|
Pairwise sequence scores | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2735 | NP1654A | NP3028A | rrnAC0158 | pNG6087 | Hmu0116 | Hut2262 | HVO_1240 | VNG0914 | pNG6086 | HQ2856A | HVO_A0627 | Hbo2357 |
1348 | NP1654A | 3512 | 2026 | 984 | 1069 | 1044 | 945 | 956 | 848 | 964 | 727 | 930 | 936 |
1424 | NP3028A | 2026 | 3250 | 1018 | 1008 | 1055 | 982 | 1039 | 815 | 946 | 808 | 950 | 976 |
1558 | rrnAC0158 | 984 | 1018 | 2731 | 1250 | 1240 | 1184 | 1085 | 1148 | 1131 | 1023 | 1129 | 1120 |
1565 | pNG6087 | 1069 | 1008 | 1250 | 2750 | 1283 | 1096 | 1135 | 1107 | 1167 | 994 | 1165 | 1169 |
1588 | Hmu0116 | 1044 | 1055 | 1240 | 1283 | 2676 | 1186 | 1218 | 1114 | 1182 | 1067 | 1188 | 1159 |
1551 | Hut2262 | 945 | 982 | 1184 | 1096 | 1186 | 2703 | 1137 | 1001 | 1052 | 1101 | 1261 | 1268 |
1520 | HVO_1240 | 956 | 1039 | 1085 | 1135 | 1218 | 1137 | 2724 | 1138 | 1019 | 1064 | 1256 | 1210 |
1634 | VNG0914 | 848 | 815 | 1148 | 1107 | 1114 | 1001 | 1138 | 2823 | 1632 | 1085 | 1330 | 1235 |
1654 | pNG6086 | 964 | 946 | 1131 | 1167 | 1182 | 1052 | 1019 | 1632 | 2748 | 1185 | 1378 | 1361 |
1591 | HQ2856A | 727 | 808 | 1023 | 994 | 1067 | 1101 | 1064 | 1085 | 1185 | 2894 | 1508 | 1589 |
1869 | HVO_A0627 | 930 | 950 | 1129 | 1165 | 1188 | 1261 | 1256 | 1330 | 1378 | 1508 | 2712 | 1866 |
1856 | Hbo2357 | 936 | 976 | 1120 | 1169 | 1159 | 1268 | 1210 | 1235 | 1361 | 1589 | 1866 | 2798 |
495 symbols consensus -------MNRRQFL-ASAGLGALAALAGCLG------------GFERQSAWRDP------ #oth 123445554..63.2546255344341..3411111122226425555446451111111 NP1654A :::::::::::::::---AA:::V:A::::::::::PDDAEPPAAVDGQGASGR:::::: NP3028A ::::MTRYT::RL::G:SA:A::G:F:::TAEQPDDPEEDSPEEPDDGEPEDQ:DAVPNI rrnAC0158 MRTQRRS:::::::::::::AGTTV::::--:::::::::::::SLSSQST:A::::::: pNG6087 :::::::::::DV::RAV:GTS:VG::::T-:::::::::::::LFETRSA:A::::::: Hmu0116 ::MDRSQYT::AL::GGVAGLGAT:T:::S-:::::::::::::LLESQ:VGE::::::: Hut2262 :::::::VF::E::::TGSALGI::::::--:::::::::::::SLESR:IDI::::::: HVO_1240 ::::::MTS::R::::AS:AV:A:G:S:::A::::::::::EL:--:LYTSNE::::::: VNG0914 :::::::::::A::T::::::ST::::::::::::::::::AL::::::::::::::::: pNG6086 :::::::::::T::KQGTA:SGGLV:S::::::::::::::RL:::T::::::::::::: HQ2856A :MPSSLSAT::GL::::TASL:::SS::::Q::::::::::QI::::K:::::::::::: HVO_A0627 ::::::::K::DA::KTL:I:::::T::::::::::::::::::::Q::::::::::::: Hbo2357 :::MAPHIT:::L::GTL:T:T:VGT::::D::::::::::TL:::T::::::::::::: consensus PLVEDRPDAVYYPTHTEGMKMYGITTAGDYGVALMYSYPHRFWTVT----GTDTEKVVVE #oth .33232.132.6.225.1.62517543.53542232211.2..34311113658522544 NP1654A :QPDAK:::::M:::R:A:VHLPVAE::P:RLSP:VAFA:E::L:::::::SE::R:DA- NP3028A :Q:D:P:N:::K:::R:A:RHLPAVE::::RLSP:VT:::S::LI::::::EES:E:IP: rrnAC0158 ::::N::::T:R:::A:::G:A::AQ::E:M:G:S::F::::::::::::::TA:::DIR pNG6087 ::P:N::::::::::Y:::::P:MKEQ:G:SC::T:::A::::LMK::::PNGIT::EIQ Hmu0116 :V::E::N:::::::V:::E:I:M:D:::RQIG:::::A:::::MD::::VG::AR:SA- Hut2262 :VLDN::::I:V:G:V:::N:V::E:T:E:D:::S::::::::::::::::::V:RTST: HVO_1240 :V:SN:::E::V:::::::R:V:SAD:::LR:GVF::::::::VMADEGD:FG:S:MS:: VNG0914 ::A:::::S::::AVV:::SV::TDSS:RV:F:::H:F::::::::::::::TQT::::D pNG6086 :I:::::::::::AII:::G:::T::::SL:F:::H:F:::::NL::::::SRKT::::Q HQ2856A :::S::::G::I:AI::::N:::R::::R:::::::::::::::LA:::::QKKQ:TP:: HVO_A0627 :::D:::::::L:AV::::::::K::::P:::::T:::::::::AA:::::S:LG:T::: Hbo2357 :::::::::::V:AI::::::::K::::P:::::T:::::::::L:::::N:EFS:T::R consensus SDDSVHLMATVWDAETGQVLPVDAGVSIEITRDGELVDEEAPWPMLSQNMGFHYGDNYAL #oth 53333.1.223.12312622.63525434273116515445312.1.25..3.2.2.472 NP1654A ::PGL:V:V:P::::::::::::T:GEMR:Y::ENRI:QR:::::I::T::::F:::IPI NP3028A QARG::::V:L::::::R:::T:::AEMRVL:::NI::QR:::::I::T::::F:::VP: rrnAC0158 :E::::::::I::P::EM::::S::L::T:E::::T:ADKS::::I::::::::::::T: pNG6087 :E::I:::PV::ETQ::II-:P:INPQLT::Q:::Q::QF::::::::P::::F:::AQ: Hmu0116 G:ADA::::S:::PD:::::::RS:L:VA:E:::QTI::RT::T:::::::::::::VS: Hut2262 EA:::::::::::::::MI::-EV::A::::Q::S::S::TVYA:::GP::V:H:A:F:G HVO_1240 PG:D:::::::::P:::V:V:-:T:L:L::A:::D::I::VVYA::::R::::::S:FG: VNG0914 AE:T:::::::::TDS:AI::::PSIT:T-DD::AT:GTTTL:::::P:::::::::V:: pNG6086 :::::::::S:::T::ETI::::VS:E:S-NS::-R:SSTNL:::I:P:::::::::I:: HQ2856A P::DI::::SL::TK:K:P::I:S::T:S:R::::::TQ:VAY::I::Q::L:::S::S: HVO_A0627 A:::I::::SL::::::T:::L::::::::L:::D::S::VAY:::::Q::M:::S::V: Hbo2357 A:::::::V:L::::::T:::R:S::T::V::N:SA:T::IAY:::::K::L:::S::K: consensus DGDGTYTVTVRVGGLSLRRTGSFAGRFEEPATATFEFTFDTDDRYDI--SIRRLP-DRAG #oth 43314.32616212636532231622174552324323136554432224556443265. NP1654A QEP:::::E:D:NPAGV:T::D:D:::M:S:::::::DY:DAV:EELVEGTTFVDA::W: NP3028A PA:D::::E:DINPIQA::::D:D::::::::MS:::EY:D:F:EQVIGGVEY:DQ:EW: rrnAC0158 G:::V:QLS:::N:MGE::L:ALE:::N:AGE::V::D:AQNT:DQL:::FEEF:::SQ: pNG6087 Q:::::::E:SI::P:T:::::L:EN-QGN:SF::::E:SESTLNE::::YTDI:D::E: Hmu0116 ::::::::::EA:::GID:L:A::D::A::V::E::WE:SRSR:NE::::F:Q:-::G:: Hut2262 LDE:D:E:A::::ATAS:P::A::::::::::::::::::QETMGE:::RFD::-:::G: HVO_1240 ::::::E:::D::AP:::LF:DLV:::DS::S::LD:EYSAG::D::::PYTM:D::QQ: VNG0914 P:S:::DA:LT::PVGIT::AP:GDA:DAG:ST:IP::::PA:T:NL::EY:::R::::: pNG6086 P:E:Q:D::LQ::P:QTA::SP:N:::T:GQS::MQ::::::ET:NL::E::::G::K:: HQ2856A ::E:E::AD:TI::M::::::::TDA:GSVK::::P:::R::EI:::::::GQ-::KNG: HVO_A0627 ::E:D:EAR:H:::T::S::::::::::SAE::::::A:::::L::V::EL:::G::E:: Hbo2357 ::E:E:E:H::I::V::K::::::::::TAE::::PI:::::EL::V::::Q:-::ENP: consensus ERGAVDPM---------------------------------------------------- #oth 431124222122221122111111111111111111111111111111111111111212 NP1654A ::::LE::GEPDRSDHGEHDHGDGGDHNGDHSDHNGDHSDHNGDHSDHNGDHSDHNGDHS NP3028A Q:::LA:PMEHGHDDHSDHD:::::::::::::::::::::::::::::::::::::SHN rrnAC0158 ::A:::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG6087 TK::::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0116 DP::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut2262 ::::IE:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1240 DP:::R:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG0914 DP:T::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG6086 T::T::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ2856A TS::I::V:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0627 S::::PA::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2357 :P:TIP:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ---------------------DMNG---------VPTGVAPAADALPGRHLGTATSGDAR #oth 11111122111111111111142631122112123.524425824211653276643246 NP1654A DHNGDHSDHNGDHSDHNGDHS:H::DHGEHDHHEM:FSAL:R:EEY::LD::VHE::::: NP3028A DHN:DHGSHNG:HSDHN:::::H:::HNSHDGHQM:FSAL:E::EY::VD::VHE::::: rrnAC0158 :::::::::::::::::::::N:DM::::::::::::SQV:EVS::::TV:::DKGS:GV pNG6087 :::::::::::::::::::::::EM:::::::::L:SSQV:TP:::::DVR:SG:::::K Hmu0116 :::::::::::::::::::::E:K-:::::::::M:LS::::RED::::IV::GET:::T Hut2262 :::::::::::::::::::::P:GA:::::::::::::::::T:D:::KAV-K:MA::I: HVO_1240 :::::::::::::::::::::E:D::::::::::L:L:RG:--ET:::TA::G::T:SL: VNG0914 :::::::::::::::::::::STD::::::::::::EP::::ES::::TV::APSVDGME pNG6086 :::::::::::::::::::::::EM:::::::::I:EP:V:TKSE::::L:HEGQ::::T HQ2856A :::::::::::::::::::::S::::::::::::::::RTSLI:TI:NH:I::RVAD::H HVO_A0627 :::::::::::::::::::::E:M::::::::::::::K:::VSD:::::::RQ::A::L Hbo2357 :::::::::::::::::::::E:S::::::::::::V:R:L:::S:Q:::::K::::::V consensus FVVTVLD-----AARFG-DDG-PYLAVSPRTPYNRVPLPMMALSATL-ERDGETVFDGT- #oth 343465442121754461553451141211.11.35512313234341556263653661 NP1654A :::RYAE:::::NH:LA::S:GG::L::::::::::::AD::::VR-:---:TVTT:--: NP3028A :::RH:E::::::S::A:::::-::L::::::::::::AD::::TE-:---:PV--ET:: rrnAC0158 YA::W:Q:::::D:A:L:A::ES:::::A::::::::::::S:DG:V::A:S::L:EDA: pNG6087 ::::I:ED:::::S:::G:EEQR::::::::::::TM::::S::G:::H:::MS::::I: Hmu0116 L::A:T::::::-----:RG:E:::::A:::::::YV::A:S::::::T:E::A:L:DS: Hut2262 Y:A::V:P::::P:GIE::E::::::L::::R::GYY:SR:GV:VS:::GN::SSTEE:: HVO_1240 L:G:A::::::::D::::::-::::::F:L:::::LLV:RLG:T::V::SG:S:R:::R: VNG0914 LA:S:VRD::::G:::::A::Q::VV:::::::::IL::R::::L:ATDAS:V:R:::A: pNG6086 ML:ALV:G::::DH::S::TEG:F:I::::::::::M::R::::::::D:G:D:ITQ::: HQ2856A :D:FIMTDTDINRQSNN:NPDT::::::A:::::NII::::QID::I:SQHD:SIATK:: HVO_A0627 :DAF:V:D::::GS::::V:::A::Y::A:::H:EFV::::GVR::::::::T:TL::AR Hbo2357 :HTF:I:SDDANSD::::-:::A::Y::::::::GII::::G:D::::S:G::::SEMD: consensus LTATLDPELGYHYGASV-------EGLARGD-TLTITVDTPPQVARHDGYETAF------ #oth .43321221242..253122221255467443434241341..31..2......111111 NP1654A :EQ:::S:V:L:::::A:::::::-D:TA:::AFDLV:E::::::::A:::::::::::: NP3028A :EQ:::S:::L::::AI:::::::---D:P:SPFELV:ES::::S::A:::::::::::: rrnAC0158 :::AVH:::::::::I:::::::::TA:QAP:SVSVD:VA::::S::E:::::::::::: pNG6087 :Q::I::::R:::::T::::::::ADVQT:::E::::::S:::T:::E:::::::::::: Hmu0116 :S:AI::D::::::TA::::::::D:VDS:::E:::A::SV::I:::E:::::::::::: Hut2262 ::RAI:::::::::TTLPREGEQG:TAS:ERDE:S:::E::::::::E:::::::::::: HVO_1240 :EPG::AD::F:::::::::::::P:::GD:A:ADLA::V:::::::E:::::::::::: VNG0914 :APS:::D::AY:::P::::::::::::G:E::::::::::::L::::::::::RAAGGT pNG6086 :Q:S:::D::SF::MGI:::::::DE:KT::::VR:::E::::L:::::::::::::::: HQ2856A ::R::::T::::::T:IPDFIHQSNTMSNEF:::E::TAI:::I:::::::::::::::: HVO_A0627 :AR::::D:S::::TG::::::::::VES::::::LS::V:::::::::::::::::::: Hbo2357 ::Q::::::::::::T:::::::::SV:P:::E:RVS:A::::I:::::::::::::::: consensus --LDMPPVTLTV--- #oth 114543356346531 NP1654A ::::::SMPVE:PDR NP3028A ::::::SM:VGED:: rrnAC0158 :::TA:SFSFASG:: pNG6087 ::V:::D:QV:L::: Hmu0116 :::S::D:E:::E:: Hut2262 ::F:V:TT::SL::: HVO_1240 :::EFD::R:G-::: VNG0914 ATVSY:TNGG:AP:: pNG6086 :::::D:IEF:AE:: HQ2856A ::MN:N::S::FQMR HVO_A0627 ::MAFE:MRFE:::: Hbo2357 ::I::D:::F::PE: