|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3394 | HQ1024A | VNG2206 | hla1015 | HVO_2989 | Hbo1533 | NP5158A | rrnAC2522 | Hmu3010 |
2327 | HQ1024A | 3401 | 2011 | 1975 | 2185 | 2282 | 1908 | 1857 | 1673 |
2682 | VNG2206 | 2011 | 3397 | 2163 | 2238 | 2273 | 2101 | 2198 | 2118 |
2499 | hla1015 | 1975 | 2163 | 3440 | 2284 | 2253 | 2022 | 2038 | 1895 |
2702 | HVO_2989 | 2185 | 2238 | 2284 | 3382 | 2646 | 2019 | 2114 | 2002 |
2744 | Hbo1533 | 2282 | 2273 | 2253 | 2646 | 3392 | 2019 | 2025 | 1965 |
2441 | NP5158A | 1908 | 2101 | 2022 | 2019 | 2019 | 3422 | 2094 | 2091 |
2420 | rrnAC2522 | 1857 | 2198 | 2038 | 2114 | 2025 | 2094 | 3445 | 2189 |
2345 | Hmu3010 | 1673 | 2118 | 1895 | 2002 | 1965 | 2091 | 2189 | 3406 |
465 symbols consensus MKLFGSSGTRGVAGEELTPEFVLRVAKAAGTVW--DADRVAVARDTRTTGEMFANAAASG #oth .51.....2...12242..42.12112.11211114432322......1123141..311 HQ1024A ::::::::::::V::GI:::L::Q:::::::::::E:NQAII::::::SSQS:V:::V:: VNG2206 :NV::::::::::N:::::G::::::::::S::::R::::::::::::::R:LE:::VA: hla1015 :E::::::I::::LRY::::L::GI::::::T:::::::::::::::::::L:::::::: HVO_2989 ::::::::::::V::S:::::::::::::::::::NTG:::I:::::::::::V:::E:: Hbo1533 ::::::::::::V:DG:::::::::S:::::::::GS::AV::::::::::::S:::T:: NP5158A :DV:::::V:::V::K:::P::G:::A::A::L:::::TM::::::::S:QL::D::::A rrnAC2522 :QV:::::V:::::D::::RY:::::Q:::D::RD:H::::I::::::::RT:I:::T:: Hmu3010 :HV:::::V::::N::V::AY::QI:Q:T:S:::::DA:I:L::::::S:::L:D::::: consensus LASVGVDVDRLGVVPTPAVQAYCERAGVPGVMITASHNPPEYNGVKLVGDDGVELAVADL #oth .212.41.23..22...3323.134432.3221......221..1..1.41.1.15144. HQ1024A :T:::I::I::::T:::S:VH:AGETDR::IV:::::::::::::::I:ET:::IG:EG: VNG2206 :Q:I::::::::::::::T:::A::::::A::V::::::SQ::::::::S:::::::::: hla1015 ::A::C:::::::::::::GN:::S::I:C:LV::::::::F::I::::::::::S:DV: HVO_2989 :::::::::D::::::::AVR:::NQA::::V:::::::::F:::::::::::::::EE: Hbo1533 :::::::::V::A::::G:VR:::VEE::A:V::::::::::::I::::::::::S:::: NP5158A ::A::CS:A::::::::GA:::AD:T:R:V::::::::::A::::::::G::T::PR:T: rrnAC2522 :TA::F:::::::::::GL::::::EA::::::::::::AA::::::I:A:::::TRST: Hmu3010 :::T:HS::L::EA:::TL::::A:H::::M:::::::::A::::::I:A:::::DRTV: consensus ERIEDRLLAEEFDTAAWDAVGSDRRVESANRDYVDQLLDAVD----REAIAAANLTVALD #oth 121.3433323226251243.34132342433.3331124122112.321.1.21.112. HQ1024A ::::ACV:N:D:TP:S::NI::IT:T:TV:TE:::K::T:LEQDGS:::::D::::::I: VNG2206 ::V:RAFTT:Q::N::::G::A::E:A::G:::RA::S:::::::::A:::::D:::::: hla1015 ::V:R:V:DD:Y:H:D:RNA:ATT:::C:VD::::::::::::::::::::D::::::V: HVO_2989 :::::HI::::::VTE::::::V:S::T::D::HED::AN::::::::K::::::::::: Hbo1533 :::::HV:::::::::::E::EI:::D:S::::::D::AS:::::::::::D:::::::: NP5158A :T::::::::D::LVGY:::::ST:IPD:PET::EE:::RLATDGL::RL:::EP:::I: rrnAC2522 D:V:QS:RDDTPNY:D:ET::::TAI:::R:R:RE:V:A::::::::DR::D:D::IVV: Hmu3010 DD:::::E:T::::VR::GL:RT:A:DG:GD::ITEV::T:::::::T:::::D:::VV: consensus PGHGAGCLTSPDFFRELGCEVVTVNAQPDGHFPGRDPEPVAENLGDLRRLVRATDADVGI #oth 1.1..12221.322.1...2.3...22........31..1432.52.432.3221..2.1 HQ1024A :::::::::::Q:::K:::D::::::T::::::::PS::I:S::TA::S::T:SN::I:: VNG2206 ::::::A::::T:Y:::::D:::::::::::::::E::::R:H::::GA::::A:::::: hla1015 :::::ASVS::RIY:::::::L::::T:::::::::S:::P:::D::Q:::AT::::::: HVO_2989 ::::::S:VT:::L:::::::R:::::::::::::QS:::P:::R::E:::::::::::: Hbo1533 ::::::::::::::::::::::::::N::::::::ES:::GSK::::C:::K:S:::::: NP5158A ::N::::V:::R:::::::D:::::G:::::::::::::::D:::S::::::S::::L:: rrnAC2522 S:::::S:::::L::::::::H:::T::::::::::::::::::E:::AF:::::::L:F Hmu3010 :::::::H:::T:L:::::T:R:::::::::::::::::IDPH:A:::EY::T::::L:: consensus AHDGDADRAVFVDETGEHIEGDASLAALAAAELEPGDAVVSAVNVSQRLVDVCNAAGATL #oth ........12.11.3.3514.1121.1112.52132122.1...1.......13331.3. HQ1024A :::::::::::I::Q:KQ:A:E:::::::::::DSNS:T:A:::::::::::::RV:::: VNG2206 :::::::::I:::::::Y:::::T:::::E:::DA::TT::::::::::::::DRT:::: hla1015 ::::::::::::::N::FVD::T:F:VM:D:C:::::::::::::::::::::::ND:D: HVO_2989 ::::::::::::N:R::C:S:E:::::::::A::::::T::::::::::::::EEV::D: Hbo1533 ::::::::::::::N::FVA:E:::::::::Q::ED:TA:A:::::::::::::EV::N: NP5158A :::::::::M::::::S::::::A:::::D::::::::::::::::::::::VAD:D:E: rrnAC2522 ::::::::GM::::::T::::::A:::::::KI:S::G::::::A:::::::VED::::: Hmu3010 ::::::::::::::::TT:N:::A::::VE:TV::::T::::::A:::::::VE::D:E: consensus ELTPIGSTNIITRIRELRAEGTNVPVAGEGNGGIFFPNYRLARDGAYTAAKFLELVADR- #oth 2..2..1.2121.113.443.43.21.......131.51.23....11111..2.22242 HQ1024A ::::::::::::::Q::QKS:VS::::::::::::::KF::V:::::IG::::R:ICEQ: VNG2206 ::::::::Q:M::::::E:::DH:::::::::::I::E::MT::::::G:R::::L::GT hla1015 ::::::A::::::T:D:HD::::::I:::::::V:::P:::S:::::IG:R::::L:AAS HVO_2989 ::::::A::L:::::::WR::R:::::::::::V:Y:::::V:::::I:::::::::E:: Hbo1533 ::::::A::L:::::D:W:Q:ET::I:::::::::::::::V:::::::::::::IT::: NP5158A :::Q::::YL:S:::K::R:::S:::::::::::M::D::I:::::::::R::A:::::: rrnAC2522 S:::::::Y:VS:::K:QN:::H:AI::::::::L::D::I:::::F::::::::::::: Hmu3010 T::R::::YL::::QQ:::A:ET:S:::::::::I::G::I::::::::G:::::::EE: consensus -PASEVVAPYDDYANVRANLEYDDEAEREAMLDAAEAYAEEADADPNTTDGYRLDYGDAW #oth 121.22212142.322.312213424114211512235133.2122211.....1.1.1. HQ1024A ::::SIIE::TK:::A:I:I:HGS:K:L::LMRG::EF:::::VT::II:::::::D::: VNG2206 :::::::::::::H:::V:VD::T::Q:G:L::::::R:LD::::RT:I::::::::::: hla1015 D:V:::::::A::HF::R:V::A:DD::DE::S::R::V:T:::E::::::::::::::: HVO_2989 :S:::L::::E::Y:::I:::::E:::LT:::N::AD:::S:::T::::::::::::::: Hbo1533 :EV:D:::::T::V:::V::G::::::L:::::::RE:::S:::T::::::::::::::: NP5158A ::::D:::D:SG::YL:::I:::HPD::::::V:::KV::D:::ELT::::::::::::: rrnAC2522 ::::::A:D::::Y:::R::::ET:E:::S::EGI::H:N::T::LD:::::::::::G: Hmu3010 :::::IA:RF:::V::::AV::E::T::A:::::V::A:T::V::LD:::::::N:::G: consensus VLVRPSGTEPVVRVYAEARDQARAEELAEDAADALRAARADA--- #oth ..2.......21.2...253541.34.143244445434436211 HQ1024A ::I:::::::::::::::KE:TQ:QT::D:::GK:YD:TD:IG:: VNG2206 :::::::::::::I:::ST:HE:::S:::AF:AD::::::::::: hla1015 ::::::::::KI:I:::SA:AD:::R::T:MYV:VESG:---::: HVO_2989 ::::::::::K::::::G:SEE::T:::::::::::S:V:TL::: Hbo1533 ::::::::::K:::::::::E::::D::AG:K:::L::LE:V::: NP5158A ::::::::::L::L::::G:R:::QT:L:TFR:PMED:Q:E:::: rrnAC2522 ::A::::::::::::::::TLD:::::::TMVSRATQQTNTYSGE Hmu3010 ::A::::::::::I::::HT:Q::D::LSTF::PIDRV:E:G:::