|
Pairwise sequence scores | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 643 | pNG7086 | NP2882A | rrnAC0494 | Hmu1165 | NP4192A | VNG0574 | HQ1556A | HVO_0827 | hla2579 | Hbo0707 |
345 | pNG7086 | 666 | 313 | 278 | 258 | 287 | 253 | 274 | 336 | 321 | 341 |
492 | NP2882A | 313 | 650 | 435 | 480 | 491 | 339 | 363 | 393 | 396 | 392 |
411 | rrnAC0494 | 278 | 435 | 779 | 516 | 481 | 363 | 325 | 346 | 368 | 351 |
460 | Hmu1165 | 258 | 480 | 516 | 630 | 530 | 376 | 333 | 343 | 364 | 387 |
487 | NP4192A | 287 | 491 | 481 | 530 | 639 | 356 | 338 | 372 | 402 | 394 |
402 | VNG0574 | 253 | 339 | 363 | 376 | 356 | 632 | 349 | 374 | 364 | 401 |
466 | HQ1556A | 274 | 363 | 325 | 333 | 338 | 349 | 647 | 474 | 432 | 461 |
492 | HVO_0827 | 336 | 393 | 346 | 343 | 372 | 374 | 474 | 640 | 456 | 497 |
499 | hla2579 | 321 | 396 | 368 | 364 | 402 | 364 | 432 | 456 | 638 | 491 |
509 | Hbo0707 | 341 | 392 | 351 | 387 | 394 | 401 | 461 | 497 | 491 | 654 |
106 symbols consensus ---MADKE---------------SDLREQFTDAFEGADYPVESQMDLVPALPDGPGTKFE #oth 1122313311111111111111132..312621.44.11.1421.3...1..4..3.3.2 pNG7086 ::MT::TA:::::::::::::::EQ::AELESV:TN:E::::EP:E:::::::::::T:: NP2882A ::::V::D:::::::::::::::-::::::E::::::::::N:P::::::::Q::::::: rrnAC0494 MGKCT:V:PFIIILPQRPTMVDRE:::S::VE:::E::::IS:P::::::::G::S:::: Hmu1165 :::::::D:::::::::::::::-:::::::E:::E::::IS:P::::::::S::S:::: NP4192A :::::::D:::::::::::::::-:::::MI:::::::::IN:P::::::::Q::::::: VNG0574 ::::STV:::::::::::::::::E:::EL::::AT:::::KN::G::::::S::S:S:: HQ1556A ::::T:T:::::::::::::::::E::Q::H:::S::EF::D:::::::T:::::K:::H HVO_0827 ::::S:T:::::::::::::::::Q:::::M::::N::F:::N::S::::::N::::::K hla2579 ::::T:VK:::::::::::::::AE:::::LE::G:::F:::N::::::::::::A:::: Hbo0707 ::::::A::::::::::::::::AE::::::E::SD:EF::KN:::::::::N::::R:: consensus AGD--VSMTAMELAAKLGGHQDFPYDSADALVDDVIEGLEAEGLI- #oth 21211224111122112355311..223141111214213222321 pNG7086 ::::::RVGV:DFG:EYADY:EY::ET:E::I::LMT:FRE:::FD NP2882A S::::F:::::::NT:A::N:::::E:S:E::E:IMN:::E::YL: rrnAC0494 S::::F:::::::NT::N:--E:::E:V:DF::::MAS::DQD::: Hmu1165 S::::F:::::::NT::::--::::::V:EF::S:M:Q:DDQD:L: NP4192A S::::F:::::::NT::::-GE::::::E:F::::::Q::DQD::: VNG0574 ::G::E:W::::::T::SSRA::::::V:T::::::A::KD:DEL: HQ1556A :DE:::TL::L:M:::::T::::::ADV:S::::I::::K::EM:: HVO_0827 TD::::TV::::::::::K::::::ED:ES::::I:A::K:::M:: hla2579 :::::::L::::::::::NE:E::::TPE:::::I:D::::K:M:: Hbo0707 :::GE::F::::M:::::S::E::::D:ES:::::::::K:::ML: