|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2912 | NP3650A | rrnAC0896 | Hmu1580 | Hbo2808 | HQ1590A | VNG0931 | hla2670 | HVO_1025 | Hbo0522 |
2322 | NP3650A | 2902 | 2131 | 2112 | 2170 | 2133 | 2156 | 2171 | 2204 | 2259 |
2350 | rrnAC0896 | 2131 | 3265 | 2630 | 2165 | 2205 | 2166 | 2174 | 2171 | 2251 |
2360 | Hmu1580 | 2112 | 2630 | 2899 | 2169 | 2206 | 2221 | 2237 | 2210 | 2249 |
2534 | Hbo2808 | 2170 | 2165 | 2169 | 2921 | 2365 | 2363 | 2394 | 2422 | 2420 |
2580 | HQ1590A | 2133 | 2205 | 2206 | 2365 | 2885 | 2348 | 2482 | 2474 | 2521 |
2569 | VNG0931 | 2156 | 2166 | 2221 | 2363 | 2348 | 2901 | 2509 | 2521 | 2522 |
2691 | hla2670 | 2171 | 2174 | 2237 | 2394 | 2482 | 2509 | 2921 | 2630 | 2590 |
2682 | HVO_1025 | 2204 | 2171 | 2210 | 2422 | 2474 | 2521 | 2630 | 2896 | 2698 |
2740 | Hbo0522 | 2259 | 2251 | 2249 | 2420 | 2521 | 2522 | 2590 | 2698 | 2905 |
433 symbols consensus ----------------------------------------------MERVAVIGASMTQF #oth 1111111111111111111111111111111111111111111111233..1.3.1..3. NP3650A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::PD:::::::::N: rrnAC0896 MAGDCSSHWPVTNPPRGYLSSRRLLEHSTRSIGQTVIHTRDPCDGTGMG:::::::::K: Hmu1580 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::-MG::::E::::K: Hbo2808 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::: HQ1590A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:A:::: VNG0931 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::I::::::A: hla2670 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I:::::::: HVO_1025 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::I:::::::: Hbo0522 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::::: consensus GQRDA-WIRELLAEAGQACLDDAGVSPDDVDHLYVSNMASGEFEGQTGVPNALAHDLAAL #oth .3.1311212..11..421.31121321321.......1...1.....13.2.....233 NP3650A :T:EK:::::::::::KD:::::::T:GE:::::::::::::::::::IQ:::::::SVV rrnAC0896 ::::V:::::::SQ::EE::T::::A::::E:::::::::::::::::IM:L:::::GV: Hmu1580 :::::::L:D::::::EE::S::PIDN:::E:::::::S::::::::::M:W:::::GL: Hbo2808 :N:EGQF:LD::::::E:::::V:::::S:::::::::::::::::::I::::::::SM: HQ1590A ::::G::::::::::::::::T::::::AIE:::::::::::L::::::S:::::::G:V VNG0931 :D:::::LLA::::::D:A:T::::DG::::::::::::::::::::::::::::::::M hla2670 :::::::V::::::::A:A:::::IDG::L:::::::::::::::::::::::::::::T HVO_1025 ::::::::::::::::::A:A::D::::EIE::::::::::::::::::::::::::::M Hbo0522 ::::::::::::::::::::::::::::AI:::::::::::::::::::::::::::S:: consensus PAYTARIDQTSSSGGAGIYAAWQSIASGASEMTLLVGGEKMTHRTTAEATDVIASLTHPV #oth ...23.11......1..1.1....1...1.11.1.........11.2221.1...1...2 NP3650A :::AQ:VG::::::A:::::::::::::::::::::::::::::::G:SS:I:::I:::: rrnAC0896 :::SE:V::::::::::::E::::V::::::::::::::::::K::GQ:::I:::I:::D Hmu1580 :::SE:V::::::::::::E:::::::::::::::::::::::K::P::::I:::I:::D Hbo2808 ::::T::::::::::::V::::::::::::::::::::::::::S::DT::I:::I:::: HQ1590A :::::::::::::::::V:::::::::::::L:::::::::::::::::::::::::::: VNG0931 ::::::::::::::::::::::::V:::::DL::::::::::::::G::::::::::::: hla2670 :::::::::::::::::V::::::::::T:DL:M:::::::::::::::::::::::::: HVO_1025 :::::::::::::::::V::::::V:::::D::M::::::::::S:::S::::::::::: Hbo0522 ::::::::::::::::::::::::V::::::::::::::::::::::::::::::::::A consensus EYKHGVTLPSFAGLTARLYLDEYDAPRESLGKVAVKNHRNGVDNPHAQFRKEVDLETVLE #oth ...1.1...1...11..3..331.....1.12......3..11..3...2.1123121.1 NP3650A ::::::::::::::A:::::::::::::::AE::::::H:::K::D:::K:KI:V::A:: rrnAC0896 :::::::::::::M:::H::ERF:::::::AR:::::::::::::K:::Q::ITM:KA:: Hmu1580 :::::::::::::::::H::ERF:::::::A::::::::::::::N:::Q::ITT::A:: Hbo2808 :::::I:::T:::::::R::H:::::::::AR::::::A:::::::::::::IT::DA:: HQ1590A :::::I::::::::::::::ET::::::A::::::::::::::::::::::::S:::::: VNG0931 :::::::::::::::::K::AQ:::::::::::::::::::L:::::::::::::::::D hla2670 :::Q::::::::::::::::::::::::::::::::::K::::::::::Q:::::D:::D HVO_1025 :::::::::::::::::::::T::::::::::::::::K::::::::::::::::D:::D Hbo0522 :::::::::::::::::::::T::::::::::::::::K::::::::::::::::D:::D consensus SPIVADPLRLYDFCPITDGSAALLFCPESVAREYT--DEYAVVSGIGGATDTHVVHERAD #oth 1.31........1..11.....12111123.312211.212211.11...........4. NP3650A ::L:::::::::Y::V:::::::::::VDQ::::A::::F:::::V::::::::::::P: rrnAC0896 :::I:::::::::::::::::::M:TT:ER:K:I:::::::L::::::::::::::::D: Hmu1580 ::::::::::::::::::::::M::TT:ER:A:L::::D:::::::::::::::::::D: Hbo2808 A:VI::::::::::::S:::::::::::::::::::::::S::T:V::::::::::::S: HQ1590A :::::::::::::::::::::::::::::L:ER:::::T::I::::::::::::::::G: VNG0931 ::M::::::::::::::::::::VL::::::A::::::D:V:I::VA:::::::::::D: hla2670 :::::::::::::::::::::::V:::::::A::VPE:::::I::::::::::::::::: HVO_1025 ::V::::::::::::::::::::V::::::::::::::D:::I::::::::::::::::: Hbo0522 :::::::::::::::::::::::ML:::::::::::::::V:I::::::::::::::::: consensus PTTMGGVVESSEQAYEMAGLGPDDIDVAELHDMFTILEFLQSEDLGFFEKGEGWKAVEDG #oth ..3.21.12.242.....23313.11.......11...1..2.22.1212.21.13142. NP3650A ::S:SA::::GR:::::::VE:E::::::::::V::::L::M:AF::S:E:AA::D:KA: rrnAC0896 ::I::::::::K::::::::::N:L::::::::::::::::L:GI:VADQ:TA:EMAM:: Hmu1580 ::V::::::::D::::::::::::L::::::::::::::::L:GI:VA:Q::A:ELAM:: Hbo2808 ::::R:::::GNI::::::RN:G:::::::::::S::::::::::::::::::::::::: HQ1590A ::::::::D::ND:::::EITS:::::::::::::::::::L:::::::::A::::ADE: VNG0931 ::::R:::::A::::::::R:::::::::::::::::::::::::::::::A:::::R:: hla2670 :::::::AD::DI::::::I::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E: HVO_1025 ::::::::N:::I:::::D:E::::E::::::::::::::::::::::::::::::::E: Hbo0522 ::::::::N:::::::::D:E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::E: consensus VTDRDGDLPINTSGGLKSKGHPLGASGVAQAYEIYKQLTGDAGPRQVEADTGLACNVGGF #oth 3.32..2....1.....11.....11.1..21.124.1413..2...1.321.1..1... NP3650A R:EL::E::::P:::::AR:::::GT:::::::L:T::V::::D:::D::I:::::I::: rrnAC0896 ::AK::E:::::::::::::::::::::::GV:::E::V:E::::::::::A:::::::: Hmu1580 Y:::::E:::::::::::::::::::::::GV:::E::V:E:::::::::V::::::::: Hbo2808 I:H:::::::::::::::::::::::::::::::H::V:N:::::::D::V::T:::::: HQ1590A I:A:::A::::::::::::::::::::I::V::::Q:V:NN::::::::K:::::::::: VNG0931 :::::::::::::::::::::::::::::::::L:Q::L:T::D:::D:EV::::::::: hla2670 ::::::E:::::::::::::::::::::::V:::F::V:::::::::::::::::::::: HVO_1025 ::::::::::::::::::::::::::::::V:::::::S::::E:::D::V::::::::: Hbo0522 :::::::::::::::::::::::::::::::::::A::M:E::D:::::Q:::::::::: consensus GNCVTTTIMEAAQ #oth ....2...1.454 NP3650A ::::N::::::S: rrnAC0896 ::::I:::::::E Hmu1580 ::::I:::::::E Hbo2808 ::::I:::::GQA HQ1590A ::::::::L:N:: VNG0931 ::::::::L:QP- hla2670 ::::::::L:GN: HVO_1025 ::::::::::SR- Hbo0522 :::::::::::RR