|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2324 | Hmu0259 | hla1935 | rrnAC2140 | NP3566A | HVO_2590 | Hbo2259 | VNG0479 | Hut0639 |
1625 | Hmu0259 | 2362 | 1328 | 1518 | 1378 | 1289 | 1290 | 1356 | 1366 |
1605 | hla1935 | 1328 | 2423 | 1508 | 1429 | 1217 | 1297 | 1332 | 1298 |
1770 | rrnAC2140 | 1518 | 1508 | 2377 | 1562 | 1382 | 1361 | 1412 | 1395 |
1740 | NP3566A | 1378 | 1429 | 1562 | 2346 | 1313 | 1385 | 1350 | 1366 |
1671 | HVO_2590 | 1289 | 1217 | 1382 | 1313 | 2355 | 1426 | 1460 | 1420 |
1610 | Hbo2259 | 1290 | 1297 | 1361 | 1385 | 1426 | 2356 | 1340 | 1423 |
1708 | VNG0479 | 1356 | 1332 | 1412 | 1350 | 1460 | 1340 | 2384 | 1479 |
1712 | Hut0639 | 1366 | 1298 | 1395 | 1366 | 1420 | 1423 | 1479 | 2333 |
338 symbols consensus ---MSDWTAADMPDLSGKTVVVTGANSGLGFEATKAFAAKGATVVMACRSTERGEDAAAE #oth 1124461124431323221.21......1.2.211.1.23..2.1..1..41.126.342 Hmu0259 ::::T::::R:::S:DDR::::::::::I:Y:::::::RR:::::::::::::::R::R: hla1935 ::::AE:::EE::R:D::::::::::::::Y:G:R:::::::::::::::A::A:T::D: rrnAC2140 ::::TG::IE:::P:RDR::::::::::::L:GS::::RR::::::::::V::::S:::: NP3566A ::MA:T:::DR:::CT:T::LI::::::::::::::L::N::::I::::::D:::Q:::: HVO_2590 :::::::::::A::::::::I:::::::::::::R:::E:::H:::::::LD:::::M:D Hbo2259 ::MS:Q:::D:V::C:::::::::::::::Y:::::L:::::H::::V::P:::RE::HA VNG0479 MSSDDA::::AL::Q::RR:::::::::::::::R:::RA::H::::::::::::::RDD Hut0639 :::--------:G:Q:E:::::::::::I:::V:::::EN::R:::::::LD::NA:SE: consensus IRAA--VA---DASLDVRECDLADLDSVRAFADWFAAEYDALHVLCNNAGVMAIPRSETA #oth 13331122111424.21431...2.22.2311162344223111.2.......1..3..2 Hmu0259 :DRS:::::::N:D:::MA:::::::T:AD::EA:TSA:GE::::::::::::L::G::: hla1935 :::D::AGGDI:GE:::::::::S:::::D:::RL::D:::VD::::::::::::::::E rrnAC2140 ::E::::P:::N:T:::::::::::SN:AS:::GLR:D:::VDI:::::::::::::::: NP3566A :QD:TA:G:::E:A::::Q::::S:A::E:V:EDI:EN::::D::::::::::L::Q::D HVO_2590 ::DS:::P:::A:::TLS:L:::::::::R:::E::::HGS:::::::::::::::R::: Hbo2259 VQD::::::::::D:TLAKL:::::::::R:SE::HDTF:E::::A::::::::::R::E VNG0479 :V:E::LP:::G:::T:H:L:::A::::A::::::T::F:S::::A:::::::::::::: Hut0639 ::::::::::::P::S:M:L:::::::::S::ET:RT::SD::::S:::::::::::::E consensus DGFETQFGVNHLGHFALTGRLLDLLRET---DGETRVVTQSSGAHERGEIDFDDLQGERS #oth 1...3.1.1.....12.113.244.4421114122.2.12...2.24.121.3.134.42 Hmu0259 ::::R:L:I::::::T:::H:MEA:AA::::::-A::::::::::QN:::::E::::::: hla1935 :::::::::::::::::::::FS::KGAEGI::DA:I:::::::::Q::M::S::NW:E: rrnAC2140 :::::::::::::::::::H:::::GAA::::::S:I:::::::::M:::::::::R::: NP3566A ::::K:L::::::::::::::::::V:S::::::S::::H::::::F::L::::::R:Q: HVO_2590 Q::::::::::::::V:SA::FPT::D::::P::::L:AM:::L::::RME::::::::D Hbo2259 Q:::M::::::::::::::L:::R:::::::EA::::::::::I:QN::M::S:PMA:H: VNG0479 ::::::::::::::V:::AG::GV::R::::S:::::::::::::R::R:::E:::H:AE Hut0639 :::::::::::::::::::L:::R:::::::A::::I::::::L::::::::A::H::Q: consensus YGKWDAYAQSKLANLLFAYELDRRLRAAGI------DVLSVACHPGYAATNLQRRGPEAA #oth .1214..21...1.1..11..11.243234411111413.121...11111..3.22434 Hmu0259 ::R:S::S::::::V::G::::::ADE:::::::::::T:AV::::::DSD::::AG::G hla1935 ::::K::GR::::::::::::QH:ID::NREADTGVN:R:A::::::TD::::L:TAAES rrnAC2140 ::::S::G:::::::::::::Q:::GNH:WD:::::::::::::::::D:D::F:::REM NP3566A ::R::::G:::::::::::::Q:::T::D:T::::::TI::::::::::::::Y:::KED HVO_2590 :DE:::::::::S:::::F::::::T::::D::::::::::GA::::::::::F:::::S Hbo2259 :D::A::::::::::::::::Q:::ERV:EG:::::G::::G::::::::::::::::M: VNG0479 ::::E::S::::::::::::::::::::SA::::::S:T::::::::::::::L:::Q:: Hut0639 :DRF::::::::::V:::::::::::::NA::::::E:T:::::::F:::::::::::L: consensus GSTLRLAMMKLANAVFAQSAERGALPMLYAATAADVDGGEYVGPGGLLNMRGAPERQRSS #oth 125225432321.1221.1.24..2.1.1.21443161.2.21.2.122...3.442511 Hmu0259 AGAIGAVIAQA:::LV::::A:::::::::::HDGIS:::::::::::::::::AV:D:: hla1935 :NP:LKIG:R:::::LG:D:AI::E::::::::-:::::A:IE::::M::::H:TVG::N rrnAC2140 :::::T:A:GV::::::::::Q:::::::::::E::I::::::::::FD:::S::F:Q:N NP3566A :::::M::::V::::VG:::Q:::::L:::SV::G:G::::Y:::::::::::::::S:N HVO_2590 :::::YW:S::G::I::::::M::::L:::::SPA:ES::::::Q::FG:::T:GIAEP: Hbo2259 ::FV:KLG:G:::R:::::::M:::::::::::D::R::S:I::T::FG:::S:GTAA:: VNG0479 ::R:::LA:RA:::LVG::::Q::W:L:::::NPSI:::::I::::V:::::H::::QP: Hut0639 ::K:::W:::::::::::::AT::::::M:G:D:::A::::::::::M::::::VI:::: consensus DASYDEDTARRLWEVSEDLTGVDYDL------------ #oth 21131532.42..43.322.114133332212211111 Hmu0259 AR::NAA::S:::H::::::::E::FEVPAAAV::::: hla1935 :::::R:D::E:::Y:TEA::::FSV:::::::::::: rrnAC2140 :::Q::E::EQ::A::T:::::E::FERT::::::::: NP3566A E::::KRD::::::E::S::::T:SF:::::::::::: HVO_2590 :RAR:PE::A:::D:::E::DTRFR:A::::::::::: Hbo2259 E::H:::D:H::::L:::::::T:GI:::::::::::: VNG0479 AR:R:::::::::T::A:R::::F::PDPA:::::::: Hut0639 :R:::DEL::Q::D::V:::::S:::PDPQAPDATSAN