Home |  Text search
8 genomes BUD0939 17 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1		 b Hma
Haloarcula
marismortui		 f Hvo
Haloferax
volcanii		 g Hbo
Halogeometricum
borinquense		 h Hmu
Halomicrobium
mukohataei		 i Hut
Halorhabdus
utahensis		 j Hla
Halorubrum
lacusprofundi		 q Nph
Natronomonas
pharaonis		 x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG6171

pNG7385

rrnAC2249

rrnB0193

HVO_2174

HVO_B0117

HVO_B0174

Hbo2988

Hbo3522

Hmu0533

Hmu1817

 -

hla0696

hla1034

NP4260A

HQ1818A

HQ2447A

HQ3633A

Pairwise sequence scores
Consensus score1511 VNG6171 HQ2447A HQ3633A HVO_2174 Hbo2988 rrnB0193 hla1034 Hmu1817 rrnAC2249 HQ1818A hla0696 HVO_B0174 pNG7385 NP4260A Hmu0533 HVO_B0117 Hbo3522
556VNG6171 1515 352 349 308 376 429 395 366 495 478 442 374 408 422 388 422 359
790HQ2447A 352 1660 1338 737 733 511 417 422 480 474 475 456 583 487 564 487 517
768HQ3633A 349 1338 1827 698 724 508 422 412 489 493 455 439 567 451 556 482 551
779HVO_2174 308 737 698 1620 960 415 416 515 495 491 532 549 597 527 567 556 647
739Hbo2988 376 733 724 960 1552 426 412 433 463 458 465 541 531 483 516 531 572
748rrnB0193 429 511 508 415 426 1641 557 493 582 604 480 502 537 581 634 595 527
760hla1034 395 417 422 416 412 557 1538 574 633 555 542 605 567 598 551 647 622
797Hmu1817 366 422 412 515 433 493 574 1503 740 683 637 552 545 682 616 596 618
947rrnAC2249 495 480 489 495 463 582 633 740 1538 1037 647 623 630 702 710 646 734
875HQ1818A 478 474 493 491 458 604 555 683 1037 1555 581 621 639 676 677 635 653
817hla0696 442 475 455 532 465 480 542 637 647 581 1616 518 500 756 579 616 566
835HVO_B0174 374 456 439 549 541 502 605 552 623 621 518 1621 626 669 656 597 676
844pNG7385 408 583 567 597 531 537 567 545 630 639 500 626 1481 676 673 613 662
914NP4260A 422 487 451 527 483 581 598 682 702 676 756 669 676 1602 615 609 747
883Hmu0533 388 564 556 567 516 634 551 616 710 677 579 656 673 615 1524 720 729
819HVO_B0117 422 487 482 556 531 595 647 596 646 635 616 597 613 609 720 1547 727
920Hbo3522 359 517 551 647 572 527 622 618 734 653 566 676 662 747 729 727 1664 

257 symbols
consensus       -----------------S-SRRGGRRSKVARLIDEYDLDGLGAELEARWTGEGG-ERESL
#oth            11111122333554488798:9657:4.15223442336252351365142574135:.1
VNG6171         :::::::::::::::::MT:EETQPCC:IV:VA:D::ISEID:K:IE:----RD:HGD::
HQ2447A         :::::::MSKQIRKEYS:A:::::KG::IE:IA:::::S:::D::VF::L::N:Y:::::
HQ3633A         :::::::::::MSKKSSPAP::::QG::IE:VA:::::P:::D::VS::L::D:Y:::::
HVO_2174        :::::::::::MRDSGR:V::::::GP:IE:IANR:G:::::DD:VDA:L:D:R:AQR::
Hbo2988         :::::::::::MGKSST:P:::::KGP:IE:VAER:SIT:::D::VE::R:DQ:::Q:::
rrnB0193        MRECLVTMGLLNRIMTTDD:QSD:GT:::DAV:QK:::V:M:::::N::V:AD:::K::T
hla1034         :::::::::::::::MTTEASGTNMNT::::V:R::::::M::N:::A::::A::::T::
Hmu1817         :::::::::::::::::-:-MNRQ:::::E::L:::G:::::D::V:S::A::D:D:K::
rrnAC2249       ::::::::::::::::MANTTD:RPS::::::::::E:::::::M::::::D:E:::M::
HQ1818A         :::::::::::::::::MSTNNNRPA:::::::E::E:E::::D:::::::DDN:::M::
hla0696         :::::::::::::::MTDTDDGS:::N:::::V:::::S:VSD:::::::AT:D:DHW::
HVO_B0174       :::::::::::VSDSHD:PGGKR:PE:::S::LR:RGF::F:::::R:::A:A::A:S::
pNG7385         :::::::::::::::::-:--M:SAQ::::Q::ET:E:ASM:::::RA:L:NT::::Q::
NP4260A         ::::::MSEPEKKSSEAERESSR:::::::::L:D::MA:V:::::RQ::A-DE:D:M::
Hmu0533         :::::::::::::::::-:------V:::::::::WE:::V:QQ::EY:L:T:D::QY::
HVO_B0117       :::::::::::::::MGTDQSTNR:L:::E:V:ET:::::F:EQ:AD:::A-PE:DSD::
Hbo3522         ::::::::::::MSSDE:ETP:R::::::Q::::::::::E:ER::DL::ANRE:::L::

consensus       RDLADRFNRRLLEAALD--DAGERALDGEVENIYRLLTDD-DVSAGDRTEARNRLERRGV
#oth            .3.1583.6522744451186378843424544246.441234654:3464463.55711
VNG6171         ::::TYL:KQI:SES:-::NT:T:EVV:DADS::NV:RG::::NRSRQV:L:SK:D:N:I
HQ2447A         ::::::V:N::IH::V::::S-LTL::::A:::R:::::::::TM:E:::T:QN:KHK:I
HQ3633A         ::::::V:S::IH::V::::S-FTL::::A:::R:::I::A::T::M:::T:EN:KYK::
HVO_2174        :E:EGDV:K::IR::::::E::AHV::::A::F:::::G::::T::S::D:::T:RE:::
Hbo2988         :T:::DV:V:II::::R::Q:::HPV:::A::F:::::S::::T::NQ:D:::T:ASKNI
rrnB0193        :::::Y:::SV::S:I:::GSDAPT:S:DIQQV:QS:HE:::AD:PL---I:S:::QS:I
hla1034         :::::E::EAV:::::R::ES:ISS:SVD:STT:EA:RGE:SG::AT:--::R::::E::
Hmu1817         :Q::TE::VA:VD:R:E::SE:VTHF:SDGKA::EA:AN:::AET-::ATIET::::E::
rrnAC2249       ::::EF::K::::RE:V:::::LS::ESD::ST:EN::G:::I:T:V::DTV:::::N::
HQ1818A         ::::TF::QQ::RQ::IAA:N:TG:::NT::T::TR::S::N::S:V::DT:S:::Q:::
hla0696         ::::AT:::E:I::R::::EVDV:LSER:IDAVA:S::G::E:::A:::QLHR::::D::
HVO_B0174       :::::A::::::R::::::GRN:::::::I:TL::V::::::::S:A::K:VH::::T::
pNG7385         ::::::::QA::M::IR:::::MDVI:::PA:F::::::::N::::K:I::::::D:A:I
NP4260A         ::::SY:::Q::QQR:E::A:NV:PV::::A::::I::::D::AEA:K:RV:R::::D:I
Hmu0533         :E:::W::Q:::A::H:::R:D:AYV:::I::T:E::::::::GT:T:A:VET:::Q::I
HVO_B0117       :::::LM:EKV:D:::R::K:::DV:E:::::L:T:::G::ETTE:M:VQ:K:T:QS:::
Hbo3522         :E:::D::::::R:VMV::EV:MNP:::::A:T:::::::::::S:MQ:Q::QT:::E::

consensus       DVESLEADFVSYQAIRTYLKDDRGVEY---SPSDTDDI-EKALETIQRLRGRLRAVTENN
#oth            132716733111122241236714246234676459863489864242264.48424477
VNG6171         :::AV:R::::H:TV:NH:H:CKAIDT:::GRKS:V:V:DD:QK::EWAQA:SEG:I:QT
HQ2447A         :INH::SSLI:::SVYN:F:R::NISR::K:QET:Q:P:TSS::P::K:AN::::IVT::
HQ3633A         NIDR::SNLI:::SVYN:::R::D:SR::E:QEA:Y:P:TSS::P::K:AN::::IVR::
HVO_2174        :::Q::::II:::SVYN:::RH:N::REDDDDDE::AT::AG:A::RK::S:::T::IDV
Hbo2988         :T:R:::::I:::SVYN:::RH:N::R:::-ED:GSSTNGDGFR:VKKISN:::S:::DA
rrnB0193        ::::VM:::I:H:TVYR:::N:::AARPEQT:AERK--::S:IDS:::::::TT:::RQT
hla1034         ::DE:TG:::TH:::H:::TQE:EASL:::-:AAD::MADRKV:::EK:Q::VS::A:SA
Hmu1817         :::Q:QS:::T:::::S:V::V:DA::::ET:::EEH::::QKT:::::VS:ATS:::EK
rrnAC2249       ::D:::T::IT:::::S:::EW::A::::QGL::DEK::::D::S::::LT:TLS::DQR
HQ1818A         :IN:::S:::T:::::S::::W::A::::QTI::EAK::Q:D::S::::MS:TTS:::ER
hla0696         ::DA:DR:V:T:::V:S::R:H::::::::ERESG:RT:TT:TKA::K:::::VS:::TK
HVO_B0174       :::R:::::::HR:M::::TSY:::TPPSETDR:DG:LR:HRT:::R::L::VER:::KS
pNG7385         ::DT::DQ::T:::::Y::TEV:::S:::D:E:E:EQV::QERG::D:::S:VETIVRDT
NP4260A         :::T::N:::T:::::::::SY::A:::::::DE::P:::REITNL:K::::VD:A:TGK
Hmu0533         :L:::R:S:::H:S:Y:::T:E:::SKPSEER::SSQ::::TA:S:R::VS:TQ::VR::
HVO_B0117       ::DQ:LS::::H::VY:::T:I:::SK:::DS:SGNR::DNVI:S::::::::V::I:QS
Hbo3522         ::DD:QKN:::H:::H:::TKY:::TQ::DKQT:E:R::Q:G:D::::::S:TA::S::I

consensus       IERLRNTGRITVGD--FEVLVDVRVLCQDCGTQYSVAELLERGGCDCQSD----------
#oth            23627745626435113437334327.55.37567374135532.5.6:57675342323
VNG6171         ::::::A:NVSDTP::A:ITLS:::G:SA::RT:RIG:F::QR:::::T:AK::::::::
HQ2447A         :DQWTRKNV::D:S::YD:D:A:WIT:::::ERW:P:AF:DES::Q:TNTTEC:::::::
HQ3633A         ::KWTRKNV::D:S::YD:D:S:WIT::H::DRW:P:TF:DES::R:AH:TESSGPSTDT
HVO_2174        VD::VKAE:VFI:A::Y::E::I::T:T::D:RMTPTA::SS:H:::ERERDE:::::::
Hbo2988         VD:VAANEDV:::S::P::S::::IV:T::DVRLTPD:FV:-:::R:E--::::::::::
rrnB0193        ::S:DKNDA:S::::::NIINE:Q:::E:::RS:DIVAF::QD::::::K::::::::::
hla1034         :SS:A:A:ELDR::::YD::::::AV:PN:::DAP:G::IR::::G:T:EAETDDE::::
Hmu1817         LT:::D::::SL:::::RLII:FQ:Y:R::E::KT::S::DE:::E:E:EES::::::::
rrnAC2249       ::K::D::::DIA::::::FL:AQ::::S::S::A:::FF:Q:::E::Q:::::::::::
HQ1818A         ::K::E:D::ALDA::::::L::Q::::A::D:H::T:::::D::P::ISSND:::::::
hla0696         L:G::::ANL:L:E:::R:TI::::::TE:DSR:G:::::SS:::::PETSDAKADSEPG
HVO_B0174       LSD:AAADELD:DPETA::Y:::::H:P::NAH:T:ES:ID::::::D--::::::::::
pNG7385         VD::NTADKLA::E::YR:F:SIDIR:::::MR::ISD::D::::::E--::::::::::
NP4260A         L:Q:GRS:DLDI:A:::RT:::I::V:E::::::EAV::::::::::AQ-::::::::::
Hmu0533         L:S:H::D:::I:N:::S:F:::Q:F:::::::::AD:::TN::::::DEPET:::::::
HVO_B0117       LSS::::SKLRL:::::D::::TQ:Y:R::::::E:V:::Q::::::DESESNY::::::
Hbo3522         V:N:VS::::H::::::::::::::F:R::::::D:QD:::E:Q:E:GG:IVSTGSEADV

consensus       -----------------
#oth            22111111111111111
VNG6171         :::::::::::::::::
HQ2447A         :::::::::::::::::
HQ3633A         SVDVCPDTKTRTETEKK
HVO_2174        :::::::::::::::::
Hbo2988         :::::::::::::::::
rrnB0193        :::::::::::::::::
hla1034         :::::::::::::::::
Hmu1817         :::::::::::::::::
rrnAC2249       :::::::::::::::::
HQ1818A         :::::::::::::::::
hla0696         E::::::::::::::::
HVO_B0174       :::::::::::::::::
pNG7385         :::::::::::::::::
NP4260A         :::::::::::::::::
Hmu0533         :::::::::::::::::
HVO_B0117       :::::::::::::::::
Hbo3522         SE:::::::::::::::