| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 1435 | hla1531 | Hut0980 | VNG1311 | NP4170A | rrnAC1088 | Hmu1796 | HVO_2814 | Hbo2552 |
| 832 | hla1531 | 1748 | 618 | 728 | 678 | 670 | 700 | 713 | 731 |
| 917 | Hut0980 | 618 | 1459 | 760 | 801 | 767 | 784 | 720 | 810 |
| 1067 | VNG1311 | 728 | 760 | 1437 | 852 | 915 | 902 | 828 | 798 |
| 1054 | NP4170A | 678 | 801 | 852 | 1532 | 960 | 1034 | 728 | 729 |
| 1085 | rrnAC1088 | 670 | 767 | 915 | 960 | 1526 | 1068 | 829 | 678 |
| 1118 | Hmu1796 | 700 | 784 | 902 | 1034 | 1068 | 1511 | 820 | 750 |
| 976 | HVO_2814 | 713 | 720 | 828 | 728 | 829 | 820 | 1476 | 851 |
| 917 | Hbo2552 | 731 | 810 | 798 | 729 | 678 | 750 | 851 | 1405 |
246 symbols consensus -----------------------------------MSD-PHDTLRADPDLAPLVEEHGEL #oth 11111111111111111111111111111111111253333451.4.252221223..3. hla1531 MVERFHLPNEKRAVSLSTCVSQEKLTPVSGPNRSP:NERVAA:::E:STM:R:IDR::R: Hut0980 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::GE:::NV::D::AM::::A::::: VNG1311 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::A::A::A::T::T::::LDA:::: NP4170A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::TA::::::::::V:E::I:R::A: rrnAC1088 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::EV::::::IG::::T:::: Hmu1796 :::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::::R::E::::G::::T:::: HVO_2814 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::DAYRE:::::N:GDV:D:::P: Hbo2552 :::::::::::::::::::::::::::::::::::---:-M:PI:N:EQ::::::::::: consensus TIEPADDLFERLVVSIVRQQLSMASAAAIRERLFDAV--EVTPAGILAADEDVLRDAGLS #oth 223.13.2.2.2211121..1.131.21132.211321131..42332115441.12.1. hla1531 :::::A:E:A::CT:::N::::T::::::H::FV:VLGGAP::DDV:::::VA::E:::: Hut0980 SV:::E:P:::::T::::::::::::D::E::::EHF::D:::TALRDVPVEQ:::V:V: VNG1311 AVT:H:::::::::A:I:::::TDA::T::::V::::::D::::::A:::PA:::::::: NP4170A :::::::::R::L::VL:::V:::::E:TKK:::::::::P::TAV::::TETF:E:::: rrnAC1088 :LD::S::::::::::L:::V:::::::T::::::::::T::::::KD::N:L::::::: Hmu1796 ::S::E:::A:ILT::::::V:::::::T::::::::::::::S:V::::D::::::::: HVO_2814 SLD::::P:::::::::N::::TTA::T::D::::R:::::::E::::V:::::::C::: Hbo2552 A::::::E:::F::::IN::::TQ:::::::::::RF::::::EAM:N:::TA:::V::: consensus RQKTRYVRNVAAAFRD--HDLTRAAFEDMDDEAVVAELTEITGVGDWTANMQLLFALGRE #oth 32.4612412.3.13311311232424333.321442..3.2.1.2...3.2.3.211.2 hla1531 GT:VE:L:EA::::::GDR::::EG:G:AS::::::A::::R:::E:::R:Y:I:::::: Hut0980 GR:GQTI::::S:WQA::::Y:Q:::DGRS::::ID:::D:S:I:P:::K:F:M:::::: VNG1311 ::::D::T:::::::E::::Y:::R:AELS:A::RE:::A:::::::::S:F:::::::A NP4170A :::AT:LH:I::::E::::GYD::Y::P::::::R::::D:::::E:::::::::S:::: rrnAC1088 :::::::NE::D::LE:::GYSLE::::AA::EIHE:::A::::::::::::::::F::K Hmu1796 :::::::N:::S::EE::RG:S:TY::::::D:::D:::S:::::E:::::::V:S:::: HVO_2814 N::VG::::::D::::::-G:SAESLRE:::GE::SA::::R:::::::K:F:I:V:A:: Hbo2552 S::IS:IQ:::T::QT::D:::::GMA:LT::D:LMR::::R:::::::K:Y:M:V:::: consensus DVFPVGDLGIRKGMEALYGDDM---TRAEMRERAERWRPYRSYASLYLWRVVD------- #oth ..1.11..11.212352345263213.22.333112.4....2112.1.13514331112 hla1531 ::L:L:::AV:::I:QV:N:GAEL:::::::NIGDA:::::::GTR:V:AEYES:::::: Hut0980 :::::E::::::::QTIFE::::::E:QA:VA:::::Q::::I::M:::::::::::::: VNG1311 :::::::::::T::Q::::A:T::::::::::I:DS:::::::::::V::AQ:A:::::: NP4170A ::::::::::::::R::LDE:L:::D::A:T:A::::A:::::::::::::NEPLDESVA rrnAC1088 :::::::::::::F::VV::GY:::S::::::Y::::S::::::::::::ASEDIAESVA Hmu1796 :::::::::::T::AS:VDPE:::::::::SAY::::E:::::::::::::EEDVEESVD HVO_2814 :::::E:::::R:::HVF:FEQDAVS:G:::::::::A:::::::R::::C::::::::: Hbo2552 :::::E::::::A:AE::RM:EN::D::V:VK:::A::::::V::R:::::::::::::: consensus ------ #oth 111233 hla1531 :::::: Hut0980 :::::: VNG1311 :::::: NP4170A EVVRRS rrnAC1088 E:VRED Hmu1796 E:VESL HVO_2814 :::::: Hbo2552 ::::::