[E] (BetA) COG2303 Choline dehydrogenase and related flavoproteins 8 genomes BUD0862 9 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG1035 rrnAC0110 rrnAC0525 HVO_1294 Hbo0249 Hmu1484 Hut2577 hla0360 - HQ3365A

Pairwise sequence scores
Consensus score	4167	rrnAC0110	Hut2577	VNG1035	HQ3365A	HVO_1294	Hbo0249	hla0360	rrnAC0525	Hmu1484
2356	rrnAC0110	4344	2039	2073	2002	2027	2029	2147	1994	2007
3258	Hut2577	2039	4268	2910	2674	2873	2908	2924	2780	2797
3279	VNG1035	2073	2910	4124	2657	2717	2735	2901	2855	2742
3175	HQ3365A	2002	2674	2657	4245	2955	3119	2815	2618	2639
3304	HVO_1294	2027	2873	2717	2955	4124	3147	2906	2715	2648
3309	Hbo0249	2029	2908	2735	3119	3147	4214	2757	2750	2680
3369	hla0360	2147	2924	2901	2815	2906	2757	4179	2829	2838
3184	rrnAC0525	1994	2780	2855	2618	2715	2750	2829	4229	3155
3114	Hmu1484	2007	2797	2742	2639	2648	2680	2838	3155	4213

579 symbols
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rrnAC0110       :::::::::::::::MTAAD::::T:-::::I::::::::FT:YS::RR::::::::::E
Hut2577         :::::::::::::::::VSA:::::DGV::::I::::::::I::::::G::E:T::::::
VNG1035         ::::::::::::::::::::S:R::PN:::::I::::::G:I:D:::S:::S::::::::
HQ3365A         MNSPAATSAISNSDSDDNAQ::::::Q::::I:::::::::I:Y:::NQDL:::I:::::
HVO_1294        ::::::::::::::::::::::S:VSD::::::::::::GI::::::ES:AS::::::::
Hbo0249         ::::::MAETPTDGGVGDGRE::::P::::::::S:::::::::::::ANAA::::::::
hla0360         ::::::::::::::MSAENT::::VAN::::::::::::::::D:::::-:E:I::D:::
rrnAC0525       ::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::::SQ::S::QNI:::::::
Hmu1484         :::::::::::::::::::----------::::::::::::::::::SA:::::::::::

consensus       RFDFADRLEQMERAIRPGHGRPSVWEMGGERDAYSSSGDRFYPLNAARVKGVGGSTLHWQ
#oth            11164415412.431..3535433.421.3..32233.23411..33...11..11...1
rrnAC0110       :LSSE:HHRR::MWL::NFE:DAF:R-N::::R:T:T::INAR::ET:::A:::TS:::D
Hut2577         :::PEQ:I::::D:L::A::::DI:G:::::::FT:::::H::::HT:::::::::::::
VNG1035         :::A:::ERR:::S:::A::PA:::::::P::::A:T:::Y:::::::::::::::::::
HQ3365A         E:SD::::T:Q:QH::::MSD:--:K:::Q::::TTA:-:G:::::::::::::::::::
HVO_1294        :::-G::R::L:QH::::L:G:--:::::P:::F:::::S::::::::::::::::::::
Hbo0249         ::::SR::::::EH::::M:N:--:::::P::D:TT::-:H:::::::::::::T:::::
hla0360         :::P::::DRQ::::::SYD::D::DV::::::H:NA:E::::::H:::::I::::::::
rrnAC0525       :::RSN:EQ:::E:::::-DHG:::::::D:::F:A::E:Y::::IS:::::::::::::
Hmu1484         ::::DA:P:::::S:::A:DDL:I:G::::::E::TG:EQ::::::N:::::::::::::

consensus       GMVMRLHERDFEMGSRDGVGADWPIDYDDLRPYYAAAERALGVAGASDNPFAPPREEPHP
#oth            1111...25..34523531242..23.32.2.1.23..312..1.14...22...3322.
rrnAC0110       ANTP:::QE::::NT:Y::AQ::::S::::Q:::VR:::EM::S::D:::HG:::K::Y:
Hut2577         :::::::::::AVA:::::A:::::A:::::::::E::A::::::::::::E::::Q:::
VNG1035         ::::::::Q::RLA:AT:::::::F:::T:K:::::::S::::S::::::::::::Q:::
HQ3365A         :::::::::::::K::YD::V::::::T::::::::::S:::::::M:::Y:::::TS::
HVO_1294        ::::::::::::LD::H::::::::G:::::::::::::E::::::A:::Y:::::::::
Hbo0249         :::::::::::::Q::H:::T:::LS::::K:H:RE::D:F:::::L:::Y:::::::F:
hla0360         ::::::::D::AS:TER:::P::::::A:::::::::::E::::::::::Y:::::::::
rrnAC0525       :::::::PS::D-::H:TDDPA:::S:::::::::D:::::::::DA::::::::DGAY:
Hmu1484         :::P:::PT::A-:EHPNDDPG:::G:EE::::::E::S::::::::::::G:::RT:F:

consensus       LPAFPPSYSDSLFAEACERLGIDMHSVPNARNSEPYDGRSACVGYGTCQPVCPSGAKYDA
#oth            221.3..1...1..3...4.1.211.111.11.14112.34.1.1.1.211..1....2.
rrnAC0110       :T::E:::::::::::::E:::A:A:Q:K:I:::E::D::E:::::V:N-A:::::::S:
Hut2577         M:::D::H:::I::::::A:::TT::::::::::G:::::::::::::::::::::::::
VNG1035         Q:::::::::::::D:::S:::AT:::::::L:AGRET:R::::::::::::::::::::
HQ3365A         :::::::H::::::P:::T:::::::::::::::R::::A::Q:::::K:::::::::T:
HVO_1294        ::::R::H:::I::A::::::::::::G::::::::::::S:::::::K:::::::::T:
Hbo0249         :::::::H:::I:::::::::::::::::::::::::::A::Q:F:::K:::::::::T:
hla0360         M:::E:::::::::::::E:E:::::::::::::A::::::::::::::::::A::::::
rrnAC0525       ::G:::::::::::::::::::T::::::::::::::::GP:::::::::::::::::::
Hmu1484         MS::E:::::::::P:::::::TT:::::::::::::D::T:::::::::::::::::S:

consensus       ESHVEKAEAAGARVIDRAPVQRLEHDDTGDRVEAAVYATPDGTEHRQEAREFVLACGGVE
#oth            32.133.252..211.31212112114423214411.2..1.2212.3.34..2.1..1.
rrnAC0110       :V::R:::S::::IV:QVQALSV:::R:::Y::SV:::::N:RQY::::DH::I::::I:
Hut2577         T:::::::K::::::::V:::::::::A:E::T:::::::::ET:::::::::::A::::
VNG1035         TV::DR:TD:::::::E:::::::::AA::::TG:::::::::T:::S:T:::::A::I:
HQ3365A         :::IQ::RS:::HI::Q::::::V:G:::EA:KK:::M::::::YH:S:QR:::::::::
HVO_1294        ::::::::::::::::::R:R::D::E::E::V::A:T::::ET:::::TQ:::::::::
Hbo0249         ::::RA::K:::::::H::::::::::S:::I:R:::::::::::E::::R::V::::::
hla0360         TV:I:R::EK::T:::::::::::::A--::IT:::::::::E:Y::::DA::V::::::
rrnAC0525       SV:I:D:::R::::V::::::::VT:TD:-:I:::::::::::::::T:::::I:A::::
Hmu1484         DT::Q:::R:::::V:::::::::TG:DSR:ID::::::::::::::R::Q::::A::I:

consensus       TPRLLLLSDSDAYPDGLANSSGAVGRYFMDHLFAGAGGTLDEPTRQNHVGFNTSESHQFY
#oth            22......4.241......1..1..21121.111122.32111...211.1311211.1.
rrnAC0110       :::::::::::V:::::::::::::::L:::PSVRTT:::E:::::SNI:WVS:R:D:::
Hut2577         ::::::::E:PQ::::::::::L:::::HE:::::TS:VI:RE:::H::::::T::::::
VNG1035         :::::::::::R::::::::::L::::::::::::::::::::::::::::::T::::Y:
HQ3365A         NA::::::Q::QH::::::T::::::F:T::::::V::Q::::::::::::::::C::::
HVO_1294        NV:::::::::R::::::::::::::::::::::::::R::R:::::::::::::C::::
Hbo0249         NA::::::Q:E::::::::::::::::::::::::V::RVERE:::::::::::::::::
hla0360         ::::::::E::::::::::::::::KF::::::::V:::::::::::::::Y::ACD:::
rrnAC0525       ::::::::A:EDH:::::::::L::H:::::::::::::::RE::::::::L:::C::::
Hmu1484         I:::::::R:PDH::::::::::::::::E:::::::::I:::::::::::L::::::::

consensus       --DDP-----------------DEPVGPIKLE----FLNYA-GPSP------VEDALSAD
#oth            111232323422222322342433433321111111.111211.1.11111115511433
rrnAC0110       AHEETGPGSYHLTFSNTAKSTSGGAQSRLPPTSPSR::DIVRN:T:DALAELAT:P:NEM
Hut2577         :::E:AAGTDR:::GIPAADAGADDL:::::::::::R::G::::::::::::GV:::DG
VNG1035         :::R:::::::::::::::::::GSR:A::::::::::::::::::::::::A:M:::G:
HQ3365A         ::::T:::::::::::::::::-S::EG:::::::::::::::::::::::::NK::T::
HVO_1294        ::::A:::::::::::::::::-:::NGL::::::::::::::::::::::::I:::H::
Hbo0249         ::::S:::::::::::::::::-D::NGL::::::::::::::::::::::::VE:MH:E
hla0360         :::EA:::::::::::::::::::E:::F:::::::::::::::::::::::::E::TG:
rrnAC0525       :::::GQAVERVADSETVVAAT::ALS:L:::::::::::::::::::::::::L:::GE
Hmu1484         :::E:GQAVTR::DGETVVPAA:G:LS:::::::::::::::::::::::::::M::D:E

consensus       TWGDALRDRLRDSYGTHIAMGGLVEQLPRAENRVTLDPSRTDDHGNPVPEIHWSLDARTR
#oth            41..41434243321322221111113.2521112.2533..31.2...31411422345
rrnAC0110       QL::::ELPTTSGPPYPLSIR:AG:M:::PD::::::Y:K::N::R:::S:NL:DG:HAQ
Hut2577         G:::G::E:IS:T::S:LTV:A::::T::R::Y:G::::::::::::::::::G::D:::
VNG1035         D::::MC::I::AS:::::V::::::Q::P::::R:H:E:::V::::::DVV:::S:YE:
HQ3365A         ::::E:LEQ:QA:::N:::V::::::::H:S::I::NH:E::T::::::HVE::I:E::S
HVO_1294        ::::D:::Q:DE::::::S::A:::::::ED:Y:G::RAT:::L:D::::::::V:EQ:E
Hbo0249         ::::E::SQ::::::::L:::A:::::::::::I:::Q:::::::::::HVE:::::Q:K
hla0360         D:::T:VE::::G::::V::::::::::QSDSY:G:::D:::::::::::::::VGD:AL
rrnAC0525       E:::T:LSS::E:::NS:::::::G:P::K:::::::T:T:::::::::D:K::WGD:LE
Hmu1484         ::::D:L:D::AG::N:V::::::G:P::::::I:::::T::::::::::::::WGE:VL

consensus       RTIERANEIQRRVLEELGAEIEWTVGPDDTGPAYHHMGTTRMGTDPDESVVDADCRTHDL
#oth            22221114..441141.1232512311361.113.1......121.251..123311.11
rrnAC0110       E:M:HCL:::KSI:T::::::TDVKTLSGR:MST::::::::::::A::::NEQ::::::
Hut2577         ::LR:::A::ETI:A::D:::T:QI::EN::::F:::::::::::::G:::::RGQ::::
VNG1035         :::::::::::EI:T::::D:::::::E:::::F::::::::::::A:::::PRL:::::
HQ3365A         :A:R:::N::::I::T:::S::::::::S::::::Q::::::::N:NQ:::N::::::E:
HVO_1294        AALS:::G::T:::D:::I:DR::::::E::::::::::::::D:::::::::E::A:::
Hbo0249         AALR:::::::::F:::::TVD:::::EH::::F:Q:::::::::::S:::::EM:::::
hla0360         :::::::::::S:::::::::::VA:::A:::::::::::::SA:::AG:::::::::::
rrnAC0525       :SLS::::::HA::S:::VD:S:::::A:::::::::::::::::::K::::PQL::::V
Hmu1484         :::::::R::HA::S:::VD:G::A:::S::::A::::::::::::AA::::P:L:::::

consensus       ANLWIASSSVFPTAGAMNPTLTIAALALRAADHIRERL-
#oth            2.11221....2.2.11......1..11142242535.1
rrnAC0110       :::::::::::T::::N:::::::::::KT::::D:E::
Hut2577         ::::L:G::::::G:::::::::::::::TV::LESV::
VNG1035         S::SV:::::::::::::::::::::::K:::::AA:::
HQ3365A         S:::VVG::::::G::::::::::::S:::::A:FDT::
HVO_1294        D::::SG::::::G::::::::::::SV:L:ESL:AA:G
Hbo0249         S::::VG::::::G:::::::::G::S::::AA:ESS::
hla0360         D:C::::::::::S:::::::::::::::V::DV:D:::
rrnAC0525       :::S:::::::V:::S::::::::::::KC:::VS::::
Hmu1484         D:C::::::::::::S:::::::::::::CG:ELD::::