|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2094 | VNG1739 | Hbo2213 | hla1213 | HVO_2629 | NP4932A | Hut0018 | rrnAC0317 | Hmu2524 |
1358 | VNG1739 | 2089 | 1176 | 1264 | 1220 | 1181 | 1165 | 1071 | 1103 |
1507 | Hbo2213 | 1176 | 2097 | 1337 | 1427 | 1222 | 1179 | 1174 | 1192 |
1508 | hla1213 | 1264 | 1337 | 2105 | 1392 | 1199 | 1230 | 1169 | 1164 |
1544 | HVO_2629 | 1220 | 1427 | 1392 | 2078 | 1312 | 1222 | 1206 | 1185 |
1548 | NP4932A | 1181 | 1222 | 1199 | 1312 | 2090 | 1296 | 1262 | 1263 |
1543 | Hut0018 | 1165 | 1179 | 1230 | 1222 | 1296 | 2102 | 1393 | 1385 |
1554 | rrnAC0317 | 1071 | 1174 | 1169 | 1206 | 1262 | 1393 | 2084 | 1538 |
1527 | Hmu2524 | 1103 | 1192 | 1164 | 1185 | 1263 | 1385 | 1538 | 2089 |
280 symbols consensus MDRIPFGIRRLDSIIGGGAPPGSVVLLSGESGAGAREFMYTSALMNALAHAD-PELFDLY #oth .531.1.1411.2224....4.2...12..2...1...12.1.32.114541131.21.1 VNG1739 :AT:::::S::::R::::::E:::::::::A:::::::L::A:M:::V:T:::::::::H Hbo2213 :NS::::VS:::R::D:::::::::::V::P::::::::F:::T:::VYGT::DD::::: hla1213 :PSL:::VA:::::LE::::::N::::A::::::::::L::::A::::G::::A:::::: HVO_2629 :SQ::::VP:::::::::::::N::::A::::::::::L::::T::::S:T::A:::::H NP4932A ::::::::::::TTV:::::::::::::::A:::::::::::::L:G::RSN::D::E:: Hut0018 :E:::L::Q:M:::VN::::R:T:::::::::::::::::::::I:G::TG:::::H::: rrnAC0317 :::::::::Q:::::N::::A:::::::::A:::S::::H::::I:G:EQV::T::H::: Hmu2524 :::::::V:Q::TT:K::::T:::::V:::::::S:::::::::I:G:SAG:SD::Y::: consensus YGDLAADATPPDEVHYVSFTAGEEQLRREMSLTMDDEIVDAASEAIEFHDLSPEYFQLSP #oth ..23544144.321..2..123256143.233231122.24154413.2111331.24.. VNG1739 ::SPHGS:RQ:E:I:::::::N:AE:Q::IAF:::E:::A:GAD:VT:A::::::::::: Hbo2213 ::::HSESS::A::::I::::DKQS:S::::YVF:ESL::S:T:R:N:R:F:AT::RP:: hla1213 ::::P:::AL::::::L::::DTGA:T:::GY::A:::::::IDG:::R::::::::::: HVO_2629 ::S::DT::::P:I::::::::::Y:::::GY:::::V:ES:V:H::::::::::::::: NP4932A ::GVDDRS::::R:::::::D::RK::S::::AV::::::E:VGN:T:::::::F:R::: Hut0018 :::::::::L:E:I:::::S:::S:F:W:V:Q:I:::::E:GLQ:VT:::::THF:HE:: rrnAC0317 :::RSP::VA::::::I:::TN:S::VS::R:A:::DV::KG:R:V::::::ER::HI:: Hmu2524 ::SPT:::VD::A:::I::::SK:D:VD::R:A:::::::NG::::Q::E:TER::HV:: consensus VPREWYADETASITDLGARH-EREDVLEALGDYLSEHAAGNLVVIDSLTDLVSAVGDDME #oth 2..2..234332231.1723132331132113513221321..11..23..124633143 VNG1739 :::S::::KHQTVR:::NTGEDTR::::RFA:::D:::S:S:::V:::N::IGRRSS::A Hbo2213 I::::::G:ATTLQ:::Q:::N::S::T:::N::::::S::::::::I::::A::S:E:S hla1213 I::D::E:::::::E::D:G::Y::::T:F:::::A::DDS::C:::V:::::M:D::T: HVO_2629 I:::::LGQPTKLE:::H:::N::S::G:::ST:::::::::::::::::::AGQS:E:T NP4932A :::::::ER:Q:::E::GSE:S:KS:P:::::R:T::::::::::::IG::I:TSTG:LT Hut0018 L::D:::ER:::V:::RS:T:D::EL:S:F::LM:T:GPD:::::::::::I:TT:EEVT rrnAC0317 :::::::S::::::::R::::::::L:GT::MV:N:V::N::::::::S:::::M:EEI: Hmu2524 :::D::::A:E:::::RK:::::QGL:::::SK:::I:PN::::::::S:::G:I::::: consensus WSDISMVVKGLQKAAHRWGGLILAHVNRETLSDTRLGQLMDATDGTLQFEWESGGSTRAR #oth 12.143232.151.135.31.21212341223541315.42134.123.3..1..14.1. VNG1739 F::VV:TL:::R:::RD:S::::L:LT:DAVRSEEF:S::SSV:::V::A:::::NE:V: Hbo2213 :N:::::IR:IS::::::::::::L:G:D::ER:E:AH::::V::::::Q::T:::K::: hla1213 :::VA::M:::K:::YE::::T:VL::TDSIT:REF:A::::AG:::::T::::::Q::: HVO_2629 ::::A::I:::E::SYQ::::::VL:ST:A::K:E::V:KG::G:::L::::::::K::: NP4932A :G:VPVLL:::SR::YN:::::I:::SQ:A:T:Q:H:E:V:::::::L::::::::A::: Hut0018 ::::NY::::::::::S:D::::::::H::V:PE:::::G::VN::MR:::::::::::: rrnAC0317 :::::SL:Q:::::::Q::C:L:L:I:P::::TV:H:::V::SH::ME:A:::::::::: Hmu2524 :::::YL:Q::T:::N::N::::V:L:H::V:S::YA::T:::T:AMR:::::::::::: consensus TLVVQQFRGVLSRLEDEDIVRFETEIGDAGFDISDVRKIR #oth .11131.....211.311..1...11412.1.1....... VNG1739 :MF:RE:::::G:::ED:::Q:::::R:S::::::::::: Hbo2213 :::::E:::::::::S::::::::Q:H:G:::V::::::: hla1213 :MF:RE:::::::::S:N::::::::HEG::::::::::: HVO_2629 :M:::E:::::A:::S:N::Q:::::NES:L:V::::::: NP4932A :M::K::::::::I:A:::::::::::::::::::::::: Hut0018 :::IK:::::::Q:::::::::::::D::::::::::::: rrnAC0317 ::::::::::::QI::::::Q::::L:::::::::::::: Hmu2524 ::::S:::::::QI:::N::::::::::S:::::::::::