|
Pairwise sequence scores | |||||||||
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Consensus score | 2634 | NP0380A | Hmu1035 | Hut0361 | VNG0393 | hla0083 | HQ1531A | HVO_0882 | Hbo0657 |
1794 | NP0380A | 2680 | 1568 | 1641 | 1583 | 1439 | 1401 | 1490 | 1512 |
1896 | Hmu1035 | 1568 | 2720 | 1828 | 1580 | 1417 | 1391 | 1468 | 1503 |
1887 | Hut0361 | 1641 | 1828 | 2682 | 1560 | 1399 | 1446 | 1440 | 1489 |
1902 | VNG0393 | 1583 | 1580 | 1560 | 2770 | 1554 | 1496 | 1585 | 1576 |
1890 | hla0083 | 1439 | 1417 | 1399 | 1554 | 2713 | 1574 | 1691 | 1694 |
1856 | HQ1531A | 1401 | 1391 | 1446 | 1496 | 1574 | 2676 | 1807 | 1811 |
1994 | HVO_0882 | 1490 | 1468 | 1440 | 1585 | 1691 | 1807 | 2707 | 1890 |
1992 | Hbo0657 | 1512 | 1503 | 1489 | 1576 | 1694 | 1811 | 1890 | 2675 |
391 symbols consensus VSTLVVCVDRSGDIGRKTGL-TPVVGWEAVRSLVTDVGLADPEDSSVNCLLEALRVTRDL #oth 2311.2.2..323343525442.11.211122...15.23....12..12.12..1312. NP0380A M:::::::::D:G:DHE:--:-::::::TI:G:::EI:ID:::::R::::::::::G::: Hmu1035 :T:::::I::G:TFPPD:S::-::A:YD::EA:::E:::::::::R::TM::G::::N:: Hut0361 ----:::L::G::LASVAEP:-:I::TD::E::::EF:ID:::::R::::::G:::A::: VNG0393 MR::::::::A:::S:Q:::R::IA:::::Q:::::M:V:::::A::::::::::::::: hla0083 :T:::I:I::::A:::A:NVPM::A:::::::::::A::S::::A:::::::S:::A::: HQ1531A M::::L:::::D:V::VSDFE::I::::::Q::::EL::V:::::::::I::::::::K: HVO_0882 :T:::L::::AN::::::::L::::::::::::::::::S:::::::::::A:::T::E: Hbo0657 :::::L:::::N:::::A::P::::::::::::::::::::::::N::::::::::S::: consensus RDDGEDAIVAVVSGGGDG-VGADRSVAAQLDDLVDRHDPDSAIVVVDSAEDERLVPIIES #oth 2134233311111252222.321.12.31315.2242223111..2..13..112.11.. NP0380A ::S::T::::::::::E:::NS::A::E:V:E:::A:::S:::::T:::N:::::::::: Hmu1035 EA::D::::T::GDR:::::S::::::R:V:E::EV::::::V::::::::::::::::: Hut0361 EA:::AVT:::I::S:ET:::VS::::R:TEQ:LSA:E:::::::T::T::::::::::: VNG0393 ::GAD::V::A::AT:::::T::::::Q:F:S:::::::::CV::::::A:::V:::V:: hla0083 ::ER:E:V:::::AES:TA::::::I::::::::::Y::RA:::::::::::QVL::V:: HQ1531A Q::DA:PT:::::::SGSL::::::L::E::T:AE:YSAE:::::I:::N::QVI:V::: HVO_0882 ::ER:::EI::I::TS:SA:::::A::R:::::AEQF:VE::V::I::::::::::VV:: Hbo0657 ::EK::S:::::::VN:TL::::::L:::V:A:::EY::E:::::::::S:::V::V::: consensus RIRVDAVDRVVVRQARDIESTYYLLKQFLADEELRSTVLVPLGAALLALPLLLLV-FSPT #oth .331.1....1...11.11..........1..1..5.1...3.331133.3.25434234 NP0380A :VQ:::::::I:::SH::Q::::::::::G:::::G:::::I::GM::F:::::LAD:VA Hmu1035 :L:::::::::::::::::::::::::::::::::K:::::::I::I:::::::::T::: Hut0361 :VA::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::I::::::M:I::::VN:V: VNG0393 ::Q::::::::::::::L:::::::::::::::::Q:::::V:IV::VF:G:MM:TG:LA hla0083 ::P::S::::::::::::::::::::::::::Q::::I:::F:V:::LV:A:FYW:::AG HQ1531A :::::S:::::::::H::Q::::::::::::::::T:::::::TT::F::I::IQ::P:: HVO_0882 :F:::::::::::::H:::::::::::::G:::::::::::::VG::LV::::VQ::::E Hbo0657 :L:I:S:::::::::H:::::::::::::::::::::I::::::T::LM::::TR::E:Q consensus VALAGIAALLGAFLLYKGLAIDEYLAELPEQIRDALYSGQVSLVTYVVAAGLALVGVFLG #oth 5.51322323.13.1....11.321253132224.1.1.1..2...1.11..211.3.3. NP0380A ::M:S:::VI:L:::::::G::DLVST::SRA:T:F::::::::::::G:::::I:::A: Hmu1035 F:VGA:::AV::::I::::G:::::SR::GE:QA:::::R::::::::::::::::::V: Hut0361 M::GA:::AV:LL::::::G::::VET::G::HN::::::::::::::::::G:I:L:V: VNG0393 ::A:S:TTVI:L:::::::GV:::V:A::G:A:::::::R::I::::::G::G:::::A: hla0083 E:I::V:G::::A:::::::::RFV:GM::R::E:::A::::V::::::G::::::G:F: HQ1531A I::::LT:::::V:::::::::Q::E:A:::VQT:::::R::V:::A:G::::::::::: HVO_0882 ::M::L:::M::V::::::::::F:SDARD::::::::::::V:::A::::::I::L::: Hbo0657 L:F:V:GSV:::A:::::::::QL:::S::R:::::::::::I:::::::::T:::A::: consensus ALG---ASATGADSVLVAAMRFIYDAVPWLALAALTASAGRLLDELIRRDGVRTAYLNLP #oth 213322455624534227224.51422..3121111114...2..224524123322... NP0380A GIN::::AGMS:E:E:LV:V::LF:S:::::A:::A:AT:::I:::LAEQP:S::LM::: Hmu1035 ::::::VRS::DQ:AFIH::::AF:G:::FTA:::A:AT:::I:::MQ::SI:S::V::: Hut0361 ::::::V:::AS::::IL::::GF::::::TA:::A::S:::::::L::::::N:::::: VNG0393 :::L::TNQAAGL:R:::::T:T:YSI::VT:G:::::G:::F::Y::N:D:::SFV::: hla0083 V:S::::::LSDAPA::E:VE:T:A::::F:V:GV::AV:::::::::GE:I::P::::: HQ1531A ::AI::PTTVS::::I:QSVQ:::S:I:::::::::V::::::::F:ESERIT:P::::: HVO_0882 ::AIRSPGVG:GEE:::PSLL:V:HSA::M:::::::::::::::::GSER:S:S:M::: Hbo0657 ::SVTPLTGS:TSAT:IST:Q:::H::::::::::::::::::::::GT:::SRQ::::: consensus FGVVAVGLVVRGFAGYFLERAGILAPFEVG----G-----G-FALSPGQRLAVFIVAGIV #oth .123.211....11221121233445443423431333223143223531..51223.12 NP0380A :::::I:::::::S::L:::::VFE::V:PSFEA:PVAVE::::V:IWG:::IY::::V: Hmu1035 ::TI:::::::::SE:::::::AIGQ:QI:PATI:PVLIEA:VT:ER:P::::::LG::L Hut0361 ::::::::::::VS:::::::DVF:SMS:SSVDL:IISIE:::T:T::T:::::LI:::: VNG0393 :::L::::::::::V::M:::::V::LTAPSAAL:ALSVR:::QV::E::::::V:L:VL hla0083 :VIA::A:::::::::::AQEA:HE:::::::::-:::::::L:V::V:Q::A:::V::: HQ1531A :::::L:F:::::::W::Q:ET::TTP::F::::-:::::N:YMIT:Q::::T::IV::I HVO_0882 :::::I:::::::::FL:::Q:E::NL:LL::::-::::::RL::T:V::::M:::::V: Hbo0657 ::I::L:::::::::W::Q:E:::SDAVLF::::-:::::S:W:::AR::::L:::G::: consensus VSLIGVRFAAYVSD-ETLEDVVD-------- #oth 1.24.12322422545353244464333221 NP0380A :::L::V:TSQMN:AGERG----:::::::: Hmu1035 :::::::::::F:QSSVQDEF:::::::::: Hut0361 :::V:::::::F:ETNIE:EL::ERAAE::: VNG0393 ::VA:I:V:T:::G:V:IR::ERSAEQ:::: hla0083 :::M::KL:SD:GT:::::::I:ADRETDGK HQ1531A I:I::::V::S:NN:Q:DD:LTQH::::::: HVO_0882 ::VV:::VS:S::::::::::::TPRENES: Hbo0657 ::V::::I::TM:EN::::EA:EQ:::::::