[R] (-) COG2252 Permeases 8 genomes BUD1036 8 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG2116 - HVO_0335 Hbo1144 Hmu3014 Hut2491 hla0279 NP1252A HQ3227A

Pairwise sequence scores
Consensus score	3415	Hut2491	NP1252A	hla0279	VNG2116	Hmu3014	HVO_0335	HQ3227A	Hbo1144
2157	Hut2491	3398	1860	1874	1951	1974	1912	1950	1963
2323	NP1252A	1860	3532	2210	1981	1989	1976	1982	2035
2476	hla0279	1874	2210	3367	2066	2244	2258	2144	2232
2632	VNG2116	1951	1981	2066	3478	2427	2389	2330	2347
2775	Hmu3014	1974	1989	2244	2427	3406	2569	2554	2532
2919	HVO_0335	1912	1976	2258	2389	2569	3407	2734	2823
2838	HQ3227A	1950	1982	2144	2330	2554	2734	3427	2845
2914	Hbo1144	1963	2035	2232	2347	2532	2823	2845	3580

509 symbols
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Hut2491         :AVTD::::::E:E:::TNL::::I::::::::::::I:::::V:SGAISA:---::---
NP1252A         ::VGDS::A::::::Y:T:Y:::T:::A::::::A::I:::::::SEAIMTDP:-::---
hla0279         ::::D:::AR::VES::::::::L:::L:::::::::I:::::::S:--::----::A:Q
VNG2116         :::A:----::G::D:DT:L:::L:::L::::::::::L:::VVM:QRTTA:EVVKP:::
Hmu3014         ::VF:R---F:GL:::DT:::::VL:::::::T:::::::::::::AF:DD:V:::::::
HVO_0335        ::::::::N:::VHK:::T:::::L:::::::T:::::::::SL:::::::Y:E:VD:::
HQ3227A         ::::::VN::::IQ::::SI::::L::V::::T:::::I:::SV:::::::::::AD:::
Hbo1144         :::T:::D::::VQ::::S:G::::::V::::T:::::::::S::::::::F:E:VD:::

consensus       IAGYSPGEVQQMLAVVTILAAAIATLVMAFYANRPFGLAPGLGLNAFFAFTVVGALGVPW
#oth            24235332131.1.11.1221231231..2..11..11...1......131.134.11..
Hut2491         ------ENTF::::::::I:SVA:M::::::::L:::::::M::::::VV-::TQ:EI::
NP1252A         -::MNQ:::I::::::::::SVA:I:::::::K::::::::M:::::::::::IG:::::
hla0279         :E::GQ:::F::I:IA:::S:::G:V:::L:::::::::::::::::::Y:::LG::I::
VNG2116         L:N::HDQTV:::::::L::SGV:M:::::::::::A:::::::::::::::::T:::::
Hmu3014         :D:FT::::F::::::::VTS:::MF:::::::::::::::::::::::I::I:V:::::
HVO_0335        ::::T:::::S::::::::::::::T::::::::::AQ::::::::::::::::::::::
HQ3227A         :S:MA:::::S:::::::I:::T::FI::I::::::AQ:::::::::::::::::::I::
Hbo1144         :::F::A:::S:::::::V:::V::F:::I:::::::Q::::::::::::::::::::::

consensus       QTALAAVFVEGLIFIALTAVGAREYVIKLFPEPVKFAVGTGIGLFLAIIGLQAMGIVVN-
#oth            11....113..23.14..11...211.42....1.311.1.1.11.221.1121321251
Hut2491         E:::::::I::VL::G:::::::::::::::::I:L:I:A:::::::LL::EQ:RVIT-:
NP1252A         :V:::::::::::::::::I:::R:::E:::::::::::A:::I::LFL:::E:NV:AAY
hla0279         :::::::::::VA:ML::L::::K:::Q:::::::RS::A::::::LF::F:ELQ:::P:
VNG2116         ::::::::T:::L::V:::::::::::T:::::::L::::::::Y::::::E::::::G:
Hmu3014         E:::::IV:::VV::V:::I:::::::::::::::::::::L::::::::::::::::D:
HVO_0335        ::::::::I:::::::::::::::AI::V::::::M::::::::::::::::::::::::
HQ3227A         :::::::V:::I:::I:::::::::I:RA:::::::::::::::::T:::::::::::D:
Hbo1144         :::::::VA::IL::L:::::::::::R::::::::::::::::::T::::::::L::::

consensus       DDATLVTLGNIASNPVAILSVAGLFFTFALYARGIPGSIIIGILTTAAAGWVLTAAGV--
#oth            253.1331143342.3.31222.133.23.2.1314.1.12..24.23412222441211
Hut2491         QTE:INP:--:GTD:I:::A:::IIV::::W::D:Q:::VL:::S:SV:AY:VS:L::::
NP1252A         P:G:::E:::FLLE:A:LVA::::GL:LF::::::K::::V:::::::::::AALMLPNG
hla0279         :::::::::G:FG::W:::GLL::A:::G:W::::T:::V::::::::V::G::L:::::
VNG2116         :AG:ILA:::L:Q::::VV:IL:::::I::H:::VT:::VL::IA:::T:G:::F:::::
Hmu3014         :P::::A::S:::::::::::::::L::V:::AR:R:A:VL:::::TLV::G::::::::
HVO_0335        :NS::::M::L::::I::V:IV::::::::::ANV::::::::VG:SLL::G:::S::::
HQ3227A         :S:::I:::SV::D:::F:::L:::I:L:::::::::::::::VL:TLG::A::TF:P::
Hbo1144         :S:::I:::PV::D:::::::V::::::::::::::::::::::G::FL:::::V::I::

consensus       ---FSP---AG---LLAGES-----LP--------------AAQYDITPLAGAFVSGLGN
#oth            111252224211111345531111143331333343311115131123..121.23.112
Hut2491         :::-M:AGNG:EDV::VETA:::::TLAPGLDNIAFD::::F:AF::S:::F:::D::Q:
NP1252A         EEQ:A:PAY:D:::VQEQGF:::::V::::::::YLL::::DV::NFL::VEG::::::Q
hla0279         ::::ER:::-::::VITP:T:::::::::::::::::::::S:::::::::::::D:::Q
VNG2116         :::VD::::-::::V:I:DF:::::VRTGGIATQRLP::::H::::::::V:::LA:FQD
Hmu3014         :::::R:::-::::V:TP:::::::I:::::::::::::::Q:::N:A:::::::G:F:D
HVO_0335        :::V:A::E::::::V:NS::::::--::::::::::::::::T::::::::::I::F::
HQ3227A         ::::T:::D::::::V::ST:::::--:::::::::::::::VS::::::::::I::::D
Hbo1144         :::VT:::D::::::V:DA:SMTLS::VLGTFDVLVPAAGAS:T:NV:::V::::G::::

consensus       V--EAFSFALIVFTFFFVDFFDTAGTLVGVGQAGGFLDDDGNLPDIDKPLMADAVGTTVG
#oth            1111213.2.111...1..........2.11231111123.11.1212......1...3.
Hut2491         ::::GLA:::VI:::::::::::::::T:L:H:ADLT:ES::::EMN:::::::::::::
NP1252A         ITEDPLV:L:V:::::V::::::::::I::SGVA::::::::::::::::::::::::::
hla0279         I:::PLT:V:V::::::::::::::::I::S:F:D:::E::D:::M::::::::::::A:
VNG2116         I::D:::::::::::::::::::::::::::::::::NT::::::A:E::::::I:::F:
Hmu3014         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::EN:DF:::::::::::::::I:
HVO_0335        ::::::::::::I::::::::::::::::::::::::N:::D::::::::::::::::A:
HQ3227A         :::::::::::I::::::::::::::::::::::D::::T::F::::R::::::I:::::
Hbo1144         ::::::::::::::::::::::::::::::S:IA::::::::::::::::::::I:::::

consensus       AMLGTSTVTTYIESATGVEEGGRTGLTALVVAVLFLASLAVVPLAAAIPQYASHIALVVV
#oth            121.......11..11.12...1..21..2123..241.331.22321.31.22...1.1
Hut2491         GI::::::::::::S::IG::::::M::::::G:::IT:P::::LDV::SF:PY::::::
NP1252A         :VI:::::::F:::S::::::::::F:::::GL:::::::::::VSLM:L::TY::::::
hla0279         ::::::::::F:::S::::::::::::::A::G::V:::::I:IV::::S:::F:::I::
VNG2116         :II::::::::::::::::::::::MV::::::::FL::L::::::::::::::::::::
Hmu3014         G:::::::::::::::::::::::::::::I::::::::V::::::::::::::::::::
HVO_0335        ::::::::::::::::::::::::::::::::L:::G:::I::::T:::::::::::::I
HQ3227A         G::::::::::::::S::K:::S::::::TI:T::VG::LL::::::::I:::::::::I
Hbo1144         G:I::::::::V:::S:::::::::::::T:S::::V:::F::V:::::::::::::::I

consensus       GVVMLQNVVDIDWDDITHAIPAGLTIIVMPFTYSIAYGIAAGIVSYPLVKTAAGERDDVA
#oth            123113123213.3.523211111.121..112...1.1...122..2113141243115
Hut2491         A:M::::IT::N:G:TV::V:::::::I::L:Q:::::::::LLT::I:AF::DR:EEIH
NP1252A         :II:::G:A::::E:PVW::SG::::T:::L:A:::D:L::::L::::I:::V:::R::T
hla0279         ::M:::GL:EV::::PAW:VS::::VT::::A::::D:L::::IA:::I:V:V::Y::::
VNG2116         ALL::A::TA::::::::S::::::::::::::::::::::::::::V::V:T:DA:E::
Hmu3014         A:LLMR:::::Q:::FA:SV::A::::::::::::::::::::::::I:::GQ::F:::L
HVO_0335        :::::R:::::E:::L:FT::::M::L:::::::::::::::::::::::V::::Y:::S
HQ3227A         :I::::::I::E::::::T::::M::L::::::::::::::::::::I::L::::VS::R
Hbo1144         :::::G::I::::S:V:NT::::M::L:::::::::::::::::::::::::G::F:::R

consensus       PGQWALAAAFVVY---FFVRTSGILAAQ-
#oth            411132.22213.1111312221424432
Hut2491         :AH:VM:LVCIG:::::A::FRVLV---:
NP1252A         L:::I::L:L:A:YVF::LADG:FV:F-:
hla0279         :::YVI::LL::::::YVLQ:R:VIL--:
VNG2116         I:::L:::::I::::::Y:::::V:::AV
Hmu3014         V:::L:::::I::::::V:::::::TSL:
HVO_0335        A::::::V:::L:::::V:::::M:Q::V
HQ3227A         I:H::::::::::::::::::::::TG:I
Hbo1144         ::H::::L::::::::::::::::IQ::V