| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2605 | rrnB0175 | HQ2269A | hla1049 | rrnAC2139 | Hut2302 | Hmu1479 | Hbo3155 | HVO_2521 | Hbo2902 | VNG0505 | HVO_0996 | rrnB0304 |
| 2015 | rrnB0175 | 2638 | 2356 | 1740 | 1655 | 1756 | 1751 | 1589 | 1628 | 1175 | 1249 | 1205 | 1194 |
| 1961 | HQ2269A | 2356 | 2650 | 1747 | 1589 | 1709 | 1718 | 1529 | 1587 | 1139 | 1214 | 1211 | 1173 |
| 1922 | hla1049 | 1740 | 1747 | 2663 | 1502 | 1608 | 1575 | 1599 | 1772 | 1183 | 1285 | 1273 | 1255 |
| 1914 | rrnAC2139 | 1655 | 1589 | 1502 | 2656 | 1728 | 1780 | 1708 | 1679 | 1157 | 1280 | 1172 | 1264 |
| 1968 | Hut2302 | 1756 | 1709 | 1608 | 1728 | 2683 | 2096 | 1724 | 1755 | 1195 | 1236 | 1177 | 1221 |
| 2056 | Hmu1479 | 1751 | 1718 | 1575 | 1780 | 2096 | 2684 | 1759 | 1846 | 1173 | 1337 | 1237 | 1233 |
| 1885 | Hbo3155 | 1589 | 1529 | 1599 | 1708 | 1724 | 1759 | 2621 | 1984 | 1187 | 1267 | 1259 | 1253 |
| 1986 | HVO_2521 | 1628 | 1587 | 1772 | 1679 | 1755 | 1846 | 1984 | 2592 | 1203 | 1242 | 1306 | 1262 |
| 1394 | Hbo2902 | 1175 | 1139 | 1183 | 1157 | 1195 | 1173 | 1187 | 1203 | 2662 | 1360 | 1463 | 1448 |
| 1494 | VNG0505 | 1249 | 1214 | 1285 | 1280 | 1236 | 1337 | 1267 | 1242 | 1360 | 2738 | 1441 | 1437 |
| 1474 | HVO_0996 | 1205 | 1211 | 1273 | 1172 | 1177 | 1237 | 1259 | 1306 | 1463 | 1441 | 2699 | 1504 |
| 1498 | rrnB0304 | 1194 | 1173 | 1255 | 1264 | 1221 | 1233 | 1253 | 1262 | 1448 | 1437 | 1504 | 2646 |
398 symbols consensus -------MNPLEIGLRLLAGVALILANGFFVAIEFALTRVRQFSESEFDG-G--PGLERA #oth 111222335442343.241.24.134.21..22..11..21.14121143541232.11. rrnB0175 ::::::M:E:::::::I:G:II::GV:AY:::::::::::::Y:K::::-:T::::::L: HQ2269A ::::::M:E:::::::IFG:II:::V:AY:::::::::::::YPK::::-:T::::::L: hla1049 MVPPVTAIP:G::A::VA:::::::I:AY::::::G:::L::YP:::M:-:T:::::R:: rrnAC2139 ::::::::Q:V:VTV:::::L::::::::::::::::::A::Y::::::-:E:::::R:: Hut2302 :::::::::S::LTI::::::F:::T:::::::::::::A::YT:E::V:D:SNA::R:: Hmu1479 ::::::::::P:::V::V:::::::::::::::::::::A:::T::::V:D::DAA:::: Hbo3155 :::::::::ST::::::V:::L:::::::::::::::::A::::::::VDGD::SR:::: HVO_2521 ::::::::::T:::I::V:::L:::::::::::::::::A:::T::::VDGD::SR:::: Hbo2902 ::::::::VD:ATVG:::::IV:LFG:AY::T::::M:::::::::::Q:S-::R::::: VNG0505 :::MSAGEITPVTA::IFG:I::LAG::::::T::::::::::D::A:QET-::A::R:: HVO_0996 ::::::::VGV:TA:::GG:LV:L:::A:::VS:::M:::P::D::A:E:S-::R:::L: rrnB0304 ::::::MPIS:VTW:::FG::::L:G:S:::TT:::M::::::E:DA:L:N:::R::::: consensus WEMTQDLEIYLTTCQVGITASSIALGIVAEPALAALFEPL---FENTTLAGVGAGS---- #oth .3..53..31.12..11.133.111.11...12113231411123533232524122231 rrnB0175 ::::T:::F:::::::W:S:T::::::I:::G::::I::V::::::::F:S::::::::: HQ2269A ::::N:::F:::::::W:S:T::::::I:::G::::I::V::::::::::S::::::::: hla1049 ::::D:::F:::::::W:SGT::::::::::GI::::A:::::V::::F:SA:::::::: rrnAC2139 ::::D:::::::S:::::::::::V::I:::::::I:::Y:::::SSV:::::V:G:::: Hut2302 ::::::::L:::::::::::::::V::::::::::I:::I::::H::V::SI:S:G:::: Hmu1479 :::::N::::::::::::::::::V::::::::::::::::::::::V::T::S:A:::: Hbo3155 :A::::::L:::::::::::::::V:::::::::::::::::::AG::::T::::A:::: HVO_2521 :::::E::L:::::::::::::::V:::::::::::::::::::AG::::TI:T:A:::: Hbo2902 :D::ER:::F:SG::L:::IC:VG::V::::::T:VLD:AVSALGLQS:S:T:SNGHTAL VNG0505 ::::DR::::::G::L:::VC:VG::V:::::::V::T:V:::::---FV:F::::IATL HVO_0996 ::::ER::V::SG::::::IA:VG::V:::::V::T:DAV:::LGG----:GA:::HTSL rrnB0304 :N::KR:::F::G::::::IC:VG::V:::::IT:VL::::::LGA---V::TG:GHTTL consensus --LLAFLIINLVHLTHGEQTPTYLGVERSKQVARYGARPLYWFAKLISPVIKVGDWVAKW #oth 224322322.24.1231..2.....1..116.24.2153113145432.3.531.33..5 rrnB0175 ::::G:::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::ILA:A:W:::S:::G HQ2269A ::::G::::::::::::::::::::::::::::Q::::V::::::ILA:A:W:::S:::G hla1049 :::::::L::MA:::::::::::::::::::::Q::::::::::W:::::::F::::::A rrnAC2139 ::AI:::L::::::::::::::::::::A:F:C::::T:::Y::WV:::I:::::G:::: Hut2302 ::II:::::::::::::::::::::::::RW:SK:::V:::::HW::::I:SL::GI::L Hmu1479 ::I::::::::::::::::::::::::::RM:C::::T:::::NH::::L:S:::G:::: Hbo3155 ::II:YG::::::::::::A:::::::::RL:C::::A:::::YLI:::L:SL::S:::: HVO_2521 :::I:Y:::::L:::::::::::::::::RM:C::::T::H::YVA:::L::F::::::: Hbo2902 AAVTSLGV:::L:::V:::A:::::I:::::::K:::PI:::WTRVF::::RLA::T::S VNG0505 SV:V:LAVM:VA::VLA::A::::::::A:T::H:C:PLH::WTRTM::I:RA::RI::A HVO_0996 SVG::LVV:::S:VVL:::V:::::::::RA::K:T:PV::GWT::MY:::V:A::L::R rrnB0304 SV:::LVVV::M:VII:::A:::::I::A:L::G::SG:::VWT::MY:::IAA:::::A consensus TLGLFGVEMTGAWLET-EEDVIE-----------TRADLRSRLGSVLEEGDLPEERREEV #oth 2.412.111121.3.31181533331111111112.4211422225153432251.23.1 rrnB0175 ::::::I:::Q::T::::KE::::::::::::::::::::N:::::::::E::A:::::I HQ2269A ::::::I:::Q::T::::KE::::::::::::::::::::T:::::::Q:E::AD::::I hla1049 ::R::::::::S:T::::GE:L::::::::::::::TQ::A::::MMK:V:::::::::: rrnAC2139 :::::::::S:::::A::V:S:::::::::::::S:GE::NE:::::DR::VSD:::::: Hut2302 ::K::::::::::::::::E::::::::::::::::::::N:V::A::::G:NQ:::D:: Hmu1479 ::K:::I:::::::::::Q:::::::::::::::S:::::NE::::::::::S::::T:: Hbo3155 ::Q:::I::::::::A::::A:::::::::::::S::Q:::::S:L::R:E:SG::HD:: HVO_2521 ::K:::I:::::::::::T:::::::::::::::S:GQ::E::H:L:Q::E::::::D:: Hbo2902 L:SVI::TI:RS:A:E::MEGEKPG:::::::::::QE:L:QM::I:T:M:::TD:K::I VNG0505 I:S:V:::::RS:T:EGA::P:D:::::::::::G:S:::::M:DL:SGTGV:D:::::: HVO_0996 L:S:V:::I:RS:Q:A::L:DEDGDGSAGEGTRL::GEV::QM:D::SQ:S:::D::::: rrnB0304 L:::::::ISRS:T:S::AESAPAT::::::::::::E:::EM:ES:SRL:IS::::S:: consensus LNALDIGEQPVREVMVPADDIVALSTTDDPEENLERIRETP-HTRYPLVGESLDDFRGIV #oth 22.252155424122235221112.2332643133334561112.1..113424324.22 rrnB0175 M:::T::::S:::::::TEE:I:I::E:SA:A:F:KLEQH::::::::I::D:TE:H::: HQ2269A M:::T::::S:::I:IS::::IS:::E:S::S:FQKLE:Y::::::::I:GE:S::H::: hla1049 :::::VD:LA::::LT:::E::S:::AASV::::D:::D::::S:F::::DEMT::E::: rrnAC2139 :S:FRV:DRE:N:::::RE::::::P:::DAT:A:::A:::::::::::::A:EE:L::: Hut2302 M:::A::::::Q::::D:EE::::::AV::Q::FRLME:H::::::::I:DD:A::E::I Hmu1479 M:::Q:::::::D:::ST:E::::::AV::A::FR:MADQ::::::::::GE:T:::::L Hbo3155 :G::KA:TTE:::::::KS:::::::DASVA:::D:VT::::::::::::SN:ETVE::: HVO_2521 :::::VD:LSIS:I:I:SS::::::::AT:G::F::::N::::::F:::::::T:::::: Hbo2902 :::AA:DHVHAGDI::DRE::::V::ERSV:A:::T::SNS:Y::F::::::V::II:TI VNG0505 IG::::DRI::GDEA::V:EV::V:::::L:T::D:MADS:::V::::::::M:::::V: HVO_0996 ::::R:::L:::D::::::HV::::ADATTD:S:::V:SN:Q:S:F::::D::::V::V: rrnB0304 I::::::AT::S:I::ARS::::::::::F:T:MD::DGM::YV:F::IED:V:S:I:V: consensus YAPSLIRNREELASGET-----AFEELAAPPMTLSPDTDVSDAIDQFQAERQELALVIED #oth .51445464151572651111141522.412234322441.122.21.214..2131534 rrnB0175 :S:V:FSH:::::::NG:::::::T:::::T:::::::::::::::::T::::M::I::: HQ2269A :S:A:FSH::Q:SNDND::::::LI:::::T:::::::::::::::::T:Q::MG::::: hla1049 ::::I:S:F:A:RRE:::::::T:A:::::::AI:AM:S::::F::::::S::::::::: rrnAC2139 :I:A:VDE:::Q:GDGGLLDRIDL:AV:S:R::M::::T::::::::::::::::F:L:: Hut2302 :L:A:S:Y:::::T::V:::::D:A::::::::::::V:::::V::::::N::::::::: Hmu1479 :F:VFA:H:DD::E:IV:::::D::A:::::V:::::V::::::::::::N::::::::N Hbo3155 :V::VVARI:::KG::::::::::SDI::::::V:A::S::::::R:::::::::V:F:: HVO_2521 ::::I:D:F:A:RA::R:::::S:D:I:::T:::AA::N::::F::::::D::::::LR: Hbo2902 :LM::::SIDD:RE:A::::::D:SDI:MS:::VP::IP::EL::E:::AD::I:F:V:S VNG0505 :L:EAF:DLDD:RD:TL::::::L:DV:H::LVFDA:MS::::::R:::::::::F:TDA HVO_0996 :::TVLS:IDR:Q::DR:::::RLDDI::::LSVPS:LS:::L::R::E:N::::M:RDP rrnB0304 :::TVLH:Y:M:Y::A::::::TL::::T::L:VAAK:TI::F::RC:::N::::::VA: consensus G--EVVGLVTATDALEAITGDLEDPLDADA-------- #oth 221422.12.21.22.313.224..3.85677545231 rrnB0175 :::::I::::V::L::T:I::I:::::Q:SADVLE::: HQ2269A :::::T::::V::L::T:I::I:::::Q:NPNVLS::: hla1049 ::::::::I:::::M::VM:Q::::::::NL::::::: rrnAC2139 :::D::::::V::L::EVV::IQ::M::E:GVD::::: Hut2302 :::::::M::V::L::SVM::ID::I:IRQRFEAGET: Hmu1479 :::::::M::V::L::S::::I:::I:VEDSSGAAEDD Hbo3155 :::D::::L:::::::TVM:E::::::::FRAERTPA: HVO_2521 ::::::::L::::::::VM:E:D::::---:::::::: Hbo2902 D::RT:::::::::F:::::E:R::M:KA::::::::: VNG0505 DTGG:::M::I::V::::::EV:::Y:EA:EKSQS::: HVO_0996 ESGS:::::::S::F:S:::Q:Y::::LG::::::::: rrnB0304 D::DI:::L:::::F:::::E::::M:RA:E:::::::