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8 genomes BUD1057 10 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2619

HVO_0084

HVO_0086

Hbo1410

Hmu2941

Hut2058

Hut2061

hla0665

NP0922A

HQ3444A

Pairwise sequence scores
Consensus score3270 Hut2061 HQ3444A HVO_0086 Hbo1410 NP0922A hla0665 HVO_0084 Hut2058 rrnAC2619 Hmu2941
1931Hut2061 3575 2386 2347 2196 1407 1525 1494 1474 1553 1487
2144HQ3444A 2386 3505 2588 2370 1540 1667 1663 1559 1604 1505
2218HVO_0086 2347 2588 3534 2662 1553 1745 1684 1574 1662 1576
2076Hbo1410 2196 2370 2662 3408 1514 1625 1620 1571 1585 1539
2312NP0922A 1407 1540 1553 1514 4388 2639 2115 2033 2157 2079
2407hla0665 1525 1667 1745 1625 2639 4406 2098 2138 2208 2190
2432HVO_0084 1494 1663 1684 1620 2115 2098 3416 2069 2180 2177
2408Hut2058 1474 1559 1574 1571 2033 2138 2069 3347 2405 2352
2478rrnAC2619 1553 1604 1662 1585 2157 2208 2180 2405 3279 2480
2412Hmu2941 1487 1505 1576 1539 2079 2190 2177 2352 2480 3293

663 symbols
consensus       ----EATPL---------------------------------QVD-PSAIAEGVNLVWVL
#oth            112457621111111111111111111111111111111111253134422521133.21
Hut2061         ::::--M:V:::::::::::::::::::::::::::::::::---:GGEV:S:::T::A:
HQ3444A         ::::-MI::::::::::::::::::::::::::::::::::::I::AG:::S:::N::I:
HVO_0086        MGWAVVI:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::Q:::Y::I:
Hbo1410         ::::MSV::::::::::::::::::::::::::::::::::::A::A:T::A:::N::I:
NP0922A         ::MI:::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::EGAE:VVNS::YS:I:
hla0665         ::MYSRS::WKRDSEHEHGRNALSIGRTFTRGDSRVTTGVLASI::::VL::::::M::A
HVO_0084        ::::ML:::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::LASVV:::::::::
Hut2058         ::MI::L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::::LTDAISN::::
rrnAC2619       :::MSY:A:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::NVL::::::L:::
Hmu2941         :::MTYEL:::::::::::::::::::::::::::::::::::SN::ES:V:::::L:::

consensus       VVTFLIFFMHAGFAMLEAGQVRAKNVANQLTKNLLTWSVGVLVFFLIGAGVSGLVGGLTS
#oth            2.3......11...1..1....1...1.1.1..111.42.2441.22.322242314435
Hut2061         ::A::::::QP:::L::S::::::::G:V:M::MTD:TL:I:SY:I::F:F:V:IAT:::
HQ3444A         ::C::::::QP:::L:::::::::::G:V:M::MTD:TL::::::IV:::::SII:M::A
HVO_0086        ::S::::::QP:::L:::::::::::G:V:M::MTD:AL::::Y::V::::ATI::::::
Hbo1410         :::::::::QP:::L:::::::::::G:V:M::MTD:IL:T:IY:VV::AIATI::::::
NP0922A         T::::::::::::::::::::::::::::::::M:::::::VT:::::M:::N:T:QV:G
hla0665         M:C::::::::::::::::::::::::::::::::::G:::::Y::::F:IE:VA::GGF
HVO_0084        T:::::::::::::::::::::::::::::::::::::I::I::::L::A::SI:AA:::
Hut2058         T::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:::V::::I:::I::DPY
rrnAC2619       T:S:::::::::::::::::::S::::::::::::::::::V::::::S:I:S:::TGSF
Hmu2941         ::::::::::::::::::::::S::::::::::::::::::AL:::V::T:E:::::AGL

consensus       PG-AFD---AF------YAGDASAWIG-WLFGAVFAMTAATIVSGAVAGRAKLRAYVTYT
#oth            5514466643253111155544541131.121......1.........1.1413..2521
Hut2061         GQ::ITPMDSLFG::::HF:G::G:V::::V:::::::::::::::::E:MNFK:::FVA
HQ3444A         ::T:L:LGS::A::::::IN:P:SY::::F::::::::::::::::::::MNFT:::FVA
HVO_0086        :::G::VAA::S::::::I::SG:::D:::::::::::::::::::::E:MDF:::IVFA
Hbo1410         :::P:SISA::A::::::VN:PT:::::::::::::::::::::::::E:MEFN:::LF:
NP0922A         V::EMGSLSM:GA::::GGESTLG::D:::YS::::::M::::::::::::::::::G::
hla0665         SP::--:::--::::::S:LSDGD::NS:::::::::::::::::::::::::::::A::
HVO_0084        GS::L:ITG::MSLYAPD:SATT::VD::::::::::::::::::::::::R::::L:::
Hut2058         TD:::PFL:--::::::----DEEY:::::Y:::::::::::::::::::::::::::::
rrnAC2619       AP:::-:::--::::::G:EA:NDYV::::::::::::::::::::::::::::::I:::
Hmu2941         SW:QMN:::--::::::--:SS:G:VT:::::::::::::::::::::::::::::I:::

consensus       ALIAAVIYPVVTGLTWGGGLL--------------ALGLGFHDFAGGMIVHGMGGIAGLT
#oth            323222....14.42.51251111111233122265632115....111..13..2...1
Hut2061         :AMT::::::A::I::D::::ALADNPANNGFIADII:V:YQ::::ATV::ML::L:::V
HQ3444A         :AMTS:::::::::::A::::::::::SADGFIGL:::V:YL::::ATV::MV::L:::V
HVO_0086        :T:TGF:::::Q::::S::::::::::SSGGYIGA:::V:YL::::ATV::MC::V:::V
Hbo1410         V:MT:I:::::V:F:::::::::::::SSGGFLGNV::A:YL::::ATV::MC::V:::V
NP0922A         F:V::I:::::A::G:Y::W:::::::::::::::GET::::::::::::::V::::::V
hla0665         IA:S:::::::A:V:::::F::::::::::::::GGS::::T::::::::::V:::::::
HVO_0084        I:::G::::::V:F:::::F:::::::::::::::-DA::::::::::::::::::::::
Hut2058         F:L::::::::::I::V:EYI:::::::::::::AVGDAV::::::::::::L:::::::
rrnAC2619       F:L:::::::::::::A:AHI:::::::::::::SLG:VV:K::::::::::::::::::
Hmu2941         V::::::::::S:MS:YD:G:::::::::::::::LA::::A::::::V:::::::::::

consensus       AAYMLGPRMGRFDEDGSANVIPGHSMTFAVLGTLILAFGWYGFNVGTAATVLSAA-DGAL
#oth            1.222.2.22.1451.33211....111.....12.1..........3145345433144
Hut2061         G:::V:::K::Y::N:NSRP::::::LL::::::F::::::::::::SGIY----::::N
HQ3444A         G:K:V:::KT:::SN:NSQP::::::LL::::::F::::::::::::Q::::A:::::::
HVO_0086        G:K:V:::K::::SN:NSQP::::::LL:::::::::::::::::::Q::::A:TDS:G:
Hbo1410         ::K:V:A:K::Y:AN:ESQP::::::LL:::::F:::::::::::::Q::I::V:D::S:
NP0922A         :::V::S:I:::ND::::::M:::::::::::::M:C:::::::::::::A::LG::S:F
hla0665         :::::::::D:YAK:::T:::::::::::::::::::::::::::::T:::F:VTES:E:
HVO_0084        ::WII::::D::KP::T::::::::I:::::::::::::::::::::::AP:AY:::::V
Hut2058         :::I:::::D::G::::P::::::::::::::::M::::::::::::::VFAE:GPN:D:
rrnAC2619       :::V:::::::YN::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:FVVE:::::
Hmu2941         :::V:::::::YN::::::::::::::::::::::::::::::::::::::F:IE:E::I

consensus       -ALGGAA----LGRVALTTTLGMAAGAIGAGLVSWLKTGKVDTLYVANGLLAGLVAVTGI
#oth            14133441114211.114..21.13.142.233145313.1.1.13...2.....11.12
Hut2061         ::FL::Q::::::::::N::::::G::LA:M:::TTWQ::P:P:WT:::::::::::::A
HQ3444A         :SFN:G:::::::Q:V:N:::::GG::VA:MI::ASWQ::P:P:WA:::::::::::::A
HVO_0086        :EFM:::::::::::::V:::::G:::VA:MI::TSYQ::P:P:WM:::::::::::::A
Hbo1410         :TFM:::::::::::::V:::::G::GAM:M:M:ARYQ::P:P:WT:::::::::::::A
NP0922A         :L:::DGGSWVA::::MA::::::M::::::A:AL::::::::::::::M:::::G:::T
hla0665         :::::Y::::AV:::::::::::G:::V::A:G:MYL:K::::::::::V::::::::::
HVO_0084        :T::SF::::YV:::::V:::::::::::::G:AMY:::::::::::::V:::::GI:A:
Hut2058         L:FN::V:::::S:::MG::IA:::::M:::::A::::D::::::::::::::::GI:A:
rrnAC2619       ::::AF::::TV::::M:::VA::M:::::A::A:::::::::::::::::::::GI:A:
Hmu2941         ::::DFS:::YV::::M:::IA::S:::::::I::V::S::::::::::::::::GI:A:

consensus       VDHVTWWGALILGLLAGAQLPIVFRFVEDRLKIDDVCAVFPVHGSAGVLGTLLIPVFAV-
#oth            2244112.13311322.3211321412223131....1..2...2..22.2323122221
Hut2061         :P::::::G::::S::::LVLPT::WTV:T:::::::G::A:::M::AV::A:::L::Y:
HQ3444A         :P::::::G:::::I:::LVLPT::W:V:S:::::::G::V::::::AI::I:::::G::
HVO_0086        :P::::::G::::A:G::IVLPAY:WTV:S:::::::G::A:::V::AV::A::::::::
Hbo1410         :P::::::GAL::G:G:FLVLPA:::TV:T::V::::G::A:::V::AV::A::::::::
NP0922A         A:VL:PM:GIM:::I:::::::::E:::K::N:::::::::::::::I::IV:Y:LWSTG
hla0665         ANLA:::::ILVA:VC:L:::L::E::S:KM:::::::::::::::::I:V:AL:FVS::
HVO_0084        A:DIV:P:::VV:::::::::V::E:::K::R:::::::::::::::::::::Y::::::
Hut2058         P:TT:::::F:V:G::::::::::G:::N:::::::::::::::::::::::AF:FV:::
rrnAC2619       P:TT:::::::V:::::G::::::S:M:N:M::::::::::::::::::::IMY:LV:T:
Hmu2941         PNTT:::::FLV:G::::::::::N:::K::Q:::::::::::::::::::::YSFV:::

consensus       ----------GG--------AGFSVSQLVMQVIGVLVIAAWTVVATAVVFGALKALGQAR
#oth            111114335514111111156346345235.22.141.24.125212322332314212.
Hut2061         ::::::::ES::TMILGDPW:FGGIDA:G::IV::I::GI:A::GS:IA::IADL:FGL:
HQ3444A         :::::::TAT:::::::::Y:FLG:N::I:::V:::::GT:::F::IA:::IAN::FGL:
HVO_0086        ::::::::::--::::::::S:::GT::::::V::V::::::II:S::::AIAD:VFGL:
Hbo1410         ::::::::::--::::::::G:::A::FAL:IL:::I::::::T:SGI:LYV:DLTVGL:
NP0922A         GTPIGAGVVP:::::::::ILSIEA:MFAP:I::T:::T::::A:::::W::FRLA::::
hla0665         ::::::::::--::::::::N::::DV::S:::::V::T:::I:::::::::F:::::::
HVO_0084        :::::PLWHD:A::::::::--SF::LA:P:::::G:::I::F:::::::DGFR::::V:
Hut2058         :::::EAWQG:L:::::::DL::V:EGFIT::L::VI:::::IL::G::W:::::I::::
rrnAC2619       :::::::::S:T::::::::V:SIG:A:AV::V::A:::G::I:T:GLIWYG:::A::::
Hmu2941         :::::DAWAG:A:::::::NV::MIDGF:T:L:::AI:TV:::A::GLIW:::::V::::

consensus       VTEEHEREGLDLSEHGVETYPEFGGGEG---------VATDGG---GVRTDGG------V
#oth            .2432.33...42...231....15646542222211442..111263533434423446
Hut2061         ::D:E:EV:::EG::::TV::::V:::PGTPGTSGPT:TP::::::EL:::::::::::R
HQ3444A         :S:KD:EQ:::E::::ISV::::VPS:RREG:::::::::::S:::::E::::VDVDSET
HVO_0086        :S::E:E::::AG::::SV::::V:DA:PDGALGSP:T:::::::SD::::::VEQDET:
Hbo1410         :G:TE:A:::::G::::SV::::VADGESP:::::::-MA:::::SS::::::EF:::::
NP0922A         :SR:::Q:::::::::TD:::::::RDA:::::::::::::::YTEA::SNSDHE::::I
hla0665         ::S::::D:::V::::::::::::KAN-::::::::::::::::::SSIV:TTDTVENSP
HVO_0084        :SSD:::::::TA::::D::::::SPDHDTG::::::IR:::S:::::PSGD:::::::F
Hut2058         ::P:::::::::::::::::::::DEDP:::::::::LVA::::::-------:::VSA:
rrnAC2619       ::P:::Q::::V::::::::::::::::::::::::::VA::::::K:N:N--:::::::
Hmu2941         ::P:::Q::::V::::::::::::S:::::::::::::VA::::::-------::::TAN

consensus       RTDGGEDE----------------------------------------------------
#oth            534244753321111212211111222112111221111111111111111112111111
Hut2061         SLN::DN:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HQ3444A         :S:SNSVNNDE:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_0086        EAN::DSQ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo1410         AS::::R:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP0922A         :::::QPNDGGIKMVMAFIRPDKLSDVKQGLAEVGAPSLTVTNVSGRGSQPAKKGQWRGE
hla0665         :A::::EAGSEIKMVTAVVRPDKLGAIKQALAEINAPSLTVTNVSGRGSQPAKTGQWRGE
HVO_0084        M:T:R::-::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hut2058         :SR:DS::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
rrnAC2619       :::::SKDD:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hmu2941         F:EVTN:D::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       ------------------------------------------------------------
#oth            122111111112121111111221111121121112111111111112212121112212
Hut2061         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HQ3444A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_0086        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo1410         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP0922A         EYSVDLHQKVKLECVVADIPAEDVAEAIAEAGKTGDPGDGKVFILPVDEAYQIRTGEVGT
hla0665         EFTVDLHQKVKIEVVVADIPADEVAEAISEAAKTGEPGDGKVFILPVEDALQVRTGATGP
HVO_0084        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hut2058         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
rrnAC2619       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hmu2941         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       ---
#oth            211
Hut2061         :::
HQ3444A         :::
HVO_0086        :::
Hbo1410         :::
NP0922A         DAV
hla0665         GAV
HVO_0084        :::
Hut2058         :::
rrnAC2619       :::
Hmu2941         :::