| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4574 | VNG6173 | HVO_B0173 | pNG7386 | HVO_2175 | Hbo2987 | hla1026 | Hmu1818 | HQ1819A | rrnAC2250 | NP4262A | HVO_B0118 | Hbo3521 | VNG6320 | NP3410A | pNG7225 | HVO_A0180 |
| 2147 | VNG6173 | 4887 | 1314 | 1539 | 1764 | 1759 | 1572 | 1695 | 1566 | 1634 | 1822 | 1837 | 1811 | 773 | 909 | 945 | 891 |
| 2158 | HVO_B0173 | 1314 | 4888 | 1459 | 1685 | 1684 | 1713 | 1564 | 1559 | 1605 | 1836 | 1825 | 1859 | 807 | 876 | 787 | 804 |
| 2698 | pNG7386 | 1539 | 1459 | 4914 | 1871 | 1953 | 2063 | 2271 | 2209 | 2383 | 2288 | 2211 | 2300 | 815 | 946 | 952 | 869 |
| 2743 | HVO_2175 | 1764 | 1685 | 1871 | 4762 | 2683 | 2036 | 2233 | 2109 | 2181 | 2323 | 2170 | 2358 | 890 | 1006 | 974 | 864 |
| 2731 | Hbo2987 | 1759 | 1684 | 1953 | 2683 | 4665 | 2035 | 2053 | 2043 | 2213 | 2238 | 2176 | 2348 | 966 | 1028 | 1129 | 1032 |
| 2801 | hla1026 | 1572 | 1713 | 2063 | 2036 | 2035 | 5196 | 2311 | 2057 | 2346 | 2250 | 2298 | 2489 | 870 | 956 | 897 | 955 |
| 2946 | Hmu1818 | 1695 | 1564 | 2271 | 2233 | 2053 | 2311 | 4747 | 2308 | 2494 | 2521 | 2346 | 2539 | 861 | 920 | 951 | 1010 |
| 2802 | HQ1819A | 1566 | 1559 | 2209 | 2109 | 2043 | 2057 | 2308 | 4787 | 2856 | 2305 | 2347 | 2501 | 890 | 962 | 937 | 814 |
| 3144 | rrnAC2250 | 1634 | 1605 | 2383 | 2181 | 2213 | 2346 | 2494 | 2856 | 4792 | 2494 | 2571 | 2737 | 975 | 1045 | 1049 | 990 |
| 3021 | NP4262A | 1822 | 1836 | 2288 | 2323 | 2238 | 2250 | 2521 | 2305 | 2494 | 4671 | 2520 | 2634 | 945 | 922 | 1016 | 945 |
| 3025 | HVO_B0118 | 1837 | 1825 | 2211 | 2170 | 2176 | 2298 | 2346 | 2347 | 2571 | 2520 | 4711 | 2857 | 837 | 957 | 1058 | 961 |
| 3215 | Hbo3521 | 1811 | 1859 | 2300 | 2358 | 2348 | 2489 | 2539 | 2501 | 2737 | 2634 | 2857 | 4726 | 953 | 1051 | 1109 | 994 |
| 1284 | VNG6320 | 773 | 807 | 815 | 890 | 966 | 870 | 861 | 890 | 975 | 945 | 837 | 953 | 4622 | 1435 | 1599 | 1455 |
| 1443 | NP3410A | 909 | 876 | 946 | 1006 | 1028 | 956 | 920 | 962 | 1045 | 922 | 957 | 1051 | 1435 | 4305 | 1732 | 1857 |
| 1479 | pNG7225 | 945 | 787 | 952 | 974 | 1129 | 897 | 951 | 937 | 1049 | 1016 | 1058 | 1109 | 1599 | 1732 | 4350 | 2001 |
| 1414 | HVO_A0180 | 891 | 804 | 869 | 864 | 1032 | 955 | 1010 | 814 | 990 | 945 | 961 | 994 | 1455 | 1857 | 2001 | 4312 |
774 symbols consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111222323332333333333 VNG6173 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::METNAVSLIYRCRVG HVO_B0173 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7386 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MGGATRVIVLMPVTRTHR HVO_2175 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2987 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla1026 MVLLNTTIIDIHVVAAPADRDQRRSQSLGSHPTRRRRRGGSVSRRSTAKDRFNTASTVFL Hmu1818 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ1819A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC2250 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP4262A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_B0118 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo3521 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG6320 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3410A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7225 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0180 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ---------MTATLDVENIGGIDETSVTLEPGVTVLTGRNATNRTSFLQSIMAALG---- #oth 435777769:9373623511.145552737313221425123211.115225225.1111 VNG6173 ERMSQHDTDGRVSVYA::::::SQCD::FK:::N::R:::::G:::L:NGLAGV:::::: HVO_B0173 ::::MATTNRP:R:T:AG:::F:::T:AF:R::::::AGD:AD:::L:RGLVT::::::: pNG7386 NMGSLSVSGEV::VT::K:::::::T:EVP::::::R:::::::::::::V:::H::::: HVO_2175 ::MNDSEALQA::VRIR:::::::RR:R:D::::::::::::::::::RAL:G:C::::: Hbo2987 ::MAETQRDT::QV::::::::EDAD:QFQQ:I:::::::::::::::R::A:G:::::: hla1026 IISMDHISKPVVRV::R:::::::A::::PD::SI::::::::::::::AL::G:::::: Hmu1818 ::::::::MNSG::T:::::::EH:TAEIP::::::ASP::S:K::::R:V::::::::: HQ1819A MMTTSQTVSDA:QFH:R::::::::::VV:::::::::E::::::::::AV:::M::::: rrnAC2250 :MPESKQGSSI:HF::T::::::::::DIP:S::::::K:::::::::::::::M::::: NP4262A ::MSSEQRATG:EIS:R::::::::T:AF:::::::A:E:::::::L:::L::V:::::: HVO_B0118 ::::::VSKSKVH:S::::::::DL:TSF:::::::A:::::::::L:R:::::H::::: Hbo3521 :MSRAQSTTG:V::H:::::::R::T:E:G::::A:A:::::::::L::::::::::::: VNG6320 :::::::::-MWNV::TC::::RSGEA::R::PNIVQAS:FQGKS:::AA:QT:I:TTGL NP3410A :::::::::::WK:EI:::A::RSGAA:I:::LN:VHAE:WQGKS:::K::RTVF::::: pNG7225 :::::::::::WNI:I:R:A::LDG:A:IA:::N:VR:S:WQGKS::IEA:KT::::::: HVO_A0180 ::::::::::SWH::::HVA::RRG:A:::::LNAVRAS:WQGKS:::AA:ATV:::::: consensus -SDAAS--LKGDADEGSVELELDGETYTRTLTRAGDT----VAFDGDPYLD---DPALAD #oth 12567511433343428.5.5643451526352644511111656.52215433156613 VNG6173 :GT:PV::::::EQ:AE:R::FN:T::DQQY::KNG::::::QAA:Q:VTE:::RRD:V: HVO_B0173 :::EH:PDCDA:T:DSW:::AVE::R:V::FAGE::R:::::VAS::::::::::::A:: pNG7386 ::EW::::V:::S:Q:R:::S:GE:::::::::TD:G::::::GS:LGL:T::::STV:: HVO_2175 ::::I:::::::::::::::::::R::::L:S:ENG::::::ST::T:::R::::A:T:: Hbo2987 :::DV:::::S:::S:H:::KI:::S:::S::QKRG::::::T:::::::E::::STI:: hla1026 ::RQS::::::::E::E:A:::GD:::::::Q:R::S:::::::G:::::::::::E::: Hmu1818 :::QV:::::::::::::S:::::T::E::FE:T:A::::::RS::T::::::::S:V:: HQ1819A ::N::T::::A:::::I:::T::ETE:Q::VSQTD:::::::I::::T::::::::DI:E rrnAC2250 ::TQ:T::::::::::::A:TYGD:V:E::::::::A:::::Q::::G:::::::::V:: NP4262A :::DV:::M:A:::KA::::RV:::::::::::Q:S:::::I:TG:::::A::::ST::: HVO_B0118 :::DVA::::::::::::::TIGD:A::::FE:Q::::::::ISG:N:V:::::::D::: Hbo3521 :::R::::::::::::::T:TVGDQ::::::K:R:S::::::VTE:::::E::::AT::: VNG6320 LTEDHP:::MENE:D:K:T::T:E::::VS::::T:SDEPAISRS:T:::TRDQ:QIA:R NP3410A :T-:NP::ITESC:::Y:::REEET:T:VR::::DGR::::IIRE:::V:ETPY:RRR:I pNG7225 :T-STE:::TEG:ES:T:H::TPTGV:DVA:::ENG:::::::RR:E:::SDEY:VIR:E HVO_A0180 :T-:SP:::TEG:T::R:S:ST:DGE:AVE:::D:RN:::::RTT:E:::SAEA:RVC:: consensus LFAFLLESNEARRAVARGDD--LRELIMRPVDTEAIDAEIEALQRERDEIDDELSALESL #oth 1.12.336.32.2216546211.3332452214541644166254328424742673455 VNG6173 ::VC:TAE:P::::IVQDGN::::DV:::::::GS:QRR::D::S::NR:GQRIR:I:DD HVO_B0173 ::::::G:::::Q::TAER:::::K:VVHS::ID:VNE::AD:RA::A:L::RIE::AA: pNG7386 :::::::D:::::::E::V::::::I::::::VAS:HRQ:R:AEQRKE:::A::DRIA:: HVO_2175 R:::::G::::::::VAER::::YDV::SL:::D::E::::R::SR:TQVERR:DS:D:: Hbo2987 ::::::G::::::::VA:A::::::IL::::::V::ES::QS:KS:::Q::S:IKQ:S:V hla1026 :::::::N::::Q::::::::::::I::::I::DS:::::RECK::::DLET:IEK:D:: Hmu1818 ::::::K::::::::QSTV:::::::::::::::::QS:::RC:::::H::EQ:DEID:: HQ1819A R::::::G:N:::::S:SV::::::I::E:::I:E:KRK:SS:ESQ:S:::EKI:DI::K rrnAC2250 :::::::T:::::S:::::::::::I::::::ID::RS:V:Q:EA:KGD:N:::ATV::R NP4262A :::::::::::::R::TEG:::::::::::::::E:QR::DR:SER:N:::::::T:D:: HVO_B0118 :::::::T:D::Q:::::::::::D:::::::V:S:NEQ::S::Q:KRD:A::::T:SN: Hbo3521 ::::::::::::Q:::::::::::::::::I:::::QE::RE:EQ:KR:::N:I:S:D:: VNG6320 :::V:G:D:PI:A::REENQER:T::LKK:LE::N::LR:::::::IK:LE::VA:A:AA NP3410A :::::G:E::I::::R::E::::EDELTA:L:LQN::EQ:T::TEK:ED:ERQ:EQA:RA pNG7225 :::C:D:R::V::::RA:EN:::EDVLL::L:FQN:::Q::T:::::EQ:ET::TQAREA HVO_A0180 :::::G:E::I::::RE::::::EP:LT::L:F:D:::N:AEAR::::RV:EA::EA:DA consensus KDRLPDLEQRRTELEAEIEELRAELAELEAEID-------E-DADVE--RE---ERDELE #oth 663347247337726542444543246647642111111158235636545111876463 VNG6173 L:QRTS:TS:K:T:VSDLD:CDQ:IE::RNQLE:::::::QF:::P:::--::::AE:I: HVO_B0173 ESER:G:RD::D::D:T::R:E::::DRQ:TL:GIESAAVDG:T:A:ANP:PDANGSDA: pNG7386 :RD:::::RQQAD:RD::A:T:D::QRV:DR::::::::::R:::FQTTQK:::N::::: HVO_2175 DADRRS::SK:DD::::::A:E::RDDI::::E:::::::AE:RT::TQ:::::HQA::D Hbo2987 E:EIHT:::::NSIKET::::ADKRD::T:::E:::::::AE:RSLSEQT::::NKA::D hla1026 ERD::N::AD:R:KVE:L:AAEED:QSVREKL::::::::DL:TG::ES:T:::RKQ:M: Hmu1818 :Q::::::EQKR::QN:V:AK:S::ES::T::E::::::::A::S::SQ::::::::::: HQ1819A :Q:::E::K:KENI:SK:SKK:E::SKK:T:::::::::::SSRNISDSQ::::KEA::: rrnAC2250 QRD:::::::::::REQ:::K:E::::R:E::::::::::NSSR:I:ES:Q::::Q:V:: NP4262A :::::S::E:::Q:RG::::TE::::DV::RL:::::::::R:::I:QT::::::KA::: HVO_B0118 S::::Q::R:::K::DQ:::KED::::K:Q:VE::::::::Y::S:SERQ::::VES::: Hbo3521 DG:::E:::K::S:KEK:::K::::E:K:Q::E::::::::A::N::QT:D:::D::::: VNG6320 SAD::AAQ:KV:R:QG:LRD:NETRD:::RKV::::::::-:-----::--::::ETDQR NP3410A A:DAI:::::VQ::S::L::::S:RSSM:THG::::::::-:-----::--:::--SDSG pNG7225 :K:I:SVQEKV:R::N:::D:Q:KRETIDS:AG:::::::-:-----::--:::SD:SS: HVO_A0180 A::::T:AG:VS:::::V:::E:KR:AAD:AGG:::::::-:-----::--:::-----D consensus EALDELRSARSDLEDVRFRIETERESIESLRDERDELEDELDSL-ETPAEELDELEAEIS #oth 564662655344343547334334535433462573685352443454866:87447524 VNG6173 Q::TS:EERKQE::SITN::R:QEDTR:A::::QS::QT:REAI:::SE:::KRI:TRL: HVO_B0173 ARQGRR:ELYAA:D:IE:EL:A::::LDA:DA:I:DI:S::::RPAD::A:::D:T::LA pNG7386 T:::::QAT::E:KR::DD:QS:Q:::AA:::::GN:AV:RSG:P:S:T:R:EA::SD:D HVO_2175 :V:S::Q:::::::S::::LQS::::V::::E::S::QS::::F:DAE:VDRG:ASDR:E Hbo2987 :I:EK:Q::::::KS::::L:S::::::::::::T:TS::::A:S::DY-:TKQI:SQ:E hla1026 ::FQRV:D:::A:D:LE:DL::::STLAE:KS::E::RETVEEA::D:D:NP:R:AGR:D Hmu1818 T::E:::DV::T:::::YE::AK:KRHS::KE::N:::T:I:E:ADV:ED::ANI:GHVD HQ1819A SK::::::T::::DSI:QQ:::Q:::::::QA:HE:NKTA:SE:SS:::AK:TR::QQ:N rrnAC2250 :K::::::T:::::S::RD::AQE:::S::KR::SD::::::D:P:::MGDQQH::D::A NP4262A :R:T:::TK::E:::::YDL::::::L:::QTQ:R:V:S::E::P:::VG:I:D:::R:: HVO_B0118 SK:GD:::K:R:IN::DR:::::KQ:LDA:ES:EA::::DAED:P:VAGGKI::I:S::: Hbo3521 NR::D:KQ:::::::::YD:DA:A:::DA:ET:::::TT:REDIP:-EIDGA::I::Q:: VNG6320 ALR:::TAKQ::::REEA:L:RLENQVDRRKAQL:DK:AA:E:::--DIPDSPTA::D:A NP3410A STTQA:ADKQAQ::RQ:N:KSRLESTVQRVE:RLT::DAAESGI:DV:EAAVG:---:LA pNG7225 SVRRQ:SQ::TEQNQAQN:V:RLEQ:::RTEQRLS:RQ:D::A::--EIP:YNDVADKL: HVO_A0180 :TREA:SD::AERSR:QS::DRLESTA:RV:EQL:ARNE:::G::--DV:DDE::AR:LD consensus ELRDRKRRLNSDINELQSVIQFNEDMLEGDRSDVA----------------ED-AGSVTD #oth 664645653566345247445315662446787381111111324456756666734634 VNG6173 ::TS:E:S:ATT::D:SAIVD::::LVSNAD::LL::::::::::::::RSG:A:E:PVS HVO_B0173 :S:A:::::DA::TDV:RTL::::QF:TSET:P:::::::::AASEVERES:SENDESDG pNG7386 R::E:::E:SEYTTR::N::G:::EL:S:EHREIT::::::::::DAIDAKPESV:DI:: HVO_2175 SV:S:IES:::T:S:::T:V:YT::V:D:KAGL:E::::::::::::DSLGA:GD::::: Hbo2987 QT:G:IDE::RT:TD::TI:EY:S:V:A:KSDV::::::::::::::DALD::A:::::: hla1026 :::R:::S:DD:V:::G:::G:::::VD:SGI:ID:::::::::::::::G:PTTDEP:: Hmu1818 D::S::QQ:DAE:S:::KT:::::K:IDEAT:GSH:::::::PAVDIATDGG:G:-T::: HQ1819A S:::DRQA::AE:SQ::NL::Y:::Q::DGEYN:IGRISDDVNSKTDTEESSSG:DAI:: rrnAC2250 S:::QRQ::::E:SD:::L::Y::ER::EEDY::I:::::::::QSLEDAP:GSD:A::E NP4262A SR:E::AT:E:AV::I::AVR::QE:::::EAA:S::::::::::::::LPAEDD:DL:: HVO_B0118 R::T:RQEIQ:TV:::::::::::E::S:TS:::V::::::::::DALRDAD:AG::::: Hbo3521 D:::QMQ::D:SV::::T:::::::::::TSA::::::::::::::AALRDGTDS::::: VNG6320 :KQT:IDE:AVK:DL:DDLHRSTKAIIDEGEI:LI::::::::::::::::--:--TDVE NP3410A TVETEL:::::::DL:::LYSA:HRL::E::LELV::::::::::::::::--:--ADI: pNG7225 :A:ESLSQVER:AEV::::YSAT:MV:SE::L:LL::::::::::::::::--:--TEVE HVO_A0180 AAKRELN:QER::EL:RG:YDA:RRVVAE::TELL::::::::::::::::--:--TDVT consensus QLLA-----GDTVVCWTCGSEVDREQIEETLDRLRDLRDEKREERNDLRDELDELESERR #oth 54684121143544.11..26247462342266254456553665645574344256465 VNG6173 K:NPM::::SE::E:::::T::E:NR:AGR::D::::V::::T::SEVQT:IE::RESQQ HVO_B0173 ESDD:::::::S:::::::TS:PEAS::S:::Q::A:::DR::::AE:A:RIER:QER:S pNG7386 ::YK::::::SKTT::::::Q:KP:R::S::QSM::HLQ:MVS:IGSIE::::::TGQ:D HVO_2175 ::VS:::::SE:TT:::::T::::D::RG:T::::EV::::::::AE::R::::::RSM: Hbo2987 ::V-:::::DS:IT:::::TN:EQS:V:::T::::S::::H::R:EE::NR:E::D::L: hla1026 A:T::::::::QT:::::::::ETD:::A::::::E::SD:LD:::EI:A:IQ::TD:QS Hmu1818 :::DQ::::RQET:::::::::EID:::D:VAN:::V:R::LDTID:IES::::YKRQKK HQ1819A R:::DENTGSE::T::::::A:::::::A:V:Q:KSV:ADRVQSL::VKSD::S:K::K: rrnAC2250 :::EGED::EES::::::::T:::::::D:V:::Q:::RQ:V:DL::IKS:::D:KTDQ: NP4262A E::P:::::SE::T::::::::PQDR::::VG:::E:SQS:LGDID:IES:IT::QQ:VE HVO_B0118 :::G:::::D:Q:::::::::::KSE::G::E:::T::E::L:DNR:H:EQ:S:::D:KS Hbo3521 A:VE:::::S:::::::::T::ETS:::::V::::S::R::LDQ::::::QI:D:::::D VNG6320 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