|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1456 | VNG1345 | rrnAC0017 | Hmu1087 | Hut0312 | hla1874 | HQ2466A | HVO_2907 | Hbo2686 |
858 | VNG1345 | 1530 | 604 | 643 | 585 | 679 | 647 | 693 | 742 |
891 | rrnAC0017 | 604 | 1382 | 888 | 691 | 659 | 610 | 703 | 635 |
818 | Hmu1087 | 643 | 888 | 1413 | 714 | 668 | 592 | 692 | 649 |
885 | Hut0312 | 585 | 691 | 714 | 1391 | 719 | 609 | 739 | 725 |
1030 | hla1874 | 679 | 659 | 668 | 719 | 1758 | 714 | 992 | 886 |
939 | HQ2466A | 647 | 610 | 592 | 609 | 714 | 1549 | 862 | 1012 |
1137 | HVO_2907 | 693 | 703 | 692 | 739 | 992 | 862 | 1564 | 1032 |
1119 | Hbo2686 | 742 | 635 | 649 | 725 | 886 | 1012 | 1032 | 1651 |
238 symbols consensus -----------------------MAKVSIGLRGWRFEEDEVFTDDGEFRPLDEMPDDTRQ #oth 11111111111111111111111.2..11..1....2.2221231132121522221114 VNG1345 ::::::::::::::::::::::::S:::::::::::D:::L:DG::-::SRS::D::::: rrnAC0017 ::::::::::::::::::::::::S::N::::::::N::-:LGS::RV:::KT:EPE::: Hmu1087 ::::::::::::::::::::::::G::N::::::::D:::::D:::RV:::GV:DE::KA Hut0312 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D::D:::SLKT:V:::P:::S hla1874 MPRERGARPRKDALLSAPRVASR:::::V:::::::D:E:I::::E:LK::::I:EEP:E HQ2466A :::::::::::::::::::::::::::::::Q::::::S:I::EE::::::A:I:::::: HVO_2907 ::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::S:I:::E:::K::::I:E:P:E Hbo2686 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::E::::::::V:::::R consensus RLLRLTELVGEPCDACYLIHGDADIQRCNQAEIVYGEPMGEVLLCSDHEPDFLYWFREEG #oth .241.351333..11.2132.2234631342421....421.21.64..3113..11.32 VNG1345 ::E::PL:L:Q:::V:::SD::D:----ATPDA:::::GA:::V:NA:::T:Y:::L:A: rrnAC0017 :::V:A:R:VD:::::W:::::E::EQ::V:DAI::::::::VV:::::T::I::::::D Hmu1087 :V:::::RLSD:::::W:QY:QD:P:Q:SP::VI::::R:::I::R:::T::V:::::VA Hut0312 :I::::A:::::::::::E::E:NVAE::VGS::::::T:T::::GP::S:::::Y:::: hla1874 ::V::VG::E::::V:::E::E:EVH::::::::::::N::::::PE::::LI::::::: HQ2466A ::V:::Y:H::::M::HC:Y::EQKR:::E:T:::::::A:::::AE::A::::::::GD HVO_2907 ::M::VS::E::::::::::::EE::Q:R::A::::::RE:::::EH::::::::::::D Hbo2686 ::I:::Y:Q:K::::::::::E:EKK:::::::::::::E:::::::::A::::::::G: consensus GSELAGDADLADAFHEWFAAGNRAPDGYGGLEHVDEDPDELPDP-PDADELQRR----LE #oth 14234.2652332.22.1221112.23.313.1.2121131.342.14624522122234 VNG1345 :D:HE:T:A:Q::::::V:::::E::W:::P:::ET:::AV:::G::TSQ:APGEPVPVT rrnAC0017 :EAY:::T:::S::::::LD:::::E::V:::::::::TA::EA:::R::AIPG:::::K Hmu1087 DE::I:TR::Q::::G:::D:G:::EA:A:V::::::::GV:ET:::PH:ELPG::::I: Hut0312 ::D:::EPE::N::Q::::D:G:::A::::::::E::R:::::VN:G:LDSLEDELCAMD hla1874 :::H:::L:FG:R::::V::::E:::::APV:::E::::G:::L:::QQDI:E:::::V: HQ2466A :ADI::TDGVQTE:VN::TH:::S::N:D:I:::VT:::S::S::::::::T:::::::N HVO_2907 :RD:V:::VF:::::::::::G::::::::::Y::TE:::::S:::::N:I::::::::: Hbo2686 :::YR:EETFR:E:::::::D::::::::::::::TG:::::T::::PA::N:::::::N consensus EEF-EG-R--IDL---------------------EALDEDDL--DDLDLDLDYPTK-- #oth 24522232222223111122343323212211333665322221342.3352223521 VNG1345 VDLP:DEQAKL::L::::::::::::::::::::::A:F:GVS:::::I:A::::SDE rrnAC0017 ::V:--:-::---::::::::::::::::::::::QM::E:::::TI:M::SDLDV:: Hmu1087 ::I:--:-::---::::::::::::::::::::::RVADE::::EA::V:::DLDV:: Hut0312 :SE:--:-::---:::::::::::::::::::::REELDA:V::E:::::I:E---:: hla1874 QG::::D:::::IL::::::ELAGESDDKEEDAADK:S::::AESGV::ST:::SNR: HQ2466A Q:Y:D:K:KR:::RTGEISWVNGSG:::::::::DTTN:E--::SS::INRE:::T:: HVO_2907 :N:V::E::::N:R::::::DYGPGADDE:::DGTP:T:::::::GV:::T::::::: Hbo2686 :NY:::K:KR:::KTGEITHDEWSGDEDETEDED::DTM::V::G::::GQ:::::::