|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1398 | HQ1908A | Hmu0339 | Hut2366 | rrnAC2115 | VNG2634 | hla1184 | HQ1096A | HVO_1868 | Hbo1742 |
1063 | HQ1908A | 1542 | 1039 | 1008 | 1109 | 734 | 770 | 241 | 418 | 374 |
1107 | Hmu0339 | 1039 | 1426 | 1028 | 1131 | 722 | 829 | 290 | 425 | 379 |
1071 | Hut2366 | 1008 | 1028 | 1440 | 1139 | 692 | 807 | 219 | 407 | 354 |
1129 | rrnAC2115 | 1109 | 1131 | 1139 | 1480 | 743 | 826 | 237 | 410 | 364 |
912 | VNG2634 | 734 | 722 | 692 | 743 | 1418 | 983 | 237 | 474 | 468 |
1008 | hla1184 | 770 | 829 | 807 | 826 | 983 | 1528 | 290 | 477 | 434 |
350 | HQ1096A | 241 | 290 | 219 | 237 | 237 | 290 | 1367 | 529 | 630 |
588 | HVO_1868 | 418 | 425 | 407 | 410 | 474 | 477 | 529 | 1321 | 894 |
532 | Hbo1742 | 374 | 379 | 354 | 364 | 468 | 434 | 630 | 894 | 1323 |
214 symbols consensus -----------------S-YDI-G-DLDDDRYEVRQSL--VRNKYKAMDADGNVVLRGKQ #oth 122121222333332464621153341323412.3133142211.523142232123311 HQ1908A :MVSFPDGIENKRSAMTRNH::S:L::TG:T:V:E:::LPI::::::::::E:::I:::: Hmu0339 :::::::::::::MSAL:K:::Q:LE:T:NS:T:E:::::::::::::::A:D::V:::: Hut2366 :::::::::::::::MAES:::E:IE:T::::T:V:::::I::::R:E:EQ::::::::: rrnAC2115 :::::::::MVNNMSTP:T:::K:I::S::S:T:E:::::::::::::::A::::::::: VNG2634 ::::::::::::::::MAD:::AAV:::G:SF::::A::::::::DVR::::E:::KA:: hla1184 VTLSTPMSQPSGFESES:A:::STVN::::::::T::V:::::::AVR:SA::::::::: HQ1096A :::::::::::::::::-:---:-:MFESRY::::REF:GFGTA:HIYENQ-TPI:KTAY HVO_1868 :::::::::::::::::-:---:-:VF:SS::::::KV:SIS:::VVYEG:-DP::SA:: Hbo1742 :::::::::::::::::-:---:-:MF:GRH:::::KI:R:G:A:RIYEN:-TAI:ES:: consensus KMFKLKEEFPFVDGD-GDEVFTVK--AGGILDIAGNYVITDAQTGEDV-VVLDNDYSLFQ #oth 131221.4.21315211423.4141112233.2223.313.24.1.2214121323.432 HQ1908A :::::::::::::SN::E:::E:N:::::MI:::::::L::S:::::L:I::::::::L: Hmu0339 ::L:M::::::T:::::N::::::::::::I:V:::::LS:::::::L:::::::::VM: Hut2366 :::::::K:::::A:::E:::::T::::::::V::D::LS::R::::I::I::::::I:: rrnAC2115 ::L:M::Q::::::N::::::E:N::::::I:V:::::L::SK::::I::I::::::I:: VNG2634 :L:::::Q::::TD::::PA:::A:::::::::G:T:T:V:DT::::::::::E:::::A hla1184 ::::::::::::T:::D:DA:S::::::::M::::::A::::G:::E::::::E::::LA HQ1096A STLQRS:S:R:S:PQT:TDQ:GIRETPTATV:E:NT:D:I::::::R:GT:RR:II:HL: HVO_1868 :K:::::D:RLN:H:T:E:R:R:::::DSV::VSAA:D:V:SR:D:R:GA:KRGAF:FAK Hbo1742 :K:R:::D:S:T:P:T:A:R:R:::::DSV:::SAA:D:V:S::::R:GS:KRSAM:F:K consensus DTWTIRDPDTGAAIATINSRGALVTLARRLVPFGNLIPHKYEITDADGDHVGAIDGQFSL #oth 221312233216431324133433231.322323432.2112.42552543.523152.2 HQ1908A :::R:::V::EEK::E:::::T:::I::NVI:::EF::::::::::NDS:I:N::::I:: Hmu0339 ::::L::AGDER:::K:D::::A:::::N:L:::EI:::::::::V::N:::S:E::L:: Hut2366 :::K:::AR:E:KL:E::::::::::::AY::::GW:::::::::L::::::R:::EL:: rrnAC2115 :::K:::AS:E:K::E:::Q:::::I::NV::::GW:::::::::Q::T:::N::::::: VNG2634 EN:::::::::D:L:::E::STVLSAL:H:IGVV::V:N::D:Y:PEERA::::E::::V hla1184 EN:::::::::E:L:::R:KNK:FSAL:H::SVA::V:N::::F::::::::D:E:K::: HQ1096A HEY:LSND:-:HIV::LREDRPP:AV::::LS--SIL:FSC::IASG:TQA:IVT:AL:: HVO_1868 H:YQLLG::-:SVAGR:VEDSVPMAV:::::T--T:::FS:R:E::A:EE:::V::R::: Hbo1742 HEYKLLG::-:QTV::VVEDNVPMA:::::IT--T:V:FS:D:ISPS:EKL:SASES::F consensus RDRYTITIDDASIVPKEAVVAAAMVIDAIEGN-- #oth 1.4141322234321213111223.3..113311 HQ1908A ::::K:::::TNT:S::::I:::::::::Q:::: Hmu0339 ::::E:::::::N::::::I:::::::::Q:::: Hut2366 K:::D:V:::T:D::R:PI::::::V:::Q:H:: rrnAC2115 K:::E:::::::T::::PII:::::::::Q:::: VNG2634 K:T::V:::::RTI:::G:::::C::::L:NQ:: hla1184 ::A::V::::::D::::::I:S:C:L::L:NQ:: HQ1096A ::QFS:ELFTTQ:D:QL:::G-TI:A::::DIEL HVO_1868 ::K::VDV:RER:D:RL:::G-:V::::::E::: Hbo1742 ::T:S:D:-RGD:D:RLT::G-MV::::::E:::