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| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2028 | VNG0587 | HQ1547A | Hut1274 | hla2656 | rrnAC0736 | Hmu0761 | HVO_0845 | Hbo0690 |
| 1254 | VNG0587 | 2309 | 908 | 983 | 934 | 932 | 1016 | 1052 | 939 |
| 1263 | HQ1547A | 908 | 2547 | 862 | 1005 | 898 | 934 | 1073 | 1041 |
| 1243 | Hut1274 | 983 | 862 | 2082 | 928 | 1002 | 1039 | 985 | 918 |
| 1347 | hla2656 | 934 | 1005 | 928 | 2135 | 953 | 1018 | 1116 | 1103 |
| 1332 | rrnAC0736 | 932 | 898 | 1002 | 953 | 2322 | 1445 | 1031 | 944 |
| 1362 | Hmu0761 | 1016 | 934 | 1039 | 1018 | 1445 | 2172 | 1074 | 1015 |
| 1467 | HVO_0845 | 1052 | 1073 | 985 | 1116 | 1031 | 1074 | 2078 | 1197 |
| 1336 | Hbo0690 | 939 | 1041 | 918 | 1103 | 944 | 1015 | 1197 | 2054 |
374 symbols consensus MADSSS---------------------PD--DAPADRGEDA-------GDADAADEEAD- #oth 142433333432322222122212222324554332335431122344535334524431 VNG0587 :T:::A:::::::::::::::::::::GGDETE::::TTQD:::::::T:::KSV:SMT: HQ1547A :TE:::DETAISDDTDAVAAEDADDSS::QT:TAQQ:THED::GDSSQ:RNGS:N:HP:E Hut1274 ------:::::::::::::::::::::--::M:::ESTN:::::::::---P:G:S:PS: hla2656 :E:T:TEPDPESP::::::::::::::::RSPDES:G::SPRGDASHESSG::P:DAD:: rrnAC0736 :::PD:TSPTEDERGNTPADAVAAETE:GEPG:TG:SA:T:::GAGES::DGESG:AL:: Hmu0761 :::PQ:TPPGDD:::::::::::::::A:QQG:T::S:I::::::DGEQSSGS:TD::S: HVO_0845 :S:::-:::::::::::::::::::::--::S::::D:SSP::::::DA:::::MSD:E: Hbo0690 :::A:-:::::::::::::::::::::--:::GT:::QT:L:::::::----EDT:::E: consensus ----LAALRAEVEEKYDFENFGPADMAEMTAEEWEAAFDPDSWITGEELLDRVEADLRSR #oth 11114221132.122...23...32.12.232..11..1212.12.23..1.2151.14. VNG0587 ::::ASDIA:::DDE::::E:::RQ::::D:D:::::::::A::::GA:::::AD::::: HQ1547A DEQAI:E:::::::T:::GD:::E::::::L::::::::::T::V:::::::::TE:KA: Hut1274 :::::SE::EQ::::::::S::::E:D::DR::::::::TET:::::K::::L:::::Q: hla2656 :::::::::ER:D:E:::DE:::S:::R:S::::D:::::::::::DR::::A::E:K:: rrnAC0736 ::::TE:::KQ:::::::D:::::::::::::::DV:::EE:::I:D::::::AR:::N: Hmu0761 ::::VE::::::::::::DD:::E:::K:::Q:::V::EEE:::::GA:::::AD::::: HVO_0845 :::::::::E:::A:::::::::::::K::P:::D::::::::VV:::::::::QE::Y: Hbo0690 :::::E:::Q:::::::::::::S:::::S:Q::::::::::::V:::::T:::KE:K:: consensus VARRDVFAVVERVTE-GEPRVLAYSDEGYAVVYPDGSVEGEGTVLRDVKPTVALCSMDSY #oth 1.4.11.122..44441322211...11..3.331.312.3..13..12.211.11.111 VNG0587 ::T:::::::::D:ID:::V:::::::::::::E::T:::S::::::::::::::::::: HQ1547A ::I:E::GI:::TD:G:QD::V::::N:::T:FA:::::::::IR:::E::::::::::: Hut1274 ::D:::::RI::E--:-DD:L::::::S:::::G::::::::::R:::E:S::::::::: hla2656 I::::::G:L:::R:D::D:L:V:::::::I:R:T:E:T:Q::::::IE:I:::AA:E:: rrnAC0736 ::N:::::RI::HQD:-P::::::::::::I::::::L::::::M::::::::::::::: Hmu0761 ::T:E:::R:::H:D:-PQ:::::::::::L:F:::T:::H:::::::::::::::::D: HVO_0845 ::I:E::::L:::::N::::I::::::::::::::::::::::::::::::::::::EDF Hbo0690 ::::EI:G:::::RVE:::HI:V:::::::L:T:::DLQ:::::Y:::R::LV:::::DF consensus DVPEPPADASLPEPDEVPEGGGELGNLMLQIIAIAQLLAGVALLGAWFLADGLV------ #oth 1232215254..4.3214324121.1411.42233.422.34.23342255555111111 VNG0587 :A:D:::::G::D:Q:I::SASGF:TTL::Y:G::::V:::L:FL:P:VY:P::RQCPPV HQ1547A ETMN::::::::::RD:VK:S::F:::::::V:A::MIV::G:::::LFIST:E:::::: Hut1274 :::D::RGDV::D::::E::D:::::V:I:LLS:::::G::V:::YG::GN:--:::::: hla2656 ::::::D:W:::H::T:T::T::F::::I:VV::V:V:::A:::I:S:VI:LN-:::::: rrnAC0736 ::::NVP:RP::Q:E:::::::::::W:::A::G::F::::::::GAA::T:G::::::: Hmu0761 ::::::S:DP:::::::::::S::::W:::L::GI:::::IV:::GG:::AIDQ:::::: HVO_0845 E:NDA:ETVR::::E::AQ:T:DF::R::::V:FG:::G:F::I:::LVLPD:D:::::: Hbo0690 E:A:::E:F:::A:E::VDQSS:::::::::::AG:I:G:IT::VL:LFT:LIP:::::: consensus -------------------------TIIAPVAGLAFLLIGLFLFVVVANARLSDRFRAEE #oth 1111111111111111113344242633243223412322321133.......13..211 VNG0587 SVPGSTARACEIAGASFTLHPLGDSG:::AI::VG:V:F:V:ML:L::::::::::::D: HQ1547A :::::::::::::::::::::::::::A:::TAVI:V:::F:::I::::::::::::V:: Hut1274 :::::::::::::::::::::::::--::F::::FL:G:::::L:::::::::EA:::DA hla2656 :::::::::::::::::::::::::::V::AM:IV::::::L:::M:::::::::::S:: rrnAC0736 ::::::::::::::::::IGNRGTSIALLV:::V::IGVS:V::FT::::::::T::S:: Hmu0761 ::::::::::::::::::IGGAGASPVLLI:::::::A:A:V::L:::::::::K::S:: HVO_0845 :::::::::::::::::::::::::S::::L:::G::V::F::::::::::::::::::: Hbo0690 ::::::::::::::::::FASNARMN:VP:::SAF:::::I::::::::::::::::::: consensus YRDRLRAI--------------GLEDGERPEFVPADDAD---GSVVEEDTRDAG------ #oth 1.4..1331111111111111124443311311175444434346655444434444322 VNG0587 F:A:::SV:::::::::::::::VGTDD::A:::QT::::::TGTA:P:EDTP-:::::: HQ1547A ::N::Q:LETTPEPEVTSNERTA:DTE:AKSNIDINND:TNTSMSSDTA:A::NIDVNPN Hut1274 ::T:::QM:::::::::::::::A:GD:::A:::D:::ELAA:::RQPEPNQD:DRPRER hla2656 ::E::::L::::::::::::::-RQAK:::D:::VE---::::G::N:::::E-:::::: rrnAC0736 ::::::::::::::::::::::::::::::::::ELSPQNSGSEEGAGE:DE:::::::: Hmu0761 ::::::::::::::::::::::::S::::::::::LEP::::S:GES::GQHE::::::: HVO_0845 ::::::VM:::::::::::::::::G:S::::::TF:G:ENVA:L::APE:::LSSEG:: Hbo0690 ::N::::V::::::::::::::--QE:G::D:::L::GS::::TAL:SND::DSNGAR:: consensus -------------- #oth 12222222221122 VNG0587 :::::::::::::: HQ1547A ANSHTDSEEHTDSI Hut1274 ASTDDTVVGDTDAE hla2656 :::::::::::::: rrnAC0736 :::::::::::::: Hmu0761 :::::::::::::: HVO_0845 :::::::::::::: Hbo0690 ::::::::::::::