| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3801 | Hut2112 | Hut1908 | HQ1686A | HVO_1057 | Hbo0555 | hla2147 | rrnAC0757 | Hmu1989 | NP4906A |
| 2512 | Hut2112 | 3834 | 2128 | 2064 | 2272 | 2253 | 1931 | 1983 | 2030 | 2109 |
| 2832 | Hut1908 | 2128 | 3837 | 2470 | 2583 | 2567 | 2079 | 2208 | 2225 | 2361 |
| 2867 | HQ1686A | 2064 | 2470 | 3993 | 2990 | 2990 | 2064 | 2136 | 2242 | 2286 |
| 3041 | HVO_1057 | 2272 | 2583 | 2990 | 3991 | 3142 | 2160 | 2201 | 2352 | 2348 |
| 3024 | Hbo0555 | 2253 | 2567 | 2990 | 3142 | 3986 | 2125 | 2165 | 2318 | 2404 |
| 2546 | hla2147 | 1931 | 2079 | 2064 | 2160 | 2125 | 3809 | 2449 | 2557 | 2475 |
| 2666 | rrnAC0757 | 1983 | 2208 | 2136 | 2201 | 2165 | 2449 | 3799 | 2581 | 2577 |
| 2848 | Hmu1989 | 2030 | 2225 | 2242 | 2352 | 2318 | 2557 | 2581 | 3853 | 2821 |
| 2919 | NP4906A | 2109 | 2361 | 2286 | 2348 | 2404 | 2475 | 2577 | 2821 | 3824 |
542 symbols consensus ---MSLR--VDWRASLSLVGTVLKYLAVPLLVPLVVALIYGEDILPFVVTIAVTVLLGLA #oth 1334442111121225212.212121333252.243224.2.3542.3222232433.64 Hut2112 MVTA:A:TY::Y:V:VAY::::::FIGITPAF:F:LS:F::::P:::::ACV:M::G:GL Hut1908 :MNGH:::::::::::::T:R::L::::::TI:VIT::::::GW:::L:::V::T:::YG HQ1686A :::::V::::EYK::I::::S:::::T:::VI:::::FW:::S:V::IA:MIL:GTV:VI HVO_1057 ::::K::::::Y::::R:::::::::::::CF::::::Y:::SV::::::M:::::V:TG Hbo0555 ::::K::::::Y::::::::::::::::::F:::L:::Y:D:TVI::::::::::V::T: hla2147 :::VTRT::I:P::VF:YT::IV:I:SASMA:::::G::::::A:A:A:SMIIA:AI:AG rrnAC0757 :::::V:::::::Q:VA:T:::T:::::AM::::GISFV::::TVV:LIS::IAIVV::: Hmu1989 :::V:WG::::::::T::::::V:::SLTM:::::::VV:::::AV:::S::A:AV:::: NP4906A MRSIR:::::::::TA::L:::::::::A:::::T::V::W:::WV:A:A::I::T::FT consensus LERLDDDPDIGPREALLMVALTWLAVAVVGAIPYLIAGHGT---------ASTLANPV-- #oth 122242331312111123.342.311242.22.122124.4122432221412124.311 Hut2112 ::AV:SGG:L:N:::F:L:S:A::V:PLA:T::::V::T:S:::::::::---V:G:::: Hut1908 :SQ::::R:::A::GF::::T::::::L::TL:::L:E::::::::::::::::SW:QVP HQ1686A :D:I:PS:::R:::G::::::::I::TI:::V:::VEA::VPFITPAIHPG::::::M:: HVO_1057 ::::A::::::A::GF::::::::::TI:::::F::EA::IPFVASPIHPE:::G::::: Hbo0555 ::::EP::::RA::GF::::A::F::T::::::::VEAL:LPPVVPAIHPD::::::A:: hla2147 M:::H::::L:::D::AV:S:A:F:A::::::::I:::Y:::::::::::::A:GH:M:: rrnAC0757 ::QVS:SHEL:::::::F:G:S:G::::I:::::V:::Y:::::::::::E:A:GE:::: Hmu1989 ::Q::PE::V::::::VL:SFA:::A:A::T:::::::N:IPFVMAPSAP:::::::::: NP4906A :::::PE::M::A::::L:TVS:::::M::SV:::L::Y::::::::::::::::::::: consensus NALFESMSGFTTTGATVLGEISFDRHSHAIMMWRQLTQWLGGMGIIVLMVAILPELSVGG #oth .....11.........1243.1244.212312.............2..11....111.1. Hut2112 ::::::::::::::::::EK::V:::G::M:L:::::::::::::L:::::::::::::: Hut1908 :::::::::::::::::MKN:GVEH::::LLI:::::::::::::V::A::::::::::: HQ1686A :::::::::::::::::::D:::SS:TRS::L:::::::::::::V::A::::::::::: HVO_1057 :::::T:::::::::::::D::::S:TRG::::::::::::::::V::A::::::::::: Hbo0555 :::::::::::::::::::D:::QT:TRG::::::::::::::::V::A::::::::::: hla2147 :::::::::::::::::TT::::EQ::::VL:::::::::::::::::::::::Q:A:N: rrnAC0757 ::::::::::::::::ATD::::A:::::LL::::::::::::::::::::::::AA:N: Hmu1989 ::::::T:::::::::::::::T::::::V:::::::::::::::::::I::::::A:N: NP4906A :::::::::::::::::M::::T:Q::::LLL:::::::::::::::::I::::::A:N: consensus AQLMDAEAPGPGLEKLTPRIAETARALWGAYLGFTVLEAALLYGLHLTGIAPNMTLYNAV #oth .11133....1211....1.22...2..33.211.12434222..44324132.421..1 Hut2112 ::VI:Q::::LS::::::::QV:::::::I:A:::::A:LVY:::NVA::::::G::::: Hut1908 ::::::::::::I::::::::::::V::I::FA:::::M::::::::A:F:KE:::F::I HQ1686A ::::ET::::::I:::::::::::::::V::::L::IQ:G:::::FI:::D:Q::::::: HVO_1057 ::::::::::::I::::::::::::::::::::L::::IV:::::NV::H:Q::GV:::I Hbo0555 ::::::::::::I::::::::Q:::::::::::::::::T::F::GVLQ:D::::::::: hla2147 :E::KS:::::::Q:::::::Q::::::II:A:::AALI:I:F::G::PL::E:N::::I rrnAC0757 :::IES:::::E:Q::::K::::::L::LF:::::::YILI:L:::Y::Y::::DA:::: Hmu1989 ::::QS:::::E:Q::::K:V:::::::LI:F:::::YV:VM:::QFV:L:E:::::::: NP4906A ::::KT:::::E:Q:::::::::::V::LV:F:::::L:::::::::A:F::::H::::: consensus AHGLTTLPTGGFSPEARSIEAFSAAVQWVIIPFMVAAGTNFALFWHVLRGDPRRLLDDTE #oth 1.111.1.......115.212.2121..2321..22..3.....152231233533614. Hut2112 ::A:::::::::::::::M:::VP::::AVMV::LV:::::::::Y:::::::E:I:N:: Hut1908 S:::::::::::::::Y:::V:::::::A::::::V:::::::::GLVQ:N::S::A:E: HQ1686A S:A:::M:::::::::::V::::::A::I:::::I::::::::::RAAT::::::F::S: HVO_1057 ::::::M::::::::::::::::::A:::V::::::::::::::::::T:::K::FR::: Hbo0555 ::A:::M:::::::::K::::::::A::I:::::::::::::::::A:T::::HIFE:S: hla2147 :::FS:::::::::Q:E::A:::PV::::FV::::I::V::::::F:::D::M:MYKN:: rrnAC0757 :::F::::::::::Q:E::AY::P::::AV::::LI::M:::::YLL:QDEYAAF:Q:R: Hmu1989 :::FS:M:::::::::A::A::KPI::::A::::::::I::::::::V::EF:S::E::: NP4906A ::AF:::::::::::SD::A::::V::::::::::I::::::::::L:D::I:T::N:A: consensus FRFYLGAIAGLTAVLAALLFTGAALPQELG--------------GATAGNVENALRQAAF #oth 124.31262424122323.17152255342223132232123423436145.211.223. Hut2112 ::S::L:A::VG:LIS::::A:VG:SGTPE::::::::::::NV:TIV:::::S:::GL: Hut1908 ::::T:VM:S::::VTVV::V:SS::GTV:::::::::::::::---LAG::QS::HGL: HQ1686A :K::::VL:A:::::TGI::SAQS:IITPPAGGTVDAAYLESLRS:VP:QF:P:::D:L: HVO_1057 :KS:::V:GVVS:I::GI::L:DG:MSVAPAGETYDQLYLEGIRT:II::::P:V::SV: Hbo0555 ::::I:V::TI::::SV::::::GFV:AVPTQSTFSAMDLGQYV:DI::QI:PSV:::V: hla2147 ::M:::LVT::::::::G::Y:G:PATAI::::::::::::::::::E:VG::::::G:: rrnAC0757 LQA::::N::VAVI:WG:::::S:P:L::::::::::::::::::I:Q:AL::S::::T: Hmu1989 ::A:A::T:V:I:::S::::R:::P:L::::::::::::::::::T:::AT::::::::: NP4906A ::V:A::::V:S:I:::::YG:::PA:::::::::::::::::::T::::T::::::::: consensus QVVSIVTTTGYASSDFNAWDPTAQYLLLFAMFIGGSAGSTGGGIKIVRWLVVLKSIRREL #oth .2312211..1.251114.5441154...31.2...1..11.21.21..2215.323.2. Hut2112 :AIAV::::::::M:V:T:H:V::TT::::Y:L::::::AA:S::::::VL:T:G:D:S: Hut1908 :::::::::::::F:::G:TT::::::::G::L:::::::::A::M:::::IA:::K::: HQ1686A :I::::::::::NV:::::RTP:::::::::::::::::::::::::::YII::TV:::: HVO_1057 :::::::::::::I:::::SAP:::V::::::::::G:::::AV:::::Y:IV::L:::: Hbo0555 :::::::::::::M:::::S:V:::I::::::::::::::::AV:::::Y:I:::::::: hla2147 :IA:LMNS::F:TA::AE::TQTKFF:::V:::::::::::::::VI:::I:A:ALY::: rrnAC0757 ::A:LLNS::::T:N:AE:GN:::GV:::::::::::::::::V::::::::::::::Q: Hmu1989 :IA:LLNS::F:T:::AQ::DHTKIF:::T:::::::::::::V:V::::::F:AV:::: NP4906A ::G:LMNS::F:T:::AQ:G::::A::::T::V::::::::::::VI:::::M:A::::: consensus FTTAHPEAVRPVRLGGRVVDEDAIRGIYAFTLLYLVLFFVSTVLLALDAARV-GYDLSVL #oth 21122.3211.1..11432.132112132.11.1232.332312273.24.321632232 Hut2112 ::SI:::::::I:::KEI::DETV:DVF::IA:F:GI:V::::::Y::SL:TPAVT::G: Hut1908 :::V:::::K:::::::AL::S:::::H::::::IA:::L:V:V:M:::G:I::ME:Q:: HQ1686A ::::::::I:::::::KPL::R::::::::::::I:T:::GAG:::F::F::::A:ITT: HVO_1057 ::::::::::::::A::A:::R::::::::::::::::::::G::H:::::I::F:V:I: Hbo0555 ::::::D::::::::::AL::R::::::::::::::I:::ASG::FI::S:Y::QS:::: hla2147 Y:::N::V::::::::E:::::V::::FV:::::FL::AL:A:FIEI:TS::A:VS:TGT rrnAC0757 ::::::S:::::::::Q:I:::V:NA::G::::::LT:GIA::F:L:::G::::LE:T:F Hmu1989 ::::N:NT::::::A:Q::::::::::MG:::::::::GI:A:F:G::S::::::::T:: NP4906A SV::R::::K::::::Y:::::VV:::MV::::::A::GAA::FF:V:SL:::::E:::: consensus EAMSASAATLGNVGPGFGFVGPMGSYLDFPDTSKLLMVFLMWIGRLEILPVLVLFTPAFW #oth 2431142.11..1.....71..12311511452.33.24...1....131.212114421 Hut2112 D:::VAI:::::::::::D::::D:F:Q:S:LG::Y:T:::::::::V:S:::I:::S:: Hut1908 DG:::I:::I::::::::A::::EN::S::W:::F:::::::::::::F:::::L:R:Y: HQ1686A :LL::T::::::::::::::::::G::S:SPV::S::II::::::::::::I::L::EY: HVO_1057 :T:::V::::::::::::V::::::::::SNG:::Y::L:::V::::::::::I:::EY: Hbo0555 :T:::V::::::::::::T::::::::A:S:AG::F::V:::::::::::::::L::EY: hla2147 Q:LA::L::I::I:::::PL::F:T:ELL:N:T::::IG:::::::::V:::A::VAG:D rrnAC0757 ::I:::L::I::I::::::L::F:T:EL::E::::::I::::::::::I::F::::G::: Hmu1989 :SV:::L:A:::I:::::RL::F:::::L:::::::::::::::::::V:::A::VDRLD NP4906A ::::::I:::::I:::::ML::F::::G::PET:IV::::::V:::::I:::AV::G::: consensus RR #oth 43 Hut2112 :S Hut1908 :S HQ1686A QQ HVO_1057 :: Hbo0555 :: hla2147 D: rrnAC0757 NE Hmu1989 :S NP4906A K: