::A:::::HIGAD::HR:::::HE:::R::::::::VFLI::K:AM HVO_0385 ::::R:R::A::::::A:A:::H:SAD:::S:::::D::::::::::E:::MA:::R::M Hmu0192 :E:::::I:A::::::A:::::H::::::::A:E:FEQ:::::::::::ALIA:I:R::M hla1618 ::-:::NILM:V--PEDD:::T:I:S:TSAQ::Q::QK:::E::GTLK:TVFS:::D::F NP2370A A:D:S:A::::N:DASQR:N::K:STPE:M:M:Q:F:ETPAV:R:::K::F:::V:F::: rrnAC0581 DED:P::::::TI::::::N:E::E::A:KKL:RAM:SDPTH::GTVK:AL:::::F::C Hmu2164 D:::P::::::SI::::G:N:E::::DD:A:LIRSF:ETPER::GTAK:AV:::::F::C HVO_0258 ::::SK:::::SV:MS:R:::T::V:DD:LRL:R:Y:SHSSV:RGT:F:AV:::A::::: Hbo1240 D::::D:::::DV::S:M:::T::R::D::DLIR:Y:THDNV::GT:F:AA:::AF:::: VNG0989 RP::SDYIDP:TMKNK:DVN:DYV:A:T:Q::I::Q:NF::N::SQ:E:::F:::::::M HVO_1422 PEDFY:R:PL:K:SGTDDVS:ST:E:D::TD::E::H::::H:::::R::EFA:::E::: Hmu2901 KPD:Y:QLSL:AMKG::DVSEST::::::LD::E::EKS::::PG::::I:IA:::E::G rrnAC2284 PED:RT::PL:TISNAG:VSAST::::::DV:::::QM:::K:::::V:::AL::::::: Hmu0499 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