| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2969 | Hbo2486 | HQ2900A | VNG1101 | HVO_2754 | rrnAC1297 | hla0935 | Hut0741 | NP4446A |
| 1757 | Hbo2486 | 3191 | 1769 | 1299 | 1348 | 1257 | 1466 | 1410 | 1390 |
| 1655 | HQ2900A | 1769 | 3259 | 1162 | 1301 | 1197 | 1362 | 1259 | 1209 |
| 1930 | VNG1101 | 1299 | 1162 | 2985 | 1418 | 1563 | 1524 | 1476 | 1434 |
| 1958 | HVO_2754 | 1348 | 1301 | 1418 | 3112 | 1536 | 1557 | 1464 | 1463 |
| 2011 | rrnAC1297 | 1257 | 1197 | 1563 | 1536 | 3248 | 1616 | 1689 | 1655 |
| 2121 | hla0935 | 1466 | 1362 | 1524 | 1557 | 1616 | 2958 | 1695 | 1710 |
| 2083 | Hut0741 | 1410 | 1259 | 1476 | 1464 | 1689 | 1695 | 2962 | 1766 |
| 2003 | NP4446A | 1390 | 1209 | 1434 | 1463 | 1655 | 1710 | 1766 | 2911 |
481 symbols consensus --------------------------------MDDAGVR--------PAVAP-------- #oth 111111111111111111111212232332235755343334321323343111111222 Hbo2486 :::::::::::::::::::::::::::::::::PVSL:QLPAIPWSL:VI:A:::::LWS HQ2900A :::::::::::::::::::::MTVIPAVESLLISISASTSASTA:TL:IFL:LAIEGSHI VNG1101 ::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::::::::::VL:T::::::::: HVO_2754 :::::::::::::::::::::::::MLLIGGAAVTHLG:VATLA:SSA::D::::::::: rrnAC1297 MPPLSPGPAPNTVRSARITLWRTSRAARRGGSSTGT:P:LSVLP:GL::AD::::::::: hla0935 ::::::::::::::::::::::::::::::::-M::L:::::::::::V:D::::::::: Hut0741 ::::::::::::::::::::::::::::::::VF:L:::::::::::I:F:::::::::: NP4446A ::::::::::::::::::::::::::::::::-----ME::::::::VVL:::::::::: consensus TAAAAALGAVAAGVALGTCSGLVPGLHANNFALLLAAVAPSVPGPPLAVGAAMLAAGVVH #oth 661324143332.24...41..1..2.1.33.1..113.134212142113.2121121. Hbo2486 HP::VT::FAVG::F:::V::::::::V:AL:::::::::TITA::T:I:T:VI:::::: HQ2900A :::::I::YACL:AT::::T:::::F:V:SV:F::VGI::TL::S:V:::::V::G:I:: VNG1101 MG:L:V:A:::::::::::::::::V:V:TL::::::A::LA::::HL::::L:::::T: HVO_2754 --TT:::LG:V:::C::::::::::::::A::::::G::SEF::::V::A::V:::ST:: rrnAC1297 ::TL:L:T:IG:::G:::L::::::::::T:::::::A:S:L:::R:Y::V:::S:::T: hla0935 GF:::::AFLCG::::::A:::::::::::::::::GL::::SAD::L::V:::G::::: Hut0741 ESTVL:VV:I:G:IC:::I:::T::::::::::::::::::::A::RL:::::::::::: NP4446A RET:V:::F::::I::::A:::::::::::M:::::GI:::::::::Y::M:::S::::: consensus TFLDVVPALALGVPDAAMAVGALPGHRLVLGGRGREALRLSALGSGLAVVLAVPLAVPLT #oth 11.221.3.2....11.2.222..2.2..23.1.1..2.1..1..14.123.12212.31 Hbo2486 :::::::::V:::::::T:::S::::::::A::::::I::::V:::V::AC:::::L::S HQ2900A :::S:::G:V::::E::T:P:V::::::::N:C:H::I:::::::AI:L:V::T::L::S VNG1101 SI:::::M:::::::::L::SV:::::::::::::::::V:::::AT:::V::AFG::A: HVO_2754 :::::::::T:::::::L:P::::A:E:::::::::::::::::::A:LC::::V::::: rrnAC1297 :::::I:::::::::P:::AS:::S:Q::IE:::::::::::::::::::F::::::::: hla0935 S:::I::::::::::::T::A::::::::VA::::::V::::V::::::A::::::I:I: Hut0741 ::::F::::::::::P:::AS:::S:::::::::::::::::::::::::F:L:::::V: NP4446A :::EI::T:::::::P::::A:::::::::E:::::::::::::::I::A::::::::I: consensus WVMVRGYPVLRAHLPLVLAGVAAALVATEPTRRARLGALVSFAASGALGVATLDLPPAGP #oth 4346324241254.212.5222231242.3243234213334421231.533.2434413 Hbo2486 HFVAT:REQ:Y:A:::I::V:IVL:::A:::W:R:T:GVAC:TLAT:::TL:::::T::S HQ2900A :IISA:EQH::SV::VL:I:::L::AG::S:WK::I:G:CCAVLATGF:IL:::::A::: VNG1101 :LA::AA::VY::::V:::VLVVV:::R:RS:::::::VLAV::::T::SVA:PMQ:DAV HVO_2754 E:L:E::::V:D::W:::V:::::::W:::S:::K:A:C:TI:::TG::L:V::R:FG:: rrnAC1297 L::K:V::L::PW:SVL:V:::VL::V::HG::QQV::AC:L::::L:::SL::A:VT:A hla0935 :::I:::::V:N::::L:G::V:F::L::SSK::AI:G::A:L::A:::F::::VD::A: Hut0741 L::LEV::M:AER::V::TAI:::VI:::::NH::KA::L::LV:A::::V:::V:AD:V NP4446A RL:TAVW:::::::S:::MA::::::L::::PGRK:V:A:::GL::L::::::S:S:EA: consensus L---PAGGMLAPLFAGLFGAPVLLDAIRGDG-IPPQDDAAIATSRRSVGRLAGAGTGAGA #oth 221232321.3.112....2...2114414.21.2.423433423242433234.333.1 Hbo2486 :VPSS:AS:::::::::::::::I:SLD:R:T:::::GTKA:L:L:ETL:A:VS:V:G:: HQ2900A IAPPG:ES::G:I::::::T::::::LGS::E::::QRS:VGL:GKKTV:A:L::A:G:: VNG1101 V::::T:DV:S:::::::::::::A:F:::::::E:A::R::VPP:E:V:PGV::SL::: HVO_2754 :::::V::V::::L:::::V::::A:R::S::V:::G:::L:::PG::A:SVA::::G:: rrnAC1297 :::::VSDV:V:::S:::::::::A::E::::V:::S:::VT:P::T::V:::I::LC:G hla0935 ::::D:::V::::::::::::::I::MG:G::V:::A::R::M:::GL:IS::G:SL::: Hut0741 :::::V:S::::::G::::::::I::M::A::V:S:::PTVR:T:K:::G::LL::VS:: NP4446A ::::S::::::::::::::::::V:::S:::::::::GPE::A:G:::TG:::L::A::: consensus AVGYLPGVSAAIAATLALGAVPG-------R---EGDRAFVVATSGANTANTVFALFALI #oth 4.1.2.11.211.212..5432311111116121434.311211.112.1112..221.3 Hbo2486 L:::::::::GV:TV::::G:G:DSRPGDESDADRI::QYI::::::D::TA:::AA::V HQ2900A L:::::::::GV:::::::GAG:::::::ETDAD:T::PY:::::::D::TA:::VAS:V VNG1101 ::A:V::::G::::VF::DLTGD:::::::D:::S::::::A:L::V::::::::::::F HVO_2754 F:::::::::GV:G::::AVL::::::::::DPD:ST::Y:T:::A:T::T::::::::A rrnAC1297 ::::I::I:S:::::::::L:SD:::::::-:::Q:P:::I:T:::V:::TA:::::::: hla0935 V:::V::I::::::VA::P:::R:::::::E::::S::G:::::::::::::I::::::V Hut0741 I::::::::S::::::::VSA:S:::::::K:::Y:S:G:::T:::V::S::L:::C::: NP4446A V:::V:A::S:::::F::L:::::::::::::::Y:A:G:I:::::V::::::::::::: consensus ALGTPRTGVLVALD-----RAEVPLGLPLLLASVVIAAAVGAVLVPVVGDRYLRVVRRLD #oth 33.3111.12..34221114233.443351133344114313321231.121122.1221 Hbo2486 VV:DE:S::A:::ASVG::GGGS:F:SVTA::VL:F::G:::I::::L:::::T:::::P HQ2900A V::S::S::T:::STLGEVSG:A:A::LT::LI:IF::SL:I::LVT::EW::T:::::P VNG1101 :I:D:H::::::FE:::::::RL:RT::V:V::::L::V:T:AM::A:::::F:A::AV: HVO_2754 G:::::::A::::T:::::E::L:T::G:AVPVT:VSGLC::G::::::::A:A::G::: rrnAC1297 S::::::::::::::::::::::::V::A:::A:A:::VA::I:::TL::::::I:G::: hla0935 :::::::::T::I:::::::::::FA::I::VAAAT:::C:FA::LL:::A:::::GNA: Hut0741 :F:N::::::::::::::::SGA::AW:::V:::L::::::F:::V::::W:::A::::: NP4446A :::S::::::::VE:::::A:S:::SV:H:::::GVS:L::V:A::L::::::A::GA:: consensus HRRLSAGVLALLVALSALFAGGVGVGVFAVATAVGLIPPRFGARRVHLMGVLIGPLALG- #oth 442.24422331342153.1.54.3322321222.22.22412..13..1..32.23232 Hbo2486 ::P:::TI::V:WV:AGV:::VT:LC:::::ALL::L:::L:V:::::::::V::IV::: HQ2900A RQP:VGC::IFITG:AVG:G:LL:GA::SLS:LI::::::I:V:::::::::L::V::M: VNG1101 ::::T:::CL:::VVAW::G::T:::LLGA:::::A:::V::::::::::::LV:I:::T HVO_2754 Q:::V:A:C:::::::WA::::G::A:LV::AV::HL:V:::C::::::C::M::::::: rrnAC1297 PTY::LS:I:V::C:::::::L::::A:GA:::::HL::K:::::AT:::::LV::::-: hla0935 YT:::I:::::::GI:YA:::T::I:::V::G:L::V:::V:::::::::::::::IA:: Hut0741 :V:::V::::V:AL:::::::PI::V::::S:L:::::A:L:::::S:::::::::I::V NP4446A PA:::VAL:CG:A:V:F::::A:::VAY:A:AV:::V:A:YR:::AN::::::C:ILFT: consensus - #oth 1 Hbo2486 : HQ2900A : VNG1101 A HVO_2754 : rrnAC1297 : hla0935 : Hut0741 : NP4446A :