|
Pairwise sequence scores | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1671 | HQ3463A | Hut2180 | Hmu2075 | HVO_1851 | Hbo1727 | rrnAC1686 | Hut0087 | HVO_2230 | Hbo1941 | hla2503 | VNG0102 | Hmu0836 |
617 | HQ3463A | 1991 | 536 | 483 | 490 | 522 | 489 | 544 | 423 | 478 | 471 | 448 | 465 |
697 | Hut2180 | 536 | 1755 | 480 | 562 | 592 | 539 | 430 | 481 | 479 | 515 | 503 | 550 |
832 | Hmu2075 | 483 | 480 | 1681 | 697 | 699 | 627 | 737 | 623 | 715 | 683 | 697 | 661 |
935 | HVO_1851 | 490 | 562 | 697 | 1664 | 1109 | 665 | 706 | 622 | 752 | 665 | 705 | 708 |
959 | Hbo1727 | 522 | 592 | 699 | 1109 | 1673 | 697 | 742 | 630 | 826 | 705 | 745 | 747 |
1014 | rrnAC1686 | 489 | 539 | 627 | 665 | 697 | 1713 | 897 | 737 | 799 | 761 | 732 | 809 |
960 | Hut0087 | 544 | 430 | 737 | 706 | 742 | 897 | 1687 | 751 | 856 | 803 | 748 | 783 |
1052 | HVO_2230 | 423 | 481 | 623 | 622 | 630 | 737 | 751 | 1895 | 899 | 829 | 747 | 809 |
1140 | Hbo1941 | 478 | 479 | 715 | 752 | 826 | 799 | 856 | 899 | 1768 | 884 | 852 | 884 |
1177 | hla2503 | 471 | 515 | 683 | 665 | 705 | 761 | 803 | 829 | 884 | 1711 | 1193 | 1204 |
1142 | VNG0102 | 448 | 503 | 697 | 705 | 745 | 732 | 748 | 747 | 852 | 1193 | 1711 | 1268 |
1244 | Hmu0836 | 465 | 550 | 661 | 708 | 747 | 809 | 783 | 809 | 884 | 1204 | 1268 | 1717 |
291 symbols consensus ---------------------------------MTYDAVVFDNDGVLVG--LTALDVLRE #oth 1111111111111111111111111111222334612212..3...14412435664354 HQ3463A MTESETDAATRAQSEKDSETNTAAHSNSETPTTE:TF::L::M:::ILKGRGADPI:HKQ Hut2180 :::::::::::::::::::::::::::::::::VS:::I:::L::::LTGYH::PA:Y:: Hmu2075 :::::::::::::::::::::::::::::::MAPA::::::::::::IE::P:DRGR:AR HVO_1851 ::::::::::::::::::::::::::::::::::C::::I:::::::TK::P:L:E:Q:: Hbo1727 ::::::::::::::::::::::::::::MRHAR:C::::I:::::::TR::P::TT:H:: rrnAC1686 ::::::::::::::::::::::::::::::::::G:ES:I:::::::LT::::DM:AHYV Hut0087 :::::::::::::::::::::::::::::::::-M:E::::::::::ME::::EMALH:R HVO_2230 :::::::::::::::::::::::::::::::::-M::S:I::H::::TT:::V::PP::D Hbo1941 ::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::::I::::::::R:::SP:A:::: hla2503 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:::::::::::::R:RF::::D VNG0102 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:::::::::::::R:RY:::ER Hmu0836 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:::::::::::::R::F:::QD consensus ATRDAFEEFGVTDP-----DPEHVEAMTIGATPREVRAICEQYDLDPEAFWRARDEAAAA #oth 144421434317431111145652263663553763643369222236412561177536 HQ3463A :FE:IL::QEWGQSWEQSLSQS:RS:FEQYEYTE:FVTA::AI:V::V::YA::E:RS:Q Hut2180 :A:ET:AD:D::VG:::::AVP--DGLVNPDDTG::::F:AHH::P:::::GY:EH:STV Hmu2075 :VS:T:A::D::VD:::::EARAR:MVAA::V:D--GDFERE:GI::AR::ER:EAI:SE HVO_1851 :V:R::D::D:-E::::::TT:T:DGVIN:GLT:-L:R::AVH:VPVDD::SHHETH::: Hbo1727 :V:A::S::::-E::::::TT:G:DSVIH:SFA:-:QR:::IH:V:Y::::PR:EAN::: rrnAC1686 GA:Q::::L::VS::::::STA:::::S::V:VP:LTD::T:::I:::R:F::::::LT: Hut0087 :A:::::AV::A:::::::AE::::::S::V:VPKLD:V::Y:G:::PE:::T::NLM:R HVO_2230 ::W:::D:L::S:::::::::D:::QVV:HV::ED:::AA:P:G:::::LF:V:::RQS: Hbo1941 :S:A:::AV::::::::::AA::::Q:ML:V::AD::EVS:V:S:::D:::A:::G:::D hla2503 ::::::::C::EE::::::::DD::R:::::::GS:GTV:QT:::::GS:::T::DVVSK VNG0102 ::EET:RR:N:D::::::::::D::::::::::KT:GDV:SR:GIS:KD::PE::R:LTE Hmu0836 ::QET::A:::::::::::::N:::N::V::::HQ:AT::G::::PR:E:::::E:KMVE consensus AQRAAIRAGRKTPYDDVDALDDL--DAPLGIVSSNQQATVDFVLDHFDIGDRFGTAYGRE #oth 52654435.328312.433196112465512..2.22411434323236545.34121.4 HQ3463A RIVDR:AD:HRGV:S:I:::NT:AGEMT::L::N:YHPA:Q::V:::::-:::DHVR::D Hut2180 LENDR:I::ERE:F::::V:PS:AEETT:::::N:RHG::R::REY::W::A::AVR::A Hmu2075 Y::Q:::S:E:AL:::S::VTA:::PHRT:L::N::H::IE:I:::H:L:RH:E:::::V HVO_1851 T:::CLEN:T:PL::::A::::I:::H::AV::N::H::IEHI::V:::::::EV::::D Hbo1727 ::A:::ER:E::L::::SV:S:::::RTM:V::N::HE::ETI::A:ELR:Q:EV::::S rrnAC1686 V:::L::::E:Q::A::SV::R::::C:::V:::::RD::A:AFE:::::HY:D:VWA:: Hut0087 R:KE:::R:E:GV::::T::AA::::R:A:::::::::::E:G::A::LAQH:EIV:::: HVO_2230 :::R::AD:::V::::F:::RRI:::::M::::::::::I:::V::L:AA:L:::::::: Hbo1941 ::ISEM:D::LSC::::A::EHI::R::R::::T:::E:I:A::::H:FSHL:A:::::: hla2503 ::QQEA:E::::::::L:E:QS:::EVEM:::::::::::::LVN:::GFE:::A::::: VNG0102 :::DEV:E::::L:::L:T:H::::NVNM::::::::::::::::::GVR:L::A::::: Hmu0836 ::QEEA:::::R::::I:T::G:::::AK:::::::::::::L::::SVR:H:::::::: consensus PTIESLRRRKPDPHYLERALADLDAE--SALFVGDSESDVRAAERAGIDSAFIRRPHRAD #oth 123413432..512.1241222.325114411...243.141.42..4111122.21264 HQ3463A IGVDGF:::::::::::E::DA:G:::::GVY:::RGT::V::H:::LE:V:L::::NTV Hut2180 ::LDGYD:M:::::::GHTIDA:EV:PTET:::::RL:::ET:D:::T:::LLV:DDDRP Hmu2075 ::::GA:::::::S:I:A::D::GTR:::::Y:::::K::V::Q::::::::L::D:::: HVO_1851 ::V:GA:VK::::::I:::MGE:GVD:::::Y::::NV::V::D::::::::::::::DG Hbo1727 ::V:GY:N:::S:::::::IDE:::::::V:Y::::NV::L::T:::A::::::::::D: rrnAC1686 ::V:::::K::R:Y:I:::MD::NVS::N::::::N:::IE::H::::::::::::::V: Hut0087 ::V:::::K::A:Y:::A:::::GTT::D::Y:::::T::E::HA::::A::V::::::G HVO_2230 :SMT::H:K::E:Y:::::M:::GV::::P::::::D::IA:::A::V:::::C:G:::: Hbo1941 ::::::::K::E:::::::M::::::::T::::::::T::L::H::::::::::::::S: hla2503 :::H::QL:::N:::I:Q::G::::G::N::::::N::::::::N:::::::::::::R: VNG0102 :::Q::E::::NS::ID::::::::D::T::::::N:::I::::N:::::::::::::ES Hmu0836 :::Q::D::::NS:::D::::::::D:::::::::N:::I::::N:::::::::::::T: consensus TELDATPTYEIDSLDDLHDICG----------------------------- #oth 652436.233235.5225534465643431222222221111111111111 HQ3463A AT::TA::AS::D:R::PRVLEQIK:::::::::::::::::::::::::: Hut2180 :G-:PD::HV::::R::EPLASDGY:::::::::::::::::::::::::: Hmu2075 LD:S::::::VAD:YE:A:RL:VRIE::::::::::::::::::::::::: HVO_1851 YQ:A:E::::L::::E:LAV:-::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1727 YQ:A:N::::VE::::VVA::-::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC1686 :Q::V::DHDVSG:E:VVHLASRRSGSD::::::::::::::::::::::: Hut0087 EN:SV::A::::G:AAVPR:LEGELPASD:::::::::::::::::::::: HVO_2230 HTPTPD::H::AG::::LELD:VPVAAGEAGASAPSDPAADGGREGGASSR Hbo1941 :::::S:::::ET:Y:I:A:D:VPVADAAADGGTEGKR::::::::::::: hla2503 W::NVW::W:::R:S:::::V:::::::::::::::::::::::::::::: VNG0102 W::N:W::WD::C:S::::::E::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0836 W::NVW::WD::::S::::::RT::::::::::::::::::::::::::::