| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3244 | Hut1909 | Hmu1988 | hla2145 | NP4902A | rrnAC1536 | HQ1685A | HVO_1058 | Hbo0556 |
| 2184 | Hut1909 | 3259 | 1777 | 1808 | 1790 | 1975 | 1912 | 1939 | 1957 |
| 2301 | Hmu1988 | 1777 | 3212 | 1867 | 1881 | 1909 | 1916 | 1995 | 2003 |
| 2381 | hla2145 | 1808 | 1867 | 3266 | 2370 | 1898 | 1919 | 2121 | 2071 |
| 2335 | NP4902A | 1790 | 1881 | 2370 | 3247 | 1926 | 1915 | 2098 | 2050 |
| 2381 | rrnAC1536 | 1975 | 1909 | 1898 | 1926 | 3379 | 2054 | 2146 | 2088 |
| 2519 | HQ1685A | 1912 | 1916 | 1919 | 1915 | 2054 | 3231 | 2389 | 2416 |
| 2750 | HVO_1058 | 1939 | 1995 | 2121 | 2098 | 2146 | 2389 | 3254 | 2717 |
| 2718 | Hbo0556 | 1957 | 2003 | 2071 | 2050 | 2088 | 2416 | 2717 | 3229 |
472 symbols consensus ---------------------MRVIIVGAGEVGSSIAASLADDHEVVVVDRDPDRVEELN #oth 111111111111111111111121111...1..21..22.155.1.2.114.32111313 Hut1909 :::::::::::::::::::::::::V:::::::::::E::::E:::::::V:G::::A:T Hmu1988 :::::::::::::::::::::::::::::::::R::::N:::G:D::::E::AEL::::T hla2145 ::::::::::::::::::::::H:V:I::::::T:::::::S::::::I:V::::ADQ:K NP4902A :::::::::::::::::::::::IV::::::::T:::D:::A::D:::::I:E::A:T:K rrnAC1536 MKIHFTCQWKGGAYVSGGGAAVYIV:::::::::N::E:::KS:::A:::I::::::A:M HQ1685A ::::::::::::::::::::::H:::::::Q:::::::D::PS:D:I:::Y:AS:::::: HVO_1058 :::::::::::::::::::::V::::I:::Q:::::::D:DET:::::I:C::E::D::: Hbo0556 ::::::::::::::::::::::::V:::::Q:::::::D:D:A:::::I::::E::::M: consensus YSLDVLAIEGDGTALDTLEEAGVERADMVIASTDDDETNIVACGTAKAISDAFTIARVKN #oth .22..1234...13322143.2225.122..2..2.22.1.3.2111133131..1.123 Hut1909 :E::::::::::A:IE::::::LAA:ELL::V:::::::::S:::::TLD:VT:::::R: Hmu1988 :::::::::::::K::V:R:::::E:::L:::::I::I::::::A::::::::::::::R hla2145 :E::::T:A:::::SEIQTA:N:G:::::::C::N:Q::L:::::::TLG:G:::::::S NP4902A :DI::MTLA::::::S::QT:D:GS::LF:::::::RA:L:::::::T:G:P:::::TNS rrnAC1536 :EA:::GV::::AE::::S:::I:K::VL::::::::::::T::::ITAA:P:::S:::S HQ1685A ::::::GTV::::SVS:::D::I:K::::::::::::::::V:S:V::VA:::::::::D HVO_1058 :::::::LH::::SV::::::D:::::::::::::::::::::A::::::N::::::::: Hbo0556 ::::::G:S:::::VS::::::IAD:::::::::N::::::V:S:::::::::::::::: consensus TEYLRTWQRSERAFGVDFMVCTNLLTAESIVRVIGLPAARDVDPFAGGQVQMAEFEIDEE #oth 322.2..14234.111.2..311..1.1412122.1.213..12.13.411.1..12425 Hut1909 :K::D::ENA:G:L:::V::G::::::RK:ASM::::::::::S::D:TI::::::LATG Hmu1988 RDL:E:::NTN:::D:::::SSD:::::A:F:IS:V:G:Q:::T::::I:R::::::::D hla2145 :DF::::EG::G::::::::::D:::::N::::::::::I::::::S:L::::::::::: NP4902A V::::::ELT:S:::::::::SD:::::D::::V:::S:V::::::::L::::::::CAG rrnAC1536 AKF::::EK:GA:::::H::A:::::::N:A::::::GS:::ET:VD:::::G:::VR:S HQ1685A ::::::::::N::::::::::::::::::LA:M:::::::::::::N:E:::::::LS:A HVO_1058 :::::::::::K:::I:::::::::A:::::::V::::::::::::::::::::::V::: Hbo0556 ::::::::::KK:::I:::::::::A::::::I::::::::::::::::::::::QVA:N consensus SPVAGQTVAEADRFESLTFAAILRDG------EVEIPRGDTVIEPGDRVVVIGSPESVQA #oth ..12211131..1122...12211321111111233.2.2132641.221...1231134 Hut1909 ::::::::::::::DD:::::::CPDDDGTCD:IVV:::::RLSA::E:I:::TD:A:T: Hmu1988 :::T::S:R::::YA::::::LF::E::::::::I::T::::::I::::::::::D:IGD hla2145 ::::::::L::::::::::VGLF::::::::::MT::::::G::A:::A::::::::::: NP4902A ::::::::::::::::::::GLF::::::::::MVL:Q::::VK::::A::::::::::: rrnAC1536 ::I:D::::::::Y:::::::V::GD::::::::I::::E:::RE::DII::::C:::RL HQ1685A ::I::::::S::Q:::::::S:::::::::::A::M:::E:TLHSA:::::::::::::E HVO_1058 ::::N:::S:::::D:::::::::::::::::::T:::::S::G:::::::::::K:::G Hbo0556 :::SNV:IR::::::A:::::V::N:::::::A::::::Q:::Q:::::::::T:R:::E consensus FASDVAPDEDPGTADEVVIVGGSEIGYHTARLLEERGIKPRLIERDHDRARELAEQLPNT #oth .1343412553343331121..131.121...1132133.21..2261..13...6.151 Hut1909 :SHA::::D:---YHD:LL::::SV::Q::::::G:::R:K:::::PE::QF:::S::K: Hmu1988 ::T:TVCAG:ESG::S:::::::K::FEV:::F::H:YY:Q:::::E::::::::::::: hla2145 ::T:::::TT::R:::I:V:::T::::Q::::::::DF:::::::ET::::W:::N:::: NP4902A ::::L::EAT::G:::I::I:::::::Q:::::::::L::::::Q::::::K:::E::E: rrnAC1536 :::EIT:ESK--:TQN:::::::DV::::::::QD:::::::::Q::::::::::D:QG: HQ1685A :::T:D:E:AGADPE::::I:::K::::V:::::AQ::T::V::QAD::::::::K::AS HVO_1058 :::S:S:::P::::E:::::::::::::V::::::::F::::::H:AE:::::::M::G: Hbo0556 ::RS:::::S::::E:::::::::V:::V::::::::FR:::::::GE:::K::::::D: consensus TVMESDATDSEFLEREHVDDADVVVAALDSDEKNLLVSLLAKRLGVERTIAVVDSTEYVD #oth 3.112.1..51..32.32221.31.22.2...2...1221.312.21.31..12343.11 Hut1909 ::LQA::::RD:::S:NI:AV::::TT:E:::A:::AG:F:::::AD:A::::EEGS::: Hmu1988 ::LQ:::::::::LE:R::E::::::::E::::::::::::E:I::D::::::NQV::A: hla2145 V:::H::::T:::S::::::::IL:T::Q:::::::::V:::::::D:V::::::PD::T NP4902A L:::H::::T:::A:::::E::I:::::::::R:::::I::S:::T::IV:::::A:::: rrnAC1536 ::L:::::::::::::::S:::A:::T::::::::::T:::::::A:::V:::N:G:::: HQ1685A I::Q::P::I::::::RLG::::::TV:::::R::::::::SLM::::::::INT::::: HVO_1058 I::::::::VD:::::YIG:::LL:S:::::::::::::::A:::::::V::I:T:P::: Hbo0556 V::::::::M:::::::IG:::L:::::E::::::::::::A:::::::V::I:T::::: consensus LFEAVGVDVAVNPREVTAEEITRFTREGDAENIALIESDKAEVLEIEIDDDSVLAGRPIR #oth 1..21.1.1122..222....1...22441111.31.2.3...1.2.2333231312213 Hut1909 :::T::I::::Q::::A::::::::::EH:::V:I::::R:::I:V::::E::FHD:T:Q Hmu1988 :::T::::I::::::E:::::V::::DNRT:K::ML:H:L:::I::::ES:::::::::A hla2145 V::EI:I:I:I:::T::::::::::Y:SV:::::VL:N:Q:::::L:LTEGCG:T::::S NP4902A :::EI:I:::::::Q::::::::::HG:V:::::VL:N:Q:::::L:LT:SGS:T:QTVQ rrnAC1536 :::::::::::::::T:::::::::::Y::TKV:I::::R::::::::AA:::::::::Q HQ1685A :::T:::::GLS::::V:::::::::::::::V::::::::::::::::E::I:VD:::: HVO_1058 :::::::::G:S::::V:::::::::::G:::V::::::::::::::V:AE:::::K::: Hbo0556 :::::::::G:S::::V:::::::::::G::::::::::::::::::V::::I::::E:: consensus EAVADLPDGVVVGAITRDRELITPRGDTVIEAGDHVVVFVDSDVVDEVTPKL #oth 2324311423.2..12.432113...1.3242..12121.124532344442 Hut1909 S:A::::::::::::V::G:FVR::::::VH::::::F::ETTAL::TLA:I Hmu1988 D::Q:::P::::::VS:SGT:V::::::T::V:::AI:::E:AI::::SAII hla2145 :I:::TDARF:I::::::HK:V:::::::LQ:::::ILL:E::S:GAI:SMA NP4902A :VADG:DAEL:F:::::G:T::A:::::ELLP:::I::::ETAF:::L:RMA rrnAC1536 :S:QE::T:::I:::S::G::VI::::::::P:::::::::A:CLEA:ND:: HQ1685A D:IN:::::I::::::::D:F:::::::I:T:::R::::::T::::TAA::: HVO_1058 :S::T::E:::I:::::R::F::::::::::P::::::::::C:I:D:::N: Hbo0556 :S:PE::::I:::::::N::F:::::N::V:V:::::L:::AS:AGD:::Q: