| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4609 | Hut2462 | NP1146A | hla2457 | Hbo1718 | HQ1116A | HVO_1788 | rrnAC2992 | Hmu0223 | rrnAC2625 | HQ2212A | hla1851 | NP4224A |
| 3658 | Hut2462 | 4621 | 3681 | 3236 | 3344 | 3220 | 3289 | 3481 | 3505 | 2454 | 2472 | 2505 | 2435 |
| 3740 | NP1146A | 3681 | 4579 | 3373 | 3471 | 3382 | 3506 | 3512 | 3574 | 2418 | 2534 | 2552 | 2447 |
| 3769 | hla2457 | 3236 | 3373 | 4642 | 3912 | 3981 | 3512 | 3504 | 3451 | 2489 | 2489 | 2574 | 2510 |
| 3877 | Hbo1718 | 3344 | 3471 | 3912 | 4641 | 3958 | 3680 | 3624 | 3468 | 2504 | 2651 | 2594 | 2493 |
| 3754 | HQ1116A | 3220 | 3382 | 3981 | 3958 | 4577 | 3535 | 3491 | 3342 | 2410 | 2492 | 2572 | 2452 |
| 3936 | HVO_1788 | 3289 | 3506 | 3512 | 3680 | 3535 | 4655 | 3768 | 3722 | 2643 | 2729 | 2604 | 2472 |
| 4038 | rrnAC2992 | 3481 | 3512 | 3504 | 3624 | 3491 | 3768 | 4698 | 4084 | 2580 | 2697 | 2643 | 2540 |
| 3919 | Hmu0223 | 3505 | 3574 | 3451 | 3468 | 3342 | 3722 | 4084 | 4685 | 2520 | 2622 | 2568 | 2506 |
| 2828 | rrnAC2625 | 2454 | 2418 | 2489 | 2504 | 2410 | 2643 | 2580 | 2520 | 4597 | 3267 | 3229 | 3201 |
| 2961 | HQ2212A | 2472 | 2534 | 2489 | 2651 | 2492 | 2729 | 2697 | 2622 | 3267 | 4620 | 3226 | 3070 |
| 2914 | hla1851 | 2505 | 2552 | 2574 | 2594 | 2572 | 2604 | 2643 | 2568 | 3229 | 3226 | 4533 | 3429 |
| 2750 | NP4224A | 2435 | 2447 | 2510 | 2493 | 2452 | 2472 | 2540 | 2506 | 3201 | 3070 | 3429 | 4615 |
603 symbols consensus MPTKVERWKDEVYGNEIREHLLEFAEEGWDSIPEDERDAWFERFKWWGLYHQRSGQESYF #oth .2311.51.3.4..511112141..15.222..111113..3...1..11.1.3...1.. Hut2462 ::S::::::::T::M:::D::ER:::::F:A::::::::::::::::::::::K:::::: NP1146A ::S:::A:::::::T:::D::F:::::::SA::::::::::::::::::::::K:::::: hla2457 :::D::N::S:A::R:V:DR:F::::::Y::::D:::::::::::::::::::N:::G:: Hbo1718 :::D:::::S:::::::::::Y::::::::A:::::H:E::::::::::::::N:::::: HQ1116A :::D:::::S::::Q::::::F::::::Y:T::::::::::::::::::::::N:::G:: HVO_1788 :::D:::::S::::::::::::::::Q::::::::::::::::::::::::::N:::::: rrnAC2992 ::::::N::::::::::::::M::::Q:::A:::::H::::::::::::::::::::::: Hmu0223 ::::::N:::::::::::D::M::::::::A:::::H::::::::::::::::::::::: rrnAC2625 :AH:K:EY:A:L::D:V::K:E::::K::::::::::EK::S:::F::VF:H:G:::::: HQ2212A :T::K:Q::::M::D::::KI:::::S::::::::D:EM::S:::F::VF:::::::::: hla1851 :AN:K:D::S:M::D:V::K::::::T:FE:::::::::::T:::F::VF:::::::G:: NP4224A ::H:K:AY:E:L::DTVQ:KI::::DR:F:::::S:::E::C:::F:::F:::::::G:: consensus MMRIGTPNGVLEPGQLRVIGEVADEYATGPVDNPEFGDAYADFTTRQSIQLHWIKLEDIP #oth ...12132.22413.11211.1.52..4..34..1..3213.2....11....1412.1. Hut2462 :::::::M:RMT:A:::TV::::R:::::::::::::::::::::::::::::::I:::: NP1146A :::::::::R:T:D::::V::I:::::R:::::::::G::C:W::::A::::::Q:Q:V: hla2457 :::::::::::::::::T:::I:::::R::GT::I:::::::::::::::::::E:S:V: Hbo1718 ::::::::::::::::::V::I:A::::::GT::I:::::::::::::::::::NI::V: HQ1116A ::::::::::MK::::::V::I:S::::::GV::I:::G:::::::::::::::E:S::: HVO_1788 :::::::::::T:::TE:VA:::::::R::AE::I::NG:V:W::::::::::::::::: rrnAC2992 ::::::::::IK::::E::::::K:::::::::::::E::C:W::::::::::::::::: Hmu0223 ::::::::::I:::::E::A::::K::R::EE::::::::C:W::::::::::::I:::: rrnAC2625 :::LTNCG:::::D:::A:::::RD::K::AE:::::NGWI::::::::::::L:::::: HQ2212A :::LANT::::NAE:::::::::G:::I:::S:::::::WI::::::::::::LN:::V: hla1851 :::LTNA::I:::::::A:A:::RD::S:::S::::::SWI:L:::::V:::::::::V: NP4224A :::LTNC::R:D:::::A::::::::::::ET:::::NGWI:L:::::V:::::R:::V: consensus EIFEKLEAVGLSTQQACGDSWRNIVGCPVAGKDAHEHIDAWPVIEELNETFKGNDDHSNL #oth 211122132.1223111..11...1.2.11.1235.51333.2352233321212223.1 Hut2462 D::DE::SA::::I::::::::::::S::::R::D:LV:V::IV:::HDR:::::LYT:: NP1146A :::D::::N::::M::::::::::::S:MT:R::K:::N:::::K::::::::::::::: hla2457 A:::::A:N:::::::::::::::::N::::::GQ:VVE:::::RD::Q::::::::A:: Hbo1718 A::::M:KN:::A:::::::::::::N:::::::Q:V:::::::R:::::::::E::::: HQ1116A D::::::EN:::::::::::::::::N:::::::R:V:::::::HD:::::::::::::: HVO_1788 :::D:::S:::::::::::::::::::::::::K:::V::L::AM::::::::::::::: rrnAC2992 :::::::::::G:::::::::::::::::::::K:::V:::::A:D:H::::::::Y::: Hmu0223 ::::L::S:::::::::::::::::::::::::K::::::::IA:D:H:::::D::YA:: rrnAC2625 ::W:::::::V:SRS:G::TM:::S:::::::-:E:YVASR:ILD:IQ::IRDDN:L::M HQ2212A ::W::I:S::::SRSSG::TM:::S::::::R:K::FV::Q::LD:ISTKLRAD::LA:M hla1851 ::W::::S::VT:RSSG::TM:::S:S:::::::D:V::TL:LL:RFQ:EIR:D::LC:M NP4224A DVWD::::A:VT:RSSG::TM:::::::::::ADD:I::TQ:ILDRFQDEIRDD:ALC:M consensus PRKWKVSVTGCREGCGQGDINDLAFEPAEKEIDG-------EETLGFNVRVGGGLARNEP #oth ...111112.353.31.23..1112...6.42.211111113355...111....213.1 Hut2462 ::::::A:::D:R:A:::::::::::::V:::::::::::::DIA::::N:::::::K:: NP1146A ::::::A:::DTR:S::AE::::G::::V::::::::::::T::K:::I::::::S:K:: hla2457 ::::::::::SAD:S:::::::::::::Y:S:::DGEGDES:DAV::::::::::::::: Hbo1718 ::::::::::SAD:S:::::::::::::Y::V:V:::::::::KV::::::::::::::E HQ1116A ::::::::::TPD:S:::::::::::::Y:T:::::::::::::V::::::::::::::: HVO_1788 ::::::::::::::::::::::::L:::T:::::::::::::::K:::I:I::::S:::: rrnAC2992 ::::::AIA::D::::::::::::::::::--::::::::::--::::::I::::S:K:: Hmu0223 :::::::I:::DQ:::::::::::Y:::::--::::::::::--:::::::::::S:K:: rrnAC2625 :::FNI:::::KQ::A:DS:::IGL:::H:F::::::::::::IE::::::::::GGR:: HQ2212A :::FNI:::::::::A:DS::GIGL:::::T::::::::::DT:W::::::::::GGR:: hla1851 :::FNI:IS:TP::GA:DA:::IGL:::K::::S:::::::G:::::::::::::GGR:: NP4224A :::FNI:I::TP::GA:DS:::IGL:::Q::::::::::::::Q:::::::::::GGH:: consensus RLARDIDVFVPPENAADVAGGLSALFRDYGDREDRFNARIKFLVDEWGTEKIREVLQEEY #oth .4..21.2123.36142333131311214.1.22.411.41.11.12.2124.44.1232 Hut2462 ::::S::::CR:::::EA:A:::G:::::::::::::::M:::::::::::::S:::::: NP1146A :F::::::::T:GEV::::::I::::::H::::::::::::::::::::::L:R::::D: hla2457 ::::::::W::::QVS:::::::::::::::::::Y:::V::::::::AD:V::T::::: Hbo1718 :F::::::W:A:::VS::::::::::::N::::N:Y::::::::::::P::V:N:::::: HQ1116A :F::::::W:::ADVST:::::::::::N::::::Y::::::::::::AD:V::T::S:: HVO_1788 ::::::::::T::Q:PE:S:AI::::::N:::DN:Y:::::::M::::A::F:N:::::: rrnAC2992 ::::::::W::::Q:::::H:M:S:::::::::::::::::::M::::P::M:S:::::: Hmu0223 ::::::::W::::K:::IGH:M:::::E::::D::::::::::M::::P::M:S:::::F rrnAC2625 :E::PL:L:IR::H:VETVRAFVEYYHEA:N:QN:SKN:AR:F:::H::DA:::E:D:R- HQ2212A :K::SL:I::T:D::Y::VR:FVE:YFET::::N:QKN:SR:F::D:::::::DQ:::S: hla1851 :V::PL::::T:DE:Y::VR:FVE:YH:H:::QV:AKN:SR:F::DH:::W::DL:D::: NP4224A :V::PL::W:A:DR:V:IVRAFVE:YH::::::N:SKN:SR:F::DN:P:W:::T::A:: consensus VDFELETAGEDLRDEYTYNAGR--EDGRNDHVGVHEQADGNYYVGLSVLVGRMGADDVIE #oth 11321422.415.32.2..2.43463355.22.111.71.5421..2.22..15241242 Hut2462 :EYD:P:::QG::E::D:::::::S:APG:Y::::D::::QHF::::::::::A:E:::: NP1146A :::::K:::::::EQ:S:::::::N:EVG:Y::::::T::::F::::::::::::QE::: hla2457 ::::::P::R:V:E:::::::-:::GE:::LI:::D:N::RNF:::N:::::::::::LN Hbo1718 :::::H:::R:V:E:::::T:-::SG::::LI:::::K::::F:::N::::::::E::L: HQ1116A :::::H:::R:V:E:::::T:-::DGD:::LI:::::H::S:FI::N::::::::S::L: HVO_1788 :::::::::::::S::S::S:Y:ADG:HS::::I::::::::::::D:::::::V::TK: rrnAC2992 :::::P:::::M::Q:S::T:S::Q::H:::::I:::N:::::I::N:::::::::::L: Hmu0223 :::::PR::::M::Q::::::-::GNEHG::::::::P::::::::D:::::::V:::Y: rrnAC2625 L:::F::::T:F:G:::::::KSA:H:AH:::::YD:Q::KN::::::P:::LS:E:T:: HQ2212A :::N:RRE:A:C:::::::::KSPT::KH::I:::::T::T:::::::PI::LT:GETVR hla1851 ::AD:R:::::I::::::::::TT:::KQ:YT:::::S::RR::::::P:::LP:EEA:: NP4224A ::W::K:S:A:M::R:::::::PS:::AF:Y::::D:KN:KKW:::::AC::LESQEA:R consensus LADLADEYGSGEVRLTQRQNVIVTDVPEDRLDAFLAEPLLENYSPDPNPFMRGSIACTGT #oth ..32.3211.1321111...2215.13445213137131.3512.1.22.31.13..... Hut2462 :::::E::D:EMIG:::::::::G:IA:SD::D::::SV::::::::H:::::::::::: NP1146A ::::::::::ELIG::::::IV:A:IA:ED:::::E:D:::YH::::H::L::::::::: hla2457 :::::E:::::::::S:::::::::::D:A::D:RD::::DH:::::S::::::V::::: Hbo1718 :::::::::::::::S::::::::::::ED::D::G:D:::H:::::S::::::V::::: HQ1116A :::::S:::::::::S::::I::::I:K:AV:E:TS:Q:::::::::S::::::V::::: HVO_1788 ::RV::::::::I:I:::::::I:::::EK:::LQN:D::DH:::::H:::::::::::: rrnAC2992 ::E:::::::::::::::::I:::::::EN::::TS:::::::::::S:::::::::::: Hmu0223 ::EI:E::::::::::::::::::::DS:::::::D::::DD:::::H:::::::::::: rrnAC2625 ::::::A:::::::::R:::PVIM:::DGNISNL:N::::DKH::E::::VQ:AM::::: HQ2212A ::N::EIH:::AM:::R:::PLIL::::SE:::L:TSD:::TH::E::V:T::AM::::: hla1851 ::::::::::::::::R:::P:IV::NS::V:EL::::::AKHR:E::R:V::AM::::: NP4224A ::E::A::::::::::R:::PLIM::DPN:V:DL:R::::HKHT:E::::V::AT::::: consensus EFCSLSIVETKNRQVRYARWLKDNVDLPEDVDDFHIHLSGCTASCAQPQIADISLRGMKT #oth .1.11111...2.11131...23..41.31243211.2.....1.11131..1112..11 Hut2462 :Y:::::::::::M:::::::::::PV::G:S:::::::::::::::::::::::::::: NP1146A :::::::::::::M::::::::::::V::G:SE::::::::::::::::::::::::::: hla2457 ::::::::::::::::F:::::V:::::A:::E:::::::::::::::::::V::::::: Hbo1718 ::::::::::::::::::::::E::E::D:I:Q::::::::::::::::::::::::::: HQ1116A :::::::::::::::::::::::::T::G:::E::::::::::::::::::::::::::: HVO_1788 ::::::::::::::::::::::E:::::AG:E:::::::::::::::::::::::::::: rrnAC2992 :Y:::::::::::::::::::::::E::::HK::::::::::::::::::::V::::::: Hmu0223 :::::::::::::::::::::::::S:::G:E:::::::::::::::::::::::::::: rrnAC2625 :::::ALT:::A:MA:LL:::G::::V:D:::RIKM:F:::::D:G:AMT:::G:Q::RA HQ2212A :::::ALT:::A:MATLL:::RS:::::D:IEQIK::Y:::::D:GHATT:::GFQ::RA hla1851 ::::IAL::::T:MATML:::RE:::::D:::QLK::F:::::D:G:ANT:::G:L::RA NP4224A :::G:ALT:::A:MA:ML:::R:::::::::CQLK::F:::::D:G:ANT:::G:L::RA consensus RKDGEPVEALDIGLGGGLGENPQFADWVEQRVPADEVPGAIANLLEAFAAEREGGETFRE #oth ..1.22...3.1.1...2.32.4.231131.111..2..315.12351225.55211..3 Hut2462 :::::A:::F:V:::::::::::::::::M:::::::::Y::::::VYE:N:::Q:S::: NP1146A :::::::::F:::::::::::::::::::M::A::::::Y:Q:::AVYE:::::D:S::: hla2457 ::::D::::::V:::::::::::::R::T::::V::::::::::IDS:::::DE::S::A Hbo1718 ::N::::::::V::::::::E::::R::T::I:V:::::::S:::DQ:K:N::D::S::: HQ1116A ::N::::::::V:::::::AE::::R::T::::V::I::::S::I:T:::::NDD:S::A HVO_1788 ::::::::::::::::::::::N::E::T::::V:::::::K:::AN:EER:::D::::: rrnAC2992 :::::::::::::::::::DD:R::::::M:::::::::::K::VNN:EDA::::::::D Hmu0223 :::::::::F:::::::::::::::::::M::A::::::Y:E:::D::E:::::D::::: rrnAC2625 ::::QM:::V:::V:::I:AE:T:IE::R::::::::::M:::IV::Y::L:SE:Q:::: HQ2212A :::::M:::I:V:V:::I:PD:S:VE:IR::::::::::LLR::::T:::H::K:Q:::Q hla1851 :::::M:::V:::V:::M::E:S:V:Y:Q:::::::A::::R::I::::ER:AP:Q:::: NP4224A :::::M:::::::::::I::D:S:VN:IR::::::::::::K:IV::Y::H:FA:Q:::: consensus FVARTDEEELAELAEPEETD-YEDPMLHNTKMTWYPYAEEDGMDASPAPT-------PIP #oth 123224414164322.1.121.4..31512.31...112455464412115342411364 Hut2462 ::TDRE:D::SG:::::::S:::::Y:G::::::::::D:EE:S::::::NASGE::::: NP1146A :I::HG:D::GG:::::::S:::::Y:E::::::::::::TE::::::--::::::::S: hla2457 ::::H:DD::DAFV::::::::::::M::::R:::::::N:T:EDA:---::::::::T: Hbo1718 ::::H:D:::D:FV::::::::::::M:::::::::::D::S::::::::FPDDS:::MS HQ1116A :ID:H:ND::DSFVA:::::::::::M::::R:::::::N::L::G:---:::::::SA: HVO_1788 :::::::::::::V:::::S::::::M::::R::::::DD::L:::::::RADGT::::A rrnAC2992 :::DR:::T::DMV::::::::H::YM::::::::::::D:D:QS:::::DGSGE:::L: Hmu0223 :::DR:::A:QS::D::::S::D::Y:G:::::::::::DND:QS:::::DANDE:::L: rrnAC2625 W:DA:GH:TIV:::::::VEG:T::C:ADG:QS:::FDDGES----::::DAEGQ::::S HQ2212A W:EA:Q::V:I:A::::::::::::C::DA:GS:::F:DSE:----::::APDDTSLATE hla1851 WADA::T:T::A:C::::::::V::S:TDA:QS:::F:::GTTA:N:E--:::::::VAS NP4224A W::A:SD:Q:I::C::V::S::D::C:YDA:QS:::FDA:KQATKG----:::::::VQG consensus ADD #oth 2.. Hut2462 T:: NP1146A ::: hla2457 ::: Hbo1718 ::: HQ1116A ::: HVO_1788 S:: rrnAC2992 S:: Hmu0223 S:: rrnAC2625 ::: HQ2212A S:: hla1851 S:: NP4224A :::