Home |  Text search
[IQR] (FabG) COG1028 Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases)
8 genomes BUD0823 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0479

rrnAC2140

HVO_2590

Hbo2259

Hmu0259

Hut0639

hla1935

NP3566A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score2324 Hmu0259 hla1935 rrnAC2140 NP3566A HVO_2590 Hbo2259 VNG0479 Hut0639
1625Hmu0259 2362 1328 1518 1378 1289 1290 1356 1366
1605hla1935 1328 2423 1508 1429 1217 1297 1332 1298
1770rrnAC2140 1518 1508 2377 1562 1382 1361 1412 1395
1740NP3566A 1378 1429 1562 2346 1313 1385 1350 1366
1671HVO_2590 1289 1217 1382 1313 2355 1426 1460 1420
1610Hbo2259 1290 1297 1361 1385 1426 2356 1340 1423
1708VNG0479 1356 1332 1412 1350 1460 1340 2384 1479
1712Hut0639 1366 1298 1395 1366 1420 1423 1479 2333

338 symbols
consensus       ---MSDWTAADMPDLSGKTVVVTGANSGLGFEATKAFAAKGATVVMACRSTERGEDAAAE
#oth            1124461124431323221.21......1.2.211.1.23..2.1..1..41.126.342
Hmu0259         ::::T::::R:::S:DDR::::::::::I:Y:::::::RR:::::::::::::::R::R:
hla1935         ::::AE:::EE::R:D::::::::::::::Y:G:R:::::::::::::::A::A:T::D:
rrnAC2140       ::::TG::IE:::P:RDR::::::::::::L:GS::::RR::::::::::V::::S::::
NP3566A         ::MA:T:::DR:::CT:T::LI::::::::::::::L::N::::I::::::D:::Q::::
HVO_2590        :::::::::::A::::::::I:::::::::::::R:::E:::H:::::::LD:::::M:D
Hbo2259         ::MS:Q:::D:V::C:::::::::::::::Y:::::L:::::H::::V::P:::RE::HA
VNG0479         MSSDDA::::AL::Q::RR:::::::::::::::R:::RA::H::::::::::::::RDD
Hut0639         :::--------:G:Q:E:::::::::::I:::V:::::EN::R:::::::LD::NA:SE:

consensus       IRAA--VA---DASLDVRECDLADLDSVRAFADWFAAEYDALHVLCNNAGVMAIPRSETA
#oth            13331122111424.21431...2.22.2311162344223111.2.......1..3..2
Hmu0259         :DRS:::::::N:D:::MA:::::::T:AD::EA:TSA:GE::::::::::::L::G:::
hla1935         :::D::AGGDI:GE:::::::::S:::::D:::RL::D:::VD::::::::::::::::E
rrnAC2140       ::E::::P:::N:T:::::::::::SN:AS:::GLR:D:::VDI::::::::::::::::
NP3566A         :QD:TA:G:::E:A::::Q::::S:A::E:V:EDI:EN::::D::::::::::L::Q::D
HVO_2590        ::DS:::P:::A:::TLS:L:::::::::R:::E::::HGS:::::::::::::::R:::
Hbo2259         VQD::::::::::D:TLAKL:::::::::R:SE::HDTF:E::::A::::::::::R::E
VNG0479         :V:E::LP:::G:::T:H:L:::A::::A::::::T::F:S::::A::::::::::::::
Hut0639         ::::::::::::P::S:M:L:::::::::S::ET:RT::SD::::S:::::::::::::E

consensus       DGFETQFGVNHLGHFALTGRLLDLLRET---DGETRVVTQSSGAHERGEIDFDDLQGERS
#oth            1...3.1.1.....12.113.244.4421114122.2.12...2.24.121.3.134.42
Hmu0259         ::::R:L:I::::::T:::H:MEA:AA::::::-A::::::::::QN:::::E:::::::
hla1935         :::::::::::::::::::::FS::KGAEGI::DA:I:::::::::Q::M::S::NW:E:
rrnAC2140       :::::::::::::::::::H:::::GAA::::::S:I:::::::::M:::::::::R:::
NP3566A         ::::K:L::::::::::::::::::V:S::::::S::::H::::::F::L::::::R:Q:
HVO_2590        Q::::::::::::::V:SA::FPT::D::::P::::L:AM:::L::::RME::::::::D
Hbo2259         Q:::M::::::::::::::L:::R:::::::EA::::::::::I:QN::M::S:PMA:H:
VNG0479         ::::::::::::::V:::AG::GV::R::::S:::::::::::::R::R:::E:::H:AE
Hut0639         :::::::::::::::::::L:::R:::::::A::::I::::::L::::::::A::H::Q:

consensus       YGKWDAYAQSKLANLLFAYELDRRLRAAGI------DVLSVACHPGYAATNLQRRGPEAA
#oth            .1214..21...1.1..11..11.243234411111413.121...11111..3.22434
Hmu0259         ::R:S::S::::::V::G::::::ADE:::::::::::T:AV::::::DSD::::AG::G
hla1935         ::::K::GR::::::::::::QH:ID::NREADTGVN:R:A::::::TD::::L:TAAES
rrnAC2140       ::::S::G:::::::::::::Q:::GNH:WD:::::::::::::::::D:D::F:::REM
NP3566A         ::R::::G:::::::::::::Q:::T::D:T::::::TI::::::::::::::Y:::KED
HVO_2590        :DE:::::::::S:::::F::::::T::::D::::::::::GA::::::::::F:::::S
Hbo2259         :D::A::::::::::::::::Q:::ERV:EG:::::G::::G::::::::::::::::M:
VNG0479         ::::E::S::::::::::::::::::::SA::::::S:T::::::::::::::L:::Q::
Hut0639         :DRF::::::::::V:::::::::::::NA::::::E:T:::::::F:::::::::::L:

consensus       GSTLRLAMMKLANAVFAQSAERGALPMLYAATAADVDGGEYVGPGGLLNMRGAPERQRSS
#oth            125225432321.1221.1.24..2.1.1.21443161.2.21.2.122...3.442511
Hmu0259         AGAIGAVIAQA:::LV::::A:::::::::::HDGIS:::::::::::::::::AV:D::
hla1935         :NP:LKIG:R:::::LG:D:AI::E::::::::-:::::A:IE::::M::::H:TVG::N
rrnAC2140       :::::T:A:GV::::::::::Q:::::::::::E::I::::::::::FD:::S::F:Q:N
NP3566A         :::::M::::V::::VG:::Q:::::L:::SV::G:G::::Y:::::::::::::::S:N
HVO_2590        :::::YW:S::G::I::::::M::::L:::::SPA:ES::::::Q::FG:::T:GIAEP:
Hbo2259         ::FV:KLG:G:::R:::::::M:::::::::::D::R::S:I::T::FG:::S:GTAA::
VNG0479         ::R:::LA:RA:::LVG::::Q::W:L:::::NPSI:::::I::::V:::::H::::QP:
Hut0639         ::K:::W:::::::::::::AT::::::M:G:D:::A::::::::::M::::::VI::::

consensus       DASYDEDTARRLWEVSEDLTGVDYDL------------
#oth            21131532.42..43.322.114133332212211111
Hmu0259         AR::NAA::S:::H::::::::E::FEVPAAAV:::::
hla1935         :::::R:D::E:::Y:TEA::::FSV::::::::::::
rrnAC2140       :::Q::E::EQ::A::T:::::E::FERT:::::::::
NP3566A         E::::KRD::::::E::S::::T:SF::::::::::::
HVO_2590        :RAR:PE::A:::D:::E::DTRFR:A:::::::::::
Hbo2259         E::H:::D:H::::L:::::::T:GI::::::::::::
VNG0479         AR:R:::::::::T::A:R::::F::PDPA::::::::
Hut0639         :R:::DEL::Q::D::V:::::S:::PDPQAPDATSAN