|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3234 | HVO_1539 | Hbo0006 | HVO_A0270 | hla2210 | Hut2170 | HQ1735A | Hmu1343 | VNG1971 | rrnAC0555 |
2352 | HVO_1539 | 3179 | 2317 | 1928 | 1950 | 1826 | 1839 | 1852 | 1756 | 1873 |
2246 | Hbo0006 | 2317 | 3174 | 1945 | 1888 | 1828 | 1767 | 1799 | 1669 | 1833 |
2306 | HVO_A0270 | 1928 | 1945 | 3413 | 2373 | 1818 | 1846 | 1905 | 1721 | 1818 |
2255 | hla2210 | 1950 | 1888 | 2373 | 3559 | 1739 | 1830 | 1817 | 1748 | 1866 |
2337 | Hut2170 | 1826 | 1828 | 1818 | 1739 | 3255 | 1909 | 1896 | 1932 | 1911 |
2354 | HQ1735A | 1839 | 1767 | 1846 | 1830 | 1909 | 3267 | 2056 | 2074 | 2228 |
2436 | Hmu1343 | 1852 | 1799 | 1905 | 1817 | 1896 | 2056 | 3184 | 2081 | 2269 |
2332 | VNG1971 | 1756 | 1669 | 1721 | 1748 | 1932 | 2074 | 2081 | 3240 | 2270 |
2494 | rrnAC0555 | 1873 | 1833 | 1818 | 1866 | 1911 | 2228 | 2269 | 2270 | 3208 |
496 symbols consensus --------------MAIESDVLVIGGGLAGLTSALAAARAGADVRLVSHKQSTLRQASGL #oth 1111111111112211.321...1...111522.21.1331321..1221311.22.... HVO_1539 :::::::::::::::::TD::::::::I:AC:A::S::ET::R:::LA::K::::::::: Hbo0006 :::::::::::::::P:RE::::V:::::AA:::::::ES:KT::::A::K::::::::: HVO_A0270 :::::::::::::::::::::::V::::::MA::V::::E:VT:::::::KT:::::::: hla2210 MAAMPEPRPQTEGS:::D:::::V:::::AI:::I::::E::::::::::A::::::::: Hut2170 ::::::::::::MAV::D:::::::::I:::ST::::R::::::::::EAET::HH:::: HQ1735A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q:DI:::::TY:::::Q::::: Hmu1343 :::::::::::::::::D:E:::V::::::V:::V:::::::::::::Y:::S::::::: VNG1971 :::::::::::::::::::E::::::::::I:::::::D::::T::::Y::::::N:::: rrnAC0555 :::::::::::::::::::E::::::::G::::::::::E::::::::Y::::::::::: consensus VDVLGYTP----------------DG-----------------DGPLVDPFDAIPDLPED #oth 2.2...4132211211111221126.12111111221122111211332.221234.134 HVO_1539 ::::::A-::::::::::::::::G::::::::::::::::::::::S::YAGLDA:::G Hbo0006 I::::::-::::::::::::::::::::::::::::::::::::::HA::YA::S:::D: HVO_A0270 ::A:::V:SRDSAA:::EGADYVTQ:RADFRAVRSNRDAY:::Q::::R:T:GFD:::A: hla2210 I:G:::V:ATESAKPLREGPP::TA:RE::::::LDRDEWPDPE:::S:::E::DR:::S Hut2170 L:::::P:N::::::::::::::A::::::::::::::::::::::V:::::::G:::DS HQ1735A ::::::R:::::::::::::::::N:::::::::::::::::::::ISN::E:::S::VE Hmu1343 I:::::V-::::::::::::::::-:::::::::::::::::::EVV:::Y::::E:H:: VNG1971 ::::::::::::::::::::::::S:::::::::::::::::::::V::::::::S::DA rrnAC0555 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::YE:::S:::A consensus HPYRLVGEDAVRDGLALFDDAVGD-YHGGHTDANALLPTHGGTVKPTARYPASAAAGLAS #oth ...541.23221311331.243253.4.4..13...21.2..21.......32132.2.. HVO_1539 :::HV::::G::A::RI::E::::A:R:::::S:::VM::::A::::::::::V:P:::: Hbo0006 :::K:::::GIKE::RI::E:::EM:A:::::T:::V::Y:::::::::::K:VEP:::: HVO_A0270 :::S::::S:L:::::::::LT::A:::::::R::::::F::A::::::::RA::E:::: hla2210 ::::IL:A::L:E::D::::LA::A:R:S:::R::::::F::S:::::::::A:E::I:: Hut2170 :::AT:::E:::::::MI::VL:ET:::S:::::::V::::::::::::::::V:::::: HQ1735A :::QT::V::::TA:S:::EVTD-::A:S:::::::I::::::I:::::::Q::C::I:: Hmu1343 :::::::VET:::AM::::ET:DG::::D::ET:::::::::::::::::::G::E:V:: VNG1971 ::::T::V:T:::AM:F::AHAPR::Q:H:::::::V::::::::::::::::::::::: rrnAC0555 ::::K::VQT:::A:S::::::PT::E:E:::T:::::::::SI::::::::G:S::::: consensus DDRDTLLVGFESLTDFDAPVAADHLEAAGVPFDVRGVTVEFPGDLRADAKVTRYAKLLDH #oth 24222.3..134422121443.32131112.132312214.1352211122..3.21..6 HVO_1539 SSG:::::::AG:::::::::::::A::::::SA::::::::KRF::::::::F::A::R Hbo0006 VGEP::F::::GT:::APQ:V:::VA::::::ET:::R:P::KTF:D::RL::L::A::K HVO_A0270 :::PM:V:::R:F:::::RML::S::::::::P:A::EI::AEEF::::P:::I::A::: hla2210 :::P::I:::R:::EY::RAF:GR::::::::::A:AE:::AEAF:::T:I::L::A::: Hut2170 :::EL::::::R::G:::G:::::::::EI:AETSAA:::::IVV:D::::::::H:::E HQ1735A :N:PM:::::D:I::::::L:::::TST::::::::::IQ:::::S:::::::::::::T Hmu1343 :::::::::::R:V:::::L::S:V::::A::SAD:::IT:::::Q:::::::::::::Q VNG1971 :::::::::::T:P::N:DH::A:::S::::::::::::P:::::::G:::::::G:::A rrnAC0555 :T:::::::I:EMV:::::HV:A::D:T::::::::E:IR:::::::::::::::::::T consensus NEDV----DGDG---PVRRALADRVAPHL----------DDEERVGFPAVLGDDHPAAVR #oth 13731111425155243.62.1421444211111111113333.1....3..1244341. HVO_1539 D:::::::::G-:::T::SV:::T::EE::::::::::::G:S::::::M:::::DED:: Hbo0006 D:SA::::GRV-:::G:::S::ET:KA::::::::::::EG::::::::M:::A:GEE:: HVO_A0270 D:RL::::::T-:::::::::V:A:K:YV:::::::::::RA::::::::::::RAD::: hla2210 D:AI::::::V-::::A:E:::KA:G:::HDVVDEAGGV:RV:::::::F:::QEGD::: Hut2170 :PT:::::::A:SDRR::A::::AIE::V::::::::::GEA::I:::::::V::::EI: HQ1735A :G::TVSET:G:GHR:A:D::::::KIY::::::::::::::T::::::::::ANA:T:: Hmu1343 :SP:::::AV::QKVDT:T:::E:I:::::::::::::::GH:::::::::::::TD::: VNG1971 :PQ:::::SV::TER:L:L:::T:::DAA::::::::::A:AD:::::::::::D::G:: rrnAC0555 :SE:::::AVR:RMV:A:E:::Q::N:L:::::::::::E:::::::::I::::N:G:I: consensus AELADRLGVDVFEVPMGPPSLPGLRLEDRLFDALDDAGVRIETG-NPVVDYEADG--GRI #oth 22.323..13...1.1....11.12.1.4.14..232.34213.11.2113332231141 HVO_1539 :::S:::::P:::::T:::::L::K:::I::::::E:::::SA::::A::F:::T::::V Hbo0006 :::E:::::S:::::T:::::L::Q::::::::::E:::::S:::::A:G:::::::D:: HVO_A0270 :A:SE::::::::I::::::::::::::::Y::::AE::LY::::::::G::T::ES:HV hla2210 ::::::::A::::I::::::::::::::::Y:::::::::F::::::::GI:TEAD::T: Hut2170 N::E::::AA::::::::::VL:G::::::YA::::::GQ::S:GG:I::FD:E::::M: HQ1735A :T:GTS::A:::::::::::::::::::Q:::::S:::GF::S:::::I::TD::S::TV Hmu1343 :T::EE:::A:::::::::::::::::::::E:::RS:T:Y:V::::::::--E:E:D:: VNG1971 DA:::H::AA::::::::::::::::S:H::G::EA::::::::::::::ADTTA:::GV rrnAC0555 DA:G:H::::::::::::::::::::::A::S:::E::AS::::::::::F--::E:D:: consensus EAVYVDRNGARIPYSADQYVLATGGLVGKGIDSDREGVREPVFGCHVPHPADRYDWFDDE #oth 23.521231342.24.1321....12111.21.1.23.2..1.11112134...2.1233 HVO_1539 :T:V::QKSRPT::::::V:::::::::::L:::::S:T:::::::::::E:::::S:P: Hbo0006 :::::::R:N:V::H:EEF:::::::::::::::::R:T:::::::I:::D:::::S:E: HVO_A0270 D::L:::K:REV::A::SF:::::::::::L::::TA::::::D:R::Q:S::::::V:D hla2210 :::A:::K:RET::G::AF:::::::::::L::N::::::::::L::EQ:::::E::V:D Hut2170 S:::M::S:SQ:::A:E:::::::DVA:G::::::D::T::I::::::::D:::E::EG: HQ1735A :K:I:E::::E::MR:E::I::::::::::VE:N::::Y::I:::::A:D::::E:::EA Hmu1343 :R:V:E:::S:V:::::::::::::::S::VE:::::::::I:D::::::K::::::E:G VNG1971 :T:::EK::::::N:::E:::::::::::::::::DA:Y::I:D:RIA:SD:::A::::D rrnAC0555 :K:FIEK:::K::N:::::::::::F::::VE::::::Y::::D::I::A:::::::EG: consensus AFGDHAFARFGVVPDDDLRPLDADGEPEFENLRAAGAVVGGYDFAAEKSASGVSIATGYA #oth 2.13131.21..431442.14322154222.11...212..11311.1.11...1...32 HVO_1539 ::::::::::::::::E:::T:E::::H::::::::G::::A:V:R::::::::L:::AV Hbo0006 :::G:E:::::::::EEM::TT:S:::H::::::::S::::A:V:R::::::::L:::AV HVO_A0270 :::A:PY:::::E::AKM:::A:::T::::::F::::::::A:A:R::::A:::L:::VV hla2210 ::::QPY:::::RI:E:G:V::::::SAY::VF:::G::::A:V:R::::::::L:::IV Hut2170 :::E::::E::::V::A:::MGEG:T:::S::::::::I::::YP::::::::::::::: HQ1735A V::E:S::::::DT:TT:::V:ES:NI:::::::::::L::::Y:::::::::::::::T Hmu1343 V:D:::::::::DVGS::::RA:G:SV::::::::::TI::::::::::G:::::::::: VNG1971 ::::::::Q:::RT::T:::R:D::AAAHA::::::::L:::N::::H:G:::::::::: rrnAC0555 L::::E:::Y::AT:::::::::SEHS:::::::::S:L::::::::::G:::::::::: consensus AGRRAAEEAT------ #oth ..54.23335321111 HVO_1539 :::L:G::::R::::: Hbo0006 ::S::G:::-:::::: HVO_A0270 :::N::K:LGD::::: hla2210 :::E::T:::Q::::: Hut2170 ::W:::K:V-:::::: HQ1735A ::MN::TTVAQTNNVS Hmu1343 :::A:T:DL::::::: VNG1971 ::TA:::AIHDE:::: rrnAC0555 ::Q:::Q::R::::::