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8 genomes BUD0854 10 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0925

rrnAC0905

HVO_1704

Hbo3132

Hmu1585

Hut2583

hla0363

-

HQ2546A

HQ3513A

HQ3524A

Pairwise sequence scores
Consensus score3035 HQ3513A HQ3524A Hut2583 HQ2546A VNG0925 rrnAC0905 Hmu1585 hla0363 HVO_1704 Hbo3132
308HQ3513A 1409 1391 290 255 225 262 266 300 252 262
558HQ3524A 1391 2943 553 414 381 487 520 525 450 445
2222Hut2583 290 553 3031 1757 1792 2184 2107 2030 1974 1965
2249HQ2546A 255 414 1757 3131 1677 2067 1952 1920 2189 2214
2059VNG0925 225 381 1792 1677 2633 1868 1857 1808 1907 1827
2564rrnAC0905 262 487 2184 2067 1868 3067 2464 2268 2310 2327
2511Hmu1585 266 520 2107 1952 1857 2464 3079 2245 2199 2211
2431hla0363 300 525 2030 1920 1808 2268 2245 3099 2294 2131
2540HVO_1704 252 450 1974 2189 1907 2310 2199 2294 3075 2405
2545Hbo3132 262 445 1965 2214 1827 2327 2211 2131 2405 3109

418 symbols
consensus       --------MRADICVVVPTIREYECMRAYFENARDHGFDLDRLFVVLVTEDFCDT---DE
#oth            111111124662122332112433343414412262223321242222222322211144
HQ3513A         ::::::::-----------------------------------------------:::--
HQ3524A         :::::::MS:KS:SF:TT::SQPTFFED:I::IIENDHS:::FEF:T:GDLSTP:SVR:Y
Hut2583         :::::::MTTQ::::::::::NH:FL:::A::::K:::::::::::::::::::::::AA
HQ2546A         ::::::::::S::::II::::T:DR:KS::::::N::::::::::L:::::D::V:::SG
VNG0925         ::::::::-----------------------------------------------:::--
rrnAC0905       :::::::::T:::::M:::::NH::::S::Q::::::::::::::::I:::::::::::A
Hmu1585         ::::::::-MT::::::::::::::IE::V::::R::::T:::SF:::::::::::::::
hla0363         MEERRPDAASG::::I:::::::::L:E:VA:::E::::VS::HF:::::::::V:::::
HVO_1704        :::::::::N:::::I::::::::::::::D:::A::::::::::L::::::::::::EG
Hbo3132         :::::::::KQ::::::::::::D::::::::::::::G::::::L::::::::::::::

consensus       MASMLDEEGVDGAVFDGTAREEWFEAHGIGEYDHLIPAASHAQTSFGLLYMWAND-FEYG
#oth            255233442352423234323413264354426233143122322212123224543342
HQ3513A         -------------------------------------------------------:----
HQ3524A         CEGLS::YDTTVRYVGVQDQID:M:SR:LERL:EYL:YN:IQRRNI:Y:QASEAG:ADVI
Hut2583         :EA::E:::LA:::::::D::D:::E:::A::A::::D::::::::::::L::HER::::
HQ2546A         :KQ:::TA::::::Y:E:R::A::D::ELSQ:I:::::K:::::::::::L:::EQ:TQ:
VNG0925         :RDL:AA:D:A::::::A:::Q:YDD:D:::::::V:::::::::::::::::H::::::
rrnAC0905       :EQ:::::::::::Y::::::A:::N::TS::S::::E::::::::::::::::::Y:::
Hmu1585         ::ALI:DL::::E::::SR:T::::RQ:A::::::::E::::::::::::::::::::::
hla0363         :Q::::DL::S:K::::SR::::Y::NEVA::G:VV::::::E::::::::::DES::::
HVO_1704        ::::::D:::S::::::::::::YDD:D:S::S::V:::::::::::::::::HSE:D::
Hbo3132         :::::E::::E:::Y::::::::::N:DL:A:T::::E::::::::::::::::PR::R:

consensus       VFIDDDTLPHDDWDFFGRHMENLDREGEIESVSSDERWVN----VLYQNADEHGLYPRGY
#oth            323111232232612233237224533433614223312111113222532433212112
HQ3513A         ----------------------------------------::::----------------
HQ3524A         :SL:::N:AQ::D--IAGDFGTVGETQSVLE::APNN:Y:SASMME:EQESSRDI:H::F
Hut2583         ::L::::A::::I:::ET:LD::AY:::LTA:E:::Q:::::::::HEAE:---::::::
HQ2546A         F::::::R::SE::::A::LH::::TDA::::H:::::::::::::::DI:N::::::::
VNG0925         :::::::::::E:::::::L:::HH::PV:::::::::::::::::::S--DSA::::::
rrnAC0905       ::::::::::E:A::::T::S::AF:::::T:::::Q::::::::::::E::::::::::
Hmu1585         ::::::::::::V::::T::R:::HD::::Q:R:::Q:::::::::::S--D:D::::::
hla0363         L:::::::::::E:Y::::::::GF::A::R::::KQ:::::::::::::::::::::::
HVO_1704        ::V::::::::E::::::::A::::TD:V:::::::::::::::A:::::::::::::::
Hbo3132         :::::::::::E::::::::::::Y:::L:::R:::::::::::::::::::::::::::

consensus       PYSAMDETVETGTAEVD--DVVASQGLWTNVPDLDAVRILMDGDLEGQAQTRTTKEDFGG
#oth            1122221354345644521612222111221..1.1111.11.11511121115642136
HQ3513A         -----------------::-----------M::V:VITH:ER:-----PRATSV::R:NN
HQ3524A         :::RR::EQGYSFT:RNR:M:MIRA:::LD:::V:VITH:ER:-----PRATSV::R:NN
Hut2583         :::::::ERTVT:EH::::S:::::::::::::::::::::::::N:::T::::TG:::E
HQ2546A         :::::N::I:::QHQLT::::::::::::D:::::::::::::::H:::::::KQSH:D:
VNG0925         ::A:::::TT::Q::T:::H:::::::::::::::::::::::::R:::::::ETA::DR
rrnAC0905       ::A::::::A:EATQ:N::::::::::::::::::::::::::::Q:::::::SGA:::D
Hmu1585         ::A::::::::E::H::::E:::::::::::::::::::::::::Q::::::::S::Y:T
hla0363         :::::N:::::::V::ESGE::::::::::::::::::::::::::::::::::AD:::S
HVO_1704        :::::::::::::R:LR::::::::::::::::::::::::::::::::::::DFD::D:
Hbo3132         :::::::S:::TERD:E::N:::::::::::::::::::::::::::::::::E:S::T:

consensus       DFVA-APGQYLTVCSMNLAFRREVIPAFYQLPMDDN--EWDVGRFDDIWSGVFLKRAADV
#oth            111.13323111.111.1..21112.11112..1.11141211......1.321111213
HQ3513A         RL::LDNETFCP:NTQ:T::HTDLM:LIHTI::G:EVEGMEIS::::::L:F:AEKILQE
HQ3524A         RL::LDNETFCP:NTQ:T::HTDLM:LIHTI::G:EVEGMEIS::::::L:F:AEKILQE
Hut2583         :::::GREN:::::::::::::::V:::::F:::::::P::::::::::::LL:::::::
HQ2546A         ::I:::::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::::::::I:::::::I
VNG0925         ::::::E:D:::::::::::::::::::::F:::::::A:::::::::::::V:::::::
rrnAC0905       ::::::E::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::C::
Hmu1585         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::R::::::::::::L::::::::
hla0363         ::::::RDN:::::::::::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::C::
HVO_1704        :::::E::::::::::::::E:::::::::::::::::::E:::::::::::::::::::
Hbo3132         :::::D::::::::::::::E:::::::::::::::::::S::::::::::::::::::L

consensus       LGGRIYNGYPLCEHNKAPRSTFDDLANEVAGLELNEHVWEIVDDAGADADTYAEVARAMA
#oth            2114243.4.112.2112121131.51.13.11...131332232353232132223132
HQ3513A         M::TVAY:S:VSI:DRNRHNLNRE:EH:AI:IR:::VIVD:LE:IKISGS::P:CY:DLI
HQ3524A         M::TVAY:S:VSI:DRNRHNLNRE:EH:AI:IR:::VIVD:LE:IKISGS::P:CY:DLI
Hut2583         ::::::::A:::D:::::::::G::::::::::::::::KL::R::DN::S:::::::V:
HQ2546A         ::KELIS:::::I:E::A:::::::M::AP:::::::::S:I::VS:::T:WT:A:T:::
VNG0925         V::D::::A::::::::::::::::::::::::::::F::E:AA:DPATE:::G::E:VG
rrnAC0905       ::KQ::::D:::::::::::::S::T:::H:::::::::::::E::::::S::::FD:I:
Hmu1585         ::KQV:::D:::::::::::::S::T:::H:::::::::::::EV:D:::S::G:F::::
hla0363         ::K:::::G::::::::A:::::::H:::::::::::L::LI::::::::D:VA:YD:::
HVO_1704        ::KD:VT::::::::::A:P:::::N:::P:::::::L::V::A::G:::S::G:FE:::
Hbo3132         :D:EVLT::::::::::::P:::::N:::P::::::::::V:::::S::T:WT:A:E:::

consensus       DALADGDFDE--YENGAFLNYCGEYMLDWLDCLDAL----A-RE-PAA--A-----DD
#oth            3324323434112412211322113231.24112312345345583341131111132
HQ3513A         EKFRQQVRS:GS:SLQ:Y:KEVLDG:EV:A:ACNEI::::-:--:---::-:::::LY
HQ3524A         EKFRQQVRS:GS:SLQ:Y:KEMLDG:EV:A:ACNKI::::-:--:---::-:::::LY
Hut2583         EEFQTSAD::::W::AD::A:::::LD::V:::::::DAD:D:REA:V::I:::::AE
HQ2546A         T::SE:::ER::LT::::::H::::W::::C::EK:SETT:PI:HTPH::TDTARVGE
VNG0925         RR::::EY:S:::N::::::E::::L:::VA::::::::::D::IA::::::::::G:
rrnAC0905       T:M:::::SD::W:::::::::::F:::::E:::E::DAA:TEQV::T::::::::::
Hmu1585         R:::E::::D::W:::P:::::::::::::S:::EI:DPGSVS:K:::VP::::::::
hla0363         :R:T:SE::::::R::::FTHV::H:R:::::::::::::-::RT::V::::::::::
HVO_1704        :::::::WSD:::R::D:F::V::H:R::::::::::::A:P:AAAP:::-:::::::
Hbo3132         ::::::::AK::WN::::::H:::FWR:::A:::DIEARVGVGSG:VT::::::::::