| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 5958 | Hut0266 | NP3130A | NP2462A | pNG5065 | HVO_A0467 | Hbo0142 | rrnAC3382 | Hmu2197 | pNG5011 | HVO_2069 | pNG7181 | HQ1542A | hla0615 | NP0784A | Hut0573 | Hbo3228 | Hut0208 |
| 1623 | Hut0266 | 6110 | 1244 | 1189 | 1190 | 1241 | 1259 | 1322 | 1281 | 1270 | 1326 | 1213 | 1066 | 1092 | 1145 | 1579 | 1457 | 1477 |
| 3156 | NP3130A | 1244 | 6331 | 2356 | 2412 | 2425 | 2496 | 2656 | 2661 | 2609 | 2570 | 2534 | 2379 | 2374 | 2254 | 1657 | 1346 | 1264 |
| 3600 | NP2462A | 1189 | 2356 | 6130 | 3748 | 3651 | 2810 | 2843 | 2836 | 2855 | 2802 | 2803 | 2597 | 2742 | 2586 | 1764 | 1772 | 1480 |
| 3520 | pNG5065 | 1190 | 2412 | 3748 | 5980 | 3907 | 2805 | 2867 | 2930 | 2824 | 2806 | 2789 | 2635 | 2644 | 2632 | 1763 | 1763 | 1424 |
| 3436 | HVO_A0467 | 1241 | 2425 | 3651 | 3907 | 6063 | 2719 | 2808 | 2855 | 2817 | 2782 | 2707 | 2583 | 2497 | 2497 | 1731 | 1647 | 1409 |
| 3968 | Hbo0142 | 1259 | 2496 | 2810 | 2805 | 2719 | 6475 | 3914 | 3710 | 3295 | 3415 | 3257 | 3098 | 2846 | 2602 | 2021 | 1687 | 1608 |
| 4223 | rrnAC3382 | 1322 | 2656 | 2843 | 2867 | 2808 | 3914 | 6178 | 4287 | 3722 | 3638 | 3474 | 3158 | 2897 | 2677 | 2139 | 1757 | 1625 |
| 4112 | Hmu2197 | 1281 | 2661 | 2836 | 2930 | 2855 | 3710 | 4287 | 6150 | 3539 | 3513 | 3371 | 3162 | 2908 | 2578 | 2063 | 1635 | 1615 |
| 4268 | pNG5011 | 1270 | 2609 | 2855 | 2824 | 2817 | 3295 | 3722 | 3539 | 6112 | 4646 | 3696 | 3336 | 2786 | 2644 | 1937 | 1610 | 1493 |
| 4317 | HVO_2069 | 1326 | 2570 | 2802 | 2806 | 2782 | 3415 | 3638 | 3513 | 4646 | 6149 | 3712 | 3454 | 2888 | 2682 | 2016 | 1619 | 1499 |
| 4070 | pNG7181 | 1213 | 2534 | 2803 | 2789 | 2707 | 3257 | 3474 | 3371 | 3696 | 3712 | 6081 | 4167 | 2735 | 2624 | 1926 | 1558 | 1416 |
| 3745 | HQ1542A | 1066 | 2379 | 2597 | 2635 | 2583 | 3098 | 3158 | 3162 | 3336 | 3454 | 4167 | 6005 | 2585 | 2494 | 1853 | 1555 | 1403 |
| 3503 | hla0615 | 1092 | 2374 | 2742 | 2644 | 2497 | 2846 | 2897 | 2908 | 2786 | 2888 | 2735 | 2585 | 6493 | 2939 | 1660 | 1567 | 1467 |
| 3252 | NP0784A | 1145 | 2254 | 2586 | 2632 | 2497 | 2602 | 2677 | 2578 | 2644 | 2682 | 2624 | 2494 | 2939 | 5922 | 1829 | 1528 | 1403 |
| 2521 | Hut0573 | 1579 | 1657 | 1764 | 1763 | 1731 | 2021 | 2139 | 2063 | 1937 | 2016 | 1926 | 1853 | 1660 | 1829 | 8786 | 2454 | 2285 |
| 2173 | Hbo3228 | 1457 | 1346 | 1772 | 1763 | 1647 | 1687 | 1757 | 1635 | 1610 | 1619 | 1558 | 1555 | 1567 | 1528 | 2454 | 6291 | 3312 |
| 1985 | Hut0208 | 1477 | 1264 | 1480 | 1424 | 1409 | 1608 | 1625 | 1615 | 1493 | 1499 | 1416 | 1403 | 1467 | 1403 | 2285 | 3312 | 6220 |
1316 symbols consensus -------------------------------DYQRLIDRIDDWIVDRPKTVILVFLLLTA #oth 111111111111111111111111123357878786657567:35854473435423414 Hut0266 :::::::::::::::::::::::::::::::-----------------------MV:::G NP3130A MADGDTPDAGDDFDRDDSLVPDAGAGKDPDR:QHPWLQ::NSL:TA::WAIVA:::AV:V NP2462A :::::::::::::::::::::::::MPAGSERAKTVF:TLKES::T:::::V:::::A:: pNG5065 ::::::::::::::::::::::::::MSLDKQIEV:TR:LNNT:::S:RK::VG::V::L HVO_A0467 ::::::::::::::::::::::::::MSLAERIETATE:LNTT:::::RV:VVA:::::G Hbo0142 ::::::::::::::::::::::::::::MNY::::IV:WV::H::E::GK:::A:::V:: rrnAC3382 ::::::::::::::::::::::::::::::M::::Y::WA::R::HDSRK:V:L::VV:V Hmu2197 ::::::::::::::::::::::::::::::ME:::Y::W:::K:IYDSRR:::A::V::L pNG5011 ::::::::::::::::::::::::::MDFELN:::Y::IA:H::A::::Q::::::I:SG HVO_2069 ::::::::::::::::::::::::::MDLQI:::HY::VV:G::::Q::::L::::::S: pNG7181 :::::::::::::::::::::::::::::ML:::KY::IL:::::N:D:::VA::IVT:L HQ1542A :::::::::::::::::::::::::::::MI:::S:::QV:E::IN:D:::::I:I:I:: hla0615 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:::QT:::TEI::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla0615 AP:MD:::AE:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP0784A AA:PL:::EEI::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0573 G::N:I:TA:IQRERGAELQATLAEFQTLNATVQEQRQQLQAERTALQQNRTEFNQSRRQ Hbo3228 GNSGSNT:S:A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0208 A:Y:DAT:ADG::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------DPSAT------------------------------- #oth 111111111111111111111111238351111111111111111111111111111111 Hut0266 ::::::::::::::::::::::::GDR:A::::::::::::::::::::::::::::::: NP3130A ::::::::::::::::::::::::::D:D::::::::::::::::::::::::::::::: NP2462A :::::::::::::::::::::::::EDV:::::::::::::::::::::::::::::::: pNG5065 ::::::::::::::::::::::::::::D::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0467 ::::::::::::::::::::::::N::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0142 ::::::::::::::::::::::::::Q::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC3382 ::::::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu2197 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG5011 ::::::::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2069 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7181 ::::::::::::::::::::::::::D:E::::::::::::::::::::::::::::::: HQ1542A ::::::::::::::::::::::::::T::::::::::::::::::::::::::::::::: hla0615 :::::::::::::::::::::::::ENVE::::::::::::::::::::::::::::::: NP0784A ::::::::::::::::::::::::::Q:N::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0573 LETRAQRLNATAESLQSALTTLRQ::::SVRDQFDAVAQNTPVTLNETHYVTFRTAAQNL Hbo3228 ::::::::::::::::::::::::GRGQS::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0208 ::::::::::::::::::::::::G:PPA::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 Hut0266 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3130A 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0208 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus --------------------TL---DEQIDAVERATPSEIRTAVRRAAEDN------PRF #oth 111111111111111111113632264546323644454247536754496122332575 Hut0266 ::::::::::::::::::::S::::E::LA::KS:SEQ::::LL:ETVT::::::::::A NP3130A ::::::::::::::::::::SA:::E:KQR::R::S:GQL::::ND:D:AA::::::--- NP2462A ::::::::::::::::::::AESSMAAHRQ:::N:::T:::G:::E:::ED::::::ES: pNG5065 :::::::::::::::::::::A:::A::RR:I:STSA:R:EKI::ELSDNS::::::-:: HVO_A0467 :::::::::::::::::::::P:::ADYRRTL:::::::::Q:::ELDDSS::::::-:L Hbo0142 ::::::::::::::::::::::::::R::TTL:Q::QADV:A:::QN:DN-:::::::A: rrnAC3382 :::::::::::::::::::::T:::EQ:VY:::A::::::DA:::::::Q:::::::::: Hmu2197 ::::::::::::::::::::::::::Q::::I:::PA:::DR:::::D:SS::::::::: pNG5011 :::::::::::::::::::::F:::E:::RV::T:A::::DQ::QT:::R::::::::Q: HVO_2069 :::::::::::::::::::::I:::::E:::::Q:::T::DR::QV:V:Q::::::::SV pNG7181 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