|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1085 | hla2649 | HQ1554A | HVO_0838 | Hbo0697 | rrnAC0728 | VNG0578 | Hmu0769 | Hut1265 |
582 | hla2649 | 1101 | 442 | 514 | 518 | 401 | 413 | 334 | 397 |
626 | HQ1554A | 442 | 1112 | 582 | 726 | 475 | 507 | 322 | 483 |
761 | HVO_0838 | 514 | 582 | 1092 | 736 | 567 | 513 | 494 | 544 |
784 | Hbo0697 | 518 | 726 | 736 | 1107 | 578 | 529 | 422 | 584 |
741 | rrnAC0728 | 401 | 475 | 567 | 578 | 1154 | 601 | 566 | 619 |
676 | VNG0578 | 413 | 507 | 513 | 529 | 601 | 1106 | 439 | 582 |
603 | Hmu0769 | 334 | 322 | 494 | 422 | 566 | 439 | 1061 | 565 |
750 | Hut1265 | 397 | 483 | 544 | 584 | 619 | 582 | 565 | 1064 |
160 symbols consensus --MPPLQFFGPLDTL--VGP-------VLEYVILVLAVANMATRILAHRRHVRQAKDG-G #oth 13342142221.132321321111111624233122122.221.622.25.15.234212 hla2649 :::D::::LV::GW:SE::::::::::M:P:A:::M::::L:::HI:::H::D:GS:::- HQ1554A :::H::::II:::A:AA:A::::::::I:A:IT:G::LL:LL:::VQ::F:LK:::ASDD HVO_0838 :::H::::LV:::Q:AA:E:::::::::VPH:A:::VL::F:::F:G::S:::::EE::: Hbo0697 MS:Q::::LV:::A:EA::::::::::::K::::G:VL:::L::V::::T::::::E:D: rrnAC0728 :MQ:SVT:::::::I::L:SPTVGGALLI::::FGVVIV:FL::Q::::S::K:Y:ND:: VNG0578 MVD:SVAI::::::::::A::::::::Y:::A::A:::L:FVS:RI::AQ::T::A:::- Hmu0769 :ME:FVNI::Q:::-::LQS:::::::FI:P:L:::V:::::::Y:::N:::E:YE:::: Hut1265 :::VSVSL:::::::::L:N:::::::NVV:LL:::::V::V::::::::::S::AS::: consensus AEALSRYLPHTFTNGGLVLASFLYLTLHHHGGMVLSVLVLGVFIADFFEFEARKVEARRD #oth 412221342.431242.22311312333112.2122121313231.1..2.1.31...43 hla2649 -DSVEP:T::A:::I::M:LT::FVLDAPVS:TI:A:I:ITML:::L::L:::N::::N: HQ1554A D:G:N:W::::A:TV::::V::::MIP:P:::::M:::A:::LF:::::Y:S:L::::SK HVO_0838 E::I:::::::I:S:A::VT:::F:VVEP::::::::::V:M:VT:::::::::::::T: Hbo0697 D:S::::::::V:TLL::::::AFMI:EP::::::::::::::L:::::::S:C::::SK rrnAC0728 :::V::HPA:::S:IA::VL::F:M::::::::::::::::AV:T::::::S:::::::: VNG0578 P:::::HWF:S::TW:::ITTLY:::::::A::::::::::::F::::::::::::::DG Hmu0769 :D:I::FI::EA::VL:M::::Y:::VN::::::::MF:A:LL:T:L::::S:::::::: Hut1265 :D:V::F:::VVS::L:I::::Y:::::::::F:TT:::::L:LT:::::::::A::::E consensus S-PLERPKGAIVASLLVLLYAGYQSLFFLVAGYWNAIV-- #oth 524121.221242242213122122112324261342111 hla2649 M:SI:A::SS:A::::::VF:S:YA:W:::S:I::QF:IA HQ1554A :KQ:S::IA:VG::AFM::::A:::V::VIEPV::S:::: HVO_0838 K::::::N:SL::AG:::::::F:::::::SD::SL:::: Hbo0697 :LE:::::S:V:G:V:::M::A:::::::I:D:::::I:: rrnAC0728 I::::::::::::A:V:FM::::::::WVIK:P:S::::: VNG0578 R:S:::::::L::ATFM:::VA:L::::I:KPL:TQV::: Hmu0769 V:::D:::ASLSLWT:S:::L:F:M::---T:TIGT:I:: Hut1265 V:T:D::::::T::::M:G:V:::::::I::PA:::VI::