|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2897 | VNG0969 | NP3118A | hla0725 | HVO_1206 | Hbo0354 | NP2104A | Hut1649 | rrnAC2193 | Hmu0418 |
1034 | VNG0969 | 2796 | 595 | 746 | 757 | 752 | 802 | 699 | 713 | 747 |
1371 | NP3118A | 595 | 2871 | 1290 | 1026 | 1019 | 1219 | 1108 | 1133 | 1200 |
1602 | hla0725 | 746 | 1290 | 2941 | 1218 | 1185 | 1298 | 1233 | 1291 | 1296 |
1811 | HVO_1206 | 757 | 1026 | 1218 | 2923 | 2057 | 1356 | 1344 | 1353 | 1390 |
1779 | Hbo0354 | 752 | 1019 | 1185 | 2057 | 2974 | 1353 | 1314 | 1335 | 1343 |
1958 | NP2104A | 802 | 1219 | 1298 | 1356 | 1353 | 2975 | 1579 | 1596 | 1595 |
2061 | Hut1649 | 699 | 1108 | 1233 | 1344 | 1314 | 1579 | 3041 | 2164 | 2169 |
2177 | rrnAC2193 | 713 | 1133 | 1291 | 1353 | 1335 | 1596 | 2164 | 3049 | 2396 |
2213 | Hmu0418 | 747 | 1200 | 1296 | 1390 | 1343 | 1595 | 2169 | 2396 | 3028 |
432 symbols consensus MNVDIQSLGTFNRLAHEGAEQAAQSLSQLTGIDAVVDVTKISLLDRADVEEEFAGQDFVG #oth .3212321332141143.134.14114211.1337231.433153542135424134433 VNG0969 :R::LDAVAS:S:TGD::GQR::D::ET::::P:NCQL:RTA:V:ADGLS-V:L:DSWER NP3118A :RIA:NQ:EEY:Y::SR::K:::RA:::M:::KMRHE::GV::VSDEALADI:T::KY:: hla0725 :R::VRA::AC::::ER::R:::GA:TD:::T:LS:E::GA:VASGE:LA:A:::RESI: HVO_1206 ::L:VR::R::S::::S:::K::G::TT:A:::TY:N:::VE:GTKS:::N:::ER:L:S Hbo0354 ::L:V:::R::S::::S:::R::G::::::::ETF:N::::EVST:::::R::RE::L:T NP2104A :QI::D::E:Y:T::RD::QS::::::::::::TH:E::NV::M:PS:L:Y:YI:GE:S: Hut1649 ::::::::::::E::::::KE:TA:MT:M:::::D::::Q:T:M::G::G:TL:E:A::: rrnAC2193 ::::::::::::Q:::::::::T::MG:M::::::::::::T:::::::G::L::R:::: Hmu0418 :K::::::::::Q:::::::::T:::A:M::::::::::::T::N:D::G::L::::::: consensus VEIGFEGGLDGETVLAFDEDSAETLTDALMPG-----ADGEMARSALKEVGNIMLSGFID #oth 132314.314.411.412644335255515211213554442362234.21..231..2. VNG0969 ISVE:D:A:T:RA::S:::AF:DHVE:E:GV::::::------AA::P::A::LT:::V: NP3118A :QV:LS::IA:::::I::PN::GR:RKR:QSR::::GGESTL:GG:FA:L::::IG:::: hla0725 :SV:LR:::E::A:::::AENVDA:L-S:L:::::::-GAS:G:::VT:::::A:G::L: HVO_1206 :H:::S:::::H:::::SPE:::R:V::::::IDATD::::L:E:S::::A::::G:::: Hbo0354 :H:::N::I::R::::::RQE:VQ:V:::V:::AADQP:::::T:G:::L:::::G::L: NP2104A ::::L::A:S:::::T:::AAQ::I:NV:A:::::::::EA:R::SI:::::::T::::: Hut1649 ::FD:::E:S:Q:A:VL:Q::S:::AGT:::::::DEISA:::K:GV::I::::M::::: rrnAC2193 ::FS:D:V:E:D::::::V:::G:I:EEM::::::SSD:EA::::GIE:I::::M::::: Hmu0418 :QFD:::A:::D:::V:ES::VGPI:E::V::::::G::::::Q:SVE:I::::M::::: consensus GWADYLGTTIDISPPTYIEATGADVLPDAAAD-------DDDQVFVFRSQIEAVDESVDF #oth 1..22222411221.3131453643134437611122345443112.2122335443352 VNG0969 V::ADDED::E:E::DRL:DE-HR:VQ:::VI:::::::-::CA:::E:::VLSSTQGTC NP3118A ::::H:::EV:MT:::::::A:TRI::PITRR:::::DAEEYG::L:E:RLQ::NHDLSV hla0725 :::N:::AA::MT::R:F::D::A::::G:LA:::::::-G:G::L:E:RLD:TTTDL:: HVO_1206 ::::::D::V::TT:::VDDENDGP:DRVD:E:GFENGG::EH:L:::N:L::A:NAIE: Hbo0354 ::::::D:S:::TT:::VDMQTEGA:E:ITG:SGFQMATG::H:LA::N:LDTD:QQ:G: NP2104A ::::H:DAQ::::T:::L:G::S::::AS::::::::::S:E:::::::RV:::S:A::: Hut1649 ::::::E::::H:::::::G::KEI::TSDDS::::::SP:::::::K:E::W::::::: rrnAC2193 :::::V:A:::H:::E:::ES:S::::::PES::::::G:HQ:::::K:E::WI::::N: Hmu0418 ::::::::::EH:::E:::::::::::P:PTV::::::A:QP:::::K::::W:G::LN: consensus YIYMLPEYDSLGDLM--HADP---------------DGDAIPIEKLAVFNEMTSRGAEQA #oth 52222.263325443445444211111111111111334231523154135326512541 VNG0969 RFAV::DVE:F:SYV::-TE:::::::::::::::::AE-FALSD::NHIQVA:VS::AV NP3118A P::LI:::SEFVK:L::R:Q::::::::::::::::S:L:V:A:::T:::GFADQS:RR: hla0725 S:::::DSGKFR::VVGKTA:AAASGADGGAGTDGTEST:::Y:S:ST:ASLAK::SAN: HVO_1206 DL::V:TAS:I:TIV::E:SG::::::::::::::::DG:L:V:SF:A:S::IND::T:: Hbo0354 H:::::TH::IKTISRIAG:-:::::::::::::::GST:V:::TFTS:SN:I:D::::: NP2104A H:LLV::R:T:V:AL::--::D::::::::::::::ED:S::F::FE::::::MH:::K: Hut1649 ::::::DQ:::T:::AD:::A:::::::::::::::EA::::VD::H:::R::QQ:TK:: rrnAC2193 ::::::::E::TEM:VE:V:T::::::::::::::::::::::D::QT:::::T::TQK: Hmu0418 :::::::::T:AE::TD::E::::::::::::::::G::::::D::S::::::TS:T::: consensus AENIEMMTGIDTEVEVSRLSFVPIEDVPKEVGDATYVGTVFEFTGTPSGYLAILFDETSA #oth 1332331..34343312234.32333113322245331223.341411122311.21611 VNG0969 SSHL:::::T:ATLVE:HVD:::V:R::SLLD::A:E:AI::SE:VVDSVI:::::::EP NP3118A SQQ:SQL::LR:D:T::Q:R:ISFS:ISS:::TNE::SV:::L::R::::FVVM:S:D:: hla0725 :D::A::::L::S:D::::R:::LA:::A:::VEPHA:::::LQ:E:::::::::E:E:: HVO_1206 S:D:TA::::::T::::::::::::G::MSLT::VRR:V:L::S::::::I::::::P:: Hbo0354 SDDLTA:::MESV::::::::::::A::M:LT:::RR:V:L::M::::::I::::::::: NP2104A ::::TT:::LT:D:::N:MT::::D:::A::::RR:::::M:YE:::::::V::::QS:: Hut1649 :::VS::::::V:A:::QIN:TR:::I::Q::TDR::::AV:::DL:::F:LV::::A:: rrnAC2193 :D:V::::::P::S::TQI::A:::::::QI:TD:F::::V::::::::::MV::::V:: Hmu0418 :::V::::::P::A::TQI::A:::::::QI::D::::::V::::V:::::LV::::V:: consensus SNVAEALLP-EMDGD-LGEMHQSAIEELGNIMTSGFIDGWANVLQTSIDHSPPRHVHDIG #oth 74213212153414234431533.34.1..121...2.1...2.31112111.5414.4. VNG0969 GA:::L::G:--:A:AGA::AE::VS:::::TA:::::Q:::A:D:T::I:T:S::R:A: NP3118A :R::S:M::GGV:P::N:G:M:E::K:::::V::::::::::T::S::E::::EYIE:S: hla0725 AKI:ASM::S:P:EP:::G:AEN:LC::::V:::::::::::::G:::T::::EF::::: HVO_1206 E:I:SS::::G:E:::-EA:R::::Q:I:::T::::L:::::A:E:T::I:::K:::::: Hbo0354 DR::D::M::G:EA::-PA:Q::::Q:I:::V::::::::::A:E:T::I:::TY:D:L: NP2104A :S:VD::V:V:T::::W:::E:::MK:::::::::::::::::::::::::::TF:A:M: Hut1649 K:A::::M:TAVE:EE:TDQ:TA:::::::::::::V:::::::::::::T:::L:::M: rrnAC2193 I:::::MM:I:::S:E:TDQ:KA:::::::::::::V::::::::::VE:T:::V:::M: Hmu0418 Q::::::M:T:P::EG:T:Q:KA:::::::::::::V::::::::::V::T::QL::::: consensus SAIIDPLAAQLGQRQEHAFVIDSTIRTD-DVEFRCEIYALPDEAE-LRDALDRLAVERA- #oth 2223212235323611231422251323234324334221.22411.252145.634434 VNG0969 R:VL:TV::AY:E:ADTIA:VNA::TLGP::TC:VCTFPS:ED:DQ:A:IA:N::ADASE NP3118A :N::ETVQRR:SDQ::Y::T::T::TI::NRQAEVQL:V:::TR:::AE::SA:P:QE-: hla0725 ::A:S::V:K:SR::DYG::::AA:Q:E:G:QA::DV::::::R:::AR:::::SEP--: HVO_1206 ::::::::TD:A:S::Y::L::::::::::D::T:D:::::::T::::K::KQ:SPAA-: Hbo0354 ::::::::TE:A:A::Y::L:::A:::P:ND::T:D:::::N::::::::::::GA:VQQ NP2104A :S:MS:IVGRMART:::::ML::V:N::G:GV::::MF:::::::::T:V::D:L::::D Hut1649 R:::::::::V::H:D:::::::RM::::::::ES::::::NDE::::E::EE::::::E rrnAC2193 R::M::::::V::Y:::::I:::QMQ::::I::QA::H:::N:K::::A::ND:D::::T Hmu0418 Q::V::::::V::H:::S:I:E:EM::::EI::SS::H:::::K::::Q::EE:E:D::D consensus ET---------- #oth 323222222121 VNG0969 :S:::::::::: NP3118A --:::::::::: hla0725 --:::::::::: HVO_1206 --:::::::::: Hbo0354 P-:::::::::: NP2104A ::EVEPDEVF:: Hut1649 ::DADPEEIFQE rrnAC2193 ::GADVEQIFK: Hmu0418 Q:DADVEQIF::