| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3999 | HQ1952A | Hut1044 | HQ2351A | HVO_1137 | Hbo0420 | hla1283 | VNG0615 | rrnAC2510 | Hmu2899 |
| 1994 | HQ1952A | 3995 | 1483 | 1723 | 1694 | 1749 | 1496 | 1595 | 1584 | 1640 |
| 2451 | Hut1044 | 1483 | 3990 | 1890 | 1971 | 2032 | 1888 | 1900 | 2075 | 2057 |
| 2493 | HQ2351A | 1723 | 1890 | 4034 | 2260 | 2471 | 1750 | 1825 | 1905 | 1954 |
| 2787 | HVO_1137 | 1694 | 1971 | 2260 | 4044 | 2635 | 1884 | 2016 | 2104 | 2158 |
| 2738 | Hbo0420 | 1749 | 2032 | 2471 | 2635 | 4008 | 1828 | 1915 | 2061 | 2054 |
| 2585 | hla1283 | 1496 | 1888 | 1750 | 1884 | 1828 | 3967 | 2375 | 2128 | 2203 |
| 2759 | VNG0615 | 1595 | 1900 | 1825 | 2016 | 1915 | 2375 | 4028 | 2399 | 2417 |
| 2953 | rrnAC2510 | 1584 | 2075 | 1905 | 2104 | 2061 | 2128 | 2399 | 4009 | 2929 |
| 2916 | Hmu2899 | 1640 | 2057 | 1954 | 2158 | 2054 | 2203 | 2417 | 2929 | 4021 |
560 symbols consensus ---------MDSWKRRLGLYLAGLAGLMLGFAAAYQWGMAVFEGDPRTFIEALRVVVETF #oth 123223343444331.454135334534252243.422245122734254412321113. HQ1952A :::::::MTRFG:RQ:FI:S:F:V:L:V:IYSLL:::AIFR:::VNI:IFQS:QT:I:I: Hut1044 :::::::::-M:RR::AYY::GAF:AVTILYTI::GA::::::SAS::LT:S:L:::QS: HQ2351A :MASNTQQPVSHTR::::::ILTASISIIL:T:L:::S::T:::ISVSW::::H::I::: HVO_1137 MSISGDGPGLSKA:::::R::::AGL:::T:SI::::AAGF:A:EDI::LQ:VH:::::: Hbo0420 :MVDGPAETLSGA::::V:::S:V:V::::Y::L::::::T:::TSVSY:D::H:::::: hla1283 ::::::::::::::::V:G:S:FVLFVLIFT:VV:RY::R:Y::::::M:::::FSI:M: VNG0615 ::::::::::NK:Q::TAA:SL::L:::AA::VG:YY::RL:::::K::VHSF::::::: rrnAC2510 :::::::::::T:L::TL::IVA:G:II::Y:F::DY::::::NN:QP:LRS:::::::: Hmu2899 ::::::::::::::::TA::VV::I:V::::TLV:DY::SA:D:R::::L:::Q:::::: consensus TTTGYGEDAP-W-ETPEMNLLVIVMDLTGVVLIFLALPLFLFPLFEEALATTPPTT--TD #oth ..1.1.21255.152431322424.322.1432131..2224.14121342421523443 HQ1952A ::A:F:G:TQY::N:AP::::::G:N::::L:V:::::V:AI:::QQ::ENN:QQS:::T Hut1044 :::::::::AA::T::Q:R::A:A:QV:::FFV:M:::::VA:WI:QR:T::V:DSI:E: HQ2351A :::::::::DQ::SSTPLLV:S:L:Q::::AF::TT::::VV::V:Q::ERS:::::::T HVO_1137 :::::::QTRF:VDH:PLLA:S:L:Q::::TTV::T:::::V::V:D::R:A:::A::ST Hbo0420 :::::::::AR::T:DA:K:IT:P:MVS::TV:::T:::::V::V::::R:A::A::::E hla1283 ::::F:G:S:::::SQQL:AFIA::::V:M::LIG:::VVVT::L:::FS::V:RSLDE: VNG0615 ::::::S::::::A:::::VF:A:::::::A:::M:::A:V:::M:D:F:::V:Q:VVD: rrnAC2510 ::::::S::::::S:T::R:::::::I:::::::::::VL::::::::M::KA:N:VENG Hmu2899 ::::::S::K::::S:::L:::T:::::::::::::::AL::::::::IS:NV:::VKN: consensus ISDHVVICSFTPRGEALVDELDSRDVPYVIVEPDRDRATELYEDGYEVIHGDPESVDGLE #oth 531.11115222.443.2611336223111214.123162134414512211.13333.4 HQ1952A ::::II:::YNS:ENV:RS::EAA::::::IDT:AETVL::NNN:V:A:C::::QEQA:K Hut1044 AD::::::GY:::T:M:I:::RMLEES::VI:::::T::DY::E:IA:M::::::I:S:T HQ2351A :E::::VSA::D::AV:IN::Q:QGISH:VI::::N::V::TQQ::::::::::A::T:A HVO_1137 R:::::::T:::::D::::::::M::::::L:A:::::E::HGA::D:V:::::D:ES:: Hbo0420 QT:::I:::::S::DT::E::E::G::::V:DE::ET:QR::AEE:::V::N:::::T:: hla1283 L:G:::V::D:S:SA::IE:F::HEI::A:::::A:::VR:::A:RT::RA::::TE::A VNG0615 Y:::::V:TY:S:AG:::AD:E::::A::::::::EQ:I::::::VD:V:A:::::S::R rrnAC2510 L:::::::Q:S::::T::T:::TW::D:::::::::L:ND::::::Y:::A::Q:::::: Hmu2899 :E::::::RY:::::T::G:::AWG:DH:V::S::E:::D:::::HR:::A::Q::E::R consensus AANLADARALVADVSDEVNASIILAARELAPDVRIISVVEDPDRADYHRYAGADEVVSPR #oth 3.2334.3.111.33.3312112.2121253234211221233334..31....5.32.. HQ1952A :::ISA:Q:::T::::TE:IPV::T:K::EE:L:::::A:NEQD:E::::::::R:IR:: Hut1044 ::GIE:::::::::N:::::::A::VDQ:::ET:T:TF:::ATL::::::::::Q:FT:: HQ2351A N::VST::::I::GD:RR:::V:::::::TSEL::V:FA:::QVS:::E::::::::::: HVO_1137 :::A:E:L:I:::DD::T::::::::KQA:::A:VV:LI::::V::::::::::R::::: Hbo0420 :::AE::M:::::DD::T::::::S:KQA:::LHV::LI::GTLS:::K::::::::::: hla1283 ::::P::::::T::::Q:D:::V:::K::S:E::V:::::::E:ER:::L::::::L::: VNG0615 G:G::S::::::::::R:D:::V:::::ANE::P:V::::::::IP:::L::::D:L::: rrnAC2510 R:H:SS:::::::A::Q::T::::T:::VDES:QT::::KE::::K::DL::::A:L::: Hmu2899 N:G::::::::::AA::::T::V:T:::VDDS:STV::::E:::ER::DL::::H::::: consensus RLLGESLASKATTPISTDLGDAVEIGDDFEIAELPVHRGSDLVGTTLAESGIRERTGVNV #oth 521.21..411133235445321212231332.331341.513.511231412333.111 HQ1952A QA::NA:::R::L::TQK:LQT::LS:E:N:S::RIEDD:E:A:Q::::LKLQ::M::TI Hut1044 H:I:::::Q::::AVTDEVS:::::::EL::V:I:IEA::::::::IG::R::::::A:: HQ2351A Q:::::::Q::AS::ASKFN:::P:::::::::VL::PD:T:::KKIIN:E:GQ:::::I HVO_1137 ::::::::G::::S::SE::::I:::E:::V:::L:Q:::PAE:R:I:::::GDV::::: Hbo0420 :I::::::R::AS::AA:IDG:I:::::::V::VL:Q:D:A:E:D:I:::A:GR:::::I hla1283 S:::::::A:V::ALQ::::E::A:::SLQL::VS:PH::S:A:S:::::R:G::A:::: VNG0615 P:::R:::::V:MSV:M:AA:::::R:G::M::F:::P::E:Q:::::R::::::::::: rrnAC2510 G:::::::::V::GV::T:::SI:::E::D:::::I::::::::::::D:::::Q::::: Hmu2899 ::::::::G:V::SV::AV::TI:::Q::D:::::I::::::::R:::D:K:::ES:::: consensus IGAWFRGEFVSPPDPEARLDEGTVLLVAGREEQLERLKELTLSSTRRFRRGEVVVAGYGE #oth 1.2.13.2.322.4.434234422.1.3.2341.2326531515413333151213.1.3 HQ1952A ::V:SN:K:I:A:G:DI:I::NMF:::::SY:A:TEVTTQ:V:P-KLSANDQ:I:::::V Hut1044 :::::::Q:::S:S:AD:INAR:::::::::P::QAFQ::ASAKA::Q:::P:LIC:::: HQ2351A ::I::::::::::S:::E:::HS::V:T:S:::::::HV:AQ:Q:::H:::R:::::::: HVO_1137 :::::T:::::::A:H:VI::H:I:::V:::K:::E:RA:::::A::::::T:I:::::: Hbo0420 ::::::::::T::::::VV::H:I:::T:::::::::::::R:E:::::::K:I:::::: hla1283 :::::N:::DAA:P:N:T:SA::::::S::SD:::::V:::N:A::::GA::T::I:::Q VNG0615 V::::N:::ET:::::T::TD::::::T::KD:::A:M:I:Q:EF:::E:::TL:I:::H rrnAC2510 :::::::Q:::::::D:E::GS:::::S:T:S:::Q::QM::::V:G:::::T:II:A:: Hmu2899 :::::Q:::E:::S:::I::N:::::::::::::Q:::DM::::V:Q:GH::T::V:::: consensus VGRTAAEALASAGVPHTVID-RADKP-GVDVVGDATDPETLRAAGIEEARSVILALDDDT #oth ..42334414512234212.28524212..22.1212322154.2144233.2..222.1 HQ1952A ::QSTV:T:EEN::SP:::::MN:DD:R:::T::I:NR::FAK::::NT:F::::V:::S Hut1044 ::S:VKQRVVR::L:V:::::LDE::::::::::::::D::EK:D:D::S::V:::P::: HQ2351A :::C:::T:E::NLT:VI::QDQS::DN::II::V:NA:::YE::::N:E::L::I:::: HVO_1137 ::S::::K::::::::L:V::KQ:::::::L:::I:::Q::SE:NVS:::G:L::::N:: Hbo0420 ::A:::D::V::N::SL:L::EV::::::::I::::NKQAFLS:D:D:GQ:::::::N:: hla1283 ::::V:::V:D:DL:V::V:::E:AE:::::::::::::::::::V:A:QT:V:::P::: VNG0615 ::KSI:DE:DT:::::::V:AS::VD:::::::N:VE::::::::::D::::::::P::: rrnAC2510 ::Q:ITS::TN:::::::L::Q::E::::::::::::::E::H::VGT::T:::::SA:: Hmu2899 ::::T:R::DR::IDY::L::HE:::::::::::::E:DE::::::AD::T:V:::S::: consensus TTEFATLVIRDLSPDTEVIARANEAESVQKLYRAGADYVLALSTVSGRMLASTILE-EDV #oth 41311111243231411221.11332122.111...2...1.1112..121.3243222. HQ1952A ::MY::VA:KESA::::M:::::SI:NTA:::::::R:::S::::T::::S:VL::D:E: Hut1044 SAV::S::V:Q:E::V::VV::::TAN:::::::::::::::A:::::::::::FG:::: HQ2351A AAI::::::SQ:::Q::I:V:::D::::::::H:::E:::::::::::I:::SLA::Q:: HVO_1137 :AV:::::SERV:EE:::::::::T::IA::::::::::::::::A:::::::V:D::E: Hbo0420 :AI::::::KQ:::E::::::::D:::IA:::::::E:::::::::::I:::NLT:::E: hla1283 ::::T:::V:::A:N:Q:L::VE::A::R:MH::::::::S:A::T:::S:::VI:GR:: VNG0615 L:::::::::E:::A::::::VE:SG:I::M:::::::::S:AA:T:::I:::VIDG::: rrnAC2510 D:::::::::::N::V:I::::E:S:N:::M:::::::::::::::::::::::::D::: Hmu2899 D:::::::VG::N::V:I::::EQT:N:::M:::::::::S:A:I::::::::::AD:Q: consensus IALDQQIEVVRTAAPGLAGQTLGEADVRARTGCTVVAIERNGELITEVGPDFRIEDDDDL #oth 1343412.11.3513513122135.41.42.12..1.22.11324.243.3433455.42 HQ1952A LT:ET:F:I:::T::E::::::RG:AI:D:::A:::::::D:::L:NPE::L:MKEN:QF Hut1044 :TF::GV::::LPVGT::::SIAS::I::E:::::I::Q:::::::DFD:T:TF::::EI HQ2351A :VAQS:::::::D:::::::S:V:::I:::::S::::A::DDG:H:NI::::V:QQR:T: HVO_1137 ::PQS:::I:::N::::V:R::AG:::::::N:::I:V::::A:V:::::E::V:A:::: Hbo0420 ::PES:V:I:::T::QI:::::A::::::::N:::I:V:::D::L:::::::T:RSE:T: hla1283 LS:N:::::::SRV:R:T:R:I:R:N::EA:::::I::::DD:TV::I:::T:::P::E: VNG0615 L:::R::::::::::::V:TRI:D:L::T:::::::::N:D:A:T:::::NS:VR:G:K: rrnAC2510 :SM:::V::I:V::N::GNT:I::::::S:::::::::::::AV::DLS::VT::PT:K: Hmu2899 :SM:E:V:I:::::DK:::::::Q:R:::::::::::V::::DV::D::::VHVAEG::: consensus VVAGTDDGINRFNALFG--- #oth 112.3234153.46636211 HQ1952A I:T:SSNV::N:TET:RYSR Hut1044 I:T:P::RVSA:T::VE::: HQ2351A ::V:::A::::::K:AST:: HVO_1137 ::::V:ED:Y:::EQ::::: Hbo0420 I::::::D::Q::VVC:::: hla1283 ::V:::E::RA:EGR:T::: VNG0615 :::::TE::RA:TDA:V::: rrnAC2510 :I::::::VT::KSV::::: Hmu2899 :::::::SVD::R:I:D:::