Home |  Text search
8 genomes BUD0895 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1927

rrnAC3287

HVO_2208

Hbo1918

Hmu2463

Hut1975

hla1362

-

HQ3144A

Pairwise sequence scores
Consensus score764 VNG1927 Hut1975 rrnAC3287 Hmu2463 hla1362 HQ3144A HVO_2208 Hbo1918
407VNG1927 809 261 296 288 272 273 289 295
456Hut1975 261 801 427 430 312 259 326 340
531rrnAC3287 296 427 770 598 364 330 379 370
510Hmu2463 288 430 598 787 369 321 360 388
503hla1362 272 312 364 369 856 389 454 406
494HQ3144A 273 259 330 321 389 761 540 565
554HVO_2208 289 326 379 360 454 540 780 611
555Hbo1918 295 340 370 388 406 565 611 788

119 symbols
consensus       --------MVSVAGLVGLLVIVLVHTAIAAVMTRFFRIRLNTRWGAVIYSLLLIPVVLLV
#oth            11111111.322434223322233121121221.1..21.3.21.232122214133221
VNG1927         :::::::::::A:TAA:VAL::V::A::::FAA:::::T::::L:::::T:V:V:::YV:
Hut1975         :::::::::TG::DA:::A::::LN::VV:LA:::::V::H:::::A::AV:FGTLI:F:
rrnAC3287       ::::::::::::::II::::::::NS:VT:L::::::V:::::::SLV:::::C:::MV:
Hmu2463         ::::::::::A:ID::::::::::NS:VT:L::::::V::D::::S:::::::C::A:F:
hla1362         MPRAPWSN:LALF:F:S::AL:AF::L::G:A:::::L::::S:::IV:T:V:T:ML::I
HQ3144A         ::::::::::::V:VILFIAVLTI::LV:::L::Y:::::K:QL:Y::F:F::::F:::I
HVO_2208        ::::::::::::VN::LMGALIVL::L::::::::::L::K:Q::YIL:A:F:::L::::
Hbo1918         :::::::::A::LN::LFG:VLV:::L:::::::::::::K:Q::Y::::::::::::F:

consensus       TTLVFSGVLGIGA--NLGSPTAVVGVTIGLPLALGFTIDYLWVPPPEEVE-LPETQ---
#oth            321213.2132.411212143324232234.242.42212212.21222221.335321
VNG1927         ::IL:-::::V::G:TFSD:GSLIVT:WAF:FF::WSVHLF:L::V::FSDR::NTRQ:
Hut1975         :::ILA:F::L:P::::D:RV::::L::VG::TI:L::::F:M:D:AA::::::PADRP
rrnAC3287       ILI:L:::FKL::::::::Q:::LL::VVI:::T:I:F::F:M:A:D::::::ASMD::
Hmu2463         LL::L:::FKL:G::::::RAL::LA::FF::G::L:F::V:M:A:D::::::::MRQ:
hla1362         SM:::T:::NV:TGI::::::L:::LLVA::VV::AA::::Y::::DD:::::D:N:::
HQ3144A         L::L:T:I::::V:::::DA:TAT::M::::F:::::::T:Y::A:::YD:::D:::::
HVO_2208        S:::::::F:::V:::::::::AL::M::M:::::::::T:Y::::::Y:N::NSR:::
Hbo1918         :::::::I:Q::P::D::DT:TAF::M::M:::::::::T:Y::::::Y:::::::N::