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8 genomes BUD0905 10 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0667

VNG2202

rrnAC0045

HVO_1012

Hbo0505

Hbo2898

Hmu1062

Hut0143

-

NP2444A

HQ1576A

Pairwise sequence scores
Consensus score1622 Hut0143 Hbo2898 VNG0667 Hmu1062 rrnAC0045 HVO_1012 Hbo0505 HQ1576A VNG2202 NP2444A
875Hut0143 1742 487 537 610 505 541 460 520 277 567
730Hbo2898 487 1615 461 514 484 538 415 500 271 483
832VNG0667 537 461 1616 633 611 546 513 523 288 558
914Hmu1062 610 514 633 1730 586 606 538 555 319 566
865rrnAC0045 505 484 611 586 1710 425 453 531 348 577
878HVO_1012 541 538 546 606 425 1464 700 737 328 565
831Hbo0505 460 415 513 538 453 700 1607 857 334 447
954HQ1576A 520 500 523 555 531 737 857 1664 377 554
437VNG2202 277 271 288 319 348 328 334 377 773 402
943NP2444A 567 483 558 566 577 565 447 554 402 1667

255 symbols
consensus       -------MST-T-FTATARP-RRTLLYAALVLNTELLLALGYLLLTEAQV---TAPRYLV
#oth            111111234354667777554464254535352534424331456355551114544485
Hut0143         ::::::::::ARR:GPIPT:SKSH::WG::LV:::V::LF:::SVSDS:LFDLASL:LY:
Hbo2898         ::::::MTE:ISGPD:L::RPT:::RLL:GLIAV:I::VGV:::T:::A::::LSV::VL
VNG0667         ::::::::P:R:VS:SVV::S:E:::TW:A:::G::VAV:L:FA::T:TP::::DTVAI:
Hmu1062         :::::::::AT:YSIGRFELD:G:::WGL:::::::::V:::VF:ASS::::::GVEP::
rrnAC0045       ::::::::::T:ATLRD:I:DT:S:VTW:A:::A:FI:I:::VVN:AQPA::::D:FL::
HVO_1012        :::::::---:-:-------:----------V::T:I::FV:::F:::S::::G::::A:
Hbo0505         MFSTPPCWR:RSECSHCL:SR::DHG::TPI-------------------:::-----RF
HQ1576A         :::::::::VKKA:RT:Q:-:TQD:V::T:LG:SLIG:::::::IADITI::::Q:::TI
VNG2202         :::::::---:-:-------:-----------------------------:::-------
NP2444A         :::::::---:-:M:::DKDPNW::I:T:I:A:ALV:A::::A::A:R:P:::::--:WA

consensus       YPFVWINVGVWALARVRPPP-ASRRTRARAAAVAVGYFLVLGYVGGLVGTGGG-------
#oth            423413533432565362351346334683652254145313541125656557431111
Hut0143         ::::::::SL::::T::::A::P::RKLFGG:::T::A:::T:L::::S:AMTDGI::::
Hbo2898         :::::V:L::L:VYS:DV:R:P:G:RT:A:TV:::L::G::AWTT::::P:S:A::::::
VNG0667         ::::::::A:::VR::GV:SV::::QA:V::G:G:::::L::G::::YMLQ:A:::::::
Hmu1062         I:::::::SL:VF::AEV:R:T:D:Q:VIGLV:::A::GL:T:F:::W:G:VPEF:::::
rrnAC0045       F::I:L:IAGLVAL::::EL:P:::RTIGSVVI:L::L::::::::VY::::Q:::::::
HVO_1012        :GVA:VI::L:V:FDTDVA::::TA:KRK:::::::::AL:AVA::::TSPVPGG:::::
Hbo0505         :GLL::A:::I:IWKT::A::TDEK::Q::RLI::::VVA:AFA::I:VSSLPSTA::::
HQ1576A         :GLL::F::AIVIWKTN:AS::DA:::R::TI::IV:LSI:SI:::VII:T::NAANALT
VNG2202         --------------------:-----------------M:M::::P:------:::::::
NP2444A         V:L:::T::::::L::S:::::A:::K:L:G:::G:::::::F::::F:PAS:PTT::::

consensus       -GLGIRVAT--LPPGWGPAVVYGGP-LAVVLIPYRVVGYLALAYLVYATVVDAAGAAVSG
#oth            15545244612351124143466458452344.3434..43.32.1223233.4343441
Hut0143         :::S::PLV::F::::A:V:SADIAG:SLT:L::K:L::IT:S:::::L::E:::-VLPA
Hbo2898         :D:SV:LVG::AM:::::ILLV::::VNLT:V:FE::::VC:TA:::VSL:R:TAGVF::
VNG0667         ::::A:::W:::S::::::L::S:TAVT:S:::FKL:::AT:::::A:A:A:::RTG:A:
Hmu1062         :PTQF:::WFS:::::A:::LLNSDH:R:SV:::QL::::::::::::::L::::S:IT:
rrnAC0045       ::T:L:LV::QA:::FS:T::FS:AT:S:::::WK:A:::::S:::FV:A:::S:G::G:
HVO_1012        :AS:V:::F::::::::::L::::DLFNL::M:A:::::A:::F:::D:::K::::::::
Hbo0505         ::W:V:L:::::A::::::P:FTT:FF:L:FM:A::::::::G:::::::I::S:S::::
HQ1576A         QSF:::::::::L::::::PIITT:IG::::M:A:I::::::T:::::::I:::R:::::
VNG2202         :--------::--------------:-R:AAA:::IG::::::::::::LA::EASL:G:
NP2444A         :::L:QATE:::::::N:::L:A:EY:QFAI:::TAF::GV::::I:V:A:E:KH:VAG:

consensus       ILGLFSCVSCSWPVLASVLSGVLGG-GSALAAAAFD-QSYDLSTAVFVVTVGLLY--WRP
#oth            21.121....3212224333233.213412345585253.331.22.232132.5223.2
Hut0143         ::::::::::V:AAVVVP:A:TV:::ST:::SLV:G:GG::::::I:::S:V::A:::::
Hbo2898         ::::AT::::VG::I:G:F::::::AST:::GSMSGAYA::::::L::::::I:WYTL:E
VNG0667         LV::A:::::A::::GTL:A:LF:S:T::AVTI:ES:DP:GV::V:::SS:VV:L:::::
Hmu1062         V:::L::::::::I:::IF:T:::::SA:::GELY:::::L:::V::L::IA:::::Y::
rrnAC0045       :V::::::::VL:I:::I:G:FV:V::AT:SQ::LS::::G:::V:::TS:::::GVH:F
HVO_1012        VV::::::::::::::::ATS:F::::T:V::TVTT:L::::::L::L:::L::R:::::
Hbo0505         ::::L::::::::I:::L:T::F:S:S:::V::T:::L:::I::L::::::V::::::::
HQ1576A         :V::L:::::::::I::::::::::::::V::I:V::F:::V::V::IL:IA::::::::
VNG2202         LV:V:T::::TL::V:A:V:SLA:::AV:VGT:SA-:L:::AA:::::LA::::A:::::
NP2444A         L:::::::::TL::I:ALVG::V::::G:V:Q::IEF:::AI::::::::::::S::Y::

consensus       -VGQRGR--------
#oth            565743434522211
Hut0143         T::N:IDLGGGRR::
Hbo2898         :------::::::::
VNG0667         :SW----::::::::
Hmu1062         :GW:::YSSH:::::
rrnAC0045       D:TLV::LQALVDRP
HVO_1012        GF:TS--::::::::
Hbo0505         FGFG::E::::::::
HQ1576A         I::RV:D::::::::
VNG2202         :DAAV::WLR:::::
NP2444A         GL::FR:WLS:::::