|
Pairwise sequence scores | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2774 | NP5220A | HQ2342A | HVO_1349 | Hbo0200 | VNG0270 | rrnAC1860 | Hmu0816 | hla1808 | HVO_0759 | Hbo0772 |
1825 | NP5220A | 2890 | 1185 | 1279 | 1196 | 1121 | 1355 | 1419 | 1461 | 1427 | 1438 |
1762 | HQ2342A | 1185 | 2894 | 1668 | 1802 | 968 | 1075 | 1334 | 1299 | 1347 | 1389 |
1820 | HVO_1349 | 1279 | 1668 | 2856 | 1820 | 976 | 1192 | 1289 | 1366 | 1435 | 1404 |
1807 | Hbo0200 | 1196 | 1802 | 1820 | 2902 | 1066 | 1157 | 1391 | 1276 | 1431 | 1416 |
1435 | VNG0270 | 1121 | 968 | 976 | 1066 | 2236 | 1035 | 1163 | 1084 | 1190 | 1180 |
1653 | rrnAC1860 | 1355 | 1075 | 1192 | 1157 | 1035 | 2763 | 1532 | 1265 | 1399 | 1373 |
1835 | Hmu0816 | 1419 | 1334 | 1289 | 1391 | 1163 | 1532 | 2756 | 1381 | 1528 | 1472 |
1808 | hla1808 | 1461 | 1299 | 1366 | 1276 | 1084 | 1265 | 1381 | 2877 | 1554 | 1581 |
1983 | HVO_0759 | 1427 | 1347 | 1435 | 1431 | 1190 | 1399 | 1528 | 1554 | 2828 | 1868 |
1887 | Hbo0772 | 1438 | 1389 | 1404 | 1416 | 1180 | 1373 | 1472 | 1581 | 1868 | 2895 |
431 symbols consensus -----LFG-LCGLVFLVNLARVVFAPLVEPLQAAFGVGPATLGLVATLVWLGSALPRIPT #oth 232221112122312221221321211334456735354324154323213121321313 NP5220A MSRRQ:::S::AM:::::::::::::::Q:VA:D:A:T::A::V:::AA:::::A::L:: HQ2342A :MTRR:::T:::::L:::FG:T::::::::::V::::::::I:F:T::::V::::::::V HVO_1349 :VTRR:::T:::::::::FG::A:P::::T::TQ:S:::::I:V:TS:::::T:I::::V Hbo0200 :VTRR:::T:::::::::FG:TA::::::TF:NQL:AS:EAV::MT::::V:T::::::V VNG0270 :::::---:--------------------------------------------------- rrnAC1860 :::::---:---M::CI::G:::::::I::IR:TT:ASD:::::L::MA:A::::::L:: Hmu0816 :::::---::L::::::::::::::::L:::GT:LDAND:A::TI:::A::::::::::: hla1808 VSRSR:::S::AI:::::F::::::::IGEFISE:AI:EG:A::IV::A:::::A::L:A HVO_0759 :::::---:---M:L::::::::::::LGEFILF:E:DR::V:I::::::::::AL:V:: Hbo0772 :::::---:---M:L::::::I:::::L:Q:ISV:SI:EG:A::IV::::V::::::::: consensus GYLLTRVPRHRVVLGSGVLLTVAAAFTALAPSIPTLMVGAFLMGLASGAYFVAANPLVSE #oth 13311232146123432541444354224.533641431.253.11..3.121141123. NP5220A ::::::::::T::AAT:L::VGTS:G::F:::L:W:T:::::::IS:::::I::::::T: HQ2342A ::V:::::::H:::TA:G::S:S:::::S:T::W::QL::LAI:I:::G:::::I::IG: HVO_1349 :::::::S:SK::::::T::V:::::::S:T:VL::QI:::GL:::::::::S:T:::G: Hbo0200 :::::HI::::::::T:A::::T:::::T:S::R:VQ::::GI:::::::::::V:::G: VNG0270 --------------------------MT:::T:ELV::::LFV:::::V:::::S::::: rrnAC1860 :V::::IS:AK:IF::::V::LGTT:::F:FDPTL:L::::T::::::V:LT:::T:::: Hmu0816 :::::HIS:SV:I:A:SGI:A:::VA:S::N:V:AV::::::::::::S::I:G:::A:: hla1808 :WA:::FS:QY:::V::AM:::G:LGV::::GV::::AA::AI:::::V:::::::FIA: HVO_0759 :W:::::::::::::T::V:V::SGV::S:TT:EA:::::VS:::::::::::::::::: Hbo0772 :WV::::::::::::T::I::A:S::::A:D:VAMVA:::L::::S:::::::::::::: consensus LFPDRVGRAIGIHGTASQLAAVGAAPVVVAALAVGD------------WRAAFWLLAAAA #oth .2.311.243.2..3.1.2..141124225315477311111111111.24315432323 NP5220A :::S:::W:L:V::M:::I:::::PLA:S:V:L:SG:::::::::::::::T:L::S:L: HQ2342A :R::::::S:::::::A:I:::I:::IA:::VTAL:::::::::::::::::::A::VTT HVO_1349 :Y:E::::MV::::A:::V:::V::::::FI::SYS::::::::::::::ET::V::::G Hbo0200 :Y::A::::::V::::A:::::V::::::TFV:LE:::::::::::::::TT::::::L: VNG0270 ::::::::V::::::::::::AV:PLL::RV:L:RYT::::::::::::::P:Y::S::: rrnAC1860 :::E:P:::L:Q::V:A:::::::PALISFV:V::T::::::::::::::T:LQGI:V:: Hmu0816 :::::::STL::::::::::::S:PAI:::::G:::::::::::::::::TV:RAM:V:: hla1808 :::T::::VM:V::M:::::::A:::::TV::WYD-::::::::::::::L::YG::L:S HVO_0759 :::::::::M:::::::::::::V::F:TLV::::PDLVDRLPFVSAA:QLV:VCVGL:: Hbo0772 :Y:E:::::M::::M:::::::I:::F:TL::TLFVE::::::::::::YVV:VC:GI:: consensus AVVTVVLAVTARRTDLPDAGAADRDLLAAARAQWRIILTGIVIIGVTGFVWQGLFNFYVL #oth 3231221454124443342235.131123116213213313343362111.1.2..1134 NP5220A F:T::::V:A::::E::::::K::S:::::::::P::::::::V:SS::L:N::::L:GP HQ2342A ::T:IL::G:::AIEGQIGTGP:::FS:-VLTH::VVVV:LIM:V:A::::::V:::::S HVO_1349 :L::LL:YAVS:DGSAGAGTG::::FS:-:LGH:KL:::::LL:APA::::::::::L:S Hbo0200 :A::::::Y:::GV:AVVETDT:::F:G-:LRH::L:FV:MLM:STA::::::::::::S VNG0270 :::::::Y:::E:A:::::AG::::::GSV:R:Y::VAL:V:TV:I::L::N:F::::PK rrnAC1860 G::::AFTII:::AQ:::::SK:::::G::::::H::V:SVAT:::A:L::N:::::::T Hmu0816 V:SGIAF:L:::::EM:::::E:TAF:::::H::::V:A:VAV:::::L::N:::::::K hla1808 :AS:::FVAL:::::::::::G:T:F::G:LSE:KL::A:V:LM:L:S::::::::::E: HVO_0759 ::::LA:F::::S::::::::::::::G:::TE::VV::::::L:F::::::::::::E: Hbo0772 F:A:::FYY::K::N::E::GE::N::R::LN:::::AL::::L:F::::::::::::E: consensus YLV-AKGLPAATARTLLTVVFAAGVPAFFLSGRLADRLPRVPYILGILGAFVVSVFALTV #oth .354414346331442.223.1......432.4.1.22252.121442431454133327 NP5220A ::AAE::IDE::G::::S:L::::::::L:A:E::::VRN::LL:A:IIG:AA::::::F HQ2342A ::ID::SI:::Q:GGY::I:::::::::W:::Q:V::FAP:::::TM::VYAT:L:M::R HVO_1349 :MTQ::AFD::::S:M::I:::::::::S:::::::N::H::::F:L:V::IGALV:::Y Hbo0200 :::D::PFTT:Q:S:M::::::::::::W::::::::F:::::::VT:AVY:AAL::::E VNG0270 ::IET::VTKR::NL:::::::::::::WYT::::::FRH::LM:A:::S:::TL::I:: rrnAC1860 :AT:SV::S:GSG::::LLA:G::::::YV:::::::::SI::L:T::A::TGC:LV:PS Hmu0816 :FL:::::TG:Q:NQ:::IA:G:::::::V:::::::::VL::::S:I:G:LL::Y:T:L hla1808 :M::D::::P:A::N::::I::::::::LI::D::::::H:::L:::VSV:L:G:VLVV: HVO_0759 :M::S:::::T:::NM:::::G::::::::::::::K:::I:::::V:VS::::::V::M Hbo0772 :MQ:T:NIAD:::KNM::LI:::::::::I::K::::::::::L:S::V:::IG:L:::: consensus VSGLLAVAAVSAVLGYVIHSLFPALDTYLLDSLPDENRASAYAVFSAGMMLIQASGSGVV #oth 45244323242332.22..21..13.222.321.265.2...13113521361.6..54. NP5220A AES::::V:::I:V:V:::A:::VI:::M:A:I::::::::::L::S:::TA::F:::G: HQ2342A :::IVGILSC:ILI:FA::::::::::W::GV::S:V:::::::::GIAL::E:T::SA: HVO_1349 AQ:FV:::::V::::::::::::::::FM:S:::SDA:G:::::::GAAL:LE:N:::A: Hbo0200 :::YAP:LV:T:::::T:::::::::SWV::T::AAV:S:::::::GVSL:LE::::::: VNG0270 :NAT:::::::LC:::A:::::::I::F:::::::SD:G::::GY::S:::V::L::V:: rrnAC1860 LT:FWSL::F:VIV::::::I:::V:A:::G::::RH::::::TYG::::VM::P::AL: Hmu0816 L::Y:GL:VL::::::::::::::V:::::G::::HH:G:::::Y:GT::I::::::TI: hla1808 S:::A::V:A:V:V:FA::M::::G:::::A::::GS:::::::::::::TT::A::W:: HVO_0759 T:S:VGLIV:T::V::::::::::::A::::T::::S:G:::S:Y:F:::IF:::::::: Hbo0772 TR::IPLLVLT:LI:::::::::::::::::T::::::::::::Y:::::VV:::::S:: consensus GFLTE-----------------------AGYAFDAVFRGLAAGLAVVVVALAVLQRAGRL #oth .71541111111111111111111111151431323234334412343542552466122 NP5220A :W:VA:::::::::::::::::::::::S:VSYT:AY:::::IVGATG:G:F::H:F::: HQ2342A :L::A::::::::::::::::::::::::::T:::::TLF:::V:::LI::LIAFHG:SI HVO_1349 :::::::::::::::::::::::::::::N:::E::::T::G::::F:S:::::YAVN:: Hbo0200 ::::G:::::::::::::::::::::::Y:::::T:::TF:FC::G::AV:TL:YVT:QI VNG0270 :T:RG:::::::::::::::::::::::T:F:Y:TI::TG::::G:LA:C:VA::W:::: rrnAC1860 :R:LD:::::::::::::::::::::::::VT:PTLL::MGVA:L::L::MVS:HLN::: Hmu0816 :S:SS::::::::::::::::::::::::::S:ETI:TW:V:V::A:LLG:TG:YVD:Q: hla1808 :EAI::::::::::::::::::::::::::AGY::::LS::G:::L::::Y:::EY:::V HVO_0759 :T::D:::::::::::::::::::::::F:::::E::FWFSV::::::TG:I:F:::::I Hbo0772 :A:R:GGGTYEFIRAATAVVPFVGILPAG:LSY::I:T:::L::::I:TT:LL:::G::: consensus PQGAR------ #oth .4544554454 NP5220A :T:GTPGETPG HQ2342A ::P:AVEPTGE HVO_1349 :GVD:VDLSSD Hbo0200 :GTT:RASAI: VNG0270 ::::S:::::: rrnAC1860 :SA::A::::: Hmu0816 :T:::A::::: hla1808 :G::AGTEHAA HVO_0759 :N---:::::: Hbo0772 ::---::::::