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8 genomes BUD0900 12 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0914

pNG6086

pNG6087

rrnAC0158

HVO_1240

HVO_A0627

Hbo2357

Hmu0116

Hut2262

-

NP1654A

NP3028A

HQ2856A

Pairwise sequence scores
Consensus score2735 NP1654A NP3028A rrnAC0158 pNG6087 Hmu0116 Hut2262 HVO_1240 VNG0914 pNG6086 HQ2856A HVO_A0627 Hbo2357
1348NP1654A 3512 2026 984 1069 1044 945 956 848 964 727 930 936
1424NP3028A 2026 3250 1018 1008 1055 982 1039 815 946 808 950 976
1558rrnAC0158 984 1018 2731 1250 1240 1184 1085 1148 1131 1023 1129 1120
1565pNG6087 1069 1008 1250 2750 1283 1096 1135 1107 1167 994 1165 1169
1588Hmu0116 1044 1055 1240 1283 2676 1186 1218 1114 1182 1067 1188 1159
1551Hut2262 945 982 1184 1096 1186 2703 1137 1001 1052 1101 1261 1268
1520HVO_1240 956 1039 1085 1135 1218 1137 2724 1138 1019 1064 1256 1210
1634VNG0914 848 815 1148 1107 1114 1001 1138 2823 1632 1085 1330 1235
1654pNG6086 964 946 1131 1167 1182 1052 1019 1632 2748 1185 1378 1361
1591HQ2856A 727 808 1023 994 1067 1101 1064 1085 1185 2894 1508 1589
1869HVO_A0627 930 950 1129 1165 1188 1261 1256 1330 1378 1508 2712 1866
1856Hbo2357 936 976 1120 1169 1159 1268 1210 1235 1361 1589 1866 2798

495 symbols
consensus       -------MNRRQFL-ASAGLGALAALAGCLG------------GFERQSAWRDP------
#oth            123445554..63.2546255344341..3411111122226425555446451111111
NP1654A         :::::::::::::::---AA:::V:A::::::::::PDDAEPPAAVDGQGASGR::::::
NP3028A         ::::MTRYT::RL::G:SA:A::G:F:::TAEQPDDPEEDSPEEPDDGEPEDQ:DAVPNI
rrnAC0158       MRTQRRS:::::::::::::AGTTV::::--:::::::::::::SLSSQST:A:::::::
pNG6087         :::::::::::DV::RAV:GTS:VG::::T-:::::::::::::LFETRSA:A:::::::
Hmu0116         ::MDRSQYT::AL::GGVAGLGAT:T:::S-:::::::::::::LLESQ:VGE:::::::
Hut2262         :::::::VF::E::::TGSALGI::::::--:::::::::::::SLESR:IDI:::::::
HVO_1240        ::::::MTS::R::::AS:AV:A:G:S:::A::::::::::EL:--:LYTSNE:::::::
VNG0914         :::::::::::A::T::::::ST::::::::::::::::::AL:::::::::::::::::
pNG6086         :::::::::::T::KQGTA:SGGLV:S::::::::::::::RL:::T:::::::::::::
HQ2856A         :MPSSLSAT::GL::::TASL:::SS::::Q::::::::::QI::::K::::::::::::
HVO_A0627       ::::::::K::DA::KTL:I:::::T::::::::::::::::::::Q:::::::::::::
Hbo2357         :::MAPHIT:::L::GTL:T:T:VGT::::D::::::::::TL:::T:::::::::::::

consensus       PLVEDRPDAVYYPTHTEGMKMYGITTAGDYGVALMYSYPHRFWTVT----GTDTEKVVVE
#oth            .33232.132.6.225.1.62517543.53542232211.2..34311113658522544
NP1654A         :QPDAK:::::M:::R:A:VHLPVAE::P:RLSP:VAFA:E::L:::::::SE::R:DA-
NP3028A         :Q:D:P:N:::K:::R:A:RHLPAVE::::RLSP:VT:::S::LI::::::EES:E:IP:
rrnAC0158       ::::N::::T:R:::A:::G:A::AQ::E:M:G:S::F::::::::::::::TA:::DIR
pNG6087         ::P:N::::::::::Y:::::P:MKEQ:G:SC::T:::A::::LMK::::PNGIT::EIQ
Hmu0116         :V::E::N:::::::V:::E:I:M:D:::RQIG:::::A:::::MD::::VG::AR:SA-
Hut2262         :VLDN::::I:V:G:V:::N:V::E:T:E:D:::S::::::::::::::::::V:RTST:
HVO_1240        :V:SN:::E::V:::::::R:V:SAD:::LR:GVF::::::::VMADEGD:FG:S:MS::
VNG0914         ::A:::::S::::AVV:::SV::TDSS:RV:F:::H:F::::::::::::::TQT::::D
pNG6086         :I:::::::::::AII:::G:::T::::SL:F:::H:F:::::NL::::::SRKT::::Q
HQ2856A         :::S::::G::I:AI::::N:::R::::R:::::::::::::::LA:::::QKKQ:TP::
HVO_A0627       :::D:::::::L:AV::::::::K::::P:::::T:::::::::AA:::::S:LG:T:::
Hbo2357         :::::::::::V:AI::::::::K::::P:::::T:::::::::L:::::N:EFS:T::R

consensus       SDDSVHLMATVWDAETGQVLPVDAGVSIEITRDGELVDEEAPWPMLSQNMGFHYGDNYAL
#oth            53333.1.223.12312622.63525434273116515445312.1.25..3.2.2.472
NP1654A         ::PGL:V:V:P::::::::::::T:GEMR:Y::ENRI:QR:::::I::T::::F:::IPI
NP3028A         QARG::::V:L::::::R:::T:::AEMRVL:::NI::QR:::::I::T::::F:::VP:
rrnAC0158       :E::::::::I::P::EM::::S::L::T:E::::T:ADKS::::I::::::::::::T:
pNG6087         :E::I:::PV::ETQ::II-:P:INPQLT::Q:::Q::QF::::::::P::::F:::AQ:
Hmu0116         G:ADA::::S:::PD:::::::RS:L:VA:E:::QTI::RT::T:::::::::::::VS:
Hut2262         EA:::::::::::::::MI::-EV::A::::Q::S::S::TVYA:::GP::V:H:A:F:G
HVO_1240        PG:D:::::::::P:::V:V:-:T:L:L::A:::D::I::VVYA::::R::::::S:FG:
VNG0914         AE:T:::::::::TDS:AI::::PSIT:T-DD::AT:GTTTL:::::P:::::::::V::
pNG6086         :::::::::S:::T::ETI::::VS:E:S-NS::-R:SSTNL:::I:P:::::::::I::
HQ2856A         P::DI::::SL::TK:K:P::I:S::T:S:R::::::TQ:VAY::I::Q::L:::S::S:
HVO_A0627       A:::I::::SL::::::T:::L::::::::L:::D::S::VAY:::::Q::M:::S::V:
Hbo2357         A:::::::V:L::::::T:::R:S::T::V::N:SA:T::IAY:::::K::L:::S::K:

consensus       DGDGTYTVTVRVGGLSLRRTGSFAGRFEEPATATFEFTFDTDDRYDI--SIRRLP-DRAG
#oth            43314.32616212636532231622174552324323136554432224556443265.
NP1654A         QEP:::::E:D:NPAGV:T::D:D:::M:S:::::::DY:DAV:EELVEGTTFVDA::W:
NP3028A         PA:D::::E:DINPIQA::::D:D::::::::MS:::EY:D:F:EQVIGGVEY:DQ:EW:
rrnAC0158       G:::V:QLS:::N:MGE::L:ALE:::N:AGE::V::D:AQNT:DQL:::FEEF:::SQ:
pNG6087         Q:::::::E:SI::P:T:::::L:EN-QGN:SF::::E:SESTLNE::::YTDI:D::E:
Hmu0116         ::::::::::EA:::GID:L:A::D::A::V::E::WE:SRSR:NE::::F:Q:-::G::
Hut2262         LDE:D:E:A::::ATAS:P::A::::::::::::::::::QETMGE:::RFD::-:::G:
HVO_1240        ::::::E:::D::AP:::LF:DLV:::DS::S::LD:EYSAG::D::::PYTM:D::QQ:
VNG0914         P:S:::DA:LT::PVGIT::AP:GDA:DAG:ST:IP::::PA:T:NL::EY:::R:::::
pNG6086         P:E:Q:D::LQ::P:QTA::SP:N:::T:GQS::MQ::::::ET:NL::E::::G::K::
HQ2856A         ::E:E::AD:TI::M::::::::TDA:GSVK::::P:::R::EI:::::::GQ-::KNG:
HVO_A0627       ::E:D:EAR:H:::T::S::::::::::SAE::::::A:::::L::V::EL:::G::E::
Hbo2357         ::E:E:E:H::I::V::K::::::::::TAE::::PI:::::EL::V::::Q:-::ENP:

consensus       ERGAVDPM----------------------------------------------------
#oth            431124222122221122111111111111111111111111111111111111111212
NP1654A         ::::LE::GEPDRSDHGEHDHGDGGDHNGDHSDHNGDHSDHNGDHSDHNGDHSDHNGDHS
NP3028A         Q:::LA:PMEHGHDDHSDHD:::::::::::::::::::::::::::::::::::::SHN
rrnAC0158       ::A:::L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
pNG6087         TK::::L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hmu0116         DP::L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hut2262         ::::IE::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_1240        DP:::R::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
VNG0914         DP:T::L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
pNG6086         T::T::L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HQ2856A         TS::I::V::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_A0627       S::::PA:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo2357         :P:TIP::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       ---------------------DMNG---------VPTGVAPAADALPGRHLGTATSGDAR
#oth            11111122111111111111142631122112123.524425824211653276643246
NP1654A         DHNGDHSDHNGDHSDHNGDHS:H::DHGEHDHHEM:FSAL:R:EEY::LD::VHE:::::
NP3028A         DHN:DHGSHNG:HSDHN:::::H:::HNSHDGHQM:FSAL:E::EY::VD::VHE:::::
rrnAC0158       :::::::::::::::::::::N:DM::::::::::::SQV:EVS::::TV:::DKGS:GV
pNG6087         :::::::::::::::::::::::EM:::::::::L:SSQV:TP:::::DVR:SG:::::K
Hmu0116         :::::::::::::::::::::E:K-:::::::::M:LS::::RED::::IV::GET:::T
Hut2262         :::::::::::::::::::::P:GA:::::::::::::::::T:D:::KAV-K:MA::I:
HVO_1240        :::::::::::::::::::::E:D::::::::::L:L:RG:--ET:::TA::G::T:SL:
VNG0914         :::::::::::::::::::::STD::::::::::::EP::::ES::::TV::APSVDGME
pNG6086         :::::::::::::::::::::::EM:::::::::I:EP:V:TKSE::::L:HEGQ::::T
HQ2856A         :::::::::::::::::::::S::::::::::::::::RTSLI:TI:NH:I::RVAD::H
HVO_A0627       :::::::::::::::::::::E:M::::::::::::::K:::VSD:::::::RQ::A::L
Hbo2357         :::::::::::::::::::::E:S::::::::::::V:R:L:::S:Q:::::K::::::V

consensus       FVVTVLD-----AARFG-DDG-PYLAVSPRTPYNRVPLPMMALSATL-ERDGETVFDGT-
#oth            343465442121754461553451141211.11.35512313234341556263653661
NP1654A         :::RYAE:::::NH:LA::S:GG::L::::::::::::AD::::VR-:---:TVTT:--:
NP3028A         :::RH:E::::::S::A:::::-::L::::::::::::AD::::TE-:---:PV--ET::
rrnAC0158       YA::W:Q:::::D:A:L:A::ES:::::A::::::::::::S:DG:V::A:S::L:EDA:
pNG6087         ::::I:ED:::::S:::G:EEQR::::::::::::TM::::S::G:::H:::MS::::I:
Hmu0116         L::A:T::::::-----:RG:E:::::A:::::::YV::A:S::::::T:E::A:L:DS:
Hut2262         Y:A::V:P::::P:GIE::E::::::L::::R::GYY:SR:GV:VS:::GN::SSTEE::
HVO_1240        L:G:A::::::::D::::::-::::::F:L:::::LLV:RLG:T::V::SG:S:R:::R:
VNG0914         LA:S:VRD::::G:::::A::Q::VV:::::::::IL::R::::L:ATDAS:V:R:::A:
pNG6086         ML:ALV:G::::DH::S::TEG:F:I::::::::::M::R::::::::D:G:D:ITQ:::
HQ2856A         :D:FIMTDTDINRQSNN:NPDT::::::A:::::NII::::QID::I:SQHD:SIATK::
HVO_A0627       :DAF:V:D::::GS::::V:::A::Y::A:::H:EFV::::GVR::::::::T:TL::AR
Hbo2357         :HTF:I:SDDANSD::::-:::A::Y::::::::GII::::G:D::::S:G::::SEMD:

consensus       LTATLDPELGYHYGASV-------EGLARGD-TLTITVDTPPQVARHDGYETAF------
#oth            .43321221242..253122221255467443434241341..31..2......111111
NP1654A         :EQ:::S:V:L:::::A:::::::-D:TA:::AFDLV:E::::::::A::::::::::::
NP3028A         :EQ:::S:::L::::AI:::::::---D:P:SPFELV:ES::::S::A::::::::::::
rrnAC0158       :::AVH:::::::::I:::::::::TA:QAP:SVSVD:VA::::S::E::::::::::::
pNG6087         :Q::I::::R:::::T::::::::ADVQT:::E::::::S:::T:::E::::::::::::
Hmu0116         :S:AI::D::::::TA::::::::D:VDS:::E:::A::SV::I:::E::::::::::::
Hut2262         ::RAI:::::::::TTLPREGEQG:TAS:ERDE:S:::E::::::::E::::::::::::
HVO_1240        :EPG::AD::F:::::::::::::P:::GD:A:ADLA::V:::::::E::::::::::::
VNG0914         :APS:::D::AY:::P::::::::::::G:E::::::::::::L::::::::::RAAGGT
pNG6086         :Q:S:::D::SF::MGI:::::::DE:KT::::VR:::E::::L::::::::::::::::
HQ2856A         ::R::::T::::::T:IPDFIHQSNTMSNEF:::E::TAI:::I::::::::::::::::
HVO_A0627       :AR::::D:S::::TG::::::::::VES::::::LS::V::::::::::::::::::::
Hbo2357         ::Q::::::::::::T:::::::::SV:P:::E:RVS:A::::I::::::::::::::::

consensus       --LDMPPVTLTV---
#oth            114543356346531
NP1654A         ::::::SMPVE:PDR
NP3028A         ::::::SM:VGED::
rrnAC0158       :::TA:SFSFASG::
pNG6087         ::V:::D:QV:L:::
Hmu0116         :::S::D:E:::E::
Hut2262         ::F:V:TT::SL:::
HVO_1240        :::EFD::R:G-:::
VNG0914         ATVSY:TNGG:AP::
pNG6086         :::::D:IEF:AE::
HQ2856A         ::MN:N::S::FQMR
HVO_A0627       ::MAFE:MRFE::::
Hbo2357         ::I::D:::F::PE: