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8 genomes BUD0857 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG2634

rrnAC2115

HVO_1868

Hbo1742

Hmu0339

Hut2366

hla1184

-

HQ1096A

HQ1908A

Pairwise sequence scores
Consensus score1398 HQ1908A Hmu0339 Hut2366 rrnAC2115 VNG2634 hla1184 HQ1096A HVO_1868 Hbo1742
1063HQ1908A 1542 1039 1008 1109 734 770 241 418 374
1107Hmu0339 1039 1426 1028 1131 722 829 290 425 379
1071Hut2366 1008 1028 1440 1139 692 807 219 407 354
1129rrnAC2115 1109 1131 1139 1480 743 826 237 410 364
912VNG2634 734 722 692 743 1418 983 237 474 468
1008hla1184 770 829 807 826 983 1528 290 477 434
350HQ1096A 241 290 219 237 237 290 1367 529 630
588HVO_1868 418 425 407 410 474 477 529 1321 894
532Hbo1742 374 379 354 364 468 434 630 894 1323

214 symbols
consensus       -----------------S-YDI-G-DLDDDRYEVRQSL--VRNKYKAMDADGNVVLRGKQ
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HQ1908A         :MVSFPDGIENKRSAMTRNH::S:L::TG:T:V:E:::LPI::::::::::E:::I::::
Hmu0339         :::::::::::::MSAL:K:::Q:LE:T:NS:T:E:::::::::::::::A:D::V::::
Hut2366         :::::::::::::::MAES:::E:IE:T::::T:V:::::I::::R:E:EQ:::::::::
rrnAC2115       :::::::::MVNNMSTP:T:::K:I::S::S:T:E:::::::::::::::A:::::::::
VNG2634         ::::::::::::::::MAD:::AAV:::G:SF::::A::::::::DVR::::E:::KA::
hla1184         VTLSTPMSQPSGFESES:A:::STVN::::::::T::V:::::::AVR:SA:::::::::
HQ1096A         :::::::::::::::::-:---:-:MFESRY::::REF:GFGTA:HIYENQ-TPI:KTAY
HVO_1868        :::::::::::::::::-:---:-:VF:SS::::::KV:SIS:::VVYEG:-DP::SA::
Hbo1742         :::::::::::::::::-:---:-:MF:GRH:::::KI:R:G:A:RIYEN:-TAI:ES::

consensus       KMFKLKEEFPFVDGD-GDEVFTVK--AGGILDIAGNYVITDAQTGEDV-VVLDNDYSLFQ
#oth            131221.4.21315211423.4141112233.2223.313.24.1.2214121323.432
HQ1908A         :::::::::::::SN::E:::E:N:::::MI:::::::L::S:::::L:I::::::::L:
Hmu0339         ::L:M::::::T:::::N::::::::::::I:V:::::LS:::::::L:::::::::VM:
Hut2366         :::::::K:::::A:::E:::::T::::::::V::D::LS::R::::I::I::::::I::
rrnAC2115       ::L:M::Q::::::N::::::E:N::::::I:V:::::L::SK::::I::I::::::I::
VNG2634         :L:::::Q::::TD::::PA:::A:::::::::G:T:T:V:DT::::::::::E:::::A
hla1184         ::::::::::::T:::D:DA:S::::::::M::::::A::::G:::E::::::E::::LA
HQ1096A         STLQRS:S:R:S:PQT:TDQ:GIRETPTATV:E:NT:D:I::::::R:GT:RR:II:HL:
HVO_1868        :K:::::D:RLN:H:T:E:R:R:::::DSV::VSAA:D:V:SR:D:R:GA:KRGAF:FAK
Hbo1742         :K:R:::D:S:T:P:T:A:R:R:::::DSV:::SAA:D:V:S::::R:GS:KRSAM:F:K

consensus       DTWTIRDPDTGAAIATINSRGALVTLARRLVPFGNLIPHKYEITDADGDHVGAIDGQFSL
#oth            221312233216431324133433231.322323432.2112.42552543.523152.2
HQ1908A         :::R:::V::EEK::E:::::T:::I::NVI:::EF::::::::::NDS:I:N::::I::
Hmu0339         ::::L::AGDER:::K:D::::A:::::N:L:::EI:::::::::V::N:::S:E::L::
Hut2366         :::K:::AR:E:KL:E::::::::::::AY::::GW:::::::::L::::::R:::EL::
rrnAC2115       :::K:::AS:E:K::E:::Q:::::I::NV::::GW:::::::::Q::T:::N:::::::
VNG2634         EN:::::::::D:L:::E::STVLSAL:H:IGVV::V:N::D:Y:PEERA::::E::::V
hla1184         EN:::::::::E:L:::R:KNK:FSAL:H::SVA::V:N::::F::::::::D:E:K:::
HQ1096A         HEY:LSND:-:HIV::LREDRPP:AV::::LS--SIL:FSC::IASG:TQA:IVT:AL::
HVO_1868        H:YQLLG::-:SVAGR:VEDSVPMAV:::::T--T:::FS:R:E::A:EE:::V::R:::
Hbo1742         HEYKLLG::-:QTV::VVEDNVPMA:::::IT--T:V:FS:D:ISPS:EKL:SASES::F

consensus       RDRYTITIDDASIVPKEAVVAAAMVIDAIEGN--
#oth            1.4141322234321213111223.3..113311
HQ1908A         ::::K:::::TNT:S::::I:::::::::Q::::
Hmu0339         ::::E:::::::N::::::I:::::::::Q::::
Hut2366         K:::D:V:::T:D::R:PI::::::V:::Q:H::
rrnAC2115       K:::E:::::::T::::PII:::::::::Q::::
VNG2634         K:T::V:::::RTI:::G:::::C::::L:NQ::
hla1184         ::A::V::::::D::::::I:S:C:L::L:NQ::
HQ1096A         ::QFS:ELFTTQ:D:QL:::G-TI:A::::DIEL
HVO_1868        ::K::VDV:RER:D:RL:::G-:V::::::E:::
Hbo1742         ::T:S:D:-RGD:D:RLT::G-MV::::::E:::