| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4235 | Hbo0068 | HVO_1479 | VNG2156 | Hbo3324 | VNG0631 | VNG2064 | Hut0754 | HQ1634A | HVO_0975 | Hbo0466 | NP2284A | Hut1399 | Hmu2319 | rrnAC1432 | Hmu1954 |
| 1731 | Hbo0068 | 4284 | 1848 | 1069 | 1085 | 1112 | 1060 | 1066 | 1226 | 1182 | 1165 | 897 | 875 | 1119 | 953 | 1101 |
| 1906 | HVO_1479 | 1848 | 4109 | 981 | 1124 | 1211 | 1153 | 1117 | 1288 | 1311 | 1307 | 1005 | 919 | 1315 | 1011 | 1106 |
| 1905 | VNG2156 | 1069 | 981 | 3987 | 1786 | 1192 | 1407 | 1303 | 1381 | 1296 | 1351 | 869 | 1049 | 1158 | 1115 | 1196 |
| 1954 | Hbo3324 | 1085 | 1124 | 1786 | 4865 | 1328 | 1300 | 1286 | 1527 | 1432 | 1507 | 1034 | 1064 | 1192 | 1154 | 1183 |
| 2016 | VNG0631 | 1112 | 1211 | 1192 | 1328 | 4582 | 1569 | 1279 | 1454 | 1452 | 1574 | 1130 | 1062 | 1360 | 1060 | 1147 |
| 2179 | VNG2064 | 1060 | 1153 | 1407 | 1300 | 1569 | 4325 | 1475 | 1528 | 1549 | 1483 | 1314 | 1241 | 1372 | 1315 | 1415 |
| 2133 | Hut0754 | 1066 | 1117 | 1303 | 1286 | 1279 | 1475 | 4251 | 1566 | 1391 | 1549 | 1213 | 1080 | 1248 | 1322 | 1321 |
| 2484 | HQ1634A | 1226 | 1288 | 1381 | 1527 | 1454 | 1528 | 1566 | 4664 | 2252 | 2687 | 1363 | 1225 | 1465 | 1304 | 1317 |
| 2535 | HVO_0975 | 1182 | 1311 | 1296 | 1432 | 1452 | 1549 | 1391 | 2252 | 4410 | 2616 | 1311 | 1210 | 1556 | 1402 | 1402 |
| 2587 | Hbo0466 | 1165 | 1307 | 1351 | 1507 | 1574 | 1483 | 1549 | 2687 | 2616 | 4736 | 1275 | 1232 | 1477 | 1334 | 1392 |
| 1798 | NP2284A | 897 | 1005 | 869 | 1034 | 1130 | 1314 | 1213 | 1363 | 1311 | 1275 | 4537 | 1162 | 1372 | 1405 | 1326 |
| 1910 | Hut1399 | 875 | 919 | 1049 | 1064 | 1062 | 1241 | 1080 | 1225 | 1210 | 1232 | 1162 | 4754 | 1491 | 1628 | 1771 |
| 2203 | Hmu2319 | 1119 | 1315 | 1158 | 1192 | 1360 | 1372 | 1248 | 1465 | 1556 | 1477 | 1372 | 1491 | 4301 | 1740 | 1722 |
| 2028 | rrnAC1432 | 953 | 1011 | 1115 | 1154 | 1060 | 1315 | 1322 | 1304 | 1402 | 1334 | 1405 | 1628 | 1740 | 5085 | 2047 |
| 2124 | Hmu1954 | 1101 | 1106 | 1196 | 1183 | 1147 | 1415 | 1321 | 1317 | 1402 | 1392 | 1326 | 1771 | 1722 | 2047 | 5019 |
844 symbols consensus -------------------------G-DARDRA---------DR-DRTLLAVVAVTALAL #oth 112134343354545556455557551589646112235557758854483243344623 Hbo0068 ::::::::::::::::::::::MSS::::S:D::SVGVFGLEF:T::VT:::::LA:::: HVO_1479 :::::::::::::::::::::::::-:MIPS::::::::::GR:P:::T:::::LA:A:: VNG2156 :::::::::::::::::::::::::-:------:::::::::--:--------------- Hbo3324 :::::::::::::::::::::::::-:MSKN:S:::::::LL::V:AIT::::GIALVGT VNG0631 :::::MPTAPALQQHATLVCAPIRPT::NM:ST:::::::GR::RVVVAG::A::V:G:: VNG2064 :::::::::::::::::::::::::-:MR:S:D::::::::::SSP:VAA:::::::A:: Hut0754 :::::::::::::::::::::::::-:------:::::::::--:----------VFV:: HQ1634A MSQDEVPEGTESISTGERSRLRIQLR:T:IESHVSTLPLLQTI:TQ:::IG:IT::LF:: HVO_0975 :::::::::::::::::::::::MST::SGTE::::::::::VARS:A:::ILG:::::: Hbo0466 MSSDDAASGPPSASAATDGSVATRS:V::AT:T::::PTRTTVDYR::::G:L:LSV::: NP2284A :::::::::::::::::::::::::M:NL:::-:::::::::--:--:VQ:::GL:VV:V Hut1399 :::::::::::MAEAVDAVDPPSAD::SP:::S::::::::FVAEHPVVV::LTI::IG: Hmu2319 ::::::::::::::::::::::MVA:::IDW::::::::::RASA:PA:TG:::::V::: rrnAC1432 :::::::MPHVLEPDMAESSLLSALH::F:::S::::RSWFA:DPRAAVKL:::::L:G: Hmu1954 ::::MHSSGPDTDSERPPQETDGEA:::PG:DG:::::RSLRTLATT:VGL:L::A:VG: consensus VARLVALGGRIAHWDEGRVGYWILRYHETGAFSYRPIVHGPFLQHVNRWLFAVLGATDFT #oth 54144612713325112212215365723.746.14241..2365334551635243.34 Hbo0068 L::::G::S:PF::::A:::::A:::L:::::E::L:AG::L:Y:LD:LV:::::VS:M: HVO_1479 :V:::G::D:PL::::A:::::S::SL:::F:::::VAG::LVY:LS:PSL:LV:::::A VNG2156 --------------------------M:H::WE::::L:::LFAR::SLV:G:V::::A: Hbo3324 AL:::G::T:VFQY:::W::::::QFM:::VWQ:::::::::FIR::SAI:GAI:VS::S VNG0631 A:::AG::A:PF:A::A:::::::D::A:::W:::::::::::F:::DA::GLF::S:AV VNG2064 L:::W:::W:V::Q::A::AD:T:Q:MDL::WQ::::I:::::P:::GVV:D:F:::::: Hut0754 :::::::DV:::::::::::::::HTAA::WWE::::I::::V:::T::T:EIG:VS::: HQ1634A IL::S:::::VF::::::::::::::::::VHT:::::::::IPIID::::EIAPI::A: HVO_0975 L:::AD:::::F::::::::::::::::::E::::::I:::::PV::DY:::::P::::: Hbo0466 GM:::::::::F:::::::::::::::DS:YHV::::::::::PV::D::::IAPVS::L NP2284A IL:T:S::S:V::::::::A::V:E:GD::VLF::::::::L:KL::AP::EL::::::A Hut1399 L::FAI::S:::::::A::A::VDYTF:::R:A:NSHT:::VI::LS:Y::GI::PS:T: Hmu2319 :::::D:::::::F:::::A::A:E:A:::SI:::Y:::::LV:YADAA::Q:::TG:AV rrnAC1432 :L:IA:::S:V::F:::::A::A:HLRDS:S:A::Y:I::::I:::DS:M:T:AAP:::: Hmu1954 :L::AF::D:::::::A::::::TY:V:::S:A::R:I::::I::::G:::PLV::N::: consensus ARLPVALIGGLLPLSALLFRERLRDVEVVALAVLLAANPVLLYYSRFMRSDVLVAAFMFA #oth 3.322.241231.4411.2.71143533352243.2411332.11..3.41212131315 Hbo0068 ::::::VL:AA:::C:::::D:FD:A:SLVF:AF::F::LFV:::::L:G::PL:F:AL: HVO_1479 L:::F::F:AA::IA:::::G::A:D::LG::AV:::::I:V::G::A:G:::AVG:ALV VNG2156 :::V:::T:A::::A:W:::T::::A:LI::GAA::C::::V:::::::K:LPL::C:LL Hbo3324 :::V:::L::I::IA:::::RH:::ST:L:F:L::T:::I:::::::::Y:LPL:::SLF VNG0631 ::A:::VV:::::GV:W:::G::D:T::I:::G:::FT:T:V:::::::::::::::SL: VNG2064 M::V::VV::::::T:W:Y:T::S::::G:::::::::::V::::::::N:L:L:G:::T Hut0754 M::::::::SA::AT:::::S::::::TI::G:V:::::L::::::::::::P::::V:V HQ1634A ::::::::::::::A:::L:D::::I::IS::::::V::LMI:::::::N:::::::A:I HVO_0975 :::::::V:::::::VW::::H:GRDVL::::FF:::::L:V:::::::N:::::::S:: Hbo0466 ::F::::::::F::C:W::::::SN:::::::GV::L::LMV:::::::N:::::::SLF NP2284A M::FP::V:A::::::::::H::::SA::S::L:::L::::::::::::N:I:::::S:L Hut1399 I:I:::I::::::V::::Y::H:::::::I:SG::S::A::::::::::::L:::T:::T Hmu2319 M:::::VF:::::::::::::H:::S:::::::V:::::::::::::F::TL:::G:V:V rrnAC1432 M:::::IV::::::T:::::KH::SD:T:LM::F::L::::::F:::::::::::::::T Hmu1954 M:::::::SAT::::::::::H::R::LL:M:LF::V:::V::::::::::L:::T:::F consensus ALGFLVRAYDTRRRRYLYAAAAALALAFATKENALLYVLCWLGAGALLLDHRLLRAR--A #oth 231352136.44572334443374232423113542245544115512438545768226 Hbo0068 FA::TL::::R:S::DA::GSI:::::::SSGF:AA::::GVVVVI::V:QPSAVVD::G HVO_1479 :F::AL:LV:GAG::NA:GL:::::::V:SSGLGVVALC:LGV::F:VF::AA:LPS::: VNG2156 T::L::::S::::P:::::S:VT:GV::::::SV::WMVT::::SV:V::RH:::::::D Hbo3324 T:::I::::::GQ:::A::::VTG::::T:::SV:::LAS::::AV::::Y:F::::::D VNG0631 :V::A:::H::G::WL:PV::GW::::LTA:::::V:AAMFA:::::VA:R:::T:N::P VNG2064 :V:LF::FL::H:A:::::S:VPF::::T::::S:::P::::::L::VT:D:MAV:G::: Hut0754 TF:A::A:V:LD:::::HL::I:F::SLTV::::I::PVS:::::T::ALS::ADDH::Y HQ1634A :::AVI:GL::GQL::SF::::::::::T::::::::PI:YI::A:II::W::M::V::: HVO_0975 ::::V::::::G:LA::IP:G:SF:TGA:::::YVV:LA:F:::AF:VF:::::ART::S Hbo0466 ::::I::GF::GKL::AFP:::S:G:::T::::::V::::F:::::::A:::::K:S::: NP2284A :FAC::::I:FDDG:::IV::G::::G:GA:::::A::FAFV::AG::FG:::VFGYLDG Hut1399 :F:L:::F:::::I::::::TICIV:GIGS::::P::::T::::::I:::VA:Y:P:NYR Hmu2319 :F:LA::::::::V::V:GV::LFG::L:A:::TVV:AVV:V::T::VV:QLFFAE:::G rrnAC1432 :F:L:::FV:::KA::::GV::FM::G::S::::IV:::T::::TG:::AKM:VLPN::G Hmu1954 :::A:::F:::::W::V:::GVLM:CG::S::::I::::T::::VG::A:QA:Y:P:ND: consensus RGEARRAVL-RRWAARIRGR---------------GWAW--RR------------HLVGA #oth 787475777789676565645573222222334357675326411111111145755445 Hbo0068 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S:S:LLLAKL:AL:G:V::GAPTAANGGSSSGRSP::CSRGG::::::::::ILL::::V consensus AAVFLAVFVFFYAPRP-----------P----GVGLWQA-------------------L- #oth 524356365442111431321222112611875542283111111111111111111153 Hbo0068 FLL::GTTILCF:::AG:::::::::::::HVD:::---:::::::::::::::::::-: HVO_1479 LL::V::YI:AF:::AG::::::::::D::TD:A::YT-:::::::::::::::::::-: VNG2156 :::::S:V:Y:::::AG:::::::::::::GQEI:::R:::::::::::::::::::::T Hbo3324 G:LW:::::::::::AP::::::::::G::AGS::FYD:::::::::::::::::::::: VNG0631 :V:AG::::A::T::::::::::::::V::AG:L:----:::::::::::::::::::-: VNG2064 :LTAAVIV:S::::K::::::::::::-::::--D:YRL:::::::::::::::::::F: Hut0754 PVEI:::::::::::S::::::::::::::KTD::::S::::::::::::::::::::V: HQ1634A VVL:VT:CA::::::::::::::::::-::::--D:::::::::::::::::::::::F: HVO_0975 LLA::::::::::::::::::::::::-::::--D::N:::::::::::::::::::::G Hbo0466 F:L:W:::I::::::::::::::::::-::::--D:::::::::::::::::::::::F: NP2284A VVT::LLITYIH:::G:::::::::::E::LPSQ::YY:SCTDYDPYFDVATAPTLGEAA Hut1399 :V:AI:L:T:LF:T:GGGIDGIYQ::::::PE:LSF:A::::::::::::::::::::I: Hmu2319 V:::GL:VF::F:::N::::::::::::::AD:::::Y::::::::::::::::::::I: rrnAC1432 :L::GF:SL::::::GAGVAGIEHPPA:VASGD:NF:SG:::::::::::::::::::V: Hmu1954 ::::::LSL::::::GAGEAGLYHPPGT::TEQ:M:::::::::::::::::::::::V: consensus GNPTRLPAVVEAATAGAVEEFADLWAGGGH--------QDHA-----------YLPYLGD #oth 57256529329534754888675625556:311111156845444333222222642474 Hbo0068 TK::TWHL:LYE::V::LWS:FGVRVAHRWP::::::HWT:E:::::::::::LF::V:: HVO_1479 --:GTVLGA:D::LFDS:RR:VGVRVVDRYP::::::DGT:E:::::::::::::::::: VNG2156 :DFAT:::::GE::L:SLHKAI:Y::T:SI:::::::::R:::::::::::::::::FT: Hbo3324 R::LLW:D:ISE::V:SFNSAIE::G::M-::::::::::::::::::::::::::::T: VNG0631 AA:::::SA:A:GS:D:AHALWQT:VVD:VD:::::::R::S::::::::::::IA::VA VNG2064 EQ:G:A:::L::::I:TYH:::::::STST::::::::VA:S::::::::::::VAF:SH Hut0754 AD::L::G::RH::L:SMG:I::::LSPSI::::::::RG::::::::::::::G:::AH HQ1634A :::A:::DILT:G:I::::K:I:T::T::R::::::::::::::::::::::::::::Y: HVO_0975 :SASM::-:L::GSV:::S:MVGS:L:::::::::::::S:E::::::::::::::::K: Hbo0466 :D::K::S:L::GSL::::K:L:T::::::::::::::::::::::::::::::::F:H: NP2284A T::LL::RL:WFSVGSTA:LY:CQ:ITPRTD:::::::DPNP:::::::::::L:EFIHE Hut1399 TS:W:ILNL:SDTLTYVIYPNGEYF:FTKMDAVLIDLPGPP:VDATASGSDPKTV:::SR Hmu2319 :H:SS:::::DTTV:DLT:G:-EY:F::TSD::::::PGC:KDNLVDG::::::ACF::R rrnAC1432 T::SLF:EL:QTTWERV:GQY-SE:FSPASE::::::KATTTETGLVDSIETF:ESVD:H Hmu1954 :D:AQ::TLL:ETW:HVRF:Y-GE:F:QAGE::::::SGEESIAST::::::::VE:::R consensus L---LETLAYGAPPLAVFAVVGFLADRYGA---DRPRPLVAFAFYWGLASLVGYPL--AT #oth 622237444552543543324235542367133764283262642426334332.61154 Hbo0068 ::::AG:::TAGL:IV:A::AV:GWN::VS:::SER:::LDAFA::SA:AFAIF:V:::: HVO_1479 :::::GA::LA:L:VVLLGAAV::V:::T::::GG::SE:SA:V::AG::::FV:M::L: VNG2156 T:::AD:VIA::SGV:AL::::::W:::AG:::AH::G::::N::C:V:A:::::::::N Hbo3324 T::::R:::E:::GIVS:S:::::Y:::VT::::::SD::::N::V:ISAI::::::::N VNG0631 A::::R:::TT:VVV:GGG:L::::E::A:::::T:::::L::G::::::V:V::A::I: VNG2064 D::::SV:VACGTVVS:A::::Y::N::AT:::ET:::::S::::::VF:VL:::A::VV Hut0754 F:::VIV::VA:AAT::::ALAVRW-----:::-Q:::I:T:CGW:A:SGV::::Y::VA HQ1634A ::::V:::I::::A:LS:GLL:II:N::A::IT::R:S:IT:GT::AI:::L:::::::: HVO_0975 F::::::FV::::V:I:::L::IVV::::V:VAG:I:W:::::T:::VVCIF:::::::: Hbo0466 ::::::::V::::AVLG:TL::V:V::::FRTGGTY:E::::GT:::::::A:::I:::: NP2284A M:::GLITLESSTT:::L:LA::GLAVFR::::RP:DD::S:T::::A::M::::F::I: Hut1399 :FAMGGG:LAK::VVLG:GL::V:YE::L::::E:S:T::L:M:FAA:F:::::::TLSI Hmu2319 F:::::::LVA:L::S:L::G:::IE:::::::V::::V:L::G:::FV:V:::::::G: rrnAC1432 YEVL:KA:G:T:A::VL:SAF:YAL::L:T:::VE::H::P::A:G:YV:IL:::I::G: Hmu1954 F:::VRVMGLK:A::T:LS::::A:E:::R:::AES:N::ML:G:C:FV:VL::::::G: consensus DIGAP-WLAVHAVVPLAIPAAVGLAAVVRWGRSA-------------------------- #oth 338321.64222321.231.1114353625259411111111111111111111111111 Hbo0068 EVS::::V:I:V:L::SPL::::G::LL:RAV:L:::::::::::::::::::::::::: HVO_1479 EVS:::::G:YV:::::L::GI::::L:::::R::::::::::::::::::::::::::: VNG2156 NFPV:::ST:::I:::TV:::::A:V:Y:::::R:::::::::::::::::::::::::: Hbo3324 NFPV:::STI:::::::L:::I:VGVTY::::A:AADLGSKQRVIAGLLGIAIGGILQTA VNG0631 TVAGA::SVT:::::::::::::I:::::T:H:::::::::::::::::::::::::::: VNG2064 ::A:A::T::N:L::::::::::VG::::Y::RG:::::::::::::::::::::::::: Hut0754 :VK::::::::V:IA::::::I::V:T:DRI:K::::::::::::::::::::::::::: HQ1634A ::Q::::V:::VA:::::::::::SV:IESA:D::::::::::::::::::::::::::: HVO_0975 ::Q::::VV::::::::::::::A:F:F:S:VQ::::::::::::::::::::::::::: Hbo0466 ::E::::A:I:V:::::::::::I:FI:ESA:D::::::::::::::::::::::::::: NP2284A :::GAS::V::I:L:::V::::A:G:LCET:IE::::::::::::::::::::::::::: Hut1399 :T:WK::NM::V::::S:::::::GI:G::ATV::::::::::::::::::::::::::: Hmu2319 ::YGA::IT:N:L::::L:::::::YLY:L::T::::::::::::::::::::::::::: rrnAC1432 :::::::::::V::::S::::::::::I:::NES:::::::::::::::::::::::::: Hmu1954 :VFGA:::V:::L:::S::::::::RI:D:A:G::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------L--DARD-----------TVGAAL #oth 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