8 genomes BUD1077 8 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - pNG7015 HVO_1553 Hbo3498 Hmu3269 Hut0110 hla0167 NP1162A HQ1667A

Pairwise sequence scores
Consensus score	3233	HQ1667A	NP1162A	pNG7015	Hmu3269	hla0167	Hut0110	HVO_1553	Hbo3498
1808	HQ1667A	3381	1272	1380	1391	1496	1462	1479	1435
1969	NP1162A	1272	3150	1247	1398	1549	1549	1557	1520
1942	pNG7015	1380	1247	3242	1989	1490	1590	1548	1597
2085	Hmu3269	1391	1398	1989	3205	1607	1572	1650	1645
2241	hla0167	1496	1549	1490	1607	4347	1739	1753	1704
2105	Hut0110	1462	1549	1590	1572	1739	3211	1789	1691
2287	HVO_1553	1479	1557	1548	1650	1753	1789	3249	2338
2314	Hbo3498	1435	1520	1597	1645	1704	1691	2338	3331

590 symbols
consensus       ------------------------------------------------------------
#oth            111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
HQ1667A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP1162A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
pNG7015         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hmu3269         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
hla0167         MPRNHCSSARSGSTSTRPPPRSAGWSARGSAGRSPSGSPQSRRARTGRRRGSGSRIPPAE
Hut0110         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_1553        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo3498         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       ----------------------------MIRARDAL-TPTPAHELALDCLEAGVEAALPD
#oth            111111111111111222222222222344642353143224134.241242114.24.2
HQ1667A         :::::::::::::::MFEQRGRNRQNTAQ:P:KTSV:SA::-Q:C:VTAVT:::N::H::
NP1162A         ::::::::::::::::::::::::::::---MF:P:S::S::::::VE::T:::R::Q:K
pNG7015         :::::::::::::::::::::::::::::::N:AEV:VGNRV::V::::I::A:D::A:E
Hmu3269         ::::::::::::::::::::::::::::::EN:AT::ERS:D:A:::::::RAIA::A:E
hla0167         SSYPRRIYVAPPRATAMTDDAETIDDAVTF:D:ER::AR::T::A:::::A::I:::::E
Hut0110         ::::::::::::::::::::::::::::::DD::R::AA::::DV::S:I:::I::ST:K
HVO_1553        ::::::::::::::::::::::::::::-MQEF::R::::::::T:I:::R:::::V:::
Hbo3498         :::::::::::::::::::::::::::MADL:F::E::::S::QT::K::SD::N:V:::

consensus       RAVREAVSVEDDTLSI-----ADGEYDLDAYDRVVVLGGGKAADGVAAALEGILG--DR-
#oth            2333333334152.21111111363...321332422.1.1.232323312441211131
HQ1667A         QVLS:TLTR:G:I:::::::::NNQ:::SK:EE:SII:::N::GRITQY:TT:VD:::H:
NP1162A         :::ERHCDI:GS::R::::::G::S:::::::SLRI:::::::::L::::::L::::E::
pNG7015         A:TKS:IGR::Q::TV:::::GGRT::::E:GE::IV::::::G::TR:::S::::::T:
Hmu3269         A:I:S::::T:E:::::::::::T::::T::RD:F:V::::::S::V::::S::::::H:
hla0167         :LI:D::::R:G::R:EGVDG:G::::::::::::L::A:::TA:A::GVA:A::RS::E
Hut0110         AVL:::L:::GGV:TV::::::GS::::G:::S:::::::::::V:TRE::RH:E:::Y:
HVO_1553        :V:::S::LDG:::TV:::::::ET:::S::::IL:V:::::G::::D:::AV:::::::
Hbo3498         :I::D:::LN:N:::V::::::EAT:::S:F::IL:I:::::G::::D:::TV:::::::

consensus       IDGGIVVTDDPT---------DA--DRVRVLPGDHPLPSERNVEAARRLLDLAEAADART
#oth            223.4.12442311111111133223214434.4..3.2542242133333425431451
HQ1667A         LT::::I::::V::::::::::::::P:N:VT:T:::::RS:IT::EQMRSY:CDCG:N:
NP1162A         L:::::::GHR::::::::::A:P::::T:RE:N::S:GPDS:DG:TA::ER:::::GQ:
pNG7015         LS::H::VKQAI::::::::::T::ET::SSV:::::::DQ::A:TADI:ETVDE:::E:
Hmu3269         VTD:L:::KH::::::::::::G::::::CVT:::::::::::R:TTD::E:VA::::E:
hla0167         ::E::::::::PDWTGADASDPSSTATID::::::::::::G::S:::V::A::R:GPDD
Hut0110         ::R:L::STK:V:::::::::AT:::T:ETVA:S::I:DTDSLDG:::VFQR:QGLGEG:
HVO_1553        ::D:V:::P::::::::::::PSPDG:IER::::::V::A:G::ST:::V::LSDL:D::
Hbo3498         ::::A:::PE:::::::::::SG::::IDR:::A::V:::TG::S:A:IV::LSET:D::

consensus       LVLAVITGGGSALLAAPADDISLADLRTTTDALLDSGAPIDEINAVRKHCSTIKGGGLAR
#oth            .2.323...2..1142..23123521132.43.253.131421....113.32...21.1
HQ1667A         :S:V::::::::::S:::EN:DKSA::RV:QE:IQC:::::R:::::::I::::::Q:::
NP1162A         ::::PM::::::::C::::GL:A::I::V:E::::A::SV::L::::RV::E:::::::A
pNG7015         :I:F:L:::A::::S:::G:LT:E::Q::::R::SG:V::A::::::::L:DL:::QI::
Hmu3269         :::P:V:::T::::T:::G:L::TE::E::AL::::::::H::::::::L:EV:::R:::
hla0167         :::::::::::::::::::P::VG:::AL:S:::T:::S::::::::::::AV:::Q:::
Hut0110         ::::P::::::::::L::G::T:V::QA::EE:VE:::S:E::::::::::A::::::::
HVO_1553        ::::A::::A::V:P:::EG::::E:QE:::R::E:::E:HDL::::::V::L:::::::
Hbo3498         :::::V:::A::VIPT:::G::::::Q:::::::R:::H:G:L::::::L::L:::::::

consensus       AAAPATVVGLVFSDVVGNDLSVIASGPTVPDETTYDDALAVLDRYDLDVPDAVRERLEAG
#oth            211..1121134...212213211...22.1221131.25212211123.53.253.421
HQ1667A         :LT::QT:::I::::TSGNP::V::::LS::S:::A:::IT:RE::VNT:ES::MH:QR:
NP1162A         :::::::::V:M:::::D:PA:V:::::::V:AAP:V:AT:::::GV:A:-:::RW:SSA
pNG7015         R::::::A::LI:::::::::T:G:::S:::::::E::RD:FE::::TP:P::CNY::S:
Hmu3269         :::::::AT::L:::::::::A:G:::::::::::G::::::EW::VTP::::ASH:A::
hla0167         ::::::T:T:AV:::I:DP:DT:::::::::PS::A::::::::::::A::S:::::R::
Hut0110         ::::::::::L::::::D:PG:::::::A::::::E:::EI:::::V:::TV:::H::::
HVO_1553        L::::::::::L::::::::G:::::::A::::::::::D::::F:::::KP::T::AR:
Hbo3498         L::::::I::::::::::::::::::::A::::::::::S:::::G::::ES::S:::R:

consensus       AAGERPETPSA-DDPVFDRVTNHVLADGATALDAARAAAAEAGYEPLVLSSRLRGEAREA
#oth            441343.1.541345533333221212352112..1431333..3221112221...212
HQ1667A         :N:DID::::ELSSST::SP:TI:::::M::::::AN:CSNL:::::I:::SI:::::::
NP1162A         T----::S::V:A------AR:::I:S:WD:V:::::H::A:::QTC:::TH:E:::EQS
pNG7015         RD:RVS:::FP:::TD:::::::LIG:N:::::::A:V:R:::::::::T:::::::::V
Hmu3269         D::R:S:::TT:AALSAE::RT:LVG:N:L::::::DV:R::::T:::VT::::::::::
hla0167         :D::L::::T::G::A:::SAAF:VGN:R::::::AT:::DR::::::::ASV:::::::
Hut0110         :::::A:::-:::PG:LGH:D::::::AW:T:A:::D:::::::::::::::I::::T::
HVO_1553        S::DV::::KP:G::::::::::::::TF:::::::EV:DDR:::S:I::::V:::::::
Hbo3498         :R::LS:::M:::::::::::::::::TH:::S:::ET:R:H::DSI:::A:V:::::::

consensus       AKTHVAIAEEVAATGTPIEPPAVILSGGETTVTVTGD----GDGGPNQEFALSAALELPD
#oth            13322.1.11432224.221..12.2...1..124.22111.3....3.22122152234
HQ1667A         :::::::::::QRNR:::D:::A::A::::::::::::::::V:::::::::A::::::S
NP1162A         GRF:A:V:TD::LRDV:V::::::::::::::S:S:::::::V::::M::::A::PK:::
pNG7015         ::PL::::::AT:::::V:::::L:A:::::::::::G::::Q:::::::V::G::AHDG
Hmu3269         GT:LL:V:::I::::D:::::::V:A:::C::SI::EG::::T::::::L::::GI::TG
hla0167         GT::A:::::C::R:S:::::::L:::::::::L-::AADP:T::::A:::A::G:A:AE
Hut0110         :LSGL:::::C::::::V:::::L::::::::::M:N::::::::::L::::RV:V:Q:E
HVO_1553        ::::::V:::SL:::N::TA:::V:::::C::::R::::::::::::L::C:A::A::::
Hbo3498         ::::::V::::::::D:LD::::::T:::C::::R::::::::::::L:YC::::R::DT

consensus       E----------------------AVVAAVDTDGEDGGTDVAGAIVDAATV---SDPQAAR
#oth            31111111111111111111111323212.1..5..2131...31135222113335412
HQ1667A         N::::::::::::::::::::::TALC:I::::F::P::A:::T:TT:::ND:NEAS:::
NP1162A         ::::::::::::::::::::::::::G::::::S::S::A:::L:::D:::::-:::V::
pNG7015         D::::::::::::::::::::::::I::::::::::SS::::::A:G:AI:::::RER::
Hmu3269         :::::::::::::::::::::::TI:::::S:::::SSA::::L::GE:::::T:RA:::
hla0167         GPLGDGGGGGGGDDDGHGHSAPRV:::SA::::L::P::A::::A::T:L:::-::D:::
Hut0110         G::::::::::::::::::::::I:C:S:::::A::::E:::::::GE:L::::N::RG:
HVO_1553        :::::::::::::::::::::::T:L:SI:S::K::::E::::V:::SS::::-AAGD:H
Hbo3498         D:::::::::::::::::::::::::::I:S:::::::T:::::::SR::DDA::ESE:A

consensus       AALAANDALPFLRDAGALIRT--GPTGTNVNDLRVLVVDDRD--------
#oth            31.321.2224141541233111.2.......221431465432222221
HQ1667A         :::K::::YS::D:NA::MLSTE:A:::::::::::TILTE:T:::::::
NP1162A         T::DE::SYRA:A:::::LFS:::S::::::::::V:::---::::::::
pNG7015         E::L:::VGSY:SEIE:T:E::::::::::::VI::AIPGPSE:::::::
Hmu3269         E:::::::GR::SETD:T::::::::::::::IV::::P::A::::::::
hla0167         D::DRH::Y:LFD:::::L:::::::::::::::AI::EK::GEEGRSL:
Hut0110         :::LE:::::A:EES::V:E:::::::::::::::F:IEA--::::::::
HVO_1553        ::::R:::::V::E::::VES:::A:::::::::::::SEGV::::::::
Hbo3498         :S::E::S:S::::RKC::::::::::::::::::AI:::L:GRDSNGNA