|
Pairwise sequence scores | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2101 | Hut1681 | rrnAC3221 | Hmu2238 | Hut1684 | rrnAC3231 | Hmu2237 | NP2166A | VNG0964 | Hut1634 | rrnAC2209 | Hmu0402 | hla1006 | HVO_1221 | Hbo0337 |
1130 | Hut1681 | 2127 | 1252 | 1236 | 800 | 834 | 838 | 858 | 779 | 818 | 835 | 844 | 788 | 841 | 845 |
1047 | rrnAC3221 | 1252 | 2156 | 1412 | 779 | 793 | 816 | 845 | 722 | 772 | 805 | 849 | 768 | 804 | 791 |
1067 | Hmu2238 | 1236 | 1412 | 2184 | 831 | 827 | 840 | 851 | 808 | 792 | 801 | 846 | 760 | 811 | 825 |
1336 | Hut1684 | 800 | 779 | 831 | 2142 | 1277 | 1287 | 1039 | 964 | 918 | 979 | 984 | 985 | 997 | 978 |
1267 | rrnAC3231 | 834 | 793 | 827 | 1277 | 2088 | 1677 | 1006 | 945 | 922 | 903 | 937 | 917 | 940 | 960 |
1402 | Hmu2237 | 838 | 816 | 840 | 1287 | 1677 | 2081 | 1041 | 988 | 1004 | 976 | 1066 | 1054 | 1006 | 1028 |
1417 | NP2166A | 858 | 845 | 851 | 1039 | 1006 | 1041 | 2099 | 1124 | 1130 | 1177 | 1138 | 1180 | 1083 | 1117 |
1326 | VNG0964 | 779 | 722 | 808 | 964 | 945 | 988 | 1124 | 2083 | 1034 | 1022 | 1100 | 1169 | 1046 | 1091 |
1351 | Hut1634 | 818 | 772 | 792 | 918 | 922 | 1004 | 1130 | 1034 | 2066 | 1228 | 1321 | 1033 | 1133 | 1064 |
1396 | rrnAC2209 | 835 | 805 | 801 | 979 | 903 | 976 | 1177 | 1022 | 1228 | 2116 | 1425 | 1110 | 1022 | 1010 |
1443 | Hmu0402 | 844 | 849 | 846 | 984 | 937 | 1066 | 1138 | 1100 | 1321 | 1425 | 2078 | 1114 | 1136 | 1154 |
1435 | hla1006 | 788 | 768 | 760 | 985 | 917 | 1054 | 1180 | 1169 | 1033 | 1110 | 1114 | 2143 | 1150 | 1134 |
1440 | HVO_1221 | 841 | 804 | 811 | 997 | 940 | 1006 | 1083 | 1046 | 1133 | 1022 | 1136 | 1150 | 2131 | 1534 |
1423 | Hbo0337 | 845 | 791 | 825 | 978 | 960 | 1028 | 1117 | 1091 | 1064 | 1010 | 1154 | 1134 | 1534 | 2172 |
302 symbols consensus -----MSDGERKLADTRGRFLQVVRDGRKLNDADWTSGRILLSNKRLVLAGNDGKRTIPL #oth 111221164.4125.56.31621354.3647.35.562.222123.22.34333125331 Hut1681 :::::::EE:::IL:IA:DYR::R:::QPVE:P::Q:A::V:TDR:::::::GSN::::H rrnAC3221 :::::::GD::::V::S:D:QY:::::DTVT:PK:R:C:LIVT::::I::T:GS:QP::H Hmu2238 VTSEE::SE:Q::V::A:DYMYA:KG:TPVD:PQ:R:C:LVMTD::::::NSS::QAL:H Hut1684 :::::::E:::::M:D::QY::AAT:::DIQ:::::QC::V:TT::I::IA-:E:QV::: rrnAC3231 ::::::::T:K:I:::K:Q:::A:SQ:QR:T::E:RNC::V:TTE:VA:L:-:D::Q:S: Hmu2237 ::::::::T:K:I:::::Q:M:A:QE::E::::S::AC::V:TTQ::::IS-::::Q:S: NP2166A :::::::KS::::L::T:::T::::::T::::IS::D:::::::R::::::T:::Q::K: VNG0964 :::::::ES:Y:I::GS:K:::A:K:::RMK::Q:SK:::::::::I::::SE:::NL:: Hut1634 :::::::E:::::::S::K:V:::EN::::::VE:LP:::::::::::::S:E::K:VS: rrnAC2209 ::::::::::HA:V::K:K:V:::S::::R::IE:LP:::::::::::::T::::::::: Hmu0402 ::::::::::Q::::AK:K:V:::K::::R::I::RA:::I::::::::VS:E::::::: hla1006 :::MSD::::Y:VT::Q:::AVA::E:::VS:VS::P::V::::R::I:::::::::::: HVO_1221 ::::::KP::Q::G::::::::::KN::EMH:V:::::::::::R::I:::TG:::::Q: Hbo0337 ::::::KA::K:V:::N::::::K:G::N::::N:AN:::::::Q::::::TG::::F:: consensus SKIDSIGGRHDVNQAIAGVSNYVSLQV--GEDVVLVSAADHEE-FETDLYRALLDQTVVL #oth 45259466353525853634424545621355.5233364:451.25444316.454633 Hut1681 GRVTIP----:DLDGAENAAETLV::M:::ST:IE::P:GETD::QDAY:::N:AGE::: rrnAC3221 :S:TLPSNPD:LIPD-G:TGGATA:E::::NN:L::DTPNLDD::Q:EYV::T:QGE:I: Hmu2238 :N:EVV:E--EELP:SVDPAGATPMRI:::DN:::FD:::VSD:::LEYC::T:HA::I: Hut1684 TDV:DV:::F::::NA:::A:::T:HI::DD::M:LR:PEQ:A:::::::::F::N:LIY rrnAC3231 TD::R:AD:F::::QS::::D::A:Y:::::::I::::S::GT:::::F:::S::GAI:: Hmu2237 QS::R:AD:::::::S:::::::A:HM:::::::::::GE::A:::::::::S:NGEII: NP2166A TNV:K:E::Y:::RT::Q:TD:::IR::::T::F:::TKES:S:::RT:HKTI::GEI:: VNG0964 :EVQGLS:::::::TV:K:G::::IRMT:N:S:M:::LG:NT:T::SK::G::::::ELQ Hut1634 AE:R:VKT:KN::E:::N::G:::V:T:::R::L:L:PS:VD:::ASEI:S:R:::Q::: rrnAC2209 ::VS:VTAS-QM::PL:Q:DS:IKV:A:::RN:T:I::KKAD:::QEK::ST:::::::: Hmu0402 :::T::T::DN::K:::K::G:L:::::::SN:T:IAPQ:I:G:::SK::S::::::::: hla1006 ::LRGL:::::A::SV:R::::::FDL:::DQ:LI:A:S:::A:::R:V:::::::RT:T HVO_1221 :::QEF:::Y::::R::T::D:F:VHI::PSG:::LAPV:YD::::::FFG:::NTEQF: Hbo0337 :S:EQL:::F::::R::T::D:LA:HYND:::::::AP::F:::::LE::G:::NS:RF: consensus VKHPAVEGGVVQ-DTEWEKARLKVDEDAVSLAIADGQFVEIELDDVGTVETGERTVMGEE #oth 3311.23...1124461433142333363742543.65274543.113347754418345 Hut1681 :N::::V:::::E:AA::::KFSTT::GF::TFPG:DR:RCDFA::::::::S:S::::T rrnAC3221 ARQQ::V:::::E:A::S:::FQL:D:IIR:QFPG:KSMSF:IE::::I:::TS::::Q: Hmu2238 T:::::V:::I:DEAT:R:T:FQL:D:VIT::FPG:EETTFAV::::::::S:QA::::T Hut1684 :Q::::K::::::G:::QR:KV:LTDE:IK::V::::Y:T:GR::I:D:::D::::D:A: rrnAC3231 :Q:::LK::::::SA::T:G::::TDE:LK::M::::A:V:DRA:I:DLAVE:KQ:S::: Hmu2237 :Q:::::::::::::::T:G:M::TDE:LQ::L::::A::V:RA:I:GLTIEDK::S::: NP2166A I::::I::::::::VS:R:::I:::::::N::VE::S::Q::I:::::::RN::Q:KSK: VNG0964 :::::::::::T::EQF:R::I::::SEL:V:MSN:S::SV::::::SA:AASLE:N:DT Hut1634 A:::::K:::::::AP:::::I::G:ES:E:::SS::::::::S::::IDET::::LEKQ rrnAC2209 :N::::K:::::::GG:::G:::L:G:CIN::::S:T:::LDI:::::::AK:K:IR:D: Hmu0402 :::::::::::::::::::G:::I:G:S:D::::S:S:::L:V::::SA:LKTK::T:KQ hla1006 A::::I:::::::E::::Q::V:I::NGLNA:LES:A::KFD:::ISGLDAAK:::N::K HVO_1221 AR::::A::::::N:::::S::::ETE:::M:TVG:K::::R:::I:D:K:::::IVD:H Hbo0337 :R:::::::::::N::::G:::::E:::::I:TVN:S::NVQ:::I:DI:M:R:::RD:S consensus RPVIEVEHTDD-GTSVETHISGEERHVSVLESLLEEGEERN-EADLELSETEKQVLMALY #oth 1424221.233422.22.13216766534255524544274156331.258162121..1 Hut1681 :::V:I:::::DDR:::::L::T:::T:::RE:F::RVAER:DE:Y::T:::S::::::: rrnAC3221 :E::::::::NQDR::::::::MDH:TRA:KT:FTRVI:DR::D:Y::::M:S::::::: Hmu2238 :TIL::::::EDDR::::YF::MDH:TTA:Q::F:RVI:ER::G:Y::D:I:S::::::: Hut1684 :RIF::::::SEDR::::::T::GQQITI::AI::::V::::R:N:D::P::Q:IV:::H rrnAC3231 :T::Q:::SEE:DI:::::LA:::F:AT::RTM:::SA:Q::Q:::D::S:::R:I:::H Hmu2237 :T::::::::E::I:::::LA:::F:AT::QVM:::SA::::Q:::D::S::RR:I:::H NP2166A :::L:A:::E::E:::::YL::NRK:C::V::V:KR:A:Q::ASSID::KD:EE:::::: VNG0964 K::LK::::VNRD:::Q:YFATDSHTA:I:::::TKEA:KS:QGSV:::::::R:::::: Hut1634 :S:L::::AI::::::K:YL::SASDC:I:A:::RS:DQHV::S:::::DA:RE:::::: rrnAC2209 ::LL:::::IE:::::::::T:TP::::LI:G:VRQ::Q::IAD:VD::DK:T::::::: Hmu0402 :R:A:I:::VE::::::::V::SKSD::::A:FVRR::QAG::V:V:::KE:NE:::::: hla1006 K:::::S::::E:::I::::A:DPNRMRFV:AW:QK::::S:STNVD::SRDRE:::::: HVO_1221 :S::::::S::E:::LQ:Y:::SD:A::F:YT::R::::LS::TSI:::::D::::T::: Hbo0337 :E::::::S::E:::LQ:YV::P::P:NI:K::FQI:::QS::TA::::QQD:::::::: consensus SGVSPFEIPDFVGMDVDEVEEIFDRLIDLDVVEEVRTRREVQLNARGRNIASEAMNEQ-- #oth 1.1.1.3214.11442443.23142.315322453.4.2..61332..32.215242211 Hut1681 :::::::MS::::LS:::::::YQK:L:VGA:DK::::T::S:::Q:::M:::::S:::: rrnAC3221 :::::::MS::::TTP::::::YQK:L:VGA:D:::V:T::A:::Q:::M:::::S:K:: Hmu2238 :::::::MS::::IP:::::::YRK:L:VGA:D:::::T::S:::Q:::M:::::::::: Hut1684 T:::::D:::::DE::R:I::::::::E:::I:TI:E:T::EMTS:::QV:::E:GS::: rrnAC3231 ::::::D::N:::I::EKT::::::::E:::ISVL:E:T::N:TTK::RV:G:R:G:::: Hmu2237 ::::::D::S:::I:IEQS::::::::E:::ISV::E:T::::TTK::RV:G:NIS:::: NP2166A :::::::V:E:LD::P:A::::YE:::::::LQ:::I::::A:KP::::::::S::S::: VNG0964 ::::S::::::L::::::::S::E:::EV::L::::K::::TMKT:::::::::I::E:: Hut1634 :::::::::::::L:IA:::D:::Q:AEQG::KQK::::::G:KP:::S::::VIAD::: rrnAC2209 ::I:::K::E::D:EIE:::DVY:::MES:IL:P:::::::::E::::S:::D::AD::: Hmu0402 T:::::Q:::::::EIGQ::::Y::::EYGIL:P:::::::::E::::S::G::VDD::: hla1006 :::::::::S:L::E::G:::T:E:::::E::::::V::::A::S::::::::::::::: HVO_1221 ::::::D::N:L:L:::::::L:Q::::HN::::I:V:H:::::::::S:::D:I::::: Hbo0337 ::::::D::A:L:I:::::::L:V::::HN:LD:::I:H::E::::::S::AD:IDD:GA consensus -- #oth 11 Hut1681 :: rrnAC3221 :: Hmu2238 :: Hut1684 :: rrnAC3231 :: Hmu2237 :: NP2166A :: VNG0964 :: Hut1634 :: rrnAC2209 :: Hmu0402 :: hla1006 :: HVO_1221 :: Hbo0337 NM