|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1539 | hla2369 | HQ1514A | VNG1280 | Hut0456 | HVO_1093 | Hbo0598 | rrnAC0962 | Hmu1464 |
1186 | hla2369 | 1647 | 850 | 897 | 1002 | 1042 | 1049 | 975 | 974 |
1030 | HQ1514A | 850 | 1511 | 899 | 919 | 992 | 1004 | 968 | 973 |
1104 | VNG1280 | 897 | 899 | 1511 | 1064 | 1033 | 1020 | 1025 | 982 |
1226 | Hut0456 | 1002 | 919 | 1064 | 1611 | 1113 | 1095 | 1017 | 1051 |
1286 | HVO_1093 | 1042 | 992 | 1033 | 1113 | 1567 | 1261 | 1051 | 1117 |
1285 | Hbo0598 | 1049 | 1004 | 1020 | 1095 | 1261 | 1592 | 1050 | 1074 |
1209 | rrnAC0962 | 975 | 968 | 1025 | 1017 | 1051 | 1050 | 1538 | 1120 |
1253 | Hmu1464 | 974 | 973 | 982 | 1051 | 1117 | 1074 | 1120 | 1581 |
221 symbols consensus ---MKKTIEEHAARFSDAAAEYDDSQDSDEYRACANLVVEHADPDSDDVVLDLGTGTGAI #oth 111..1121...2..135.24..1313132.32.142.241.12544.1...1.2..... hla2369 VAG::::V::::::::EK:::::::-K::::H:::S:::DY:::::::::::::A::::: HQ1514A ::::::::D:::E:::E::ST:::E:::EP::M::QQ::N::AST:C:T:::I::::::: VNG1280 :::::::L:::::::D:V::A:::D-QTP::NE:VA::L::::VGGA:T:::::C::::: Hut0456 :::::R:L:::::::DEQ:DS:::G-N:P:::::::::I::::::DG:T::::::::::: HVO_1093 ::::::::::::::::HI::::::::::::::::VS:::HY:::SPE::::::::::::: Hbo0598 ::::::::::::E:::A:::::::E::::::L::::::::::::TDE::::::::::::: rrnAC0962 ::::::SLD:::E::::H:DA::ED:::AA::::V:F::D::A:E::::::::::::::: Hmu1464 :::::RS:D:::D::::H::D::E::::E:::E::D:::R::A:AA:::::::::::::: consensus ALALAPDAARVVGRDISEGMLEQAREKADERGIENVEFGEGRFREPNV--DRDVDIVTSN #oth .13.132.41121....2..2231.4..343122.22.23.1..2.22331642.1.11. hla2369 ::::::H:E::LA:::::::M:EG:R::::::LA::::AY:E::::E:DS:QPI:::::: HQ1514A :FE:TSA:D::I:::::T:::D:::M:::IEN:::IS:A:::::D:::DS:IT::::::: VNG1280 ::G::A::G::::::::D:::T::::::TT::VD::A:DT:::::::Y:::G:A:V:V:: Hut0456 ::::::A:G::I::::::::R:R::Q::AD::L::T:::::::::::LPE:A:::V:V:: HVO_1093 ::::::::K::::::::::::::::T::A:V:::::::D:::::D:::GD:EQI:::VT: Hbo0598 ::::::::K:::::::::::::::::::QDA::D::::::::::D::Y::EDE::::::: rrnAC0962 :F:::S:::EII:::::D::::K::::::G::V:::S::D::::A:::::::P::::::: Hmu1464 ::P::DA::E:::::::::::::::T::T::::D::S:::::::::S:::::E::V:::: consensus FAMHHLSDDEKREAIDTIAALEPRRFVLGDVMFFGEPDPDAPFYSPEVDDPATVGTLADA #oth ..1...3.21.12..531121313111....21.2521.231..2.2........3.11. hla2369 ::L:::A::::::::REM::TGA::I:::::A::E:::::::::G::::::::::::VE: HQ1514A :::::::::::CN::TV:S::::D::I:::::L::AAN::ES::D:S::::::::I:V:: VNG1280 ::::::::A:::S::::::G:N:H:I::::::L::G:N::::::::A::::::::V:::: Hut0456 ::L:::::A::::::E:::G:D:A:::::::L:::M::::E:::::A::::::::::V:: HVO_1093 ::::::::E::::::GV::D:::::::::::::::T::::E::::::::::::::F:::: Hbo0598 ::::::::E::::::AV::D:N:DK::::::::::T:::EK::::::::::::::::::: rrnAC0962 ::::::G::::::::::::D:G:::I::::::L::DD::::::::::::::::::V:::: Hmu1464 ::::::D:EA::::::A:::::::::::::::::D::::SI:::D:S::::::::V:::: consensus FTDAGFALTAVERVHEQVGVLVAERVPDA------------ #oth 1..2.11212..3.12.11.1.1.25334444444321111 hla2369 :::E:::V:::::::D::A:I::::LG:RGEDAERGTARSR HQ1514A L:::::VISE::F:::::::::::Q----:::::::::::: VNG1280 :::::Y:V::::M:::::::::::TR---:::::::::::: Hut0456 :::V:::::V:::::D::::::G::::TGTTGEGGQ::::: HVO_1093 L:::::V:::::S::::::::::::A:T:DE:::::::::: Hbo0598 L::E::V::::::::::::::::::FG::GKRVSLDE:::: rrnAC0962 :::::Y::::::M:T::A::::::::KSD:::::::::::: Hmu1464 ::::::::::::M::G::::::G::::::EAVDQS::::::