| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2777 | pNG7323 | VNG1847 | hla1259 | HVO_2616 | Hbo2229 | NP3178A | Hmu2343 | rrnAC3436 | Hut0654 |
| 1306 | pNG7323 | 3043 | 923 | 967 | 1013 | 999 | 1049 | 1080 | 1156 | 1122 |
| 1788 | VNG1847 | 923 | 3000 | 1406 | 1345 | 1324 | 1482 | 1460 | 1510 | 1519 |
| 1857 | hla1259 | 967 | 1406 | 2902 | 1557 | 1501 | 1592 | 1564 | 1603 | 1587 |
| 1931 | HVO_2616 | 1013 | 1345 | 1557 | 2936 | 1782 | 1543 | 1519 | 1565 | 1596 |
| 1841 | Hbo2229 | 999 | 1324 | 1501 | 1782 | 2939 | 1521 | 1505 | 1561 | 1481 |
| 1935 | NP3178A | 1049 | 1482 | 1592 | 1543 | 1521 | 2870 | 1597 | 1679 | 1646 |
| 2051 | Hmu2343 | 1080 | 1460 | 1564 | 1519 | 1505 | 1597 | 2847 | 1879 | 1780 |
| 2150 | rrnAC3436 | 1156 | 1510 | 1603 | 1565 | 1561 | 1679 | 1879 | 2924 | 1942 |
| 2092 | Hut0654 | 1122 | 1519 | 1587 | 1596 | 1481 | 1646 | 1780 | 1942 | 2797 |
457 symbols consensus ----MDRERD---------WLG-------------ARATILLTFLVAVLSVATGIANISA #oth 122334851433123221222221222222212224134441264114.1222.242235 pNG7323 MLMANVP:DSSDRTLEDVFYPADRVPFVEWDELSG:KP:VV::GT::L:AFV::LS:L:Q VNG1847 MCCGVATA:RRRRAY::::YV:RRRSRMDGAERVPG:LAVA::LV:::::::::VVG:ID hla1259 :::::ELT::::::::::::VT:::::::::::::V::S:::::A::I::ILA:L:Q:GG HVO_2616 :::::ASV:E::::::::::V:::::::::::::::::::GTV:VA::::::I::L:::S Hbo2229 :::::VI::E::::::::::V:::::::::::::::::SMV:::::GA::::::::::T- NP3178A ::MTDTG:::GSRAVRSVR::::::::::::::::S:LPF:::AI::::::V:::V::G: Hmu2343 ::::::DV:::::::::::L:::::::::::::::V::VL::PT:::G::FV::V::::: rrnAC3436 ::MG:::P:N:::::::::::::::::::::::::::T::::PV::::::FV::VV:::: Hut0654 ::::::EF:::::::::::::::::::::::::::PKPA:Y::SV:::::::::LI:VG: consensus AGIS--GP----LAEYIPAAVQQTAGFTGALTGFLLLVSVFGLRRRLRAAWYSTAVLLPV #oth 54432111111123542165343322.1.3111.31253341.1122131.221412113 pNG7323 :SLALN:::::::TA-VVDLPLPFVR:G:V:FA:V:GIVTV::Q::KQL::RVA::V:LG VNG1847 P:TGF:::::::V:::V::W:S:A::::::::::::V::AG::::G::::::::V::::: hla1259 L:VD:::::::::SL:V::V:R::V::::TI:::SM:G:S:A::NGY:VG:::::::::L HVO_2616 PVAG:::V::::::P:::D::RI::::::T:::::::A::::::::Y:::::::::M::: Hbo2229 VT:D::A:DFVLFGITL:GY:::ITA:::T::::::::TA::::::::VG::A:M::F:: NP3178A T:V:::::::::F:A:::E:MAR::::::::::::M:L:AY::::CY:I:::::L::::I Hmu2343 QRA::::::::::::HL:TV:S::V::::::::::::FA:S:::::Y::G::A:VL:::L rrnAC3436 VS:::::::::::GDL::RSI:R:::::::::::T:::::V:::::::I:::A:I::::: Hut0654 :S:::::::::::::L::P:::R::::::S:::::M:A::::::::::I::F::VL:::: consensus TAAQGLLQ-------------SSPVSIPLVVLSLISLPVVLLNRRRFDRALDLSTTQLAA #oth 214111511222211211211353525..23114324232352433.126443133.312 pNG7323 LVVLP:TT:::::::::::::FQ:TD:::LL:T:VTY:LLVR::H:::QS::::PI:I:S VNG1847 :::::::::::::::::::::AT:Y:V::::V:VG:::::GVTAG::TGRTPR::S:::V hla1259 ::I:::M::::::::::::::A:VL:F:::A::IV:M:ALAY::G::::PFSP:P::::: HVO_2616 ::::::I:::::::::::::::PERAA:::G::::::ALLVF:H:A:::D:::TA:::S: Hbo2229 :V:::A::::::::::::::::TEQ::::IG::T:AFV::G::F:A:::E:Q:T:::V:: NP3178A ::L:::A::::::::::::::::V::Y:::G::A:::::::::YSY::::AN:T:::::S Hmu2343 ::I::::::GVIDLPYVGT::EL:::L::::::VL:::T::I:::L::::::V::::Q:: rrnAC3436 A:V:::V:NSAVTLPFVGPVP::A::::::::::::::AM:::::::::PI::::A:::: Hut0654 ::F:::V:::::::::::::::AV::V::I:::VL:V:T:::SY:::::KI:::LS:::: consensus LAALAGAQAYGTVGAYALR-D-QFNGVSTLLDAFYFTLVTASTVGYGDITP----QSQAA #oth 231242445.2.3.221.11224.7424244..2.142..32......131113342261 pNG7323 :S:IF:VVL:::::::G:::G:::LELDSWG::V:YVV::IA:::::::::::::VTAE: VNG1847 GTG:I:VL::::::T::::G:DG:RA:::V:::::Y:::::T:::::::::::::TT::: hla1259 G:::VT:IS:::I:T::::::::::::E:IV::::::V::::::::::V::VAGAAADI: HVO_2616 :L:I::::T:T:A::W::::E:::::ID::F:::::GV::G::::::::Y::::::TAI: Hbo2229 :T:::::::::::::F:::::PH:D:IHN:::::::S:::G::::::::::::APT:AVG NP3178A :::VVFV:V:::I:::::Q:::E:E:IN:I::::::::::::::::::::A::::TT:FG Hmu2343 V:::I:G:V:I:T:T:::::E:::G:::::T::L::AI::S::::::::S:::DP::::: rrnAC3436 G:::L:SLM:::A:S:::::::D:TNL::AT::::Y::::::::::::V:::::::::Q: Hut0654 ::::L:TMT:::::T:::::E:E:AQ:E::T::L:Y:V::::::::::VI::::SS:DG: consensus RLFSLSVLVLGTASFAVALGSLLGPAIEARLAKALGRMTDSQLDLLEDHVLVLGYGDLTE #oth 31.42.32162222.231113221.2112132411.4.1442113.22.12.2.1.1111 pNG7323 :W::::IILF::GA:T::V:A:I:::::S:M:T:F:V::A:E:T::::::V::::::V:A VNG1847 :::::::::S:A:::::::TT:I:::L:::::NV:::::QRD::A:N:::V:A::::::: hla1259 Q::V::S::MNV:A::::::VI:T:::::Q:S::::K:::K:I:::D::::::::::::: HVO_2616 :::GI:A:LITV:T::::::V::T:::::::T:::::::E::::I::N::::::::E::: Hbo2229 E::T:::ILVTVS:::AV::VVFT:L:::Q:S:::::::EE::::::N::::::H::::: NP3178A ::::M:::LT:VS::G::V:T::::L::::::T:::N:S:K:::::D::FI:I::::::: Hmu2343 K::TM::V::::S:::L::::V:::::QS:IT::::T::E::::::::::::::::::S: rrnAC3436 K::GM::V::::::::I:::::::::::K::SE:::N:::A::::::N::::::H::::: Hut0654 :::A:::V::::::::L:::::I::M:Q::F:R:::T::R::::Q::G:::::::::::: consensus PILEELGDA--TDFVVVTPDEEAATRLQDRDINVLTADPSDEEPLQRAGIDRARAVVAAT #oth 11121.4652144331213.344232.45223623121.2.21325133145.4213211 pNG7323 SL::::::E:::EV::::::::TVAS::GEGV:L::G::T::DV:RD:RVGT:SG::VGS VNG1847 :::T::DRGP:GEY::::S:DRSV:A:RE::LH::V:E:A:D:A:T:::V:::::::::: hla1259 ::::::DARDG:KYA:::T::T::R::SE::VP:F::::::VD::E:VN:QG:::::V:: HVO_2616 ::::::::R::ARV:I:::::GR:K::T::GYD:V:D::::::A:::TRV:A::S::V:: Hbo2229 ::::::TQK::::VLIL:::::RTR::T::GYT:::::::::DSQI:GRVKS:Q:::T:: NP3178A ::::S::T-::ASA:::V::P:D:K::R:::YE:I:::::::D::::VH:E::KGLI::: Hmu2343 :::D::SG:::VE:::::N:PDD:AA::H:::P::::::::::::Y::::E::Q::M::: rrnAC3436 ::I:::TG:::I::::I:::T:T:::::QQ::A:::::::::::M:::::ED:V:::::: Hut0654 ::::::QSE:::::I:::::DD:::A:GN:N::AIVG::::D::::::::::::::LV:: consensus NDDAQDALAILTARQLNPDVRIVAAATDRENVEKLRRAGADTVISPAVLGGHLLVESALG #oth .1.12.11211123321.2342...11321123.1111..14.11.231.112133113. pNG7323 ::::R:V::VIATKNV:::I:T:::::AEKH:::F:AV:::E::N:RSI::R::GK:V:: VNG1847 :::GE:::VV::V:ESH:::AV::::S:Q::EA:::::::::::::::I::R:IAQ:::: hla1259 ::::R::::::::::::::::::::V:Q::::N::::::::Q:::::T::::I:IDC:F: HVO_2616 :N::E:::::::::::::::H::::::Q:::ER:::::::N::::::A::::F:A:::V: Hbo2229 :N::E:::::::::::::E:T::::::H::::N::K:::::::::::A::A:F:A::::: NP3178A :::::::MTV::::E:::EL::::::::::::R::::::::::L::S::::R::::::F: Hmu2343 ::::::::::::::::::G:::::::::::::A::K:::::V:::::AI::::::::::: rrnAC3436 :::::::::::::QT:::E:N::::::::::I:::::::::::::::::::::I:Q:::: Hut0654 :::::::::::::S:::::A:::::::::::I:::::::::S::::::I::::::Q::M: consensus GEDSESIADRLLA----------VGEADDP------- #oth 4525.74354233232331111122344165512221 pNG7323 RKS::PLL:GIV:D:::::::::D::SG:TTE::::: VNG1847 DR:A:RK:HDV--::::::::::::D:A::::::::: hla1259 A-:::DATTD::GDSIDD::::::E:L::SSA::::: HVO_2616 :SGL:T:EE:::DEQPTEPAEDGT::::::GTDDRN: Hbo2229 ::GV:EL:Q::M:EEPSQ:::::D:D:Q:VLRDEDDA NP3178A ND:P:QVLNE::G::::::::::::KD---::::::: Hmu2343 D:::::L:::I:-::::::::::D::L---::::::: rrnAC3436 R:GM:N:::H::D:::::::::::NDE::ADI::::: Hut0654 :DGM::::::::::::::::::::ENE::L:::::::