|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2586 | HQ2035A | NP2480A | VNG1837 | hla1635 | HVO_2638 | Hbo2204 | Hmu2493 | rrnAC3455 |
1422 | HQ2035A | 2576 | 1035 | 1187 | 1247 | 1262 | 1251 | 1145 | 1149 |
1750 | NP2480A | 1035 | 2563 | 1422 | 1598 | 1467 | 1530 | 1330 | 1315 |
1899 | VNG1837 | 1187 | 1422 | 2600 | 1695 | 1639 | 1691 | 1306 | 1340 |
2070 | hla1635 | 1247 | 1598 | 1695 | 2608 | 1808 | 1913 | 1340 | 1383 |
2083 | HVO_2638 | 1262 | 1467 | 1639 | 1808 | 2583 | 1966 | 1320 | 1361 |
2058 | Hbo2204 | 1251 | 1530 | 1691 | 1913 | 1966 | 2594 | 1305 | 1369 |
1612 | Hmu2493 | 1145 | 1330 | 1306 | 1340 | 1320 | 1305 | 2604 | 1546 |
1664 | rrnAC3455 | 1149 | 1315 | 1340 | 1383 | 1361 | 1369 | 1546 | 2613 |
352 symbols consensus --MNTEFERVSLPLEDPFTIARGTQTTAENVIVRITDE-GMTGVGAAAPSAHYGETADTV #oth 23253323233322442.2.2.11334223331425124.31.2.111.231.1.1.211 HQ2035A :::K:S:NQI::NIT:S:N:::::TERV:ITLI::Q::N:HI:I:G:T:T:Y:::::A:M NP2480A :::KASI:::E::::T::::S:::KR:V::L::V:KHN::S::Y:::::ARY:::::::: VNG1837 :::::D:::RQF:::H:::::::::D::TV:T:SVS:DD:T::::::::::::::::A:: hla1635 MTLE:::::::::::N::::F:::::D::::::K:A::A::::::G:::::::::::::: HVO_2638 :MLA::::L::MS:AE::G::::V::E::::V:::E::G:::::::::::S::::::::: Hbo2204 VLLT:::::::Y::A:A:::S:::::A:::::::V::DG::::::::::::::::::::: Hmu2493 ::VRFS:Q:HE::TD:::G:::::T:::AV:T:E::H:::T::::G::::EY:::::AS: rrnAC3455 ::::WTVD:HD:::SN::G:S:E:SE:S:TAT:EL:H:::T::I::VT:::Y:D:S:QS: consensus EAVLPDLLDVVESVGDPHALQRIERRLAEVVRDNPAARAAVSIALHDLAAKRLGVPLYRL #oth 324.1312531133122124531245124424221..12.111.22.11213114.2122 HQ2035A R:I::EF:EII::H:-MEPRHA::Q::YNH::G:::::::::T::A:I:G::ADM:::E: NP2480A A:L::E:::A:::I:::::RNQVHE:M:T:AG:::::K:::DT::W:::G:L::E:V::: VNG1837 D:::::::A:::R:DA:EH:A:::AG:RD::SG:::::::::::C:::V:::ADC:::QY hla1635 :::::::::A::R:::::::HE::AE::A::NG:::::::::::V::::::::::::H:: HVO_2638 ::::::::S:::A:::A::ID::::EM::T::R:::::T::::::::::::::::::::: Hbo2204 :::::E::T:::::::::::TE:::KMR:R:GR:::::T::::::::::S::::L::::Q Hmu2493 RDA:EA:RP:::AWD::::G::VANA::TRLP:AA:::::::T::A::::RD::::C::Q rrnAC3455 AQT::L:CET:DGI:::::Q:::::D:::QAP:Q::::M:L:::V:::::RQ:DL::::Q consensus WGLDPAAT-PPTSYTIGLDDPETMREKAEAAVDAGYGVLKVKLGTDRDRA--RIRAVRDA #oth 1..11344115111.121133221211145.232.123..2.1.232115112242..33 HQ2035A :::::TDI::K:::::S::T:RA:QA:::T::NN:FDI::L:::H:NE:NHK::A:::Q: NP2480A L::SAS:SC::::::V::::::::A:R:K:::::::P:::L:::SE:::D::IV:S::EI VNG1837 ::::::N::VE::::::I::A::::::TR::::::F:T:::::::P::EQ:::LS:::E: hla1635 :::::T:A::A::::::::ET:RV::::::::::::PI::I::::::::E::L:D:::E: HVO_2638 :::::SR:::TS:::V::::LD:::::TAE:YE:::::::::::::::::::I:E::::E Hbo2204 ::::ADE::::::F:::::ET::::::T:D::E:::P:::I:::::::EE::IVET:::: Hmu2493 :::::::A::R::::VAIA:::::A:R::R::A:::DT::::V:::D::S::::::::RG rrnAC3455 :::::D:V::::T::V:IAS::R:A:::GK:A:S:F:H:::::::GD::::::LD::::: consensus APDATIRVDANEAWTPREAVRNAEWLADYGVEFVEQPVPADDPEGLRFVYERSALPIAAD #oth 1.2131.1...2.11232.124435..2311212....2.5242.131.433332.11.. HQ2035A T:::Q::A:::A:L:SQQ::EISDI::N:DI::L::::::N:ID::Q::QAYGSV:V::: NP2480A ::E:::::::::::::SA::::CKA:::::::::::::A:GNA::::R:::Q:P:::::: VNG1837 ::::::::::::::::::::::I:R::::::::::::::::H:A::Q::H::A::::::: hla1635 ::::RL:::::::::::::::KC:::::RD::::::::::E:::::::::::::::V::: HVO_2638 ::GV::::::::::::::::EMT:F:::H:::::::::::E:H:::K:::D:G::::::: Hbo2204 :::::::::::::::::::::KS:M::::::::I::::::S::::VQ:::::::::V::: Hmu2493 :::::L:::::C::S:A::IEQ:G:::ERD:Q:L::::A:::LD::ER:ASATS:::C:: rrnAC3455 ::::EL:::::A:::AQ::ID::D::::A::TML::::E:H:ID:::R:TDATEI:V::: consensus ESCVTAADIPRVADACDIVNLKLMKCGGLREAKRAIHAARAHGLDVMLGCMIESNASIAA #oth ..12213.11221.32.1222..1.1.11221414232.3.11112.1...2.1.11..1 HQ2035A ::VI::::VS::S::V::IVA::::::T:::VR:IAAV:D:VNCES:::::V:::V:::: NP2480A ::::V:G:::A:::S::::::::::T:::TP:VE::YT:::::::::C:::V:T:::::: VNG1837 :::MV:S:::QL::K::::T:::::T::::A:M:L::T:T:::::::C:::::::::::: hla1635 :::::LS:::AI::R:::A::::::T:::L::::M:A:::::::E::C:::::::::::: HVO_2638 :::I:::::::I::RV::A::::::::::T::::::::::::::E:::::::::::A::: Hbo2204 :::::L::V:::::RT:::::::::::::T::::M::T::::::E:::::::::::A::: Hmu2493 ::::A:P:V::::::::L:TV:::::::V:P:VEQ::::H:::::::::::L:::::::P rrnAC3455 ::::::S:V:::::::::::A::V::::::P:T:LLN::D:::::L:::::V:::::::: consensus AAHLAPLLDYADLDGSLLLAEDPYDGVPMDGGEIDLGALDRAGTGARRR--- #oth 132.1..22.1....11..34.223.123443422.523424..11335422 HQ2035A :WN::::F::V::::::::S:::IG:I::::NAAN:S::::S::C:VDTVE: NP2480A ::Q:L:::S::::::::::DS:::E::SVSD:RF::::V:-C:::VAP:::: VNG1837 ::::::::::::::::::::D:DF:::::PA:H:::A:I:GP:::::E-::: hla1635 ::Q:::::::::::::::::::Q:::IE:G::::R::DQE:::::::PSAEQ HVO_2638 GC::::::::::::::::::D:::E::::PN:::::D::::P::::Q::::: Hbo2204 :C:::::::::::::A:::G::D:::::IKE:::R:HD:N:S::::::TE:: Hmu2493 :W:::::VE::::::AA::SR:::A::SL::RRA:::SIT:-::::::C::: rrnAC3455 :V:::::V::V::::A::::A::::::SL::DVF::T:VS-::::V::MRDA