|
Pairwise sequence scores | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3937 | Hbo2810 | rrnAC0903 | Hmu1583 | NP4364A | rrnAC0004 | Hmu1289 | VNG1529 | hla0750 | HQ3018A | HVO_2471 | Hbo2371 |
3037 | Hbo2810 | 3924 | 2871 | 2890 | 2869 | 2476 | 2798 | 2828 | 2900 | 2827 | 2866 | 2831 |
3094 | rrnAC0903 | 2871 | 4025 | 3616 | 2913 | 2518 | 2777 | 2889 | 2932 | 2813 | 2850 | 2867 |
3151 | Hmu1583 | 2890 | 3616 | 4055 | 2879 | 2525 | 2837 | 2872 | 2988 | 2839 | 2873 | 2857 |
3401 | NP4364A | 2869 | 2913 | 2879 | 3955 | 3041 | 3330 | 3185 | 3153 | 3060 | 3125 | 3134 |
2998 | rrnAC0004 | 2476 | 2518 | 2525 | 3041 | 3464 | 3121 | 2766 | 2778 | 2739 | 2768 | 2740 |
3365 | Hmu1289 | 2798 | 2777 | 2837 | 3330 | 3121 | 3970 | 3107 | 3086 | 3049 | 3053 | 3061 |
3464 | VNG1529 | 2828 | 2889 | 2872 | 3185 | 2766 | 3107 | 3910 | 3285 | 3226 | 3254 | 3295 |
3531 | hla0750 | 2900 | 2932 | 2988 | 3153 | 2778 | 3086 | 3285 | 4071 | 3322 | 3373 | 3380 |
3469 | HQ3018A | 2827 | 2813 | 2839 | 3060 | 2739 | 3049 | 3226 | 3322 | 3944 | 3390 | 3558 |
3488 | HVO_2471 | 2866 | 2850 | 2873 | 3125 | 2768 | 3053 | 3254 | 3373 | 3390 | 3951 | 3568 |
3525 | Hbo2371 | 2831 | 2867 | 2857 | 3134 | 2740 | 3061 | 3295 | 3380 | 3558 | 3568 | 3921 |
531 symbols consensus ----------------TMEDRIEELRERREEALLGGGEDRIESQHEKGKMTARERIDYFL #oth 122223322233333424425333123333325311123114311311121111124223 Hbo2810 ::::::::::::::::-:Q:KLN::K:::::SHR::::E:::K::D:::L::::::S:L: rrnAC0903 ::::MSQQEEPDDETGAPD:AV::::QK:A::E:::::A::::::::::::::::::FLV Hmu1583 MSEHDADQEDEQVTDDAVS:P:::::::KR::Q::::::::QA::D:::::::::::FLV NP4364A :::::::::::::::M::D:E::::::KKRD:E:::::E:::K::::::L::::::E::: rrnAC0004 ::::::::::::::::-------------------------------------------- Hmu1289 :::::::::::::::V:H:::VDD::::KR::E:::::E:::A::D:::L:::::::::: VNG1529 :::::::::::::::M:::E:::D:::QT:R:::::::A::::::::::L:::::::::: hla0750 MPLADPRGNDSGWSGV::D::::D::::::R:A::::::::::::::::::::::V:::: HQ3018A :::::::::::::::M:::::L:K::K:::R::K:::Q:::DA::Q::::::::::N::F HVO_2471 ::::::::::::::::-:::::D::::K:::::K:::::::A:::D:::::::::::::: Hbo2371 ::::::::::::::::-:::::D::::K::R::K:::::::::::::::::::::::::: consensus DDGTFNEFDQFRTHRSTNFGMEEKQLPGDGVVTGYGEVDGRKVFVFAHDFTVFGGSLGEV #oth 12221514142421234212.214442..1.11.1.3.3..3221.......1...1111 Hbo2810 :E:S:V:V:A:AE:QCR:::::DRTV:::A::::H:T:N::PIV::::::::::::VSS: rrnAC0903 :::::::V:P:VE:::::::::::RFA::A::::::::::::::L:::::::L:::V::: Hmu1583 :::::::I:P:VE::::::::::::FA::A::::::::::::::L:::::::L:::V::: NP4364A :::::E::::LK:::C:::D::DD:PY::::::::::::::::::::::::::::::::A rrnAC0004 --------------------:AD:KV::::::V:::K::::R:Y:::::::::::::::A Hmu1289 ::D::V:I::L:E::::::D:D:RHV::::::::::::E::::::::::::::::::::A VNG1529 :::::::L::L::::::::D:D:TK:::::::::::D:N::TT::::::::::::::::: hla0750 :::::H:::R:::::NN::::::Q:I::::::::::::N:::T::::::::::::::::: HQ3018A :E:::::I::::::::HK:::::R:P::::::::::D:::::T::::::::::::::::: HVO_2471 :::::R:::::::::NHK:::::TK::::::I::::::G::T:::::::::::::::::: Hbo2371 :::::::::::::::NHK::::::::::::::::::::::::T::::::::::::::::: consensus FAEKVCKVMDKAIEVGAPVIGLNDSAGARIQEGVDSLGGFAEIFRRNTEASGVVPQISAI #oth 1.2.13.11.2.213.2.11.....1.......121.3.1131.41.22...11....1. Hbo2810 V:::IN:IV:T:::A:V::V:::::G:::::::::::D:::NL:::::K:::::::::C: rrnAC0903 V:D:I:::::R:::N:V::::::::G:::::::::::V:::K::E:::K:::LI:::::: Hmu1583 V:D:I:::::::::N:V::::::::G:::::::::::V:::K::Q:::::::LI:::::: NP4364A ::::::::::R:::T:::I::::::::::::::I:::A:Y:D::H::QK::::::::::: rrnAC0004 ::Q:::::::::::T:::I::::::::::::::I:::A:Y:D::H::QQ::::::::::: Hmu1289 ::Q:::::::::::T:C:I::::::::::::::I:::A:Y:D::H::QQ::::::::::: VNG1529 :::::T::::R:M::::::V:::::::::::::::A::::::::T::EK::::::::::: hla0750 ::::::::::::MD:::::V::::::::::::::A::::::::::::::::::I:::::: HQ3018A :::::S::::::V:::::IV::::::::::::::Q:::::G::::Q:::::::::::::: HVO_2471 ::::::::::::M::::::V::::::::::::::Q:::::G::::::::::::I:::::: Hbo2371 :::::S::::::V:::::I:::::::::::::::Q:::::G::::::::::::::::::: consensus MGPCAGGAVYSPAITDFTFMVEDTSHMFITGPDVIETVTGEEVGFEELGGATTHASESGV #oth ........1...11...23.131....1.......1.....1.222.....72.232... Hbo2810 :::::::::::::L:::::::Q:::::M:::::::::::::Q:TMD:::::NA:T:K::: rrnAC0903 ::::::::T::::L:::::::Q:::::::::::::::::::Q:SK::::::GS:STK::: Hmu1583 ::::::::T::::L:::::::::::::::::::::::::::Q:SKG:::::GS:S:K::: NP4364A :::::::::::::::::IY::::::::::::::::::::::::::::::::S::TG:::: rrnAC0004 ::::::::::::S::::VY:::E::::::::::::::::::::::D:::::K:::::::: Hmu1289 ::::::::::::S::::VC:::E::::::::::::::::::::::D:::::Q:::::::: VNG1529 ::::::::::::::::::V::K:::::::::::::::::::Q:::::::::::::A:::: hla0750 :::::::::::::::::::::K:::::::::::::::::::::S:::::::V::S:T::: HQ3018A ::::::::::::::::::::I::::::::::::::::::::::T:::::::I::::T::: HVO_2471 :::::::::::::L:::::::R:::::::::::::K:::::::T:D::::::::T:T::: Hbo2371 :::::::::::::::::::::K:::::::::::::K:::::::T::::::::::::T::: consensus AHFAAASEEAALDDIRRLLSYLPQNNVEDPPRVEPWDDPERRDEELNDIVPDAPRKPYDM #oth ..22542113.113.241...1.3..1.1....2.1.1.2.522517521.22.21...2 Hbo2810 ::K:FRDD:::::S::E::::::A::M::::::::::::N:::D::I::I:EE:K::::: rrnAC0903 :::SYP:::E::EN:::::::::A::M::::::K:::::D:EIPGVT::::S:::::::: Hmu1583 ::::YP::::::EN::::::::::::M::::::K:::E:D:EVP:VT::::::::::::: NP4364A :::S::D:KD::::::Y::::::S::::::::::::::::::::K:KE:::SE:K::::I rrnAC0004 :::T::D:KD:M::::Y::::::::::::::::K::::::::::::KSA:::::Q::::: Hmu1289 ::LT::D:K::M::::YM:::::::::::::::D::::::::::::V:V::E::QQ:::: VNG1529 ::::CD:::::::N:K:::::::::::::::::::Y:::::::DA:ET::::E::::::: hla0750 ::::EE:::D:::::A:::::::A:::::::::::::::::T:D::G::::::::::::: HQ3018A ::::CE:::::::::::::::I:S::::N::::::::::D:S::S::NV:::E::::::I HVO_2471 ::::TDT::Q::::::H::::::::::::::::::::::::V:DD:AGV:::Q::::::I Hbo2371 ::::CE:::E:::Q::L::::::P:::::::::::::::::A::S::TV:::E::::::A consensus TDVIDGIVDEGSFFEVHEDFARNIVVGFARLDGRSVGVVANQPRVNAGTLDIDASEKGAR #oth 33.23412.22.11112242.2.213..2.1..211.1.1.1...1....1.3113.11. Hbo2810 :E::QH:::V:::Y:T::NY:K:L:::::::::::I::::::::::::::::A::::::: rrnAC0903 :K:::A::::D::::::GNW:::V::::S:M::Q:::::::::::S::::::::A::A:: Hmu1583 :R::GS::::D:::::::SW:::V::::::M::::::I:::::::S::::::::A::A:: NP4364A V::::R::::D:::::A:SY:::L:T::G::::::::::::::::::::::::::L::S: rrnAC0004 :::VGR::::D:::::A::::::::I::::M::H:::::G::::::::::::N::R:::: Hmu1289 :R::::V:::::Y:::A:A:::::TM:::::::::I:::G::::::::::::E::R:A:: VNG1529 :::V:SV:::Q:::::QA:Y:K:::::::::::::::I::::::::::::::::::::S: hla0750 K:::GSV:::::::::Q:N::K:::::::::::H:::I:::N::::::::::ES:Q:::: HQ3018A H:::N::I:K:::::::::::Q:V:I::S::::HAI::::::::::::::N:E::::A:: HVO_2471 H::L::VL::::::G:Q::::K::::::G::::H:::I::::::::::::N:N::::::: Hbo2371 H:::::VL::::::G:::Q::K::::::G::::H::::::::::::::::::E::::A:: consensus FVRFCDAFNIPILTFVDVPGFMPGTDQEHNGIIRHGAKLLYAYSEATVPLLTVITRKAYG #oth .1.1..1..1..2111.....1..1...221..21....1..12..1...31.11..... Hbo2810 :::::::::::::::::::::::::::::G:::K:::::I:::G:::::::::V:::::: rrnAC0903 ::::::S:::::::L:::::::::::::::::::R::::I:::A:::::::S:VV::::: Hmu1583 :I:M::S::V::VSL:::::::::::::::::::R::::I:::A:::::::S:VV::::: NP4364A ::::::::::::V::::::::::::::::::::K:::::::::::::::::::::::::: rrnAC0004 ::::::::::::::::::::::::K:::T:A::N::::::::::::::::V::::::::: Hmu1289 ::::::::::::C:::::::::::K:::R:A::N:::::::::::::::::::::::::: VNG1529 ::::::S::V::::L::::::L:::::::G::::::::::::F:::S:::M::::::::: hla0750 :::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::::F::::::::::::::::: HQ3018A :::::::::::::::::::::L::::::::::::::::::::::::::::A::::::::: HVO_2471 :I::::S::::::::::::::L::::::::::::::::::::::::::::M::::::::: Hbo2371 ::::::S:::::V::::::::L:::::::E:::::::::::::::::::::::::::::: consensus GAYDVMASKHLGADVNYAWPTAEIAVMGPQGAVNVLYRDELAAADDPEARRQELIDEYRE #oth ...2..1..2112.1.....11.2..1..2....1.123.123.1122.1.12.11.1.1 Hbo2810 :::I:::::G:::::::::::::L:::::R::::::H:R:I:K::N:::K:::::::F:: rrnAC0903 :::I::S::F::S:::::::GS:M::L::R::::I:::N:I:D:G::D:K::::M::F:D Hmu1583 :::I::S::F::S:::::::GS:M::L::R::::I:::N:I:E::::D::::A:M::F:: NP4364A :::::::::::D:::::::::::::::::K::::::::::::D:::V:::::Q::::::D rrnAC0004 ::::::::::I:::M::::::::::::::::::::::D:::ED:::V:::::Q::::::D Hmu1289 ::::::::::I::::::::::::::::::::::::::D:::E::::V:::::Q::::::D VNG1529 ::::::::::I::::::::::::::::::K:::::::S:::E::::TA:::::::::::: hla0750 :::C::S:::I:G::::::::::::::::K::::::::E::::::::D:::::::::::: HQ3018A ::::::::::::::::::::::::::::::::::I::D:::E:::::::::D:::E:::: HVO_2471 ::::::::::::::::::::::::::::::::::I::::::D:::::D:::D:::E:::: Hbo2371 ::::::::::::::::::::::::::::::::::I::S:::D:::::::::D:::E:::: consensus EFANPYTAADRGFVDDVIEPTETRPRLIDDLDMLRSKRKEQPDKKHGNIPL #oth 1..1..21121.22.2.12.41..4..15.142154..335.212...2.1 Hbo2810 :::H::R:SEK:HI::::D:R:::::::K::QLRET::A:N:P:T:::V:: rrnAC0903 ::::::GP:K::YL::::::K:::K:::Q:::L:QR::EDT:P:D:::::: Hmu1583 :::H::GP:K::YL::::::KD::K:::::::L:ER::E:S:P:D:::::: NP4364A A::::::::E:::::::L::QD::::::N::E::E::::D:::R::::::: rrnAC0004 A::::::::K::::::::::Q:::::::::::L::G:::D:::R::::::: Hmu1289 A::::::::E:::::::L::Q:::::::::::T::N:::H::ER::::::: VNG1529 ::::::::::::YL:A::::::::::::::::::A:::E:T:::::::::: hla0750 ::::::::::::::::::::::::A::::::T::KG::S:A:E:::::::I HQ3018A :::::::::::::I:S:LK:::::R:::::M:::::::SSL:E:::::L:I HVO_2471 :::::::::::::I::::::G:::E:::S::R::N::::S::::::::::: Hbo2371 :::::::::::::::A::::::::A::VE::E:::::::SL:::::::::I