|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 4190 | VNG0823 | NP3106A | Hut0470 | rrnAC0466 | Hmu1138 | HVO_1034 | hla2295 | Hbo0528 |
3175 | VNG0823 | 4303 | 2598 | 2727 | 2714 | 2682 | 2657 | 2695 | 2644 |
3168 | NP3106A | 2598 | 4199 | 2685 | 2735 | 2790 | 2661 | 2763 | 2704 |
3301 | Hut0470 | 2727 | 2685 | 4240 | 3088 | 3114 | 2657 | 2694 | 2658 |
3267 | rrnAC0466 | 2714 | 2735 | 3088 | 4120 | 3333 | 2602 | 2610 | 2577 |
3284 | Hmu1138 | 2682 | 2790 | 3114 | 3333 | 4143 | 2670 | 2622 | 2683 |
3093 | HVO_1034 | 2657 | 2661 | 2657 | 2602 | 2670 | 4218 | 2924 | 3099 |
3256 | hla2295 | 2695 | 2763 | 2694 | 2610 | 2622 | 2924 | 4221 | 3194 |
3214 | Hbo0528 | 2644 | 2704 | 2658 | 2577 | 2683 | 3099 | 3194 | 4891 |
652 symbols consensus ---------------------------------------MARRETDEAGDLSGD------ #oth 111111111111111111111111111111111111223445554545156445433332 VNG0823 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::VT:LNAPV:AMA::LFAGLD NP3106A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::SNH::SR------:::::: Hut0470 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::MSEPH::TDQ:::T:::TATSTAE rrnAC0466 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::SNP::P:P::FVS:P::::: Hmu1138 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::GD::EHD:SS:TP:::::: HVO_1034 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::-M:DPSV:R:V:RLLASGEFD hla2295 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MASDARE:D:::R---:::::: Hbo0528 VTYRNEDAMSETEFDLGDTGEQADAASDGDAGATASPNDG:DSPN:DN::P::FE::::: consensus -------LAALRRRLSRTAEVLRGSAVDVRNYDPSDHGPLVEFDGPAGYDEVDRYWLNAP #oth 1111123345333312.2222.3.242236222.42233143254222451111..1... VNG0823 :::::GGFD::Q::A::IV:::::T::::PP:::QA:::::::::V:D:E::::::V::: NP3106A ::::::::ES:::Q:R::::L:Q:TT:PGGA:R::::S:I:GDHDVD:-RV::Q:::::: Hut0470 ADESVGR:GSAKEW:V:V:R::A::Q:A:E::::RR:DH:TD:G:L::M::I:::::::: rrnAC0466 ::::::::GHIQSW:::::T::S::::PTA:::::R::T::::::LD::N::E::::::: Hmu1138 ::::::::SGV:DW:::::RM:S:A::PST::::QR::K:::YTV:EQ:::I:::::::: HVO_1034 :::::AAA:EAE:L:R::::M::::DL::HPLS:D:-T::GTYEV:E:HE::E:::V::: hla2295 :::::::IE:::::::::W::::::DI:::AFR:G:D:::AD:AI:D:ES::::::V::: Hbo0528 :::::AA::D:::::R:::::::::RI:::P:R:::-:T:ST:EP::DEAVI:Q::V::: consensus FAFAVINYDPEADEHRYHVVEPDLDDFERDLLDRLFEDIRDPLLYREDTDEDP-EAALRA #oth 1111213214332415.221..4.121.332.12132.1.31.1.344325431.42.44 VNG0823 Y::VF:GF:A:S:T:Y::::::H:::::QTV::Q:YD::::A:I:DAT::P:DR::V:I: NP3106A :SY:::S::ETESQ::::AI:::::R::S:::ET:YD:V:A::::-:KR::P:::E:::Q Hut0470 Y:::S::::::R::::::::::G:::::::::::::::V:::::::A:V::::::G::L: rrnAC0466 ::::S::H::DR:::L:Q::::S:T:I::E::::::::::I::I::D:V:T::::RV:AE Hmu1138 ::::S::H::::::QF:Q::::S::E::::::::::::::G::I::::VSD:::::::A: HVO_1034 ::YV:VT::TD:TA:Q::T::::::E::AS::E:VRT:::::::::REA:PRT::T::VE hla2295 Y:YV::T:HDAES::::YA:::E::R::::::::VVD::::::::::G:GRTD::ET::T Hbo0528 Y:YV::T::EA:SK:C:YA:::::::::::I:E:VR:::::::::NTE:GSSA::TT::R consensus ELRRRLEEYGVDVEMETFHRLFYYLYRDFQGYGRIDPLMHDPHIEDISCDGYDLPIFVYH #oth 31253122.13324331112.2...4.4.4.1132..214.12...1....14..112.. VNG0823 QMQ:L:S::SI::TPNA::::::::H:T:E:FEKL::V:Q::::::V:::::G::L:::: NP3106A ::::::QQ::TNIDTA:VY::::::::R:::F::L::::Y::::::::::::E::LYI:: Hut0470 :::D:::::::::RI::V:::::::F:E:::::K::::::::A::::::::AS::::::: rrnAC0466 ::EA:::::::VI:P:::Y::::::H:S:::::H::::::::D::::::::AN::::::: Hmu1138 A::D:I:::::V::P:::Y::L:::::S:L:::::::::::::::::::::AG::::A:: HVO_1034 ::QSI::Q::LELD:N::YT:L:::R:::H:::PL::::K:::::::::::::::L:::: hla2295 ::EGL::G::::IG:D:::A:A:::::::R:::KV::FLN:R:::::::::::::::::: Hbo0528 T::TV::Q::IE:::A:::T:L:::L:::R:::::::::Q:::::::::::::::::A:: consensus DDYTDIETNITFDEDELDNFVIRLAQRSGRHISVGDPVVETTLPDGSRAELALGEEVTPR #oth 13.1.11111213442.2321111..1..1.1.121.222...12.1.1.....1....1 VNG0823 T::::::::::YEQQ:::S::V::::Q::::::I::::T::::::::::::::::::::: NP3106A :::Q:::S:::::R:::::YI::M::Q::::::::N:I:::::Q:::::::::::::::: Hut0470 :A:::V:::::Y::S::E:L:VQ:::::::::::A::::S::::::::I:::::T::::: rrnAC0466 :G:::::::::Y:A:::ND:::Q::::::::V::S::::S::::G:::I::::::::::: Hmu1138 :A::::::SVVYE:G::ND:::Q::::::::V::S::::S::::::::I::::::::::: HVO_1034 :E::::A::VS:AAE::::::::::::::Q::::::::LG::::N:A::::::::::::: hla2295 :::::::::VS:GKSA:::Y::::::Q::::::::::M:::::::::::::::::::::: Hbo0528 :::::::::VS:G:EQ::Q::V:::::::::::::::::G:::::::::::::::::::H consensus GSAFTIRKYADEPFTPIDLLEYGTFSVEQMAYLWLAIEHNKSLIFAGGTASGKTTSMNAV #oth .....1.3.111.1..22.1411.113111..1.11..1..112......1........2 VNG0823 :::::::::SE:::::AT:VD:D:::LD::::::::::S::::L:::::::::::::::: NP3106A :::::V:::S::::::::::::::Y:L:::::::M::::::NIV:::::::::::::::I Hut0470 ::::::::::ED::::::::K::::NR:ML:::::::::::::L::::::A::::::::: rrnAC0466 :::::::::::::::::E::::::::::ML::::::::S:::::::::::A::::::::L Hmu1138 ::::::::::::::::::::N:::::::ML::::::::S:::::::::::A::::::::: HVO_1034 :::::::L::E::::::::VR:::::I::::::::C:::::::::::::::::::::::: hla2295 :::::::Q::ED:L:::::V::::::I:::::F::C:::::::::::::::::::::::: Hbo0528 :::::::M:::D::::V::V:F:::::::::::::C:::::::::::::::::::::::: consensus SMFIPPRSKVLTIEDTRELSLYHDNWLSSVTRERLDEGSD-ITMYDLLRSALRHRPEYII #oth 1..2...1.211.......1.1......11..2143214.112.......1......1.1 VNG0823 :::V:::A:I:::::::::A::::::::::::GADGG:G:T::::::::::::::::::: NP3106A :::::::::LI:::::::::::::::::C:::::::::A::V::::::::S::::::::: Hut0470 :::::::A::::::::::::::::::::::::::F::-D:::S::::::::::::::::V rrnAC0466 A::L:::::::S::::::::::::::::::::::::D-:::::::::::::::::::::: Hmu1138 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::-:::::::::::::::::::::: HVO_1034 :::V:::::::S:::::::A:::::::::::::::H::T:::S::::::::::::::::: hla2295 :::V:::A:I:::::::::::::::::::I::::RY::A:::D::::::::::::::::V Hbo0528 :::::::::::S:::::::::H::::::::::N:MH::::::D::::::::::::::F:: consensus VGEVRGEEAITLFQAMNTGHTTFSTMHADSVQTVINRLENEPINVPRAMVQSLDILCVQT #oth ......2..2............2.......11........1......1.1....3.21.1 VNG0823 :::::::::M::::::::::::Y:::::::::::::::::D::::::::I:::::::::: NP3106A ::::::::::::::::::::::L::::::::::::::::::::::::P::::::V::::: Hut0470 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::P::::::::A::V rrnAC0466 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::P:::::::::::V Hmu1138 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::P:::::::::::V HVO_1034 ::::::D::V::::::::::::::::::::IE::::::::::::::::::::::L::::: hla2295 ::::::A:::::::::::::::::::::::IE::::::::::::::::::::::M:SI:: Hbo0528 :::::::::V::::::::::::::::::::IE::::::::::::::::::::::L::::: consensus LTRSGDERVRRAKTIAEIEGIDQRTGELDYSNAFEWDAETDEFEQRDSSLLDEIREERGW #oth .214111....13211..11......1...23114.3234.513332131121.23.1.. VNG0823 ::HV:::::::SSV::::::::::::D::::T:::::PTR:D::::::NV::::QD:::: NP3106A :A:F:G::::::S:::::::::::::::::T::YR:ESGS:::REGTR::M::::::::: Hut0470 :::Q::::::::::L:::::::::::::::A::Y::QPTA:GYAE::::::ED::::::: rrnAC0466 :A::::::::::::L::::::::::::::::TTYN:R:TE:R:SENN:E::::::::::: Hmu1138 :G:::G::::::::L::::::::::::::::::YA:Q:DE:Y::DSN:D::::::R:::: HVO_1034 :::H:G:::::SQ::G::GD:::::::::::S::A:EP:::T:S:N:::::T::QR:N:: hla2295 ::::::Q::::::::G::G::::::::::::S:::::::::::SRN::::ME::AD:::: Hbo0528 ::::KG:::::SRA:G::G::::::::::::R::S::::::T::::N::::E::QS:::: consensus SRSELLRELRRRERFLRYLQEEGVTDYRRFTALVNEYYADPERVMARIEAAED------- #oth 1121.11.232.321143.3442121.13..121.2...2314.3522245635111111 VNG0823 :::D::::::N:K:V:Q::V:QD::::::::::I:::::Q::::V::VTD:L:::::::: NP3106A :Q:::::::Q::RLV:QF:::R::NE:Q::::M::R:::S:DT::Q:::E::TD:::::: Hut0470 :QA::::::ED:::::A::L::D::::::::SF::R::::KDA:LST:::QP:TE::::: rrnAC0466 :Q::::T:::N:Q:::::::S::I::::K:::M::K::::K:Q:I:N:DD:IA::::::: Hmu1138 :Q::::::MDD:K:::::::A:SI::::::::M::K::::S:T::E::DR---::::::: HVO_1034 ::T::R:::::::G:::::LDK:::::::::::I::::::S:D::R:V::D::I:::::: hla2295 ::::::::V:::::::EL:RGL::::::A::::::::::::::::D:L:ERS:G:::::: Hbo0528 T:A::R::V::::::IWS:V:L:ID:::Q:::::::::::AD:::D:L:SEV:AEIPTER consensus ---------------------------------SDVGDAA------------ #oth 1111111111111111111112212111111225243353333331111111 VNG0823 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::AA::PGVVE::::::: NP3106A :::::::::::::::::::::::::::::::LDT:LD:KSDQQQA::::::: Hut0470 :::::::::::::::::::::::::::::::::-------:::::::::::: rrnAC0466 :::::::::::::::::::::::::::::::::-------:::::::::::: Hmu1138 :::::::::::::::::::::::::::::::::A:IDATP:::::::::::: HVO_1034 :::::::::::::::::::::::::::::::::V:A:SE::::::::::::: hla2295 ::::::::::::::::::::AAKPS::::::::GP:::::D::::::::::: Hbo0528 DERDGLSVGVENEPHVESGSAEEPQTGDDSGVE:P:::DSHRSDGTGDETAR