|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2080 | hla0244 | NP0326A | HVO_0055 | Hbo1438 | VNG2351 | Hut2191 | rrnAC2699 | Hmu3064 |
1536 | hla0244 | 2068 | 1332 | 1406 | 1369 | 1323 | 1297 | 1366 | 1320 |
1570 | NP0326A | 1332 | 2067 | 1384 | 1369 | 1395 | 1349 | 1414 | 1415 |
1681 | HVO_0055 | 1406 | 1384 | 2080 | 1540 | 1410 | 1426 | 1400 | 1432 |
1720 | Hbo1438 | 1369 | 1369 | 1540 | 2076 | 1512 | 1402 | 1474 | 1465 |
1681 | VNG2351 | 1323 | 1395 | 1410 | 1512 | 2114 | 1382 | 1497 | 1540 |
1618 | Hut2191 | 1297 | 1349 | 1426 | 1402 | 1382 | 2101 | 1543 | 1503 |
1694 | rrnAC2699 | 1366 | 1414 | 1400 | 1474 | 1497 | 1543 | 2139 | 1621 |
1713 | Hmu3064 | 1320 | 1415 | 1432 | 1465 | 1540 | 1503 | 1621 | 2084 |
295 symbols consensus --------MNVADAMTPRSDVVTVEIPGTRDDVLEYLQERGFSSVPVVKETDDGEEYRGL #oth 11111111.1.2.1..11311.1121..2.2.2...1..23..1...1.52231152..1 hla0244 :::::::::::S::::::::L:V:::::S:N:::::I::F:::::::::DV:GD:V:::: NP0326A :::::::::::V:::::::E::::::::K:E::::::::::::::::::S:A:::LF::: HVO_0055 :::::::::K::::::RGEE::::SL::::::::::::::::::::::::::E:TK:::: Hbo1438 ::::::::::::::::::E::::::L:::::::::::::::::::::::R:::::A:::I VNG2351 ::::::::::::::::::D::::::L::::::I:::::::A::A:::::ASE:::R:::: Hut2191 :::::::::::::V::::V::::A:L::::::::::::::Q::::::I::::A:::C::: rrnAC2699 MREGSSGS:::::::::::E::::T:::::::A::::::QA::::::I::::::::F::I Hmu3064 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::I:Q::::::F::I consensus VSRDDLIEHPDEDQLALLMREVPTTTADTSIEAVAALMVEEGARRIPVV-DG-RLEGIIT #oth 11.32..24.1.1...2.221..13332232432.53113433..2.1.1.21412..2. hla0244 :::N::::Q:::::::::::::::VD::DA:GDA::T::A:DS::L::::::D::V::L: NP0326A :T:ES:::Q:::::::::T:::::VEPSA::A:L:E:VL:S:E::V:::E:D:E:V::V: HVO_0055 I::E::::::::::::V:V:::::AS::DDL:::::T::S::::::::::::DAI:::L: Hbo1438 :T:Q::::::::N:::V::ND:::::::::V:D::HM:::KN:::V:::::::T:::::: VNG2351 I:::::::R:E:::::::::D:::::Q::TVPE::S:::DS:T::V:::E:E::::::V: Hut2191 :T::A::KN:::::::M:VED:::::GE::LAS::RT:::T:E::::::::::Q::::V: rrnAC2699 I:::A:::S:::::::::VE:::AISG::::::A:QV:::D:E::L:I:::::E:K:::: Hmu3064 ::::A::N::::::::::TE::::V::::::Q:::::::::R:::::::::::::::::: consensus VTDVIRAIARGDV-DGDTEVGELARRDVNTTYEGTPLTVAEREISYANVPYAVVLDDDGD #oth 1..11.11.4.431112251231.3221.22.422..411..2132.2...2.1.11215 hla0244 ::::V::::::EI::::::::G::T:A::A::TE:::S::::::GL::::::::::::AG NP0326A :::IV::::E::Q:::A::::S::THE:::I:Q::::P::::QL:::::::::::::::R HVO_0055 ::::V:::::::I:::E::::DV:A:::::::VDV::HIV::::F::::::::::::EAS Hbo1438 :::::::::::E::EL:AGAADV:T::::::::EA:::::::::F::::::::A::ET:T VNG2351 ::::V::::D:QA:::::D::G:::::I::::::A:::::::S::::::::S:::GET:: Hut2191 I::::::L:E:G:D::::P::::::P:::CV:A:A::G:::::L:H:D:::G::::::AE rrnAC2699 ::::::S::N:N:::::KV:D:::N::I:CV::::::::::::L:H:::::G:::G:::: Hmu3064 :::::::::T::::::A:S:D::::::::CV:A::::::::::LD::E:::G:::G:E:E consensus MAGILTEVDIIDVARVVEGEADTGDSIANQDDDWMWEGIKAVGNRYMPTRNVEIPAEPVS #oth 33.11....112..1..1..241.122.31.11.3..11..1.3.13.....12.421.3 hla0244 L::::::::VLA:::::::::S::::::E::SE:S::::::T:A::L::::::L:VG::H NP0326A QT:M:::::::E:::::Q::T:P::AV::::SE::::::::::S:AV::::::::SAA:A HVO_0055 L:::V::::::E:::::::::G::::V:::::E:::::::::::::I::::::::::::: Hbo1438 :S::::::::::::::::::D:::::V:::::::::::::::::::I::::::::::::: VNG2351 :::MV:::::::::::::::DN::::M:AD::::K::S:::::S::L:::::Q::::::R Hut2191 V::::::::V:E::E:::::TG::E:::::::E::::::::::::::::::::F:D:::: rrnAC2699 :S:M:::::::A::::::::D:::::::::::::A::::::::G:::::::::L:::::H Hmu3064 :C:M:::::::::::::::::E::ENM:SD::::K::SV::::S:::::::::::H:::R consensus EFMTADLVTVSKRRTARDAAQLMIRNDIEQIPLVSGDELTGIVRDVDLLEAL--- #oth 41.14.121.543411311.1411441...2..22.12.4.1...2111311421 hla0244 H::::::::::DT:::KEV:KEL:S:::::V:::N:TD:D::::::::::G:::: NP0326A ::::E::IS:P:HK:S:::::Q::S::::::::::::::V::::::::::::V:: HVO_0055 K:::D:::S:AT:A::K::::T:::E:::::::::::::I:V:::IN:::::YE: Hbo1438 T::ST::::::::TS:VE:::A::T:::::::::G::Q::::::::::::::::: VNG2351 ::::S:V:::TGK::S:::::T:LDT::::L::M:::::::::::::::A::TDE Hut2191 :Y::::::::GS::::KE::::L::HE::::::::::D:A:::::I:VIK:VQ:: rrnAC2699 ::::::V:::N:::::EE::::::EH:::::::L:::::::::::I:::RG:::: Hmu3064 A:::E:VL:::::E::::::::::DAE::::::::::D:V:::::M::::G::::