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[C] (QcrA) COG0723 Rieske Fe-S protein
8 genomes BUD0858 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0584

rrnAC0733

rrnAC3424

HVO_2620

Hbo2223

Hmu0764

Hut1271

hla0964

-

HQ3198A

Pairwise sequence scores
Consensus score2218 rrnAC3424 VNG0584 hla0964 HVO_2620 Hbo2223 HQ3198A Hut1271 rrnAC0733 Hmu0764
1307rrnAC3424 2320 1031 1067 1089 1073 1116 1284 1117 1177
1388VNG0584 1031 2182 1119 1265 1204 1181 1157 1063 1016
1583hla0964 1067 1119 2203 1387 1342 1389 1147 1081 1065
1742HVO_2620 1089 1265 1387 2222 1623 1640 1233 1239 1208
1746Hbo2223 1073 1204 1342 1623 2194 1783 1217 1195 1208
1762HQ3198A 1116 1181 1389 1640 1783 2217 1225 1233 1199
1466Hut1271 1284 1157 1147 1233 1217 1225 2284 1298 1315
1409rrnAC0733 1117 1063 1081 1239 1195 1233 1298 2278 1490
1437Hmu0764 1177 1016 1065 1208 1208 1199 1315 1490 2249

307 symbols
consensus       --------MSDSDKYPAESGRRRFVKGVVGGAALAGVGAGGAAAVNSTTSSGGVGGGSTQ
#oth            111111123442....331........1..212.221224.3222333.434.4...425
rrnAC3424       MTQESSPNHGQR:::::P:::::::::L::AS::S::TTV:GL::DA::DQ::I:::TVS
VNG0584         ::::::::--M:::::ES::::::::::::S:::::A:TA:T:VLE:V:NPT:S:::Q:N
hla0964         ::::::::::Q:::::::::::::::::::::::S::::M:S:T::TL:T:::::::::I
HVO_2620        :::::::::::::::::D::::::::::::::::::::TT:::::::A:::T:S:::P::
Hbo2223         ::::::::--M:::::DD::::::::::::::T::::::T::T:I::A:::S:A::::::
HQ3198A         ::::::::::ER:::::D:::::::::::::::::::::T:::::::A:T:P:A:::T::
Hut1271         :::::::::AHE::::N:::::::::::::S:V:GT:AT:::T:IGL::APS:::::I:P
rrnAC0733       :::::::MPL:E::::::T:::::::::::S:::S:::V::::::DA::DAA:E:::T:P
Hmu0764         :::::::MPL:E::::::::::::::::::S:T:SS::::::::LET:::::::::::ST

consensus       AVAIENTAGPAPRGMPQIPIEIDDDGYIRGVWPEVQEV-TQNGQTIQVAEE-D-QGGGVT
#oth            24212113...1.11.21.2113341514.41.223241345154554.45312412.33
rrnAC3424       Y:G:R:I::::N:P::IV:L::-S::AL::M::S:S::::AG:D:FRL:RG:-:EL::::
VNG0584         YF:V::::::::::::MV::::::N:D:K::F:D:K::E:ET:G:KKQ:RM:-:EL::IE
hla0964         :MT::K:G::::::L::V:V:VT:::::::I:::T:TI:::E::E::::Q::-::L::K:
HVO_2620        :Y:::::G::::::::::::::::E:::::::::::T::::::VEVEL:ITE:Y::T:::
Hbo2223         :M::::I:::::::::::::::::E::LK:I::::KTI:E:::VK:K:::LE:YK:S:::
HQ3198A         :Y:::::D:::::::::::V:V:SE:FLK::::::KTE:K:G:IS::I::TD:FK:S:::
Hut1271         YIG:K::D::::::::IV:V::Q::DT:A::::DT::T::VQ:::VT:::M:-:DL::T:
rrnAC0733       F::V:::S::::::::I:::::-NG:E:S:L:::YD:N:------AGA:VAP:FG:S:ID
Hmu0764         Y:::::::::::::::I:::T:-ES:ELQ:H:::YDPE:------RGI:I:D:FG:S:IP

consensus       YSSQWFQYCGVQSYAGINPDYE-SDNYFRS-SNGGYDWQSE-YSDGDRLHVDDFDDYEEW
#oth            .14512....21334225.341141341361353412.1323344.4323233.32.23.
rrnAC3424       ::Q:::::::LEVAP:LE::P::R:GFL:-::KTT:::::::LP::EK:R:EH:EN::S:
VNG0584         :TPN:Y::::::G:G:LR:::D:G:::::F::GA::S::PS:---:GKVNI:E::::DT:
hla0964         :TGA:Y:::::E:QEN:E::::AE::L::A:AP:K:::MD:V:DE:E:I:I::::::D::
HVO_2620        ::QD::::::::T:D:L::TF::::::::::D::A::::::T::A::::N:N:::E::T:
Hbo2223         :T:E:::::::E:::::Q:E::::::::I:G::P::T::::A::E:::::::::S::KD:
HQ3198A         ::TE:::::::E:::::::Q:D:::::::VG::P::::M::T::E::K::::::T:::S:
Hut1271         :::T::::::::T::::S::AD:Q:DA:::::S:T:::::D:IE::QA:TLS::::::::
rrnAC0733       ::::::::::I::T:A:Y:QSD:RNST:LN:DT:TFS::G:::ES:KP:T::M:E::K::
Hmu0764         ::::ML::::L:TAE:VQ:QA::QN:T:TM:TT:D::::::::::::P:T::M:::::::

consensus       GNGIGDAGLGKPATATWRSQ-DAENTIPVQVIRSPEIEEAANGEG------G-V-EWLEA
#oth            2.22.54.2.11.324..122343453312121154222325442313324242352241
rrnAC3424       ::N::SD::::::V::::::GEDVKE:Q:::L:T:AVSKMVA::DEYADLA:EIRDF:D:
VNG0584         E:DY::::I::::K:::::::NTD::::ILI::::VL:DRVESA-:::::E:E:A:::::
hla0964         ::::::D:V::::SV::::::N::TALN:N::::SR::::VENS:D:::::-:-::::::
HVO_2620        :::::Q::::M:::G:::::::T:D:M:I::L::TR:::::QDN-::::::-:-::::A:
Hbo2223         :::V:KS::::G::GR:::E::::D:::I::V::EK:::::KDD-::::::-:-:P::K:
HQ3198A         S::::R::::::::GR:::E:::::I::I:::K:K:::::TGQD-::::::-:-:A::::
Hut1271         ::D::ES::::::S:G:::EG:NVQ::::::L::::VSKMV::::EYSELSPD:RSF:D:
rrnAC0733       ::::::P:V::::SVV::TNS:GK:GA:::I:::V:V:KM:::::EYGDLP:N:QSFISE
Hmu0764         ::D::SE::::::::N:::E:GDVQN:T:::L::::VPKI:::::KYSSIP:P:QQYFAE

consensus       ATDQGFMAWLNKCTHFCCVP-GYKT-EGSAKFNAEDKVYCQCHQSVYDPFSIVQTLFVAR
#oth            1.32212.21.2...1..3.131155631252311141..2....1.1..223353.312
rrnAC3424       ::AED:I::V:R:::L::N:::::KTP:::::E:A:::::N::::::::::PAMAT:AS:
VNG0584         :::::V::IV::::::::A:Q:FR::--:NYEG::::I:::::::I:::::::KKS:::F
hla0964         S:::::V:Y::V::::::I::D::VL:E::RYD:ANG:::V::::::N::TLEEA::I::
HVO_2620        S::::VI:::::::::::::::::QAAS::T:GG::G::::::::::::::::E:::T:L
Hbo2223         S:QD:::::::::::::::::K::::D:::::::::D:::::::::::::::::::::::
HQ3198A         S::E::V::::::::::::::Q::S::::::::::ND:::::::::::::::::::::::
Hut1271         ::EDDV::::::::::::::::F:AYG::ER::::NE:::::::::::::QP::RQ:T:L
rrnAC0733       ::::::I:::::::::::::::F::Q::::N:GGANSI:::::::::::::P::ST:::L
Hmu0764         ::E:S::::V:::::::::::::::LS:A:AY:::::::::::::::::::PT:VT:T:L

consensus       PRPQE--
#oth            1..6311
rrnAC3424       :::::::
VNG0584         A::EN::
hla0964         :::D:::
HVO_2620        :::S:::
Hbo2223         ::::-::
HQ3198A         :::::::
Hut1271         :::G:::
rrnAC0733       :::PQTD
Hmu0764         :::LQ::